MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004041	TCCGT	2	10	318109	318118	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6502	NC_004041	CAT	2	6	318135	318140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_004041	AAG	2	6	318207	318212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_004041	GA	3	6	318267	318272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_004041	CGC	2	6	318455	318460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_004041	CTT	2	6	318538	318543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_004041	GCC	2	6	318551	318556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_004041	CCG	2	6	318568	318573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_004041	CGA	2	6	318671	318676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_004041	A	6	6	318703	318708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_004041	CGA	2	6	318725	318730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_004041	CCA	2	6	318736	318741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_004041	TGGA	2	8	318759	318766	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_004041	CGTT	3	12	318786	318797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6515	NC_004041	GAC	2	6	318804	318809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_004041	AGC	2	6	318811	318816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_004041	ACA	2	6	318822	318827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_004041	TTC	2	6	318906	318911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492667
6519	NC_004041	CG	4	8	318919	318926	0 %	0 %	50 %	50 %	21492667
6520	NC_004041	CGGC	2	8	318948	318955	0 %	0 %	50 %	50 %	21492667
6521	NC_004041	TCC	2	6	319002	319007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492667
6522	NC_004041	TCG	3	9	319008	319016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492667
6523	NC_004041	CAGGT	2	10	319125	319134	20 %	20 %	40 %	20 %	21492667
6524	NC_004041	CG	3	6	319159	319164	0 %	0 %	50 %	50 %	21492667
6525	NC_004041	CTTC	2	8	319209	319216	0 %	50 %	0 %	50 %	21492666
6526	NC_004041	TC	3	6	319248	319253	0 %	50 %	0 %	50 %	21492666
6527	NC_004041	GCG	3	9	319325	319333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492666
6528	NC_004041	GCT	2	6	319362	319367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492666
6529	NC_004041	ATG	2	6	319410	319415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492665
6530	NC_004041	GTC	2	6	319559	319564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492665
6531	NC_004041	AAGC	2	8	319567	319574	50 %	0 %	25 %	25 %	21492665
6532	NC_004041	GCT	2	6	319722	319727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492665
6533	NC_004041	CAG	2	6	319750	319755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492665
6534	NC_004041	CAG	2	6	319860	319865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492665
6535	NC_004041	TCC	2	6	319904	319909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_004041	CTT	2	6	319921	319926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_004041	GAA	2	6	319985	319990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_004041	GCA	2	6	320070	320075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_004041	CCG	2	6	320102	320107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_004041	GCC	2	6	320111	320116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_004041	GC	3	6	320149	320154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6542	NC_004041	TGC	2	6	320166	320171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_004041	TTC	2	6	320174	320179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_004041	GCAG	2	8	320182	320189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6545	NC_004041	GGC	2	6	320256	320261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_004041	CCG	3	9	320279	320287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_004041	GCTC	2	8	320329	320336	0 %	25 %	25 %	50 %	89255388
6548	NC_004041	TCG	2	6	320374	320379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255388
6549	NC_004041	GCC	2	6	320393	320398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
6550	NC_004041	GGT	2	6	320422	320427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255388
6551	NC_004041	AGC	2	6	320541	320546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255388
6552	NC_004041	GCCC	2	8	320570	320577	0 %	0 %	25 %	75 %	89255388
6553	NC_004041	CCG	2	6	320679	320684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
6554	NC_004041	TTC	2	6	320745	320750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255388
6555	NC_004041	CGA	2	6	320785	320790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255388
6556	NC_004041	GGA	2	6	320817	320822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255388
6557	NC_004041	TCA	2	6	320851	320856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255388
6558	NC_004041	TCG	2	6	320862	320867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255388
6559	NC_004041	GACC	2	8	320911	320918	25 %	0 %	25 %	50 %	89255388
6560	NC_004041	TGC	2	6	320955	320960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255388
6561	NC_004041	GCC	2	6	321014	321019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
6562	NC_004041	GTAC	2	8	321032	321039	25 %	25 %	25 %	25 %	89255388
6563	NC_004041	CAT	2	6	321098	321103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255388
6564	NC_004041	GTT	2	6	321128	321133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255388
