MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005027	ACGA	2	8	227116	227123	50 %	0 %	25 %	25 %	32470909
4502	NC_005027	GAC	2	6	227175	227180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4503	NC_005027	GGC	2	6	227188	227193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470909
4504	NC_005027	TCGC	2	8	227213	227220	0 %	25 %	25 %	50 %	32470909
4505	NC_005027	ATCG	2	8	227227	227234	25 %	25 %	25 %	25 %	32470909
4506	NC_005027	TCTT	2	8	227255	227262	0 %	75 %	0 %	25 %	32470909
4507	NC_005027	ACT	2	6	227324	227329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470909
4508	NC_005027	GCGA	2	8	227364	227371	25 %	0 %	50 %	25 %	32470909
4509	NC_005027	AAC	2	6	227380	227385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470909
4510	NC_005027	CGTG	2	8	227403	227410	0 %	25 %	50 %	25 %	32470909
4511	NC_005027	CGC	2	6	227505	227510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470909
4512	NC_005027	CAA	2	6	227524	227529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470909
4513	NC_005027	GCTG	2	8	227532	227539	0 %	25 %	50 %	25 %	32470909
4514	NC_005027	CAC	2	6	227583	227588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470909
4515	NC_005027	A	6	6	227589	227594	100 %	0 %	0 %	0 %	32470909
4516	NC_005027	CCT	2	6	227647	227652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470909
4517	NC_005027	CAT	2	6	227670	227675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470909
4518	NC_005027	TCG	2	6	227677	227682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4519	NC_005027	CCG	2	6	227687	227692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470909
4520	NC_005027	TGC	2	6	227705	227710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4521	NC_005027	CGA	2	6	227805	227810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4522	NC_005027	CGA	2	6	227871	227876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4523	NC_005027	CGAT	2	8	227894	227901	25 %	25 %	25 %	25 %	32470909
4524	NC_005027	GGT	2	6	227935	227940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470909
4525	NC_005027	GCA	2	6	228033	228038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4526	NC_005027	CAAGAC	2	12	228235	228246	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32470909
4527	NC_005027	GCA	2	6	228255	228260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4528	NC_005027	CCA	2	6	228314	228319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470909
4529	NC_005027	CGA	2	6	228387	228392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4530	NC_005027	A	6	6	228499	228504	100 %	0 %	0 %	0 %	32470909
4531	NC_005027	ACC	2	6	228512	228517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470909
4532	NC_005027	GTTC	2	8	228519	228526	0 %	50 %	25 %	25 %	32470909
4533	NC_005027	CATT	2	8	228567	228574	25 %	50 %	0 %	25 %	32470909
4534	NC_005027	GAA	2	6	228634	228639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470909
4535	NC_005027	AG	3	6	228688	228693	50 %	0 %	50 %	0 %	32470909
4536	NC_005027	ACG	2	6	228737	228742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4537	NC_005027	CAA	2	6	228768	228773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470909
4538	NC_005027	GAAA	2	8	228798	228805	75 %	0 %	25 %	0 %	32470909
4539	NC_005027	CTTC	2	8	228888	228895	0 %	50 %	0 %	50 %	32470909
4540	NC_005027	CAA	2	6	229000	229005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470909
4541	NC_005027	AGC	2	6	229030	229035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4542	NC_005027	CCATC	2	10	229063	229072	20 %	20 %	0 %	60 %	32470909
4543	NC_005027	CGA	2	6	229083	229088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4544	NC_005027	GAT	2	6	229131	229136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470909
4545	NC_005027	AAC	2	6	229210	229215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470909
4546	NC_005027	TCGC	2	8	229223	229230	0 %	25 %	25 %	50 %	32470909
4547	NC_005027	GGC	2	6	229309	229314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470909
4548	NC_005027	GCCG	2	8	229335	229342	0 %	0 %	50 %	50 %	32470909
4549	NC_005027	CGC	2	6	229417	229422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470909
4550	NC_005027	CTG	2	6	229457	229462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4551	NC_005027	CGC	2	6	229507	229512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470909
4552	NC_005027	GAAC	2	8	229513	229520	50 %	0 %	25 %	25 %	32470909
4553	NC_005027	TTG	3	9	229540	229548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470909
4554	NC_005027	TC	3	6	229640	229645	0 %	50 %	0 %	50 %	32470909
4555	NC_005027	ACGA	2	8	229696	229703	50 %	0 %	25 %	25 %	32470909
4556	NC_005027	GAA	2	6	229762	229767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470909
4557	NC_005027	CGT	2	6	229815	229820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4558	NC_005027	GGT	2	6	229848	229853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470909
4559	NC_005027	TCG	2	6	229955	229960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470910
4560	NC_005027	CGG	2	6	229981	229986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470910
4561	NC_005027	GCC	2	6	229995	230000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470910
4562	NC_005027	CGA	2	6	230339	230344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470910
4563	NC_005027	CTT	2	6	230437	230442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470910
4564	NC_005027	TGA	2	6	230503	230508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470910
4565	NC_005027	CGC	2	6	230667	230672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470910
4566	NC_005027	TGA	2	6	230807	230812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470910
4567	NC_005027	TGT	2	6	230874	230879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470910
4568	NC_005027	CGG	2	6	230889	230894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470910
4569	NC_005027	ACCA	2	8	230995	231002	50 %	0 %	0 %	50 %	32470910
4570	NC_005027	CGGC	2	8	231004	231011	0 %	0 %	50 %	50 %	32470910
4571	NC_005027	TGG	2	6	231055	231060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470910
