MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003911	TGA	2	6	113714	113719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695036
2502	NC_003911	GAC	2	6	113775	113780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2503	NC_003911	GTC	2	6	113808	113813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2504	NC_003911	GAT	2	6	113844	113849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695036
2505	NC_003911	CTG	2	6	113850	113855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2506	NC_003911	TCA	2	6	113993	113998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695036
2507	NC_003911	CAG	2	6	114183	114188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2508	NC_003911	CATGT	2	10	114264	114273	20 %	40 %	20 %	20 %	56695036
2509	NC_003911	CAAGG	2	10	114286	114295	40 %	0 %	40 %	20 %	56695037
2510	NC_003911	CTG	2	6	114397	114402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2511	NC_003911	GCC	2	6	114439	114444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2512	NC_003911	CGG	2	6	114513	114518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695037
2513	NC_003911	TGCG	2	8	114536	114543	0 %	25 %	50 %	25 %	56695037
2514	NC_003911	AC	3	6	114561	114566	50 %	0 %	0 %	50 %	56695037
2515	NC_003911	GAT	2	6	114661	114666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695037
2516	NC_003911	GCT	2	6	114708	114713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2517	NC_003911	CGC	2	6	114799	114804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2518	NC_003911	CAT	2	6	114805	114810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695037
2519	NC_003911	CAGCAT	2	12	114826	114837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56695037
2520	NC_003911	GCA	2	6	115059	115064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2521	NC_003911	CGG	2	6	115081	115086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695037
2522	NC_003911	AAGGC	2	10	115316	115325	40 %	0 %	40 %	20 %	56695037
2523	NC_003911	TCGA	2	8	115346	115353	25 %	25 %	25 %	25 %	56695037
2524	NC_003911	GC	3	6	115360	115365	0 %	0 %	50 %	50 %	56695037
2525	NC_003911	TGCC	2	8	115464	115471	0 %	25 %	25 %	50 %	56695037
2526	NC_003911	CTT	2	6	115497	115502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695037
2527	NC_003911	CGC	2	6	115597	115602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2528	NC_003911	CGT	2	6	115641	115646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2529	NC_003911	CG	3	6	115647	115652	0 %	0 %	50 %	50 %	56695037
2530	NC_003911	CCCGT	2	10	115678	115687	0 %	20 %	20 %	60 %	56695037
2531	NC_003911	CCT	2	6	115812	115817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695037
2532	NC_003911	GCA	2	6	115836	115841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2533	NC_003911	GTC	2	6	115981	115986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2534	NC_003911	GCCTT	2	10	116015	116024	0 %	40 %	20 %	40 %	56695037
2535	NC_003911	TGG	3	9	116058	116066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695037
2536	NC_003911	GGT	2	6	116213	116218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695037
2537	NC_003911	GCA	2	6	116256	116261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2538	NC_003911	TTC	2	6	116425	116430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695037
2539	NC_003911	CTG	2	6	116458	116463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2540	NC_003911	CCG	2	6	116561	116566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2541	NC_003911	AGA	2	6	116618	116623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695037
2542	NC_003911	TTG	2	6	116624	116629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695037
2543	NC_003911	GCG	2	6	116638	116643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695037
2544	NC_003911	GCGAT	2	10	116744	116753	20 %	20 %	40 %	20 %	56695037
2545	NC_003911	GGT	2	6	116769	116774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695037
2546	NC_003911	CGGT	2	8	116777	116784	0 %	25 %	50 %	25 %	56695037
2547	NC_003911	CGC	2	6	116790	116795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2548	NC_003911	CGC	2	6	116808	116813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2549	NC_003911	CCG	2	6	116901	116906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2550	NC_003911	GTC	2	6	117036	117041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695038
2551	NC_003911	CAG	2	6	117099	117104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695038
2552	NC_003911	CCG	2	6	117155	117160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695038
2553	NC_003911	GGATC	2	10	117233	117242	20 %	20 %	40 %	20 %	56695038
2554	NC_003911	CAG	2	6	117273	117278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695038
2555	NC_003911	CG	4	8	117287	117294	0 %	0 %	50 %	50 %	56695038
2556	NC_003911	GAA	2	6	117296	117301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695038
2557	NC_003911	CCA	2	6	117413	117418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695038
2558	NC_003911	GCG	2	6	117508	117513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695038
2559	NC_003911	CAG	2	6	117651	117656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695038
2560	NC_003911	CTG	2	6	117675	117680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695038
2561	NC_003911	CGG	2	6	117695	117700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695038
2562	NC_003911	CTTGG	2	10	117702	117711	0 %	40 %	40 %	20 %	56695038
2563	NC_003911	CCA	2	6	117749	117754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695038
2564	NC_003911	GCC	2	6	117918	117923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695038
2565	NC_003911	CATTG	2	10	117967	117976	20 %	40 %	20 %	20 %	56695038
2566	NC_003911	TCT	2	6	117978	117983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695038
