MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005027	AC	3	6	202041	202046	50 %	0 %	0 %	50 %	32470887
4002	NC_005027	TGG	2	6	202098	202103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470887
4003	NC_005027	CAA	2	6	202117	202122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470887
4004	NC_005027	CGA	2	6	202170	202175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470887
4005	NC_005027	ACG	2	6	202249	202254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470887
4006	NC_005027	CGG	2	6	202284	202289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470887
4007	NC_005027	CGGG	2	8	202326	202333	0 %	0 %	75 %	25 %	32470887
4008	NC_005027	AGC	3	9	202337	202345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470887
4009	NC_005027	GTGAAC	2	12	202457	202468	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	32470887
4010	NC_005027	CCGG	2	8	202479	202486	0 %	0 %	50 %	50 %	32470887
4011	NC_005027	GAG	2	6	202527	202532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470887
4012	NC_005027	CGTTT	2	10	202534	202543	0 %	60 %	20 %	20 %	32470887
4013	NC_005027	ATG	2	6	202584	202589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470887
4014	NC_005027	TC	3	6	202610	202615	0 %	50 %	0 %	50 %	32470887
4015	NC_005027	TGCGG	2	10	202650	202659	0 %	20 %	60 %	20 %	32470887
4016	NC_005027	TTG	2	6	202675	202680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470888
4017	NC_005027	ATG	2	6	202683	202688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470888
4018	NC_005027	CGG	2	6	202744	202749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470888
4019	NC_005027	TC	3	6	202770	202775	0 %	50 %	0 %	50 %	32470888
4020	NC_005027	GCG	2	6	202790	202795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470888
4021	NC_005027	AAC	2	6	202871	202876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_005027	GTG	2	6	202995	203000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470889
4023	NC_005027	TGG	2	6	203003	203008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470889
4024	NC_005027	GGT	2	6	203019	203024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470889
4025	NC_005027	CGAG	2	8	203072	203079	25 %	0 %	50 %	25 %	32470889
4026	NC_005027	GATC	2	8	203153	203160	25 %	25 %	25 %	25 %	32470889
4027	NC_005027	T	6	6	203238	203243	0 %	100 %	0 %	0 %	32470889
4028	NC_005027	GCA	2	6	203266	203271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470889
4029	NC_005027	CGT	3	9	203417	203425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470889
4030	NC_005027	CCG	2	6	203431	203436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470889
4031	NC_005027	A	6	6	203446	203451	100 %	0 %	0 %	0 %	32470889
4032	NC_005027	GTC	3	9	203466	203474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470889
4033	NC_005027	GAAA	2	8	203519	203526	75 %	0 %	25 %	0 %	32470889
4034	NC_005027	A	7	7	203540	203546	100 %	0 %	0 %	0 %	32470889
4035	NC_005027	CAT	2	6	203609	203614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470889
4036	NC_005027	CTGGTT	2	12	203639	203650	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	32470889
4037	NC_005027	GAA	2	6	203730	203735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470889
4038	NC_005027	GAA	2	6	203745	203750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470889
4039	NC_005027	CCG	2	6	203840	203845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470889
4040	NC_005027	CTC	2	6	203906	203911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470889
4041	NC_005027	TCG	2	6	203959	203964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470889
4042	NC_005027	GAA	2	6	203972	203977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470889
4043	NC_005027	GAC	2	6	203979	203984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470889
4044	NC_005027	AAC	2	6	203995	204000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470889
4045	NC_005027	CGA	2	6	204014	204019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470889
4046	NC_005027	AAGG	2	8	204024	204031	50 %	0 %	50 %	0 %	32470889
4047	NC_005027	ACA	2	6	204067	204072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470889
4048	NC_005027	AAACC	2	10	204247	204256	60 %	0 %	0 %	40 %	32470889
4049	NC_005027	ACA	3	9	204282	204290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470890
4050	NC_005027	GGC	2	6	204494	204499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470890
4051	NC_005027	A	6	6	204510	204515	100 %	0 %	0 %	0 %	32470890
4052	NC_005027	TCGA	2	8	204548	204555	25 %	25 %	25 %	25 %	32470890
4053	NC_005027	AGA	2	6	204571	204576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470890
4054	NC_005027	TCGC	2	8	204594	204601	0 %	25 %	25 %	50 %	32470890
4055	NC_005027	AATCG	2	10	204656	204665	40 %	20 %	20 %	20 %	32470890
4056	NC_005027	GTG	2	6	204681	204686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470890
4057	NC_005027	TCG	2	6	204699	204704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470890
4058	NC_005027	TG	3	6	204801	204806	0 %	50 %	50 %	0 %	32470890
4059	NC_005027	GCT	2	6	204966	204971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_005027	GAC	2	6	205175	205180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470891
4061	NC_005027	CA	3	6	205211	205216	50 %	0 %	0 %	50 %	32470891
4062	NC_005027	ACG	2	6	205234	205239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470891
4063	NC_005027	AC	3	6	205254	205259	50 %	0 %	0 %	50 %	32470891
4064	NC_005027	ATC	2	6	205272	205277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470891
4065	NC_005027	CAAA	2	8	205344	205351	75 %	0 %	0 %	25 %	32470891
4066	NC_005027	CAC	2	6	205358	205363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470891
4067	NC_005027	ATC	2	6	205400	205405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470891
4068	NC_005027	AGT	2	6	205421	205426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470891
4069	NC_005027	ATC	2	6	205455	205460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470891
4070	NC_005027	GTC	2	6	205535	205540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470891
