MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004041	GCCGT	2	10	25307	25316	0 %	20 %	40 %	40 %	89255302
502	NC_004041	ATTC	2	8	25338	25345	25 %	50 %	0 %	25 %	89255302
503	NC_004041	GACG	2	8	25347	25354	25 %	0 %	50 %	25 %	89255302
504	NC_004041	GCG	2	6	25379	25384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255302
505	NC_004041	CGT	2	6	25404	25409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255302
506	NC_004041	ATC	2	6	25429	25434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255302
507	NC_004041	GGA	2	6	25444	25449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255302
508	NC_004041	GCATCG	2	12	25451	25462	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89255302
509	NC_004041	GC	3	6	25607	25612	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
510	NC_004041	CGG	2	6	25640	25645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255302
511	NC_004041	GCGCG	2	10	25701	25710	0 %	0 %	60 %	40 %	89255302
512	NC_004041	CG	3	6	25774	25779	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
513	NC_004041	GTG	2	6	25804	25809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255302
514	NC_004041	GCT	2	6	25834	25839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255302
515	NC_004041	CGCCGA	2	12	25872	25883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	89255302
516	NC_004041	CGT	4	12	25917	25928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255302
517	NC_004041	GGCC	2	8	25953	25960	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
518	NC_004041	GAC	2	6	25969	25974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255302
519	NC_004041	TCG	2	6	25979	25984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255302
520	NC_004041	CAG	2	6	25993	25998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255302
521	NC_004041	GACG	2	8	26004	26011	25 %	0 %	50 %	25 %	89255302
522	NC_004041	CTC	2	6	26020	26025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255302
523	NC_004041	TCA	2	6	26057	26062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255302
524	NC_004041	CGT	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255302
525	NC_004041	AGC	2	6	26117	26122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255302
526	NC_004041	TGA	2	6	26171	26176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004041	ACG	2	6	26183	26188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004041	GCG	2	6	26196	26201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_004041	AGG	2	6	26231	26236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004041	CAGA	2	8	26259	26266	50 %	0 %	25 %	25 %	89255303
531	NC_004041	CGA	2	6	26274	26279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255303
532	NC_004041	ACTG	2	8	26346	26353	25 %	25 %	25 %	25 %	89255303
533	NC_004041	CG	3	6	26358	26363	0 %	0 %	50 %	50 %	89255303
534	NC_004041	CGC	2	6	26382	26387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255303
535	NC_004041	GAC	4	12	26470	26481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255303
536	NC_004041	ACG	2	6	26615	26620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255303
537	NC_004041	GTA	2	6	26641	26646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255303
538	NC_004041	CGG	2	6	26684	26689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255303
539	NC_004041	CGC	2	6	26730	26735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255303
540	NC_004041	GGC	2	6	26820	26825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255303
541	NC_004041	GC	3	6	26829	26834	0 %	0 %	50 %	50 %	89255303
542	NC_004041	CGA	2	6	26865	26870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255303
543	NC_004041	CAG	2	6	26933	26938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492940
544	NC_004041	GC	3	6	26992	26997	0 %	0 %	50 %	50 %	21492940
545	NC_004041	CAC	2	6	27025	27030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492940
546	NC_004041	TTG	4	12	27068	27079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492940
547	NC_004041	GAA	2	6	27121	27126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492940
548	NC_004041	CTG	2	6	27191	27196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492940
549	NC_004041	AGC	3	9	27228	27236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492940
550	NC_004041	CTT	2	6	27272	27277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492940
551	NC_004041	CAGC	2	8	27278	27285	25 %	0 %	25 %	50 %	21492940
552	NC_004041	TCG	3	9	27390	27398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492940
553	NC_004041	GGC	2	6	27517	27522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492940
554	NC_004041	CGT	2	6	27547	27552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492940
555	NC_004041	ACC	2	6	27558	27563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492940
556	NC_004041	GCT	2	6	27604	27609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492940
557	NC_004041	GAA	2	6	27646	27651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492940
558	NC_004041	CGT	2	6	27662	27667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492940
559	NC_004041	GAA	2	6	27776	27781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492940
560	NC_004041	CCGGTG	2	12	27818	27829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21492940
561	NC_004041	AGTCGA	2	12	27889	27900	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
562	NC_004041	GGA	2	6	27955	27960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004041	CAA	2	6	28039	28044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_004041	TGA	2	6	28052	28057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004041	TGT	2	6	28085	28090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004041	TCA	2	6	28143	28148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_004041	GTTG	2	8	28167	28174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004041	TCGG	2	8	28190	28197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
569	NC_004041	CGAT	2	8	28330	28337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_004041	GA	3	6	28351	28356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004041	GTTG	2	8	28407	28414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004041	TTTG	2	8	28425	28432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004041	CG	4	8	28502	28509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_004041	TGCA	2	8	28552	28559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_004041	CGA	2	6	28565	28570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_004041	CTC	2	6	28637	28642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_004041	ACC	2	6	28677	28682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_004041	GTTC	2	8	28814	28821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_004041	TGC	2	6	28870	28875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492939
580	NC_004041	AAG	2	6	28954	28959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492939
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582	NC_004041	GGT	2	6	29186	29191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492939
