MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_003911	GCC	2	6	183901	183906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695087
4003	NC_003911	CGCTG	2	10	183915	183924	0 %	20 %	40 %	40 %	56695087
4004	NC_003911	GCAG	2	8	183954	183961	25 %	0 %	50 %	25 %	56695087
4005	NC_003911	GGC	2	6	183967	183972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695087
4006	NC_003911	GCCC	2	8	184098	184105	0 %	0 %	25 %	75 %	56695087
4007	NC_003911	GC	3	6	184149	184154	0 %	0 %	50 %	50 %	56695087
4008	NC_003911	GCT	2	6	184167	184172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695087
4009	NC_003911	ATC	2	6	184175	184180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695087
4010	NC_003911	CG	3	6	184260	184265	0 %	0 %	50 %	50 %	56695087
4011	NC_003911	CGG	3	9	184272	184280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695087
4012	NC_003911	ATC	2	6	184307	184312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695087
4013	NC_003911	GC	3	6	184328	184333	0 %	0 %	50 %	50 %	56695087
4014	NC_003911	TGG	2	6	184386	184391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695087
4015	NC_003911	TTC	2	6	184415	184420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695087
4016	NC_003911	CG	3	6	184497	184502	0 %	0 %	50 %	50 %	56695088
4017	NC_003911	GCC	2	6	184557	184562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695088
4018	NC_003911	ACGC	2	8	184625	184632	25 %	0 %	25 %	50 %	56695088
4019	NC_003911	AGCC	2	8	184675	184682	25 %	0 %	25 %	50 %	56695088
4020	NC_003911	CGC	2	6	184683	184688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695088
4021	NC_003911	ATC	2	6	184689	184694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695088
4022	NC_003911	GA	3	6	184712	184717	50 %	0 %	50 %	0 %	56695088
4023	NC_003911	GC	3	6	184727	184732	0 %	0 %	50 %	50 %	56695088
4024	NC_003911	GCC	2	6	184741	184746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695088
4025	NC_003911	CGG	2	6	184751	184756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695088
4026	NC_003911	CCA	2	6	184802	184807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695088
4027	NC_003911	CAT	2	6	184824	184829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695088
4028	NC_003911	GCC	2	6	184839	184844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695088
4029	NC_003911	CAT	2	6	184866	184871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695088
4030	NC_003911	CGG	2	6	184877	184882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695088
4031	NC_003911	CTG	2	6	184947	184952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695088
4032	NC_003911	CAA	2	6	185033	185038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695088
4033	NC_003911	GCG	2	6	185074	185079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695088
4034	NC_003911	ACG	2	6	185152	185157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695088
4035	NC_003911	GGTTCC	2	12	185169	185180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695088
4036	NC_003911	TCA	2	6	185211	185216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695089
4037	NC_003911	GGTT	2	8	185301	185308	0 %	50 %	50 %	0 %	56695089
4038	NC_003911	CAC	3	9	185422	185430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695089
4039	NC_003911	GCT	2	6	185458	185463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695089
4040	NC_003911	GC	3	6	185483	185488	0 %	0 %	50 %	50 %	56695089
4041	NC_003911	CAG	2	6	185515	185520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695089
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4043	NC_003911	GC	4	8	185559	185566	0 %	0 %	50 %	50 %	56695089
4044	NC_003911	ATG	2	6	185591	185596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695089
4045	NC_003911	TCA	2	6	185622	185627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695089
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4052	NC_003911	CGA	2	6	185817	185822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695089
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4054	NC_003911	GCC	2	6	185855	185860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695089
4055	NC_003911	GCG	2	6	185897	185902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695089
4056	NC_003911	GAT	2	6	185923	185928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695089
4057	NC_003911	ATC	2	6	185933	185938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695089
4058	NC_003911	GCC	2	6	185977	185982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695089
4059	NC_003911	TGG	2	6	186014	186019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695089
4060	NC_003911	GCG	2	6	186029	186034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695089
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4062	NC_003911	CCG	2	6	186054	186059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695089
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4065	NC_003911	CGA	2	6	186237	186242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695089
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4071	NC_003911	GCC	2	6	186553	186558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695089
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4087	NC_003911	CCG	3	9	187059	187067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695089
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4106	NC_003911	GC	3	6	187926	187931	0 %	0 %	50 %	50 %	56695090
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4113	NC_003911	CGG	2	6	188175	188180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695090
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4119	NC_003911	GCA	2	6	188514	188519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695090
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4123	NC_003911	CAG	2	6	188686	188691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695090
4124	NC_003911	GCAGGT	2	12	188730	188741	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56695090
4125	NC_003911	CGG	2	6	188754	188759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695090
4126	NC_003911	GCCT	2	8	188764	188771	0 %	25 %	25 %	50 %	56695090
4127	NC_003911	GCG	2	6	188782	188787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695090
4128	NC_003911	CGG	2	6	188792	188797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695090
4129	NC_003911	CTGG	2	8	188968	188975	0 %	25 %	50 %	25 %	56695091
4130	NC_003911	CTTG	2	8	189094	189101	0 %	50 %	25 %	25 %	56695091
4131	NC_003911	GAT	2	6	189106	189111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695091
4132	NC_003911	GAAGA	2	10	189122	189131	60 %	0 %	40 %	0 %	56695091
4133	NC_003911	TCG	2	6	189177	189182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695091
