MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003911	CCG	2	6	138258	138263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695057
3002	NC_003911	CGG	2	6	138333	138338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695057
3003	NC_003911	GTT	2	6	138529	138534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695057
3004	NC_003911	TGGT	2	8	138587	138594	0 %	50 %	50 %	0 %	56695057
3005	NC_003911	CGG	2	6	138606	138611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695057
3006	NC_003911	TCGG	2	8	138635	138642	0 %	25 %	50 %	25 %	56695057
3007	NC_003911	GCC	2	6	138689	138694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695057
3008	NC_003911	CG	3	6	138737	138742	0 %	0 %	50 %	50 %	56695057
3009	NC_003911	GAC	2	6	138827	138832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695057
3010	NC_003911	CGCGC	2	10	138862	138871	0 %	0 %	40 %	60 %	56695057
3011	NC_003911	TGT	2	6	138909	138914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695057
3012	NC_003911	GCA	2	6	138976	138981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695057
3013	NC_003911	GGC	2	6	139068	139073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695057
3014	NC_003911	CAT	2	6	139183	139188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695057
3015	NC_003911	CGTT	2	8	139247	139254	0 %	50 %	25 %	25 %	56695057
3016	NC_003911	ATGG	2	8	139333	139340	25 %	25 %	50 %	0 %	56695057
3017	NC_003911	AGA	2	6	139424	139429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695057
3018	NC_003911	CCA	2	6	139497	139502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695057
3019	NC_003911	GCA	2	6	139590	139595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695057
3020	NC_003911	TCT	2	6	139599	139604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695057
3021	NC_003911	TGA	2	6	139638	139643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695057
3022	NC_003911	CAG	2	6	139648	139653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695057
3023	NC_003911	GCT	2	6	139689	139694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695057
3024	NC_003911	GGC	2	6	139807	139812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695057
3025	NC_003911	CG	4	8	139824	139831	0 %	0 %	50 %	50 %	56695057
3026	NC_003911	GC	3	6	139832	139837	0 %	0 %	50 %	50 %	56695057
3027	NC_003911	CGC	2	6	139893	139898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695057
3028	NC_003911	ATC	2	6	139916	139921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695057
3029	NC_003911	CAC	2	6	139951	139956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695057
3030	NC_003911	GA	3	6	139971	139976	50 %	0 %	50 %	0 %	56695057
3031	NC_003911	CAT	2	6	139990	139995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695057
3032	NC_003911	GCC	2	6	140012	140017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695057
3033	NC_003911	GAT	2	6	140032	140037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695057
3034	NC_003911	TCA	2	6	140049	140054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695057
3035	NC_003911	GGC	2	6	140202	140207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695057
3036	NC_003911	TCG	2	6	140267	140272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695057
3037	NC_003911	GCC	2	6	140351	140356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695057
3038	NC_003911	CAG	2	6	140380	140385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695057
3039	NC_003911	CG	4	8	140402	140409	0 %	0 %	50 %	50 %	56695057
3040	NC_003911	AGG	2	6	140564	140569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_003911	TTCT	2	8	140600	140607	0 %	75 %	0 %	25 %	56695058
3042	NC_003911	T	6	6	140619	140624	0 %	100 %	0 %	0 %	56695058
3043	NC_003911	AAC	2	6	140764	140769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695058
3044	NC_003911	CG	3	6	140793	140798	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3045	NC_003911	CGG	2	6	140861	140866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3046	NC_003911	CGG	3	9	140882	140890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3047	NC_003911	CAA	2	6	140908	140913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695058
3048	NC_003911	GCG	2	6	140914	140919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3049	NC_003911	GGCT	2	8	140921	140928	0 %	25 %	50 %	25 %	56695058
3050	NC_003911	TCC	2	6	140930	140935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695058
3051	NC_003911	GC	3	6	140968	140973	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3052	NC_003911	GCC	2	6	140992	140997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3053	NC_003911	GCC	2	6	141058	141063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3054	NC_003911	CGCC	2	8	141120	141127	0 %	0 %	25 %	75 %	56695058
3055	NC_003911	TGC	2	6	141128	141133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3056	NC_003911	CAG	2	6	141153	141158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3057	NC_003911	GC	3	6	141175	141180	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3058	NC_003911	GCGG	2	8	141213	141220	0 %	0 %	75 %	25 %	56695058
3059	NC_003911	CTG	2	6	141253	141258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3060	NC_003911	ACGGG	2	10	141273	141282	20 %	0 %	60 %	20 %	56695058
3061	NC_003911	TGC	2	6	141305	141310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3062	NC_003911	CG	3	6	141332	141337	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3063	NC_003911	GGC	2	6	141348	141353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3064	NC_003911	GC	3	6	141457	141462	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3065	NC_003911	TGCG	2	8	141581	141588	0 %	25 %	50 %	25 %	56695058
3066	NC_003911	CGG	2	6	141662	141667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3067	NC_003911	GGTC	2	8	141679	141686	0 %	25 %	50 %	25 %	56695058