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599	NC_004041	CGC	2	6	29955	29960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_004041	CGC	2	6	30024	30029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_004041	TCG	2	6	30033	30038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_004041	GAC	3	9	30051	30059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_004041	GAA	2	6	30064	30069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004041	CAA	2	6	30115	30120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004041	TGCT	2	8	30162	30169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_004041	CAT	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_004041	GAC	2	6	30181	30186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_004041	GAC	2	6	30192	30197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004041	CGA	2	6	30201	30206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_004041	GGC	2	6	30284	30289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_004041	CTG	2	6	30315	30320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004041	CG	3	6	30364	30369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_004041	CGT	2	6	30440	30445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_004041	GCC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_004041	CGA	2	6	30598	30603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_004041	GCC	2	6	30627	30632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_004041	CGG	2	6	30732	30737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_004041	GGC	2	6	30745	30750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_004041	CGG	2	6	30769	30774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_004041	ACA	2	6	30783	30788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_004041	CT	3	6	30813	30818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_004041	CGTCG	2	10	30877	30886	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
623	NC_004041	TGG	2	6	30915	30920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004041	CGA	2	6	30955	30960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004041	CT	4	8	30985	30992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_004041	TCA	2	6	31118	31123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492936
627	NC_004041	CGGCG	2	10	31163	31172	0 %	0 %	60 %	40 %	21492936
628	NC_004041	TCTCT	2	10	31230	31239	0 %	60 %	0 %	40 %	21492936
629	NC_004041	TGGG	2	8	31313	31320	0 %	25 %	75 %	0 %	21492936
630	NC_004041	A	6	6	31323	31328	100 %	0 %	0 %	0 %	21492936
631	NC_004041	GC	3	6	31346	31351	0 %	0 %	50 %	50 %	21492936
632	NC_004041	CGC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492936
633	NC_004041	GCGGAA	2	12	31421	31432	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21492936
634	NC_004041	ATCT	2	8	31514	31521	25 %	50 %	0 %	25 %	21492936
635	NC_004041	TGA	2	6	31530	31535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004041	GCT	2	6	31590	31595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_004041	GTC	2	6	31641	31646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_004041	GCG	2	6	31716	31721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492935
639	NC_004041	TTC	2	6	31842	31847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492935
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641	NC_004041	ATC	2	6	31914	31919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492935
642	NC_004041	CAA	2	6	31925	31930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492935
643	NC_004041	CAA	2	6	31951	31956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492935
644	NC_004041	TCA	2	6	31969	31974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492935
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647	NC_004041	GC	3	6	32088	32093	0 %	0 %	50 %	50 %	21492935
648	NC_004041	TAA	2	6	32199	32204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_004041	TC	3	6	32239	32244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
650	NC_004041	TCGC	2	8	32253	32260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
651	NC_004041	CGA	2	6	32272	32277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_004041	CAG	2	6	32406	32411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_004041	CTG	2	6	32478	32483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_004041	CGT	3	9	32530	32538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492934
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656	NC_004041	GCG	2	6	32598	32603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492934
657	NC_004041	GCA	2	6	32664	32669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492934
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659	NC_004041	GGC	2	6	32867	32872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492934
660	NC_004041	GC	3	6	32904	32909	0 %	0 %	50 %	50 %	21492934
661	NC_004041	TGA	2	6	33003	33008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492934
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663	NC_004041	CG	3	6	33066	33071	0 %	0 %	50 %	50 %	21492934
664	NC_004041	GGC	2	6	33083	33088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492934
665	NC_004041	CTT	2	6	33169	33174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492934
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668	NC_004041	CT	3	6	33258	33263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
669	NC_004041	ATC	2	6	33349	33354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492933
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672	NC_004041	GAT	2	6	33385	33390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492933
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674	NC_004041	CTT	2	6	33450	33455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492933
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694	NC_004041	TAC	2	6	34436	34441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255305
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698	NC_004041	TGG	2	6	34518	34523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255305
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700	NC_004041	ATG	2	6	34711	34716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
701	NC_004041	CG	3	6	34807	34812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
702	NC_004041	GATT	3	12	34854	34865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
703	NC_004041	AGG	2	6	34919	34924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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713	NC_004041	CGA	2	6	35365	35370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255306
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717	NC_004041	TGA	2	6	35540	35545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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731	NC_004041	GTC	2	6	36310	36315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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753	NC_004041	ACC	2	6	37497	37502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255308
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757	NC_004041	TCC	2	6	37654	37659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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767	NC_004041	TCG	2	6	38035	38040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255309
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771	NC_004041	GCC	2	6	38328	38333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255309
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807	NC_004041	GTA	2	6	39920	39925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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