MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_005296	AGC	2	6	172416	172421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933230
4503	NC_005296	TCGA	2	8	172461	172468	25 %	25 %	25 %	25 %	39933230
4504	NC_005296	GCG	2	6	172520	172525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933230
4505	NC_005296	ACCG	2	8	172557	172564	25 %	0 %	25 %	50 %	39933230
4506	NC_005296	ACG	3	9	172581	172589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933230
4507	NC_005296	CCA	3	9	172609	172617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933230
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4509	NC_005296	TAT	2	6	172803	172808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933230
4510	NC_005296	TTC	2	6	172841	172846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933230
4511	NC_005296	CGG	2	6	172867	172872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933230
4512	NC_005296	GTT	2	6	172937	172942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933230
4513	NC_005296	CTA	2	6	173069	173074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933230
4514	NC_005296	ATG	2	6	173091	173096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933230
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4516	NC_005296	GGC	2	6	173241	173246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933230
4517	NC_005296	CGAT	2	8	173281	173288	25 %	25 %	25 %	25 %	39933230
4518	NC_005296	AGA	2	6	173407	173412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933230
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4523	NC_005296	GTC	2	6	173726	173731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933231
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4533	NC_005296	TCG	2	6	174036	174041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933231
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4538	NC_005296	CCGC	2	8	174367	174374	0 %	0 %	25 %	75 %	39933232
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4556	NC_005296	CGGCGC	3	18	174977	174994	0 %	0 %	50 %	50 %	39933233
4557	NC_005296	CGG	2	6	174995	175000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933233
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4566	NC_005296	CAG	2	6	175414	175419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933233
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4573	NC_005296	GAACA	2	10	175696	175705	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4574	NC_005296	GAGG	2	8	175728	175735	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_005296	GGT	2	6	175838	175843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_005296	GAG	2	6	175861	175866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4606	NC_005296	GGTT	2	8	177172	177179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_005296	CCG	2	6	177203	177208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_005296	GCG	2	6	177209	177214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_005296	CGGCG	2	10	177245	177254	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4610	NC_005296	TCG	3	9	177364	177372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_005296	GAAG	2	8	177434	177441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_005296	TCA	2	6	177458	177463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933235
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4626	NC_005296	A	6	6	177853	177858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4749	NC_005296	GCA	2	6	182444	182449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933240
4750	NC_005296	GTC	2	6	182473	182478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933240
4751	NC_005296	CCG	2	6	182489	182494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933240
4752	NC_005296	GGC	2	6	182514	182519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933240
4753	NC_005296	CG	3	6	182534	182539	0 %	0 %	50 %	50 %	39933240
4754	NC_005296	GGC	2	6	182562	182567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933240
4755	NC_005296	GATC	2	8	182616	182623	25 %	25 %	25 %	25 %	39933240
4756	NC_005296	CGG	2	6	182646	182651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933240
4757	NC_005296	CGAT	2	8	182741	182748	25 %	25 %	25 %	25 %	39933240
4758	NC_005296	GC	3	6	182762	182767	0 %	0 %	50 %	50 %	39933240
4759	NC_005296	GC	3	6	182769	182774	0 %	0 %	50 %	50 %	39933240
4760	NC_005296	CTG	2	6	182785	182790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933240
4761	NC_005296	CCGG	2	8	182791	182798	0 %	0 %	50 %	50 %	39933240
4762	NC_005296	ACG	2	6	182891	182896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933240
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4765	NC_005296	GAT	2	6	182973	182978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933240
4766	NC_005296	CGA	2	6	182985	182990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933240
4767	NC_005296	GTC	2	6	182995	183000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933240
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4769	NC_005296	TCG	2	6	183109	183114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4770	NC_005296	ACG	2	6	183264	183269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933241
4771	NC_005296	TGA	2	6	183271	183276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933241
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4774	NC_005296	CCG	2	6	183327	183332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933241
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4778	NC_005296	CTGACG	2	12	183465	183476	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933241