6565	NC_004041	ATG	2	6	321162	321167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255388
6566	NC_004041	CCT	2	6	321184	321189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255388
6567	NC_004041	CGA	2	6	321262	321267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255388
6568	NC_004041	AGGC	2	8	321268	321275	25 %	0 %	50 %	25 %	89255388
6569	NC_004041	GACC	2	8	321308	321315	25 %	0 %	25 %	50 %	89255388
6570	NC_004041	GTC	2	6	321350	321355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255388
6571	NC_004041	GGT	2	6	321377	321382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255388
6572	NC_004041	ATC	2	6	321393	321398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255388
6573	NC_004041	TGTA	2	8	321415	321422	25 %	50 %	25 %	0 %	89255388
6574	NC_004041	TTC	2	6	321444	321449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255388
6575	NC_004041	CCG	2	6	321453	321458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
6576	NC_004041	TCC	2	6	321471	321476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255388
6577	NC_004041	CCG	2	6	321493	321498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
6578	NC_004041	TAA	2	6	321537	321542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255388
6579	NC_004041	TCT	2	6	321751	321756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255388
6580	NC_004041	CCG	2	6	321817	321822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
6581	NC_004041	CTTT	2	8	321842	321849	0 %	75 %	0 %	25 %	89255388
6582	NC_004041	CGC	2	6	321856	321861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
6583	NC_004041	GGC	2	6	321868	321873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255388
6584	NC_004041	GCCTG	2	10	321921	321930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6585	NC_004041	CAGGC	2	10	321944	321953	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6586	NC_004041	T	6	6	321992	321997	0 %	100 %	0 %	0 %	21492663
6587	NC_004041	CGT	2	6	322006	322011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6588	NC_004041	ATT	2	6	322028	322033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492663
6589	NC_004041	AAT	2	6	322096	322101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21492663
6590	NC_004041	TCT	2	6	322135	322140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492663
6591	NC_004041	CAA	2	6	322171	322176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492663
6592	NC_004041	CGT	2	6	322225	322230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6593	NC_004041	GTC	2	6	322277	322282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6594	NC_004041	CGA	2	6	322309	322314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6595	NC_004041	TGA	2	6	322342	322347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492663
6596	NC_004041	GCC	2	6	322364	322369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492663
6597	NC_004041	CGA	2	6	322417	322422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6598	NC_004041	TGA	2	6	322450	322455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492663
6599	NC_004041	CGA	2	6	322471	322476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6600	NC_004041	GGAC	2	8	322526	322533	25 %	0 %	50 %	25 %	21492663
6601	NC_004041	TCCA	2	8	322548	322555	25 %	25 %	0 %	50 %	21492663
6602	NC_004041	TCC	2	6	322572	322577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492663
6603	NC_004041	GC	4	8	322639	322646	0 %	0 %	50 %	50 %	21492663
6604	NC_004041	AGCG	2	8	322655	322662	25 %	0 %	50 %	25 %	21492663
6605	NC_004041	CCT	2	6	322702	322707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492663
6606	NC_004041	CGA	2	6	322756	322761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6607	NC_004041	CGT	2	6	322828	322833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6608	NC_004041	TGG	2	6	322842	322847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492663
6609	NC_004041	CGC	2	6	322864	322869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492663
6610	NC_004041	CTT	2	6	322919	322924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492663
6611	NC_004041	GTC	2	6	322943	322948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6612	NC_004041	GTT	2	6	322991	322996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492663
6613	NC_004041	CTC	2	6	323009	323014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492663
6614	NC_004041	TCG	2	6	323019	323024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6615	NC_004041	CTT	2	6	323039	323044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492663
6616	NC_004041	CGC	2	6	323047	323052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492663
6617	NC_004041	GTA	2	6	323129	323134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492663
6618	NC_004041	GCG	2	6	323138	323143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492663
6619	NC_004041	AAT	2	6	323155	323160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21492663
6620	NC_004041	ACCG	2	8	323168	323175	25 %	0 %	25 %	50 %	21492663
6621	NC_004041	TCA	2	6	323257	323262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492663
6622	NC_004041	TCG	2	6	323319	323324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492663
6623	NC_004041	CTT	2	6	323348	323353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492663
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6625	NC_004041	CGC	2	6	323363	323368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492663
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