3068	NC_003911	TGC	2	6	141692	141697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3069	NC_003911	CGG	2	6	141704	141709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3070	NC_003911	GCG	2	6	141712	141717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3071	NC_003911	CCA	2	6	141740	141745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695058
3072	NC_003911	TGATC	2	10	141750	141759	20 %	40 %	20 %	20 %	56695058
3073	NC_003911	GCG	2	6	141762	141767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3074	NC_003911	CTG	2	6	141784	141789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3075	NC_003911	CG	3	6	141790	141795	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3076	NC_003911	AGG	2	6	141800	141805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695058
3077	NC_003911	CG	3	6	141813	141818	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3078	NC_003911	ACC	2	6	141919	141924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695058
3079	NC_003911	GGC	2	6	141957	141962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3080	NC_003911	GCG	3	9	142234	142242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3081	NC_003911	CGG	2	6	142262	142267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3082	NC_003911	ACC	2	6	142372	142377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695058
3083	NC_003911	CG	4	8	142440	142447	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3084	NC_003911	TGG	2	6	142521	142526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695058
3085	NC_003911	G	6	6	142534	142539	0 %	0 %	100 %	0 %	56695058
3086	NC_003911	ACC	2	6	142555	142560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695058
3087	NC_003911	CG	3	6	142574	142579	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3088	NC_003911	GCCA	2	8	142627	142634	25 %	0 %	25 %	50 %	56695058
3089	NC_003911	CTG	2	6	142639	142644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3090	NC_003911	CGC	2	6	142721	142726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3091	NC_003911	GC	3	6	142738	142743	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3092	NC_003911	GC	3	6	142797	142802	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3093	NC_003911	GCC	2	6	142841	142846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3094	NC_003911	GCG	2	6	142900	142905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3095	NC_003911	GTG	2	6	142969	142974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695058
3096	NC_003911	GCC	2	6	142996	143001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3097	NC_003911	AACTGG	2	12	143212	143223	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56695058
3098	NC_003911	CGC	2	6	143236	143241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3099	NC_003911	CTC	2	6	143323	143328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695058
3100	NC_003911	CCT	2	6	143357	143362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695058
3101	NC_003911	GCC	2	6	143392	143397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3102	NC_003911	GCG	3	9	143401	143409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3103	NC_003911	CG	3	6	143466	143471	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3104	NC_003911	CG	3	6	143535	143540	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3105	NC_003911	GCC	2	6	143650	143655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3106	NC_003911	CG	3	6	143756	143761	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3107	NC_003911	GC	3	6	143792	143797	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3108	NC_003911	GGC	2	6	143826	143831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3109	NC_003911	GCG	2	6	143901	143906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3110	NC_003911	CGGG	2	8	143981	143988	0 %	0 %	75 %	25 %	56695058
3111	NC_003911	CGC	3	9	144017	144025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3112	NC_003911	GGTG	2	8	144066	144073	0 %	25 %	75 %	0 %	56695058
3113	NC_003911	GGC	2	6	144079	144084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695058
3114	NC_003911	GGT	3	9	144198	144206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695058
3115	NC_003911	CAG	2	6	144243	144248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695058
3116	NC_003911	GGT	2	6	144264	144269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695058
3117	NC_003911	CCG	2	6	144283	144288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695058
3118	NC_003911	GCGCC	2	10	144335	144344	0 %	0 %	40 %	60 %	56695058
3119	NC_003911	CACCGC	2	12	144396	144407	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56695058
3120	NC_003911	CGGG	2	8	144446	144453	0 %	0 %	75 %	25 %	56695058
3121	NC_003911	GC	3	6	144486	144491	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3122	NC_003911	GGT	2	6	144501	144506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695058
3123	NC_003911	CG	3	6	144557	144562	0 %	0 %	50 %	50 %	56695058
3124	NC_003911	GGCCG	2	10	144609	144618	0 %	0 %	60 %	40 %	56695058
3125	NC_003911	GCT	2	6	144708	144713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695058
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3129	NC_003911	CGA	2	6	144984	144989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695058
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3219	NC_003911	CG	3	6	148713	148718	0 %	0 %	50 %	50 %	56695061
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3231	NC_003911	CCG	2	6	149059	149064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695061
3232	NC_003911	GAT	2	6	149065	149070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695061
