MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004041	GA	3	6	123247	123252	50 %	0 %	50 %	0 %	89255333
2502	NC_004041	GGT	2	6	123283	123288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255333
2503	NC_004041	CGG	2	6	123316	123321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255333
2504	NC_004041	TCA	2	6	123369	123374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255333
2505	NC_004041	GGAC	2	8	123396	123403	25 %	0 %	50 %	25 %	89255333
2506	NC_004041	GTC	2	6	123406	123411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255333
2507	NC_004041	TTC	2	6	123418	123423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255333
2508	NC_004041	ATTTCA	2	12	123424	123435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	89255333
2509	NC_004041	CTT	2	6	123481	123486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255333
2510	NC_004041	GAG	2	6	123500	123505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255333
2511	NC_004041	TCA	2	6	123553	123558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255333
2512	NC_004041	TGC	2	6	123567	123572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255333
2513	NC_004041	CAT	2	6	123617	123622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255333
2514	NC_004041	GAT	2	6	123643	123648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255333
2515	NC_004041	CG	3	6	123696	123701	0 %	0 %	50 %	50 %	89255333
2516	NC_004041	TTGC	2	8	123821	123828	0 %	50 %	25 %	25 %	89255333
2517	NC_004041	AGATGC	2	12	123849	123860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21492854
2518	NC_004041	CGC	2	6	123942	123947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492854
2519	NC_004041	CAAT	2	8	124011	124018	50 %	25 %	0 %	25 %	21492854
2520	NC_004041	CGT	2	6	124069	124074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2521	NC_004041	GCA	2	6	124076	124081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2522	NC_004041	AGGTTG	2	12	124101	124112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	21492854
2523	NC_004041	GTCAT	2	10	124124	124133	20 %	40 %	20 %	20 %	21492854
2524	NC_004041	TGC	2	6	124210	124215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2525	NC_004041	CGG	2	6	124231	124236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2526	NC_004041	ACC	2	6	124269	124274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492854
2527	NC_004041	GCG	2	6	124278	124283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2528	NC_004041	TGTCG	2	10	124306	124315	0 %	40 %	40 %	20 %	21492854
2529	NC_004041	GCT	2	6	124361	124366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2530	NC_004041	CT	3	6	124365	124370	0 %	50 %	0 %	50 %	21492854
2531	NC_004041	TGA	2	6	124404	124409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492854
2532	NC_004041	CGG	2	6	124456	124461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2533	NC_004041	CGA	2	6	124566	124571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2534	NC_004041	T	6	6	124576	124581	0 %	100 %	0 %	0 %	21492854
2535	NC_004041	TTG	2	6	124599	124604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492854
2536	NC_004041	GCG	2	6	124626	124631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2537	NC_004041	GGAGA	2	10	124775	124784	40 %	0 %	60 %	0 %	21492854
2538	NC_004041	CG	3	6	124824	124829	0 %	0 %	50 %	50 %	21492854
2539	NC_004041	TGA	2	6	124906	124911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492854
2540	NC_004041	CCAT	2	8	125018	125025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2541	NC_004041	ACT	2	6	125102	125107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_004041	TTG	2	6	125144	125149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_004041	ATCC	2	8	125200	125207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_004041	GCA	2	6	125212	125217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_004041	TGA	2	6	125221	125226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_004041	AGT	2	6	125233	125238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_004041	TCA	2	6	125239	125244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_004041	AC	3	6	125266	125271	50 %	0 %	0 %	50 %	21492853
2549	NC_004041	GTC	2	6	125407	125412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492853
2550	NC_004041	ATG	2	6	125453	125458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492853
2551	NC_004041	GTT	2	6	125524	125529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492853
2552	NC_004041	GGC	2	6	125542	125547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492853
2553	NC_004041	ACA	2	6	125651	125656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492853
2554	NC_004041	TCA	2	6	125687	125692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492853
2555	NC_004041	T	6	6	125794	125799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_004041	TGT	2	6	125885	125890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_004041	CT	3	6	125931	125936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_004041	TTG	2	6	125945	125950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_004041	TGG	2	6	126005	126010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255334
2560	NC_004041	TTA	2	6	126089	126094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255334
2561	NC_004041	GAG	2	6	126139	126144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255334
2562	NC_004041	CG	3	6	126166	126171	0 %	0 %	50 %	50 %	89255334
2563	NC_004041	CTC	2	6	126235	126240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255334
2564	NC_004041	ATC	2	6	126292	126297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255334
2565	NC_004041	TGA	2	6	126326	126331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255334
2566	NC_004041	GCA	2	6	126335	126340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255334
2567	NC_004041	CGT	2	6	126368	126373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255334
2568	NC_004041	TTG	2	6	126391	126396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255334
2569	NC_004041	CCAG	2	8	126414	126421	25 %	0 %	25 %	50 %	89255334
2570	NC_004041	GGC	2	6	126422	126427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255334
2571	NC_004041	AG	3	6	126451	126456	50 %	0 %	50 %	0 %	89255334
2572	NC_004041	TTGCG	2	10	126470	126479	0 %	40 %	40 %	20 %	89255334
2573	NC_004041	ACT	2	6	126545	126550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255334
2574	NC_004041	AGT	2	6	126578	126583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255334
2575	NC_004041	CT	3	6	126644	126649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_004041	CAA	2	6	126683	126688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_004041	CAT	2	6	126689	126694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_004041	GGA	2	6	126703	126708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_004041	ACA	2	6	126793	126798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492851
2580	NC_004041	TCA	2	6	126829	126834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492851
