MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005296	GTC	2	6	192406	192411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_005296	GCCG	2	8	192419	192426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_005296	CGC	2	6	192429	192434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_005296	GCA	2	6	192437	192442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_005296	GCG	2	6	192493	192498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_005296	GCC	2	6	192506	192511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_005296	CCGT	2	8	192526	192533	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_005296	GCGAT	2	10	192601	192610	20 %	20 %	40 %	20 %	39933250
5009	NC_005296	CGA	2	6	192616	192621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933250
5010	NC_005296	GCG	3	9	192632	192640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933250
5011	NC_005296	ATT	2	6	192710	192715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933250
5012	NC_005296	ACG	2	6	192779	192784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933250
5013	NC_005296	CGA	2	6	192810	192815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933250
5014	NC_005296	GC	3	6	193056	193061	0 %	0 %	50 %	50 %	39933250
5015	NC_005296	CG	3	6	193116	193121	0 %	0 %	50 %	50 %	39933250
5016	NC_005296	ACG	2	6	193157	193162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933250
5017	NC_005296	GTG	2	6	193168	193173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933250
5018	NC_005296	CGA	2	6	193299	193304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933250
5019	NC_005296	TGA	2	6	193403	193408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933250
5020	NC_005296	CGC	2	6	193462	193467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933250
5021	NC_005296	CGCC	2	8	193557	193564	0 %	0 %	25 %	75 %	39933251
5022	NC_005296	CGC	2	6	193584	193589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933251
5023	NC_005296	CGA	2	6	193649	193654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933251
5024	NC_005296	ATC	2	6	193665	193670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933251
5025	NC_005296	GGC	2	6	193701	193706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933251
5026	NC_005296	CGA	2	6	193709	193714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933251
5027	NC_005296	CCGT	2	8	193924	193931	0 %	25 %	25 %	50 %	39933251
5028	NC_005296	GCC	2	6	193940	193945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933251
5029	NC_005296	TCG	2	6	193993	193998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933251
5030	NC_005296	CCG	2	6	194006	194011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933251
5031	NC_005296	GCT	2	6	194055	194060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933251
5032	NC_005296	T	6	6	194080	194085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_005296	CAC	2	6	194086	194091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_005296	CGT	2	6	194096	194101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_005296	CATC	2	8	194120	194127	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_005296	GGAT	2	8	194141	194148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_005296	GGT	2	6	194265	194270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933252
5038	NC_005296	CG	3	6	194316	194321	0 %	0 %	50 %	50 %	39933252
5039	NC_005296	TCG	2	6	194329	194334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933252
5040	NC_005296	CTG	2	6	194352	194357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933252
5041	NC_005296	TGG	2	6	194372	194377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933252
5042	NC_005296	GCC	2	6	194463	194468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933252
5043	NC_005296	ACG	2	6	194473	194478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933252
5044	NC_005296	TCT	2	6	194480	194485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933252
5045	NC_005296	TTG	2	6	194488	194493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933252
5046	NC_005296	CCG	2	6	194498	194503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933252
5047	NC_005296	CCA	2	6	194534	194539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933252
5048	NC_005296	GCT	2	6	194665	194670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_005296	CT	4	8	194669	194676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_005296	GATG	2	8	194730	194737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_005296	TC	3	6	194765	194770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_005296	GCC	2	6	194778	194783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
5053	NC_005296	CGG	2	6	194785	194790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933253
5054	NC_005296	CTT	2	6	194795	194800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933253
5055	NC_005296	CGC	2	6	194843	194848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
5056	NC_005296	CG	3	6	194882	194887	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
5057	NC_005296	CGA	2	6	194914	194919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5058	NC_005296	CGA	2	6	194950	194955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5059	NC_005296	GAT	2	6	195047	195052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933253
5060	NC_005296	CTG	2	6	195083	195088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5061	NC_005296	CG	3	6	195096	195101	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
5062	NC_005296	CGA	2	6	195121	195126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5063	NC_005296	GTCGA	2	10	195150	195159	20 %	20 %	40 %	20 %	39933253
5064	NC_005296	CCG	2	6	195169	195174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
5065	NC_005296	GGT	2	6	195212	195217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
5066	NC_005296	GTC	2	6	195263	195268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5067	NC_005296	TGG	4	12	195310	195321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
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5069	NC_005296	GTCG	2	8	195347	195354	0 %	25 %	50 %	25 %	39933253
5070	NC_005296	CCG	2	6	195376	195381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
5071	NC_005296	AGC	2	6	195396	195401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5072	NC_005296	TGT	2	6	195439	195444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933253
5073	NC_005296	CGA	2	6	195445	195450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5074	NC_005296	CGG	2	6	195530	195535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933253
5075	NC_005296	GC	3	6	195559	195564	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
5076	NC_005296	CGC	3	9	195577	195585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
5077	NC_005296	CTT	2	6	195587	195592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933253
5078	NC_005296	CCG	2	6	195675	195680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
5079	NC_005296	GTT	2	6	195695	195700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933253
5080	NC_005296	GCC	2	6	195740	195745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
5081	NC_005296	CAG	2	6	195782	195787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5082	NC_005296	CGA	2	6	195790	195795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5083	NC_005296	TGG	2	6	195858	195863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
5084	NC_005296	ATG	2	6	195927	195932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933253
5085	NC_005296	GC	3	6	195970	195975	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