3233	NC_003911	TCC	2	6	149111	149116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695061
3234	NC_003911	TCA	2	6	149130	149135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695061
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3236	NC_003911	GCA	2	6	149154	149159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695061
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3239	NC_003911	CAG	2	6	149260	149265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695061
3240	NC_003911	CGGC	2	8	149266	149273	0 %	0 %	50 %	50 %	56695061
3241	NC_003911	TCA	2	6	149286	149291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695061
3242	NC_003911	CAGC	2	8	149329	149336	25 %	0 %	25 %	50 %	56695061
3243	NC_003911	GGCG	2	8	149379	149386	0 %	0 %	75 %	25 %	56695061
3244	NC_003911	GC	3	6	149440	149445	0 %	0 %	50 %	50 %	56695061
3245	NC_003911	CGG	2	6	149484	149489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695061
3246	NC_003911	CGC	2	6	149506	149511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695061
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3249	NC_003911	GCCGC	2	10	149578	149587	0 %	0 %	40 %	60 %	56695061
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3374	NC_003911	GCG	3	9	154230	154238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695063
3375	NC_003911	CGG	2	6	154278	154283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695064
3376	NC_003911	GGC	2	6	154303	154308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695064
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3379	NC_003911	CG	3	6	154341	154346	0 %	0 %	50 %	50 %	56695064
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3382	NC_003911	GCC	2	6	154428	154433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695064
3383	NC_003911	GCA	2	6	154437	154442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695064
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3386	NC_003911	CGGA	2	8	154543	154550	25 %	0 %	50 %	25 %	56695064
3387	NC_003911	GC	3	6	154553	154558	0 %	0 %	50 %	50 %	56695064
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3410	NC_003911	GGACG	2	10	155483	155492	20 %	0 %	60 %	20 %	56695065
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3415	NC_003911	CTT	2	6	155885	155890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695065
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3432	NC_003911	GC	3	6	156449	156454	0 %	0 %	50 %	50 %	56695066
3433	NC_003911	GC	3	6	156456	156461	0 %	0 %	50 %	50 %	56695066
3434	NC_003911	GGCG	2	8	156470	156477	0 %	0 %	75 %	25 %	56695066
3435	NC_003911	TCG	2	6	156496	156501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695066
3436	NC_003911	GGT	2	6	156555	156560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3437	NC_003911	AATGT	2	10	156573	156582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3438	NC_003911	ATTAC	2	10	156584	156593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3439	NC_003911	CGC	3	9	156631	156639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3442	NC_003911	GCTGC	2	10	156681	156690	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3443	NC_003911	GGTC	2	8	156716	156723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3446	NC_003911	CTG	2	6	156817	156822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3450	NC_003911	ATGAC	2	10	156958	156967	40 %	20 %	20 %	20 %	56695067
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3457	NC_003911	TCA	2	6	157333	157338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695067
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3465	NC_003911	CGA	2	6	157607	157612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695067
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3474	NC_003911	CATCGC	2	12	158111	158122	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56695067
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3477	NC_003911	GGC	2	6	158247	158252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695068
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3479	NC_003911	GGCA	2	8	158332	158339	25 %	0 %	50 %	25 %	56695068
3480	NC_003911	CGGG	2	8	158405	158412	0 %	0 %	75 %	25 %	56695068
3481	NC_003911	CCG	2	6	158504	158509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695068
3482	NC_003911	TGA	2	6	158540	158545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695068
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3484	NC_003911	ATC	2	6	158596	158601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695068
3485	NC_003911	CTG	2	6	158649	158654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695068
3486	NC_003911	GGC	2	6	158679	158684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695068
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3489	NC_003911	GCTTG	2	10	158727	158736	0 %	40 %	40 %	20 %	56695068
3490	NC_003911	ATG	2	6	158779	158784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695068
3491	NC_003911	CAGTC	2	10	158891	158900	20 %	20 %	20 %	40 %	56695068
3492	NC_003911	GAC	2	6	158916	158921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695068
3493	NC_003911	CTG	2	6	158977	158982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695068
3494	NC_003911	GTC	2	6	159045	159050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695068
3495	NC_003911	GCGG	2	8	159077	159084	0 %	0 %	75 %	25 %	56695068
3496	NC_003911	GGC	2	6	159214	159219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_003911	CAG	2	6	159251	159256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3498	NC_003911	GC	3	6	159277	159282	0 %	0 %	50 %	50 %	56695069
3499	NC_003911	GGGC	2	8	159289	159296	0 %	0 %	75 %	25 %	56695069
3500	NC_003911	CGC	2	6	159302	159307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695069

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