MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004041	GCA	2	6	172266	172271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492807
3502	NC_004041	TGG	2	6	172299	172304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492807
3503	NC_004041	GTCG	2	8	172309	172316	0 %	25 %	50 %	25 %	21492807
3504	NC_004041	GAG	2	6	172375	172380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492807
3505	NC_004041	GA	3	6	172411	172416	50 %	0 %	50 %	0 %	21492807
3506	NC_004041	GAA	2	6	172533	172538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492807
3507	NC_004041	TA	3	6	172572	172577	50 %	50 %	0 %	0 %	21492807
3508	NC_004041	GC	3	6	172651	172656	0 %	0 %	50 %	50 %	21492807
3509	NC_004041	TGCAA	2	10	172727	172736	40 %	20 %	20 %	20 %	21492807
3510	NC_004041	GCC	2	6	172741	172746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_004041	ACG	2	6	172836	172841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_004041	GGA	2	6	172848	172853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_004041	T	6	6	172914	172919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_004041	GTGCA	2	10	172920	172929	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3515	NC_004041	AG	3	6	172946	172951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_004041	CG	3	6	173001	173006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_004041	AGG	2	6	173042	173047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_004041	ATC	2	6	173128	173133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255352
3519	NC_004041	TCG	2	6	173158	173163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255352
3520	NC_004041	TCG	2	6	173168	173173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255352
3521	NC_004041	CGG	2	6	173193	173198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255352
3522	NC_004041	CG	3	6	173240	173245	0 %	0 %	50 %	50 %	89255352
3523	NC_004041	CTT	2	6	173272	173277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255352
3524	NC_004041	ATGG	2	8	173316	173323	25 %	25 %	50 %	0 %	89255352
3525	NC_004041	ACC	2	6	173350	173355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255352
3526	NC_004041	CGATGA	2	12	173411	173422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89255352
3527	NC_004041	CAGTTC	2	12	173448	173459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89255352
3528	NC_004041	TCT	2	6	173537	173542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255352
3529	NC_004041	CG	3	6	173549	173554	0 %	0 %	50 %	50 %	89255352
3530	NC_004041	TCA	3	9	173585	173593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255352
3531	NC_004041	GGACCG	2	12	173602	173613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	89255352
3532	NC_004041	GC	3	6	173641	173646	0 %	0 %	50 %	50 %	89255352
3533	NC_004041	TCC	2	6	173668	173673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255352
3534	NC_004041	TGA	2	6	173674	173679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255352
3535	NC_004041	CCG	2	6	173716	173721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255352
3536	NC_004041	ATC	2	6	173728	173733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255352
3537	NC_004041	CAG	2	6	173748	173753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255352
3538	NC_004041	GCT	2	6	173754	173759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255352
3539	NC_004041	TCAG	2	8	173806	173813	25 %	25 %	25 %	25 %	89255352
3540	NC_004041	CCAT	2	8	174100	174107	25 %	25 %	0 %	50 %	89255352
3541	NC_004041	CGG	2	6	174129	174134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255352
3542	NC_004041	GTC	2	6	174210	174215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255352
3543	NC_004041	CGT	2	6	174248	174253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255352
3544	NC_004041	TCC	2	6	174254	174259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_004041	AAGG	2	8	174291	174298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_004041	TAGT	2	8	174335	174342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_004041	AGA	2	6	174391	174396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_004041	AAAATT	2	12	174417	174428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_004041	GCCG	2	8	174543	174550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_004041	CCG	2	6	174559	174564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_004041	GCC	2	6	174573	174578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_004041	CGGC	3	12	174631	174642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_004041	CGC	2	6	174876	174881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_004041	GCCC	2	8	174892	174899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3555	NC_004041	GCG	2	6	174930	174935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_004041	TTC	2	6	174963	174968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_004041	CCG	2	6	175025	175030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_004041	CGC	2	6	175041	175046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_004041	CGA	2	6	175160	175165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_004041	GCCCC	2	10	175175	175184	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3561	NC_004041	ACCG	2	8	175197	175204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_004041	GGA	2	6	175274	175279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_004041	GTC	2	6	175284	175289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_004041	CCT	2	6	175367	175372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_004041	CAACG	2	10	175446	175455	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3566	NC_004041	GCT	2	6	175526	175531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_004041	GC	3	6	175559	175564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_004041	GGC	2	6	175605	175610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_004041	GAT	2	6	175654	175659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_004041	CCGC	2	8	175680	175687	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3571	NC_004041	GC	3	6	175690	175695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_004041	GGCA	2	8	175717	175724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_004041	CGG	3	9	175738	175746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_004041	ACGA	2	8	175764	175771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_004041	TGC	3	9	175818	175826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_004041	CGG	2	6	175828	175833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_004041	CTGC	2	8	175860	175867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_004041	GC	3	6	175877	175882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_004041	CCG	2	6	175941	175946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_004041	GAC	2	6	175951	175956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_004041	CGT	2	6	175980	175985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_004041	CCG	2	6	176031	176036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_004041	GCG	2	6	176060	176065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_004041	GCA	2	6	176179	176184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255353