5086	NC_005296	GGT	2	6	196013	196018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
5087	NC_005296	TGC	2	6	196056	196061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5088	NC_005296	CGA	2	6	196147	196152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
5089	NC_005296	CGGT	2	8	196240	196247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5090	NC_005296	CGT	2	6	196271	196276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5091	NC_005296	GAT	2	6	196297	196302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933254
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5093	NC_005296	ATC	2	6	196367	196372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933254
5094	NC_005296	GC	3	6	196413	196418	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
5095	NC_005296	GTT	2	6	196432	196437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933254
5096	NC_005296	AGC	2	6	196442	196447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5097	NC_005296	GC	3	6	196446	196451	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
5098	NC_005296	AGG	2	6	196524	196529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933254
5099	NC_005296	CGGC	2	8	196545	196552	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
5100	NC_005296	GCT	2	6	196575	196580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5101	NC_005296	CTT	2	6	196672	196677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933254
5102	NC_005296	GAT	2	6	196738	196743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933254
5103	NC_005296	GCG	2	6	196759	196764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933254
5104	NC_005296	GCT	2	6	196767	196772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5105	NC_005296	AGA	2	6	196794	196799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933254
5106	NC_005296	TCA	2	6	196821	196826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933254
5107	NC_005296	CG	3	6	196834	196839	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
5108	NC_005296	GAG	2	6	196862	196867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933254
5109	NC_005296	CAG	3	9	196906	196914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5110	NC_005296	TTGCCG	2	12	196928	196939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5111	NC_005296	CAG	2	6	196942	196947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5112	NC_005296	GC	3	6	196953	196958	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
5113	NC_005296	CGC	2	6	196969	196974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933254
5114	NC_005296	TCT	2	6	197007	197012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933254
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5118	NC_005296	GGC	2	6	197065	197070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933254
5119	NC_005296	TCT	2	6	197094	197099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933254
5120	NC_005296	TCG	2	6	197109	197114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
5121	NC_005296	ACC	2	6	197323	197328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933255
5122	NC_005296	CGG	2	6	197342	197347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933255
5123	NC_005296	GCA	2	6	197408	197413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
5124	NC_005296	CAG	2	6	197418	197423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
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5250	NC_005296	GCG	2	6	202672	202677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933258
5251	NC_005296	ACC	2	6	202752	202757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933258
5252	NC_005296	ACG	2	6	202791	202796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933258
5253	NC_005296	CG	3	6	202819	202824	0 %	0 %	50 %	50 %	39933258
5254	NC_005296	GATC	2	8	202846	202853	25 %	25 %	25 %	25 %	39933258
5255	NC_005296	GCT	2	6	202904	202909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933258
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5258	NC_005296	TCA	2	6	202956	202961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_005296	GGAAA	2	10	202965	202974	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_005296	GCTTC	2	10	203066	203075	0 %	40 %	20 %	40 %	39933259
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5294	NC_005296	CGG	2	6	204135	204140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5314	NC_005296	CG	3	6	204842	204847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5315	NC_005296	CG	3	6	204863	204868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5330	NC_005296	CAG	2	6	205395	205400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933261
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5333	NC_005296	GGCC	2	8	205450	205457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5334	NC_005296	ATGG	2	8	205479	205486	25 %	25 %	50 %	0 %	39933262
5335	NC_005296	CCT	2	6	205511	205516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933262
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5340	NC_005296	GGT	2	6	205695	205700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933262
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5342	NC_005296	CGT	2	6	205838	205843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933262
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5356	NC_005296	CGA	2	6	206385	206390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933262
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5361	NC_005296	CTTGCC	2	12	206529	206540	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	39933262
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5368	NC_005296	CG	3	6	206811	206816	0 %	0 %	50 %	50 %	39933262
5369	NC_005296	GCC	2	6	206832	206837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933262
5370	NC_005296	GAC	2	6	206853	206858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933262
5371	NC_005296	C	6	6	206915	206920	0 %	0 %	0 %	100 %	39933263
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5373	NC_005296	AGG	2	6	206949	206954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933263
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5387	NC_005296	CGA	2	6	207381	207386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933263
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5480	NC_005296	CGA	2	6	210207	210212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933266
5481	NC_005296	TCGGC	2	10	210287	210296	0 %	20 %	40 %	40 %	39933266
5482	NC_005296	CAG	2	6	210339	210344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933266
5483	NC_005296	GGT	2	6	210383	210388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933266
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5487	NC_005296	CGGTG	2	10	210596	210605	0 %	20 %	60 %	20 %	39933266
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5492	NC_005296	GC	3	6	210799	210804	0 %	0 %	50 %	50 %	39933266
5493	NC_005296	TGA	2	6	210839	210844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933266
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5495	NC_005296	GCC	2	6	210959	210964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933266
5496	NC_005296	GAC	2	6	210984	210989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933266
5497	NC_005296	GGC	2	6	211029	211034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933266
5498	NC_005296	ACC	2	6	211039	211044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933266
5499	NC_005296	TCG	2	6	211054	211059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933266
5500	NC_005296	ATC	2	6	211087	211092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933266

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