MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	GA	3	6	533	538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004041	CG	3	6	670	675	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
3	NC_004041	GC	3	6	1427	1432	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
4	NC_004041	CG	3	6	1527	1532	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
5	NC_004041	GC	3	6	1561	1566	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
6	NC_004041	GC	3	6	2294	2299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004041	GC	3	6	2716	2721	0 %	0 %	50 %	50 %	21492961
8	NC_004041	AG	3	6	3191	3196	50 %	0 %	50 %	0 %	21492961
9	NC_004041	GC	3	6	3232	3237	0 %	0 %	50 %	50 %	21492961
10	NC_004041	CG	3	6	4166	4171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004041	CT	3	6	4374	4379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004041	TG	3	6	5599	5604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004041	GC	3	6	7407	7412	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
14	NC_004041	CA	3	6	7954	7959	50 %	0 %	0 %	50 %	21492958
15	NC_004041	GA	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	21492958
16	NC_004041	GC	3	6	9196	9201	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
17	NC_004041	GC	3	6	9412	9417	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
18	NC_004041	AG	3	6	10738	10743	50 %	0 %	50 %	0 %	21492956
19	NC_004041	CG	3	6	11061	11066	0 %	0 %	50 %	50 %	21492956
20	NC_004041	TG	3	6	11350	11355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004041	CT	3	6	12297	12302	0 %	50 %	0 %	50 %	21492955
22	NC_004041	CG	4	8	12326	12333	0 %	0 %	50 %	50 %	21492955
23	NC_004041	CG	3	6	12594	12599	0 %	0 %	50 %	50 %	21492955
24	NC_004041	GA	3	6	15616	15621	50 %	0 %	50 %	0 %	21492955
25	NC_004041	GC	3	6	17073	17078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004041	AC	3	6	18162	18167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004041	CG	3	6	18575	18580	0 %	0 %	50 %	50 %	21492952
28	NC_004041	CG	3	6	20788	20793	0 %	0 %	50 %	50 %	89255300
29	NC_004041	CG	3	6	21386	21391	0 %	0 %	50 %	50 %	21492948
30	NC_004041	GC	4	8	21420	21427	0 %	0 %	50 %	50 %	21492948
31	NC_004041	GA	3	6	21963	21968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004041	CG	3	6	22613	22618	0 %	0 %	50 %	50 %	21492946
33	NC_004041	AG	3	6	22804	22809	50 %	0 %	50 %	0 %	21492946
34	NC_004041	TG	3	6	22820	22825	0 %	50 %	50 %	0 %	21492946
35	NC_004041	GC	3	6	22968	22973	0 %	0 %	50 %	50 %	89255301
36	NC_004041	TC	3	6	23477	23482	0 %	50 %	0 %	50 %	89255301
37	NC_004041	GC	3	6	24612	24617	0 %	0 %	50 %	50 %	21492943
38	NC_004041	GC	3	6	25295	25300	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
39	NC_004041	GC	3	6	25607	25612	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
40	NC_004041	CG	3	6	25774	25779	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
41	NC_004041	CG	3	6	26358	26363	0 %	0 %	50 %	50 %	89255303
42	NC_004041	GC	3	6	26829	26834	0 %	0 %	50 %	50 %	89255303
43	NC_004041	GC	3	6	26992	26997	0 %	0 %	50 %	50 %	21492940
44	NC_004041	GA	3	6	28351	28356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004041	CG	4	8	28502	28509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004041	GA	3	6	29009	29014	50 %	0 %	50 %	0 %	21492939
