MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_005296	TGC	2	6	230784	230789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933283
6002	NC_005296	GCT	2	6	230794	230799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933283
6003	NC_005296	GTT	2	6	230818	230823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933283
6004	NC_005296	CGGC	2	8	230879	230886	0 %	0 %	50 %	50 %	39933283
6005	NC_005296	CGC	2	6	230895	230900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933283
6006	NC_005296	CCG	2	6	230903	230908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933283
6007	NC_005296	CGT	2	6	230980	230985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933283
6008	NC_005296	CGT	2	6	230997	231002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933283
6009	NC_005296	GTGC	2	8	231004	231011	0 %	25 %	50 %	25 %	39933283
6010	NC_005296	GCT	2	6	231031	231036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933283
6011	NC_005296	TCG	2	6	231069	231074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933283
6012	NC_005296	CCG	2	6	231106	231111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933283
6013	NC_005296	CGC	2	6	231139	231144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933283
6014	NC_005296	ACA	2	6	231267	231272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933283
6015	NC_005296	GGC	2	6	231310	231315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933283
6016	NC_005296	GACC	2	8	231327	231334	25 %	0 %	25 %	50 %	39933283
6017	NC_005296	AAAT	2	8	231361	231368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_005296	GCG	2	6	231404	231409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_005296	AAC	2	6	231442	231447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_005296	CGT	2	6	231486	231491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933284
6021	NC_005296	CGC	3	9	231509	231517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933284
6022	NC_005296	CAGC	2	8	231567	231574	25 %	0 %	25 %	50 %	39933284
6023	NC_005296	CGC	2	6	231577	231582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933284
6024	NC_005296	CCG	2	6	231612	231617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933284
6025	NC_005296	GGC	2	6	231647	231652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933284
6026	NC_005296	CTC	2	6	231681	231686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933284
6027	NC_005296	CCG	2	6	231703	231708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933284
6028	NC_005296	ATC	2	6	231756	231761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933284
6029	NC_005296	GGCC	2	8	231765	231772	0 %	0 %	50 %	50 %	39933284
6030	NC_005296	AGA	3	9	231799	231807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933284
6031	NC_005296	AGA	2	6	231817	231822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933284
6032	NC_005296	ACG	2	6	231826	231831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933284
6033	NC_005296	ATC	2	6	231846	231851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933284
6034	NC_005296	AAGT	2	8	231861	231868	50 %	25 %	25 %	0 %	39933284
6035	NC_005296	TAC	2	6	231900	231905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_005296	CATC	2	8	231929	231936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_005296	CAA	2	6	231943	231948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_005296	TCG	2	6	232021	232026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6039	NC_005296	GCA	2	6	232085	232090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6040	NC_005296	CAC	2	6	232113	232118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933285
6041	NC_005296	GTCG	2	8	232146	232153	0 %	25 %	50 %	25 %	39933285
6042	NC_005296	CAG	2	6	232179	232184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6043	NC_005296	AGA	2	6	232196	232201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933285
6044	NC_005296	CAGCG	2	10	232210	232219	20 %	0 %	40 %	40 %	39933285
6045	NC_005296	CGC	2	6	232236	232241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933285
6046	NC_005296	ATG	2	6	232267	232272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933285
6047	NC_005296	CAG	2	6	232293	232298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6048	NC_005296	CCG	2	6	232300	232305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933285
6049	NC_005296	TGA	2	6	232352	232357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933285
6050	NC_005296	TCG	2	6	232363	232368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6051	NC_005296	GCA	2	6	232370	232375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6052	NC_005296	CAC	3	9	232401	232409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933285
6053	NC_005296	GAC	2	6	232446	232451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6054	NC_005296	ACC	2	6	232474	232479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933285
6055	NC_005296	CCA	2	6	232481	232486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933285
6056	NC_005296	GAA	2	6	232533	232538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933285
6057	NC_005296	CAG	2	6	232542	232547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6058	NC_005296	GTC	2	6	232605	232610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933285
6059	NC_005296	GCC	2	6	232617	232622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933286
6060	NC_005296	CG	4	8	232651	232658	0 %	0 %	50 %	50 %	39933286
6061	NC_005296	CGCCGA	2	12	232687	232698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933286
6062	NC_005296	CCA	2	6	232735	232740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933286
6063	NC_005296	GCC	2	6	232745	232750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933286
6064	NC_005296	GC	3	6	232751	232756	0 %	0 %	50 %	50 %	39933286
6065	NC_005296	TCA	2	6	232774	232779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933286
6066	NC_005296	CGG	2	6	232795	232800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933286
6067	NC_005296	CAG	2	6	232859	232864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933286
6068	NC_005296	GCG	2	6	232873	232878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933286
6069	NC_005296	TGA	2	6	232897	232902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933286
6070	NC_005296	CAC	2	6	232907	232912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933286
6071	NC_005296	GCTC	2	8	232921	232928	0 %	25 %	25 %	50 %	39933286
6072	NC_005296	CGG	2	6	232957	232962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933286
6073	NC_005296	CAG	2	6	232970	232975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933286
6074	NC_005296	GC	3	6	233044	233049	0 %	0 %	50 %	50 %	39933286
6075	NC_005296	GATC	2	8	233095	233102	25 %	25 %	25 %	25 %	39933286