4071	NC_005027	TCA	2	6	205543	205548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470891
4072	NC_005027	ACC	2	6	205553	205558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470891
4073	NC_005027	GTT	2	6	205572	205577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470891
4074	NC_005027	TGA	2	6	205602	205607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470891
4075	NC_005027	CTCA	2	8	205613	205620	25 %	25 %	0 %	50 %	32470891
4076	NC_005027	GT	3	6	205711	205716	0 %	50 %	50 %	0 %	32470891
4077	NC_005027	ATCCA	2	10	205742	205751	40 %	20 %	0 %	40 %	32470891
4078	NC_005027	GAA	2	6	205782	205787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470891
4079	NC_005027	TCA	2	6	205885	205890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470891
4080	NC_005027	CGTC	2	8	205984	205991	0 %	25 %	25 %	50 %	32470891
4081	NC_005027	ACG	2	6	206016	206021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470891
4082	NC_005027	AC	3	6	206053	206058	50 %	0 %	0 %	50 %	32470891
4083	NC_005027	GTA	2	6	206129	206134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470891
4084	NC_005027	TCAA	2	8	206223	206230	50 %	25 %	0 %	25 %	32470891
4085	NC_005027	TGT	2	6	206269	206274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470891
4086	NC_005027	ACG	2	6	206323	206328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470891
4087	NC_005027	CCA	2	6	206362	206367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470891
4088	NC_005027	GTT	2	6	206375	206380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470891
4089	NC_005027	CTT	2	6	206422	206427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470891
4090	NC_005027	GTT	2	6	206483	206488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470891
4091	NC_005027	CAA	2	6	206564	206569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470891
4092	NC_005027	ATC	2	6	206619	206624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470891
4093	NC_005027	CT	3	6	206992	206997	0 %	50 %	0 %	50 %	32470891
4094	NC_005027	TACC	2	8	207126	207133	25 %	25 %	0 %	50 %	32470892
4095	NC_005027	GCG	2	6	207141	207146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470892
4096	NC_005027	CGC	2	6	207268	207273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470893
4097	NC_005027	GGCTTT	2	12	207274	207285	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	32470893
4098	NC_005027	CTT	2	6	207352	207357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470893
4099	NC_005027	CGG	2	6	207436	207441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470893
4100	NC_005027	GCT	2	6	207443	207448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4101	NC_005027	GA	3	6	207492	207497	50 %	0 %	50 %	0 %	32470893
4102	NC_005027	CCA	2	6	207500	207505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470893
4103	NC_005027	CGA	2	6	207523	207528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4104	NC_005027	ACG	2	6	207532	207537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4105	NC_005027	TCG	2	6	207607	207612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4106	NC_005027	TTG	2	6	207680	207685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470893
4107	NC_005027	CGC	2	6	207769	207774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470893
4108	NC_005027	CCG	2	6	207807	207812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470893
4109	NC_005027	TCC	2	6	207814	207819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470893
4110	NC_005027	GAT	2	6	207899	207904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470893
4111	NC_005027	CGT	2	6	207910	207915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4112	NC_005027	AGA	2	6	208023	208028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470893
4113	NC_005027	AAC	2	6	208071	208076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470893
4114	NC_005027	CAT	2	6	208174	208179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470893
4115	NC_005027	TGG	2	6	208191	208196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470893
4116	NC_005027	ACA	2	6	208206	208211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470893
4117	NC_005027	GAT	2	6	208325	208330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470893
4118	NC_005027	GA	3	6	208371	208376	50 %	0 %	50 %	0 %	32470893
4119	NC_005027	CAG	2	6	208408	208413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4120	NC_005027	CCG	2	6	208563	208568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470893
4121	NC_005027	CGC	2	6	208570	208575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470893
4122	NC_005027	T	6	6	208594	208599	0 %	100 %	0 %	0 %	32470893
4123	NC_005027	CGC	2	6	208699	208704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470893
4124	NC_005027	GAA	2	6	208898	208903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470893
4125	NC_005027	T	6	6	208913	208918	0 %	100 %	0 %	0 %	32470893
4126	NC_005027	CCG	2	6	209035	209040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470893
4127	NC_005027	CGG	2	6	209068	209073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470893
4128	NC_005027	GAAC	2	8	209115	209122	50 %	0 %	25 %	25 %	32470893
4129	NC_005027	CGT	2	6	209131	209136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4130	NC_005027	GT	3	6	209142	209147	0 %	50 %	50 %	0 %	32470893
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4132	NC_005027	GCA	2	6	209228	209233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4133	NC_005027	GCT	2	6	209245	209250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470893
4134	NC_005027	CGAAG	2	10	209261	209270	40 %	0 %	40 %	20 %	32470893
4135	NC_005027	TGCC	2	8	209281	209288	0 %	25 %	25 %	50 %	32470893
4136	NC_005027	ATTG	2	8	209293	209300	25 %	50 %	25 %	0 %	32470893
4137	NC_005027	GGC	2	6	209339	209344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470893
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4141	NC_005027	CGA	3	9	209772	209780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470894