47	NC_004041	CG	3	6	30364	30369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004041	CT	3	6	30813	30818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004041	CT	4	8	30985	30992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004041	GC	3	6	31346	31351	0 %	0 %	50 %	50 %	21492936
51	NC_004041	GC	3	6	32088	32093	0 %	0 %	50 %	50 %	21492935
52	NC_004041	TC	3	6	32239	32244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004041	GC	3	6	32904	32909	0 %	0 %	50 %	50 %	21492934
54	NC_004041	CG	3	6	33066	33071	0 %	0 %	50 %	50 %	21492934
55	NC_004041	CT	3	6	33258	33263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_004041	CG	3	6	33742	33747	0 %	0 %	50 %	50 %	89255304
57	NC_004041	GA	3	6	33788	33793	50 %	0 %	50 %	0 %	89255304
58	NC_004041	TC	3	6	34485	34490	0 %	50 %	0 %	50 %	89255305
59	NC_004041	CG	3	6	34807	34812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004041	CG	3	6	35519	35524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004041	CG	3	6	36053	36058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004041	AC	3	6	36163	36168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004041	GC	3	6	36426	36431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004041	GC	3	6	36825	36830	0 %	0 %	50 %	50 %	89255307
65	NC_004041	GC	3	6	36879	36884	0 %	0 %	50 %	50 %	89255307
66	NC_004041	CG	3	6	37080	37085	0 %	0 %	50 %	50 %	89255307
67	NC_004041	GC	3	6	37830	37835	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
68	NC_004041	GC	3	6	37931	37936	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
69	NC_004041	GC	3	6	39375	39380	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
70	NC_004041	CG	3	6	39733	39738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_004041	GC	3	6	39891	39896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_004041	GA	3	6	40088	40093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004041	CT	3	6	40125	40130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_004041	CG	3	6	40727	40732	0 %	0 %	50 %	50 %	89255310
75	NC_004041	TC	3	6	41825	41830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004041	CG	3	6	43053	43058	0 %	0 %	50 %	50 %	21492924
77	NC_004041	GC	3	6	43188	43193	0 %	0 %	50 %	50 %	89255312
78	NC_004041	AT	3	6	43351	43356	50 %	50 %	0 %	0 %	89255312
79	NC_004041	TC	3	6	43913	43918	0 %	50 %	0 %	50 %	89255312
80	NC_004041	CG	3	6	44227	44232	0 %	0 %	50 %	50 %	21492922
81	NC_004041	CG	3	6	44725	44730	0 %	0 %	50 %	50 %	21492922
82	NC_004041	TC	3	6	44825	44830	0 %	50 %	0 %	50 %	21492922
83	NC_004041	AC	3	6	45248	45253	50 %	0 %	0 %	50 %	21492921
84	NC_004041	CT	3	6	46370	46375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004041	TC	3	6	46488	46493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004041	TG	3	6	48104	48109	0 %	50 %	50 %	0 %	21492919
87	NC_004041	GC	3	6	48211	48216	0 %	0 %	50 %	50 %	21492919
88	NC_004041	CA	3	6	49228	49233	50 %	0 %	0 %	50 %	21492919
89	NC_004041	GT	3	6	49290	49295	0 %	50 %	50 %	0 %	21492919
90	NC_004041	GA	3	6	49823	49828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004041	AG	3	6	52656	52661	50 %	0 %	50 %	0 %	89255314
92	NC_004041	CG	3	6	52784	52789	0 %	0 %	50 %	50 %	89255314
93	NC_004041	CG	3	6	54051	54056	0 %	0 %	50 %	50 %	21492914
94	NC_004041	CG	4	8	54134	54141	0 %	0 %	50 %	50 %	21492914
95	NC_004041	AC	3	6	54406	54411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004041	GC	3	6	54752	54757	0 %	0 %	50 %	50 %	89255315
97	NC_004041	TC	3	6	58203	58208	0 %	50 %	0 %	50 %	89255317
