MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005027	TGC	2	6	26058	26063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_005027	CGAT	2	8	26075	26082	25 %	25 %	25 %	25 %	32470703
503	NC_005027	CGA	2	6	26151	26156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470703
504	NC_005027	ATC	2	6	26300	26305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470703
505	NC_005027	GCC	2	6	26306	26311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470703
506	NC_005027	TCG	2	6	26365	26370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_005027	GCTTG	2	10	26426	26435	0 %	40 %	40 %	20 %	32470704
508	NC_005027	AACCAC	2	12	26440	26451	50 %	0 %	0 %	50 %	32470704
509	NC_005027	TCC	2	6	26476	26481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470704
510	NC_005027	TCC	2	6	26612	26617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470704
511	NC_005027	CAA	2	6	26644	26649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470704
512	NC_005027	GCAA	2	8	26700	26707	50 %	0 %	25 %	25 %	32470704
513	NC_005027	GAT	2	6	26716	26721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470704
514	NC_005027	CAA	2	6	26746	26751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470704
515	NC_005027	TTG	2	6	26765	26770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470704
516	NC_005027	TCG	2	6	26844	26849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470704
517	NC_005027	CAAC	2	8	26940	26947	50 %	0 %	0 %	50 %	32470704
518	NC_005027	AAG	2	6	26952	26957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470704
519	NC_005027	TGT	2	6	27076	27081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470704
520	NC_005027	GTC	2	6	27110	27115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470704
521	NC_005027	GTTG	2	8	27154	27161	0 %	50 %	50 %	0 %	32470704
522	NC_005027	AATGG	2	10	27174	27183	40 %	20 %	40 %	0 %	32470704
523	NC_005027	GGC	2	6	27194	27199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470704
524	NC_005027	GGC	2	6	27212	27217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470704
525	NC_005027	TTG	2	6	27270	27275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470704
526	NC_005027	ATCGC	2	10	27278	27287	20 %	20 %	20 %	40 %	32470704
527	NC_005027	TAC	2	6	27359	27364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470704
528	NC_005027	GTT	2	6	27430	27435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470704
529	NC_005027	CGA	2	6	27447	27452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470704
530	NC_005027	CATG	2	8	27547	27554	25 %	25 %	25 %	25 %	32470704
531	NC_005027	GTT	2	6	27593	27598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470704
532	NC_005027	CCAAC	2	10	27634	27643	40 %	0 %	0 %	60 %	32470704
533	NC_005027	CCTT	2	8	27748	27755	0 %	50 %	0 %	50 %	32470705
534	NC_005027	GCA	2	6	27823	27828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470705
535	NC_005027	GAC	2	6	27865	27870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470705
536	NC_005027	CGT	2	6	27931	27936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470705
537	NC_005027	GCC	2	6	28007	28012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470705
538	NC_005027	TGA	2	6	28023	28028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470705
539	NC_005027	CTG	2	6	28061	28066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470705
540	NC_005027	CGA	2	6	28086	28091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470705
541	NC_005027	GATT	2	8	28136	28143	25 %	50 %	25 %	0 %	32470705
542	NC_005027	TGA	2	6	28151	28156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470706
543	NC_005027	ATC	2	6	28165	28170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470706
544	NC_005027	CGA	2	6	28171	28176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470706
545	NC_005027	GTTC	2	8	28195	28202	0 %	50 %	25 %	25 %	32470706
546	NC_005027	TC	3	6	28201	28206	0 %	50 %	0 %	50 %	32470706
547	NC_005027	AGA	2	6	28228	28233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470706
548	NC_005027	TTTC	2	8	28237	28244	0 %	75 %	0 %	25 %	32470706
549	NC_005027	GCC	2	6	28261	28266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470706
550	NC_005027	CGTTG	2	10	28392	28401	0 %	40 %	40 %	20 %	32470706
551	NC_005027	GAT	2	6	28425	28430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470706
552	NC_005027	TTC	2	6	28444	28449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470706
553	NC_005027	GTG	2	6	28480	28485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470706
554	NC_005027	GAA	2	6	28558	28563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470706
555	NC_005027	CGCT	2	8	28582	28589	0 %	25 %	25 %	50 %	32470706
556	NC_005027	GCG	2	6	28628	28633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470706
557	NC_005027	TCG	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_005027	CCA	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470707
559	NC_005027	CTG	2	6	28769	28774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470707
560	NC_005027	CGG	2	6	28785	28790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470707
561	NC_005027	TCA	2	6	28800	28805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470707
562	NC_005027	ATG	2	6	28892	28897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470707
563	NC_005027	GTC	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470707
564	NC_005027	CGA	2	6	29029	29034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_005027	TTTG	2	8	29163	29170	0 %	75 %	25 %	0 %	32470708
566	NC_005027	CGT	2	6	29224	29229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470708
567	NC_005027	CGG	2	6	29283	29288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470708