2581	NC_004041	GCC	3	9	126936	126944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492851
2582	NC_004041	TCG	2	6	127058	127063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492851
2583	NC_004041	TCGA	2	8	127094	127101	25 %	25 %	25 %	25 %	21492851
2584	NC_004041	CGG	2	6	127143	127148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492851
2585	NC_004041	TCC	2	6	127202	127207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492851
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2587	NC_004041	ACCTG	2	10	127367	127376	20 %	20 %	20 %	40 %	21492851
2588	NC_004041	TCG	2	6	127400	127405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492851
2589	NC_004041	TCG	2	6	127418	127423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492851
2590	NC_004041	GGA	2	6	127426	127431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492851
2591	NC_004041	GCG	2	6	127441	127446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492851
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2593	NC_004041	GCC	2	6	127506	127511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492851
2594	NC_004041	CAACGT	2	12	127548	127559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21492851
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2598	NC_004041	CGT	2	6	127716	127721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492851
2599	NC_004041	ACCG	2	8	127749	127756	25 %	0 %	25 %	50 %	21492851
2600	NC_004041	TTC	2	6	127757	127762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492851
2601	NC_004041	TC	3	6	127761	127766	0 %	50 %	0 %	50 %	21492851
2602	NC_004041	ACT	2	6	127778	127783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492851
2603	NC_004041	AGC	2	6	127803	127808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492851
2604	NC_004041	CTT	2	6	127899	127904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492851
2605	NC_004041	TCG	2	6	127922	127927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492851
2606	NC_004041	CG	3	6	128024	128029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_004041	GCGG	2	8	128063	128070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2608	NC_004041	GTT	2	6	128097	128102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_004041	ATG	2	6	128143	128148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_004041	TTG	2	6	128162	128167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_004041	AGA	2	6	128168	128173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_004041	TTG	2	6	128188	128193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_004041	GAT	2	6	128199	128204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_004041	GCC	2	6	128212	128217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_004041	TCGGC	2	10	128240	128249	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2616	NC_004041	GAA	2	6	128271	128276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_004041	CTCA	2	8	128287	128294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2618	NC_004041	CGC	2	6	128401	128406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_004041	CGA	2	6	128475	128480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_004041	TGG	2	6	128485	128490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_004041	GGC	2	6	128517	128522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_004041	ACG	2	6	128566	128571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_004041	CGC	2	6	128652	128657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_004041	GTTG	2	8	128675	128682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_004041	GCA	2	6	128853	128858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_004041	CCA	2	6	128915	128920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2627	NC_004041	GAC	2	6	128926	128931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_004041	CGA	2	6	128993	128998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_004041	GTC	2	6	129043	129048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_004041	ACG	2	6	129062	129067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_004041	CGTC	2	8	129075	129082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2632	NC_004041	TCG	2	6	129083	129088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_004041	CTG	2	6	129094	129099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_004041	ATGAG	2	10	129166	129175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_004041	ACC	2	6	129261	129266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2636	NC_004041	TCCTTC	2	12	129475	129486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2637	NC_004041	GCC	2	6	129645	129650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2641	NC_004041	CG	4	8	129934	129941	0 %	0 %	50 %	50 %	89255335
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2652	NC_004041	CTG	2	6	130509	130514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2654	NC_004041	GGA	2	6	130550	130555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2655	NC_004041	CATGG	2	10	130662	130671	20 %	20 %	40 %	20 %	89255336
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2749	NC_004041	GCGG	2	8	134581	134588	0 %	0 %	75 %	25 %	21492844
2750	NC_004041	TCG	2	6	134652	134657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492844
2751	NC_004041	CGT	2	6	134680	134685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492844
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2754	NC_004041	CCG	2	6	134759	134764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492844
2755	NC_004041	CGC	2	6	135011	135016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492844
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2771	NC_004041	GA	3	6	135897	135902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2772	NC_004041	AGA	2	6	135920	135925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2783	NC_004041	CG	3	6	136584	136589	0 %	0 %	50 %	50 %	89255340
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2856	NC_004041	A	6	6	141281	141286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2857	NC_004041	CTT	2	6	141290	141295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2858	NC_004041	GTCTT	2	10	141347	141356	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2859	NC_004041	CTG	2	6	141492	141497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492836
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2862	NC_004041	CG	3	6	141794	141799	0 %	0 %	50 %	50 %	21492836
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2870	NC_004041	CAACA	2	10	142302	142311	60 %	0 %	0 %	40 %	21492836
2871	NC_004041	ACC	2	6	142342	142347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492836
2872	NC_004041	CGA	2	6	142373	142378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492836
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2999	NC_004041	TTCGCG	2	12	147637	147648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255343
3000	NC_004041	CAA	2	6	147675	147680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255343

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