4134	NC_003911	GCTG	2	8	189207	189214	0 %	25 %	50 %	25 %	56695091
4135	NC_003911	GC	3	6	189263	189268	0 %	0 %	50 %	50 %	56695091
4136	NC_003911	CT	3	6	189379	189384	0 %	50 %	0 %	50 %	56695091
4137	NC_003911	GCT	2	6	189551	189556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695091
4138	NC_003911	CGGG	2	8	189571	189578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4139	NC_003911	GAA	2	6	189600	189605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_003911	TG	3	6	189657	189662	0 %	50 %	50 %	0 %	56695092
4141	NC_003911	CT	3	6	189664	189669	0 %	50 %	0 %	50 %	56695092
4142	NC_003911	GCG	2	6	189679	189684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695092
4143	NC_003911	GTC	2	6	189717	189722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695092
4144	NC_003911	CG	3	6	189738	189743	0 %	0 %	50 %	50 %	56695092
4145	NC_003911	TGC	2	6	189779	189784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695092
4146	NC_003911	GC	3	6	189783	189788	0 %	0 %	50 %	50 %	56695092
4147	NC_003911	CCGA	2	8	189880	189887	25 %	0 %	25 %	50 %	56695092
4148	NC_003911	GC	3	6	189895	189900	0 %	0 %	50 %	50 %	56695092
4149	NC_003911	TCGA	2	8	189994	190001	25 %	25 %	25 %	25 %	56695092
4150	NC_003911	GCC	2	6	190036	190041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695092
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4152	NC_003911	CGCA	2	8	190108	190115	25 %	0 %	25 %	50 %	56695092
4153	NC_003911	ATGCCT	2	12	190127	190138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56695092
4154	NC_003911	CG	3	6	190156	190161	0 %	0 %	50 %	50 %	56695092
4155	NC_003911	CGCAC	2	10	190190	190199	20 %	0 %	20 %	60 %	56695092
4156	NC_003911	GC	3	6	190214	190219	0 %	0 %	50 %	50 %	56695092
4157	NC_003911	GCC	2	6	190245	190250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695092
4158	NC_003911	CGGCC	2	10	190251	190260	0 %	0 %	40 %	60 %	56695092
4159	NC_003911	GCCC	2	8	190294	190301	0 %	0 %	25 %	75 %	56695092
4160	NC_003911	ACC	2	6	190342	190347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695093
4161	NC_003911	ATC	2	6	190396	190401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695093
4162	NC_003911	TGA	3	9	190403	190411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695093
4163	NC_003911	GCC	2	6	190450	190455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695093
4164	NC_003911	ACCCTG	2	12	190483	190494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56695093
4165	NC_003911	CGA	2	6	190529	190534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695093
4166	NC_003911	CTCGC	2	10	190540	190549	0 %	20 %	20 %	60 %	56695093
4167	NC_003911	TGC	2	6	190553	190558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695093
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4173	NC_003911	AGC	2	6	190793	190798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695093
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4182	NC_003911	CGG	2	6	191171	191176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695093
4183	NC_003911	GCT	2	6	191193	191198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695093
4184	NC_003911	GCGGT	2	10	191252	191261	0 %	20 %	60 %	20 %	56695093
4185	NC_003911	GCC	2	6	191272	191277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695093
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4193	NC_003911	TGA	2	6	191618	191623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695093
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4198	NC_003911	CTG	2	6	191773	191778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695093
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4202	NC_003911	TGCA	2	8	191933	191940	25 %	25 %	25 %	25 %	56695093
4203	NC_003911	CTG	2	6	191950	191955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695093
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4233	NC_003911	GC	3	6	193420	193425	0 %	0 %	50 %	50 %	56695095
4234	NC_003911	CGG	2	6	193438	193443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695095
4235	NC_003911	CGG	4	12	193491	193502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695095
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4237	NC_003911	GC	3	6	193525	193530	0 %	0 %	50 %	50 %	56695095
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4239	NC_003911	TGC	2	6	193650	193655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695095
4240	NC_003911	GT	3	6	193664	193669	0 %	50 %	50 %	0 %	56695095
4241	NC_003911	TCA	2	6	193680	193685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695095
4242	NC_003911	TCGTC	2	10	193704	193713	0 %	40 %	20 %	40 %	56695095
4243	NC_003911	GC	3	6	193727	193732	0 %	0 %	50 %	50 %	56695095
4244	NC_003911	TGC	2	6	193740	193745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695095
4245	NC_003911	TGG	2	6	193779	193784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695095
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4249	NC_003911	GCG	2	6	194045	194050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695095
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4353	NC_003911	GCTGC	2	10	198649	198658	0 %	20 %	40 %	40 %	56695104
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4362	NC_003911	CCTC	2	8	198972	198979	0 %	25 %	0 %	75 %	56695104
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4369	NC_003911	TTG	2	6	199438	199443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_003911	CAGCCT	2	12	199496	199507	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56695106
4371	NC_003911	G	6	6	199541	199546	0 %	0 %	100 %	0 %	56695106
4372	NC_003911	TTGAA	2	10	199597	199606	40 %	40 %	20 %	0 %	56695106
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4378	NC_003911	GGT	2	6	199766	199771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695106
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4492	NC_003911	GAC	2	6	204493	204498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695110
4493	NC_003911	GC	3	6	204535	204540	0 %	0 %	50 %	50 %	56695110
4494	NC_003911	GCG	3	9	204555	204563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695110
4495	NC_003911	GGGC	2	8	204564	204571	0 %	0 %	75 %	25 %	56695110
4496	NC_003911	TCG	2	6	204574	204579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695110
4497	NC_003911	TGG	2	6	204925	204930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695111
4498	NC_003911	GCG	2	6	204936	204941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695111
4499	NC_003911	GGC	2	6	204947	204952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695111
4500	NC_003911	GTT	3	9	204953	204961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695111

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