4572	NC_005027	GC	3	6	231100	231105	0 %	0 %	50 %	50 %	32470910
4573	NC_005027	CAAG	2	8	231176	231183	50 %	0 %	25 %	25 %	32470910
4574	NC_005027	CGT	2	6	231185	231190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470910
4575	NC_005027	ACA	2	6	231217	231222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470910
4576	NC_005027	CGA	2	6	231259	231264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470910
4577	NC_005027	ACGA	2	8	231289	231296	50 %	0 %	25 %	25 %	32470910
4578	NC_005027	CGT	2	6	231353	231358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470910
4579	NC_005027	GCC	2	6	231398	231403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470911
4580	NC_005027	GTC	2	6	231444	231449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470911
4581	NC_005027	CCGAT	2	10	231470	231479	20 %	20 %	20 %	40 %	32470911
4582	NC_005027	CAA	2	6	231594	231599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470911
4583	NC_005027	ACAA	2	8	231818	231825	75 %	0 %	0 %	25 %	32470912
4584	NC_005027	GCAA	2	8	231855	231862	50 %	0 %	25 %	25 %	32470912
4585	NC_005027	TCT	2	6	231915	231920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470912
4586	NC_005027	GAA	2	6	231932	231937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470912
4587	NC_005027	GTT	2	6	231946	231951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470912
4588	NC_005027	TTGG	2	8	231962	231969	0 %	50 %	50 %	0 %	32470912
4589	NC_005027	CTT	2	6	232053	232058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_005027	GCC	2	6	232095	232100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_005027	TTC	2	6	232178	232183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470913
4592	NC_005027	AAAGC	2	10	232270	232279	60 %	0 %	20 %	20 %	32470913
4593	NC_005027	GCAA	2	8	232320	232327	50 %	0 %	25 %	25 %	32470913
4594	NC_005027	TC	3	6	232346	232351	0 %	50 %	0 %	50 %	32470913
4595	NC_005027	GAG	2	6	232356	232361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470913
4596	NC_005027	TGG	2	6	232381	232386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470913
4597	NC_005027	CTA	2	6	232409	232414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470913
4598	NC_005027	GAT	2	6	232538	232543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470913
4599	NC_005027	GCC	2	6	232631	232636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470913
4600	NC_005027	GAA	2	6	232673	232678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470913
4601	NC_005027	GATCC	2	10	232704	232713	20 %	20 %	20 %	40 %	32470913
4602	NC_005027	TTG	2	6	232732	232737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470913
4603	NC_005027	TCGG	2	8	232847	232854	0 %	25 %	50 %	25 %	32470913
4604	NC_005027	TG	3	6	232859	232864	0 %	50 %	50 %	0 %	32470913
4605	NC_005027	CTT	2	6	232947	232952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470913
4606	NC_005027	TGC	2	6	233027	233032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470913
4607	NC_005027	CCG	2	6	233063	233068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470913
4608	NC_005027	TGCG	2	8	233168	233175	0 %	25 %	50 %	25 %	32470913
4609	NC_005027	CCT	2	6	233190	233195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470913
4610	NC_005027	TC	3	6	233201	233206	0 %	50 %	0 %	50 %	32470913
4611	NC_005027	GAA	3	9	233208	233216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470913
4612	NC_005027	AAG	2	6	233220	233225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470913
4613	NC_005027	CA	3	6	233265	233270	50 %	0 %	0 %	50 %	32470913
4614	NC_005027	GCC	2	6	233307	233312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470913
4615	NC_005027	CGCC	2	8	233390	233397	0 %	0 %	25 %	75 %	32470913
4616	NC_005027	GCT	2	6	233468	233473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470914
4617	NC_005027	CAA	2	6	233475	233480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470914
4618	NC_005027	CGAA	2	8	233536	233543	50 %	0 %	25 %	25 %	32470914
4619	NC_005027	GGC	2	6	233544	233549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470914
4620	NC_005027	CCA	2	6	233581	233586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470914
4621	NC_005027	AGA	2	6	233601	233606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470914
4622	NC_005027	AG	3	6	233618	233623	50 %	0 %	50 %	0 %	32470914
4623	NC_005027	ATT	2	6	233633	233638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470914
4624	NC_005027	CCA	2	6	233658	233663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470914
4625	NC_005027	GGT	2	6	233676	233681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470914
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4981	NC_005027	CGCCT	2	10	251631	251640	0 %	20 %	20 %	60 %	32470932
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4985	NC_005027	TGC	2	6	251871	251876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470933
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4988	NC_005027	TACT	2	8	252017	252024	25 %	50 %	0 %	25 %	32470933
4989	NC_005027	CGAA	2	8	252130	252137	50 %	0 %	25 %	25 %	32470934
4990	NC_005027	TCG	2	6	252141	252146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470934
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4992	NC_005027	GATTTT	2	12	252197	252208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	32470934
4993	NC_005027	GT	3	6	252226	252231	0 %	50 %	50 %	0 %	32470934
4994	NC_005027	TGA	2	6	252271	252276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470934
4995	NC_005027	TCTT	2	8	252278	252285	0 %	75 %	0 %	25 %	32470934
4996	NC_005027	AC	3	6	252314	252319	50 %	0 %	0 %	50 %	32470934
4997	NC_005027	CTT	2	6	252329	252334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470935
4998	NC_005027	GAA	2	6	252384	252389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470935
4999	NC_005027	TCC	2	6	252394	252399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470935
5000	NC_005027	TCA	2	6	252432	252437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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