MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005296	GC	3	6	19406	19411	0 %	0 %	50 %	50 %	39933096
502	NC_005296	GCC	2	6	19448	19453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933096
503	NC_005296	GTC	3	9	19463	19471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933096
504	NC_005296	GCC	2	6	19493	19498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933096
505	NC_005296	ACC	2	6	19542	19547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933096
506	NC_005296	TTC	2	6	19584	19589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933096
507	NC_005296	CGAG	2	8	19600	19607	25 %	0 %	50 %	25 %	39933096
508	NC_005296	TCT	2	6	19627	19632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933096
509	NC_005296	CGC	2	6	19633	19638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933096
510	NC_005296	GC	3	6	19677	19682	0 %	0 %	50 %	50 %	39933096
511	NC_005296	GAG	2	6	19683	19688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933096
512	NC_005296	TCA	2	6	19717	19722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933096
513	NC_005296	GAT	2	6	19763	19768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933096
514	NC_005296	CCA	2	6	19790	19795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933096
515	NC_005296	GCG	2	6	19804	19809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933096
516	NC_005296	GTC	2	6	19902	19907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_005296	TCG	2	6	19939	19944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933097
518	NC_005296	CGA	2	6	19988	19993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933097
519	NC_005296	GCG	2	6	20009	20014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933097
520	NC_005296	CCA	2	6	20016	20021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933097
521	NC_005296	TGT	2	6	20045	20050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933097
522	NC_005296	GAT	2	6	20058	20063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933097
523	NC_005296	CGC	2	6	20075	20080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_005296	TCG	2	6	20101	20106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933098
525	NC_005296	TCGG	2	8	20167	20174	0 %	25 %	50 %	25 %	39933098
526	NC_005296	CAC	2	6	20202	20207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933098
527	NC_005296	CGG	2	6	20240	20245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933098
528	NC_005296	GCC	3	9	20278	20286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933098
529	NC_005296	TCG	2	6	20299	20304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933098
530	NC_005296	TTG	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933098
531	NC_005296	TTC	2	6	20428	20433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933098
532	NC_005296	GTC	2	6	20451	20456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933098
533	NC_005296	GCC	2	6	20466	20471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933098
534	NC_005296	AG	3	6	20545	20550	50 %	0 %	50 %	0 %	39933098
535	NC_005296	CGGA	2	8	20583	20590	25 %	0 %	50 %	25 %	39933098
536	NC_005296	AGC	2	6	20612	20617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933098
537	NC_005296	CGA	2	6	20723	20728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933098
538	NC_005296	ACC	2	6	20730	20735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933098
539	NC_005296	CGA	2	6	20759	20764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933098
540	NC_005296	GAC	2	6	20769	20774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933098
541	NC_005296	GC	3	6	20918	20923	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
542	NC_005296	GCC	3	9	20937	20945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933099
543	NC_005296	GGC	2	6	20946	20951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933099
544	NC_005296	CGAC	2	8	20981	20988	25 %	0 %	25 %	50 %	39933099
545	NC_005296	CGAG	2	8	21014	21021	25 %	0 %	50 %	25 %	39933099
546	NC_005296	GCT	2	6	21140	21145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933099
547	NC_005296	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
548	NC_005296	CAT	2	6	21282	21287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933099
549	NC_005296	CGAC	2	8	21320	21327	25 %	0 %	25 %	50 %	39933099
550	NC_005296	ACC	2	6	21328	21333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933099
551	NC_005296	GCA	2	6	21341	21346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933099
552	NC_005296	TCA	2	6	21386	21391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933099
553	NC_005296	GCC	2	6	21405	21410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933099
554	NC_005296	GGT	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933099
555	NC_005296	GAT	2	6	21537	21542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933099
556	NC_005296	AGT	2	6	21590	21595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933099
557	NC_005296	ATG	2	6	21598	21603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933099
558	NC_005296	CGG	2	6	21614	21619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933099
559	NC_005296	GAA	2	6	21624	21629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933099
560	NC_005296	ACC	2	6	21650	21655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933099
561	NC_005296	GTT	2	6	21732	21737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933099
562	NC_005296	GCA	2	6	21746	21751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933099