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4144	NC_005027	GT	3	6	209854	209859	0 %	50 %	50 %	0 %	32470894
4145	NC_005027	TTG	2	6	209905	209910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470894
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4169	NC_005027	ACC	2	6	211138	211143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4170	NC_005027	ATC	2	6	211275	211280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470895
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4200	NC_005027	GA	3	6	212706	212711	50 %	0 %	50 %	0 %	32470895
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4203	NC_005027	TGCGA	2	10	212816	212825	20 %	20 %	40 %	20 %	32470896
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4229	NC_005027	GAT	2	6	214282	214287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470897
4230	NC_005027	GATC	2	8	214327	214334	25 %	25 %	25 %	25 %	32470897
4231	NC_005027	TGC	2	6	214399	214404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
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4233	NC_005027	TCC	3	9	214526	214534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470897
4234	NC_005027	GCC	2	6	214538	214543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470897
4235	NC_005027	CCCATG	2	12	214560	214571	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32470897
4236	NC_005027	CCAT	2	8	214614	214621	25 %	25 %	0 %	50 %	32470897
4237	NC_005027	GTC	2	6	214664	214669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4238	NC_005027	GCCC	2	8	214674	214681	0 %	0 %	25 %	75 %	32470897
4239	NC_005027	GAACA	2	10	214778	214787	60 %	0 %	20 %	20 %	32470897
4240	NC_005027	CGA	2	6	214846	214851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4241	NC_005027	TGC	2	6	214852	214857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4242	NC_005027	CTCG	2	8	214936	214943	0 %	25 %	25 %	50 %	32470897
4243	NC_005027	CTT	2	6	214999	215004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470897
4244	NC_005027	CTC	2	6	215036	215041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470897
4245	NC_005027	CCAC	2	8	215071	215078	25 %	0 %	0 %	75 %	32470897
4246	NC_005027	GTT	2	6	215131	215136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470897
4247	NC_005027	CGA	2	6	215140	215145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4248	NC_005027	CTT	2	6	215186	215191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470897
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4251	NC_005027	GTC	2	6	215271	215276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4252	NC_005027	TGGA	2	8	215279	215286	25 %	25 %	50 %	0 %	32470897
4253	NC_005027	AC	3	6	215347	215352	50 %	0 %	0 %	50 %	32470897
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4258	NC_005027	CA	4	8	215717	215724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_005027	GCA	3	9	215752	215760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_005027	ACG	2	6	215771	215776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4272	NC_005027	GTA	2	6	216432	216437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470898
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4281	NC_005027	GTA	2	6	216783	216788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470898
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4358	NC_005027	AATC	2	8	220491	220498	50 %	25 %	0 %	25 %	32470902
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4367	NC_005027	ACGAC	2	10	221018	221027	40 %	0 %	20 %	40 %	32470902
4368	NC_005027	CCG	2	6	221039	221044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470902
4369	NC_005027	CGG	2	6	221054	221059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470902
4370	NC_005027	GAT	2	6	221134	221139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470902
4371	NC_005027	GAA	2	6	221205	221210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_005027	ATCCA	2	10	221235	221244	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4373	NC_005027	ACTCC	2	10	221245	221254	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4374	NC_005027	GAA	2	6	221303	221308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_005027	ATC	3	9	221336	221344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470903
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4378	NC_005027	CCG	2	6	221430	221435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470903
4379	NC_005027	TCG	2	6	221478	221483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470903
4380	NC_005027	GAC	2	6	221552	221557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470903
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4382	NC_005027	TTGA	2	8	221747	221754	25 %	50 %	25 %	0 %	32470903
4383	NC_005027	TCA	2	6	221763	221768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470903
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4385	NC_005027	CATCG	2	10	221854	221863	20 %	20 %	20 %	40 %	32470903
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4393	NC_005027	CCG	2	6	222310	222315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470904
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4401	NC_005027	GGCA	2	8	222674	222681	25 %	0 %	50 %	25 %	32470904
4402	NC_005027	TCG	3	9	222688	222696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470904
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4405	NC_005027	ATGC	2	8	222767	222774	25 %	25 %	25 %	25 %	32470904
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4476	NC_005027	CTT	2	6	226242	226247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4494	NC_005027	GCC	2	6	226839	226844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470909
4495	NC_005027	CGTT	2	8	226865	226872	0 %	50 %	25 %	25 %	32470909
4496	NC_005027	CGA	2	6	226908	226913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4497	NC_005027	AC	4	8	226982	226989	50 %	0 %	0 %	50 %	32470909
4498	NC_005027	TCAA	2	8	227051	227058	50 %	25 %	0 %	25 %	32470909
4499	NC_005027	TCA	2	6	227078	227083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470909
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