4779	NC_005296	GC	3	6	183480	183485	0 %	0 %	50 %	50 %	39933241
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4787	NC_005296	AAGCG	2	10	183902	183911	40 %	0 %	40 %	20 %	39933241
4788	NC_005296	ATCG	2	8	183989	183996	25 %	25 %	25 %	25 %	39933241
4789	NC_005296	GCG	2	6	184030	184035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933241
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4820	NC_005296	TG	3	6	185214	185219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4821	NC_005296	CGGCG	2	10	185232	185241	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4822	NC_005296	GAAAG	2	10	185339	185348	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4823	NC_005296	CGA	2	6	185532	185537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4825	NC_005296	GTC	2	6	185602	185607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933243
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4831	NC_005296	CGA	2	6	186005	186010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933244
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4835	NC_005296	CGA	2	6	186152	186157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933244
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4838	NC_005296	CGG	2	6	186245	186250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933244
4839	NC_005296	GCG	2	6	186275	186280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933244
4840	NC_005296	G	7	7	186306	186312	0 %	0 %	100 %	0 %	39933244
4841	NC_005296	TGC	2	6	186343	186348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933244
4842	NC_005296	CGA	2	6	186370	186375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933244
4843	NC_005296	ATC	2	6	186394	186399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933244
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4845	NC_005296	GGC	2	6	186479	186484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933245
4846	NC_005296	CGG	2	6	186485	186490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933245
4847	NC_005296	ACG	2	6	186530	186535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933245
4848	NC_005296	CG	3	6	186537	186542	0 %	0 %	50 %	50 %	39933245
4849	NC_005296	GCCG	2	8	186585	186592	0 %	0 %	50 %	50 %	39933245
4850	NC_005296	ACG	2	6	186595	186600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933245
4851	NC_005296	CG	5	10	186654	186663	0 %	0 %	50 %	50 %	39933245
4852	NC_005296	CAG	2	6	186664	186669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933245
4853	NC_005296	GCC	2	6	186676	186681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933245
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4855	NC_005296	CGC	2	6	186762	186767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933245
4856	NC_005296	GCGG	2	8	186774	186781	0 %	0 %	75 %	25 %	39933245
4857	NC_005296	GC	3	6	186808	186813	0 %	0 %	50 %	50 %	39933245
4858	NC_005296	CGCC	2	8	186861	186868	0 %	0 %	25 %	75 %	39933245
4859	NC_005296	GCG	2	6	186869	186874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933245
4860	NC_005296	GCTG	2	8	186888	186895	0 %	25 %	50 %	25 %	39933245
4861	NC_005296	GC	3	6	186903	186908	0 %	0 %	50 %	50 %	39933245
4862	NC_005296	GCT	2	6	186930	186935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933245
4863	NC_005296	GTG	2	6	186991	186996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933245
4864	NC_005296	GCC	2	6	187069	187074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933245
4865	NC_005296	CGC	2	6	187089	187094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933245
4866	NC_005296	TCACC	2	10	187104	187113	20 %	20 %	0 %	60 %	39933245
4867	NC_005296	CGC	2	6	187131	187136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933245
4868	NC_005296	GAG	2	6	187144	187149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933245
4869	NC_005296	CGGCAA	2	12	187150	187161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933245
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4871	NC_005296	GCC	3	9	187291	187299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933245
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4977	NC_005296	CGT	2	6	191594	191599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933249
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4980	NC_005296	CGCC	2	8	191633	191640	0 %	0 %	25 %	75 %	39933249
4981	NC_005296	GC	3	6	191641	191646	0 %	0 %	50 %	50 %	39933249
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4989	NC_005296	ACC	2	6	192124	192129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933249
4990	NC_005296	ACG	2	6	192130	192135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933249
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4992	NC_005296	CGG	2	6	192152	192157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933249
4993	NC_005296	GCA	2	6	192170	192175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933249
4994	NC_005296	ATC	2	6	192213	192218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933249
4995	NC_005296	GGTCCA	2	12	192228	192239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933249
4996	NC_005296	CAGG	2	8	192240	192247	25 %	0 %	50 %	25 %	39933249
4997	NC_005296	GCC	3	9	192279	192287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933249
4998	NC_005296	TGAAT	2	10	192332	192341	40 %	40 %	20 %	0 %	39933249
4999	NC_005296	GCA	2	6	192358	192363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5000	NC_005296	GCGCC	2	10	192365	192374	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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