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3587	NC_004041	CGT	2	6	176326	176331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255353
3588	NC_004041	CGG	2	6	176394	176399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255353
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3590	NC_004041	TGG	2	6	176461	176466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_004041	ACG	3	9	176471	176479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_004041	ATG	2	6	176525	176530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255354
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3597	NC_004041	GGAG	2	8	176739	176746	25 %	0 %	75 %	0 %	89255354
3598	NC_004041	CGG	2	6	176913	176918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492803
3599	NC_004041	CAG	2	6	177044	177049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492803
3600	NC_004041	TAT	2	6	177100	177105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492803
3601	NC_004041	TGT	2	6	177184	177189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492803
3602	NC_004041	GAC	2	6	177236	177241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492803
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3604	NC_004041	TGG	2	6	177322	177327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492803
3605	NC_004041	GCA	2	6	177365	177370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492802
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3607	NC_004041	CCA	2	6	177437	177442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492802
3608	NC_004041	AGA	2	6	177461	177466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492802
3609	NC_004041	GCAAG	2	10	177539	177548	40 %	0 %	40 %	20 %	21492802
3610	NC_004041	GAA	2	6	177550	177555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492802
3611	NC_004041	GCC	2	6	177604	177609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492802
3612	NC_004041	CG	3	6	177621	177626	0 %	0 %	50 %	50 %	21492802
3613	NC_004041	CGG	2	6	177708	177713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492802
3614	NC_004041	AAG	2	6	177724	177729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492802
3615	NC_004041	GAA	2	6	177755	177760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492802
3616	NC_004041	AGCG	2	8	177764	177771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_004041	GC	3	6	177814	177819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_004041	TCC	2	6	177859	177864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_004041	GCC	2	6	177930	177935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_004041	TCC	2	6	178001	178006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_004041	CCG	2	6	178018	178023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_004041	CAT	2	6	178070	178075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_004041	GAC	3	9	178092	178100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_004041	GCC	2	6	178172	178177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_004041	AGG	2	6	178235	178240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_004041	CGC	2	6	178251	178256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_004041	GGC	2	6	178270	178275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_004041	CCT	2	6	178281	178286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_004041	CG	3	6	178430	178435	0 %	0 %	50 %	50 %	21492801
3630	NC_004041	TCC	2	6	178477	178482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492801
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3637	NC_004041	TGA	2	6	178732	178737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492800
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3747	NC_004041	GCA	2	6	184148	184153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3748	NC_004041	GAG	2	6	184179	184184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492793
3749	NC_004041	GCGAT	2	10	184210	184219	20 %	20 %	40 %	20 %	21492793
3750	NC_004041	TGC	2	6	184244	184249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3751	NC_004041	GCC	2	6	184300	184305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3752	NC_004041	CGAT	2	8	184423	184430	25 %	25 %	25 %	25 %	21492793
3753	NC_004041	GCT	2	6	184449	184454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3754	NC_004041	GC	3	6	184455	184460	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3755	NC_004041	AG	3	6	184461	184466	50 %	0 %	50 %	0 %	21492793
3756	NC_004041	TGA	2	6	184514	184519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492793
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3769	NC_004041	CGA	2	6	185198	185203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
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3773	NC_004041	CCG	2	6	185359	185364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
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3822	NC_004041	TGGT	2	8	187353	187360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3823	NC_004041	GATC	2	8	187395	187402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3998	NC_004041	GCG	2	6	196530	196535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492784
3999	NC_004041	GTA	2	6	196631	196636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492784
4000	NC_004041	TGA	2	6	196718	196723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492784

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