6076	NC_005296	CGG	2	6	233125	233130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933286
6077	NC_005296	TGG	3	9	233182	233190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933286
6078	NC_005296	TTG	2	6	233235	233240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933286
6079	NC_005296	ATC	2	6	233328	233333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933286
6080	NC_005296	CGC	2	6	233372	233377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933286
6081	NC_005296	GC	3	6	233397	233402	0 %	0 %	50 %	50 %	39933286
6082	NC_005296	AGC	2	6	233403	233408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933286
6083	NC_005296	CCA	2	6	233522	233527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933286
6084	NC_005296	TCA	2	6	233557	233562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933286
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6086	NC_005296	CGA	2	6	233636	233641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933287
6087	NC_005296	CCG	2	6	233694	233699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933287
6088	NC_005296	TTCG	2	8	233747	233754	0 %	50 %	25 %	25 %	39933287
6089	NC_005296	C	6	6	233780	233785	0 %	0 %	0 %	100 %	39933287
6090	NC_005296	GCC	2	6	233836	233841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933287
6091	NC_005296	GCT	2	6	233867	233872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933287
6092	NC_005296	TCG	2	6	233911	233916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933287
6093	NC_005296	GGC	2	6	233919	233924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933287
6094	NC_005296	CCGA	2	8	233925	233932	25 %	0 %	25 %	50 %	39933287
6095	NC_005296	TGG	2	6	233985	233990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933287
6096	NC_005296	GCCG	2	8	234059	234066	0 %	0 %	50 %	50 %	39933287
6097	NC_005296	CGA	2	6	234070	234075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933287
6098	NC_005296	CTCCC	2	10	234122	234131	0 %	20 %	0 %	80 %	39933287
6099	NC_005296	GGGGGT	2	12	234149	234160	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	39933287
6100	NC_005296	AGATAA	2	12	234248	234259	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	39933287
6101	NC_005296	GC	3	6	234289	234294	0 %	0 %	50 %	50 %	39933287
6102	NC_005296	CTGG	2	8	234314	234321	0 %	25 %	50 %	25 %	39933287
6103	NC_005296	ACA	2	6	234397	234402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933287
6104	NC_005296	CTGCAT	2	12	234438	234449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	39933287
6105	NC_005296	CAA	2	6	234479	234484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933287
6106	NC_005296	GCC	2	6	234485	234490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933287
6107	NC_005296	TGG	2	6	234493	234498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933287
6108	NC_005296	CGC	3	9	234505	234513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933287
6109	NC_005296	CAG	2	6	234553	234558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933287
6110	NC_005296	CGC	2	6	234611	234616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_005296	GC	3	6	234649	234654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_005296	AAC	3	9	234723	234731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_005296	CGG	2	6	234823	234828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_005296	CGG	2	6	234887	234892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_005296	GGA	2	6	234917	234922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_005296	ACG	2	6	234943	234948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933288
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6118	NC_005296	ACG	2	6	234982	234987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933288
6119	NC_005296	CGC	2	6	235151	235156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933288
6120	NC_005296	GCG	2	6	235189	235194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933288
6121	NC_005296	ATC	2	6	235206	235211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933288
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6123	NC_005296	GCA	2	6	235240	235245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933288
6124	NC_005296	ACG	2	6	235264	235269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933288
6125	NC_005296	ATCT	2	8	235332	235339	25 %	50 %	0 %	25 %	39933288
6126	NC_005296	GAT	2	6	235343	235348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933288
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6142	NC_005296	ACG	2	6	235893	235898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933288
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6245	NC_005296	CGGG	2	8	239423	239430	0 %	0 %	75 %	25 %	39933290
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6372	NC_005296	ACC	2	6	243760	243765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933294
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6401	NC_005296	ATTG	2	8	244763	244770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_005296	CCTC	2	8	244845	244852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6403	NC_005296	CG	3	6	244917	244922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6404	NC_005296	CGG	3	9	244929	244937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6405	NC_005296	TGCGA	3	15	244938	244952	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6406	NC_005296	GCC	2	6	245000	245005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6438	NC_005296	GC	5	10	246190	246199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6439	NC_005296	GT	3	6	246212	246217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6475	NC_005296	GAAC	2	8	247858	247865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6476	NC_005296	ACGAA	2	10	247867	247876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6477	NC_005296	A	6	6	247894	247899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6491	NC_005296	CCAA	2	8	248304	248311	50 %	0 %	0 %	50 %	39933299
6492	NC_005296	GCCG	2	8	248330	248337	0 %	0 %	50 %	50 %	39933299
6493	NC_005296	TACC	2	8	248393	248400	25 %	25 %	0 %	50 %	39933299
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6495	NC_005296	GGC	2	6	248523	248528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933299
6496	NC_005296	CGT	2	6	248602	248607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933299
6497	NC_005296	CGC	2	6	248624	248629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6498	NC_005296	CGGCG	2	10	248642	248651	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6499	NC_005296	CGC	2	6	248668	248673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6500	NC_005296	CG	4	8	248723	248730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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