568	NC_005027	TTGCCT	2	12	29292	29303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	32470708
569	NC_005027	GCG	2	6	29310	29315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470708
570	NC_005027	GTT	2	6	29495	29500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470708
571	NC_005027	GCC	2	6	29545	29550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470708
572	NC_005027	TCA	2	6	29566	29571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470708
573	NC_005027	GGC	2	6	29587	29592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470708
574	NC_005027	CAG	2	6	29625	29630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470708
575	NC_005027	GA	4	8	29695	29702	50 %	0 %	50 %	0 %	32470708
576	NC_005027	GCA	2	6	29741	29746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_005027	ACC	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470710
578	NC_005027	GTT	2	6	29806	29811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470710
579	NC_005027	TCG	2	6	29828	29833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470710
580	NC_005027	TGC	2	6	29862	29867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470710
581	NC_005027	CT	3	6	29879	29884	0 %	50 %	0 %	50 %	32470710
582	NC_005027	GCT	2	6	29937	29942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470710
583	NC_005027	GAT	2	6	30169	30174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470710
584	NC_005027	CCA	2	6	30202	30207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470710
585	NC_005027	GCGG	2	8	30237	30244	0 %	0 %	75 %	25 %	32470710
586	NC_005027	TGAA	2	8	30254	30261	50 %	25 %	25 %	0 %	32470710
587	NC_005027	TGG	2	6	30315	30320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470711
588	NC_005027	TTG	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470711
589	NC_005027	CCG	2	6	30445	30450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_005027	GAC	2	6	30575	30580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470712
591	NC_005027	ATCA	2	8	30655	30662	50 %	25 %	0 %	25 %	32470712
592	NC_005027	TGC	2	6	30759	30764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470712
593	NC_005027	GTT	2	6	30811	30816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470712
594	NC_005027	CCAA	2	8	30822	30829	50 %	0 %	0 %	50 %	32470712
595	NC_005027	TCGA	2	8	30860	30867	25 %	25 %	25 %	25 %	32470712
596	NC_005027	TTGC	2	8	30886	30893	0 %	50 %	25 %	25 %	32470712
597	NC_005027	ACG	2	6	31089	31094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470712
598	NC_005027	CTT	2	6	31228	31233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_005027	TGA	3	9	31250	31258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_005027	CCT	2	6	31278	31283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_005027	CGA	2	6	31299	31304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470713
602	NC_005027	GATT	2	8	31359	31366	25 %	50 %	25 %	0 %	32470713
603	NC_005027	CGC	2	6	31398	31403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470713
604	NC_005027	CGG	2	6	31409	31414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470713
605	NC_005027	GAC	2	6	31447	31452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470713
606	NC_005027	CGT	2	6	31474	31479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_005027	GA	3	6	31493	31498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_005027	CAT	2	6	31503	31508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470714
609	NC_005027	TTG	2	6	31516	31521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470714
610	NC_005027	GCG	2	6	31546	31551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470714
611	NC_005027	TG	4	8	31555	31562	0 %	50 %	50 %	0 %	32470714
612	NC_005027	GAC	2	6	31591	31596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470714
613	NC_005027	GCT	2	6	31624	31629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470714
614	NC_005027	AAG	2	6	31748	31753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470714
615	NC_005027	A	6	6	31792	31797	100 %	0 %	0 %	0 %	32470714
616	NC_005027	TGA	2	6	31845	31850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470714
617	NC_005027	GATCGG	2	12	31957	31968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	32470714
618	NC_005027	CGC	2	6	32022	32027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470714
619	NC_005027	GGA	2	6	32028	32033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470714
620	NC_005027	CAA	2	6	32047	32052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470714
621	NC_005027	ACG	2	6	32057	32062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470714
622	NC_005027	TGA	2	6	32064	32069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470714
623	NC_005027	AGCG	2	8	32111	32118	25 %	0 %	50 %	25 %	32470714
624	NC_005027	GATCC	2	10	32154	32163	20 %	20 %	20 %	40 %	32470714
625	NC_005027	GGC	2	6	32301	32306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470714
626	NC_005027	TCA	2	6	32369	32374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470714
627	NC_005027	GTG	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470714
628	NC_005027	CGT	2	6	32490	32495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470714
629	NC_005027	A	6	6	32502	32507	100 %	0 %	0 %	0 %	32470714
630	NC_005027	GTTT	2	8	32515	32522	0 %	75 %	25 %	0 %	32470714
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754	NC_005027	GTG	2	6	38484	38489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470719
755	NC_005027	GCAGTT	2	12	38523	38534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32470719
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