563	NC_005296	TGA	3	9	21761	21769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933099
564	NC_005296	TCA	2	6	21818	21823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933099
565	NC_005296	CAG	2	6	21840	21845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933099
566	NC_005296	CGATGA	2	12	21944	21955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	39933099
567	NC_005296	TCT	2	6	22019	22024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933099
568	NC_005296	CAC	2	6	22026	22031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933099
569	NC_005296	AGC	2	6	22048	22053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933099
570	NC_005296	GCC	2	6	22059	22064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933099
571	NC_005296	CCG	2	6	22079	22084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933099
572	NC_005296	CGGA	2	8	22095	22102	25 %	0 %	50 %	25 %	39933099
573	NC_005296	GCCG	2	8	22103	22110	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
574	NC_005296	GGCC	2	8	22169	22176	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
575	NC_005296	GCG	2	6	22265	22270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933099
576	NC_005296	GAT	2	6	22299	22304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933099
577	NC_005296	CGC	2	6	22380	22385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933099
578	NC_005296	ACC	2	6	22428	22433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933099
579	NC_005296	CGG	2	6	22493	22498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_005296	ACG	3	9	22570	22578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_005296	CG	3	6	22577	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_005296	TGC	2	6	22606	22611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_005296	GGAC	2	8	22682	22689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_005296	CGC	2	6	22796	22801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
585	NC_005296	TCG	2	6	22859	22864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933100
586	NC_005296	AGC	2	6	22964	22969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933100
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588	NC_005296	CGC	2	6	23014	23019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
589	NC_005296	TCG	2	6	23039	23044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933100
590	NC_005296	CCG	2	6	23069	23074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
591	NC_005296	GCC	2	6	23078	23083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
592	NC_005296	ACCG	2	8	23092	23099	25 %	0 %	25 %	50 %	39933100
593	NC_005296	CGC	2	6	23100	23105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
594	NC_005296	GCC	2	6	23203	23208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
595	NC_005296	CGA	2	6	23239	23244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933100
596	NC_005296	GAGC	2	8	23283	23290	25 %	0 %	50 %	25 %	39933100
597	NC_005296	GCC	2	6	23338	23343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
598	NC_005296	CGC	3	9	23433	23441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
599	NC_005296	CGT	2	6	23457	23462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933100
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602	NC_005296	TCG	2	6	23547	23552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933100
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604	NC_005296	CCG	2	6	23598	23603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
605	NC_005296	GGCCG	2	10	23607	23616	0 %	0 %	60 %	40 %	39933100
606	NC_005296	GCCG	2	8	23652	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	39933100
607	NC_005296	GCC	2	6	23668	23673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933100
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609	NC_005296	TGC	2	6	23745	23750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_005296	CAC	2	6	23780	23785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933101
611	NC_005296	GCT	2	6	23835	23840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933101
612	NC_005296	CGG	2	6	23875	23880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933101
613	NC_005296	CAG	2	6	23884	23889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933101
614	NC_005296	GAT	2	6	23968	23973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933101
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616	NC_005296	CG	3	6	24009	24014	0 %	0 %	50 %	50 %	39933101
617	NC_005296	CG	3	6	24031	24036	0 %	0 %	50 %	50 %	39933101
618	NC_005296	CGC	2	6	24061	24066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933101
619	NC_005296	GCC	2	6	24076	24081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933101
620	NC_005296	ACG	2	6	24087	24092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933101
621	NC_005296	GAA	2	6	24106	24111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933101
622	NC_005296	TGCCC	2	10	24117	24126	0 %	20 %	20 %	60 %	39933101
623	NC_005296	GCCC	2	8	24169	24176	0 %	0 %	25 %	75 %	39933101
624	NC_005296	GGT	2	6	24214	24219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933101
625	NC_005296	GCG	2	6	24273	24278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933101
626	NC_005296	CGAG	3	12	24333	24344	25 %	0 %	50 %	25 %	39933101
627	NC_005296	CGA	2	6	24345	24350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933101
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629	NC_005296	GGC	2	6	24361	24366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933101
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