98	NC_004041	GC	3	6	58660	58665	0 %	0 %	50 %	50 %	89255317
99	NC_004041	GC	3	6	59153	59158	0 %	0 %	50 %	50 %	89255317
100	NC_004041	CT	3	6	61775	61780	0 %	50 %	0 %	50 %	21492910
101	NC_004041	CG	3	6	63704	63709	0 %	0 %	50 %	50 %	89255318
102	NC_004041	GC	3	6	64083	64088	0 %	0 %	50 %	50 %	89255318
103	NC_004041	TC	3	6	64235	64240	0 %	50 %	0 %	50 %	89255318
104	NC_004041	GC	3	6	64285	64290	0 %	0 %	50 %	50 %	89255318
105	NC_004041	CT	3	6	64381	64386	0 %	50 %	0 %	50 %	89255318
106	NC_004041	CA	3	6	65092	65097	50 %	0 %	0 %	50 %	89255319
107	NC_004041	TC	3	6	65875	65880	0 %	50 %	0 %	50 %	21492905
108	NC_004041	CG	3	6	66034	66039	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
109	NC_004041	GC	3	6	66174	66179	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
110	NC_004041	GC	3	6	66246	66251	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
111	NC_004041	GC	3	6	66559	66564	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
112	NC_004041	CT	3	6	66680	66685	0 %	50 %	0 %	50 %	21492905
113	NC_004041	GC	3	6	66796	66801	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
114	NC_004041	GC	3	6	67059	67064	0 %	0 %	50 %	50 %	21492904
115	NC_004041	GC	3	6	67361	67366	0 %	0 %	50 %	50 %	21492904
116	NC_004041	CG	3	6	69075	69080	0 %	0 %	50 %	50 %	21492902
117	NC_004041	GC	3	6	69607	69612	0 %	0 %	50 %	50 %	21492902
118	NC_004041	CG	3	6	70005	70010	0 %	0 %	50 %	50 %	21492901
119	NC_004041	CG	4	8	70436	70443	0 %	0 %	50 %	50 %	21492901
120	NC_004041	GC	3	6	70528	70533	0 %	0 %	50 %	50 %	21492901
121	NC_004041	CA	3	6	71565	71570	50 %	0 %	0 %	50 %	89255320
122	NC_004041	TC	3	6	71661	71666	0 %	50 %	0 %	50 %	21492899
123	NC_004041	CG	3	6	72066	72071	0 %	0 %	50 %	50 %	21492899
124	NC_004041	GC	4	8	72398	72405	0 %	0 %	50 %	50 %	21492899
125	NC_004041	GC	3	6	72575	72580	0 %	0 %	50 %	50 %	21492899
126	NC_004041	CG	3	6	73115	73120	0 %	0 %	50 %	50 %	21492899
127	NC_004041	GA	3	6	73403	73408	50 %	0 %	50 %	0 %	21492899
128	NC_004041	AG	3	6	73806	73811	50 %	0 %	50 %	0 %	21492898
129	NC_004041	AG	3	6	73895	73900	50 %	0 %	50 %	0 %	21492898
130	NC_004041	CG	3	6	75398	75403	0 %	0 %	50 %	50 %	21492896
131	NC_004041	TC	3	6	75611	75616	0 %	50 %	0 %	50 %	21492895
132	NC_004041	GC	3	6	75696	75701	0 %	0 %	50 %	50 %	21492895
133	NC_004041	GC	3	6	75898	75903	0 %	0 %	50 %	50 %	21492895
134	NC_004041	CG	3	6	76439	76444	0 %	0 %	50 %	50 %	21492894
135	NC_004041	GA	3	6	77141	77146	50 %	0 %	50 %	0 %	89255321
136	NC_004041	GC	3	6	78001	78006	0 %	0 %	50 %	50 %	21492892
137	NC_004041	TC	3	6	78557	78562	0 %	50 %	0 %	50 %	21492891
138	NC_004041	CG	3	6	79087	79092	0 %	0 %	50 %	50 %	21492891
139	NC_004041	CG	3	6	79108	79113	0 %	0 %	50 %	50 %	21492891
140	NC_004041	GC	3	6	79428	79433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_004041	CT	3	6	80478	80483	0 %	50 %	0 %	50 %	21492890
142	NC_004041	CG	3	6	81202	81207	0 %	0 %	50 %	50 %	21492889
143	NC_004041	TG	3	6	81247	81252	0 %	50 %	50 %	0 %	21492889
144	NC_004041	AT	4	8	81476	81483	50 %	50 %	0 %	0 %	21492889
145	NC_004041	CT	3	6	82136	82141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_004041	AG	3	6	82382	82387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004041	CG	3	6	82957	82962	0 %	0 %	50 %	50 %	89255322
148	NC_004041	CG	3	6	84347	84352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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