2567	NC_003911	TGC	3	9	118055	118063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695038
2568	NC_003911	CGG	2	6	118105	118110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_003911	CGC	2	6	118151	118156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_003911	CCA	2	6	118324	118329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695039
2571	NC_003911	CG	3	6	118405	118410	0 %	0 %	50 %	50 %	56695039
2572	NC_003911	CTGGA	2	10	118474	118483	20 %	20 %	40 %	20 %	56695039
2573	NC_003911	GCG	2	6	118567	118572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695039
2574	NC_003911	CGG	2	6	118630	118635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695039
2575	NC_003911	TGG	2	6	118705	118710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695039
2576	NC_003911	ACA	2	6	118720	118725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695039
2577	NC_003911	TCT	2	6	118812	118817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695039
2578	NC_003911	GAAG	2	8	118848	118855	50 %	0 %	50 %	0 %	56695039
2579	NC_003911	CGA	2	6	118893	118898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695039
2580	NC_003911	C	6	6	118924	118929	0 %	0 %	0 %	100 %	56695039
2581	NC_003911	TAC	2	6	119086	119091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695039
2582	NC_003911	GAC	2	6	119206	119211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695039
2583	NC_003911	CGT	2	6	119226	119231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695039
2584	NC_003911	A	6	6	119270	119275	100 %	0 %	0 %	0 %	56695039
2585	NC_003911	CCG	2	6	119321	119326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695039
2586	NC_003911	CGG	2	6	119343	119348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695039
2587	NC_003911	TCA	2	6	119420	119425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695039
2588	NC_003911	ATG	2	6	119455	119460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695039
2589	NC_003911	ACC	2	6	119482	119487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695039
2590	NC_003911	GAT	2	6	119508	119513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695039
2591	NC_003911	CCG	2	6	119519	119524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695039
2592	NC_003911	TCTGG	2	10	119526	119535	0 %	40 %	40 %	20 %	56695039
2593	NC_003911	CGA	2	6	119565	119570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695039
2594	NC_003911	AAC	2	6	119662	119667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695039
2595	NC_003911	CGTT	2	8	119684	119691	0 %	50 %	25 %	25 %	56695039
2596	NC_003911	TGAC	2	8	119714	119721	25 %	25 %	25 %	25 %	56695039
2597	NC_003911	GACCT	2	10	119812	119821	20 %	20 %	20 %	40 %	56695039
2598	NC_003911	GCG	2	6	119834	119839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695039
2599	NC_003911	CG	3	6	119901	119906	0 %	0 %	50 %	50 %	56695039
2600	NC_003911	GAA	2	6	119955	119960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695039
2601	NC_003911	GTG	2	6	119970	119975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695039
2602	NC_003911	C	6	6	120021	120026	0 %	0 %	0 %	100 %	56695039
2603	NC_003911	ACGT	2	8	120064	120071	25 %	25 %	25 %	25 %	56695039
2604	NC_003911	GCTT	2	8	120119	120126	0 %	50 %	25 %	25 %	56695040
2605	NC_003911	AACG	2	8	120160	120167	50 %	0 %	25 %	25 %	56695040
2606	NC_003911	GC	3	6	120185	120190	0 %	0 %	50 %	50 %	56695040
2607	NC_003911	GATG	2	8	120324	120331	25 %	25 %	50 %	0 %	56695040
2608	NC_003911	CCT	2	6	120350	120355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695040
2609	NC_003911	GAAG	2	8	120402	120409	50 %	0 %	50 %	0 %	56695040
2610	NC_003911	GCG	2	6	120454	120459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695040
2611	NC_003911	CGG	2	6	120522	120527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695040
2612	NC_003911	CTG	2	6	120532	120537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695040
2613	NC_003911	GGT	2	6	120564	120569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695040
2614	NC_003911	GCC	2	6	120601	120606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695040
2615	NC_003911	GGC	2	6	120630	120635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695040
2616	NC_003911	TGA	2	6	120686	120691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695040
2617	NC_003911	GCC	2	6	120697	120702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695040
2618	NC_003911	CGA	2	6	120732	120737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695040
2619	NC_003911	CG	6	12	120742	120753	0 %	0 %	50 %	50 %	56695040
2620	NC_003911	GCA	2	6	120756	120761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695040
2621	NC_003911	CG	3	6	120819	120824	0 %	0 %	50 %	50 %	56695040
2622	NC_003911	TCATG	2	10	120864	120873	20 %	40 %	20 %	20 %	56695040
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2624	NC_003911	TTG	2	6	121051	121056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695041
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2626	NC_003911	AGT	2	6	121121	121126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2744	NC_003911	CTA	2	6	127674	127679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2749	NC_003911	CG	3	6	127950	127955	0 %	0 %	50 %	50 %	56695045
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2751	NC_003911	TGA	2	6	127981	127986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695045
2752	NC_003911	CGC	2	6	128004	128009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695045
2753	NC_003911	AG	3	6	128033	128038	50 %	0 %	50 %	0 %	56695045
2754	NC_003911	CGG	2	6	128046	128051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695045
2755	NC_003911	CG	3	6	128060	128065	0 %	0 %	50 %	50 %	56695045
2756	NC_003911	CGC	2	6	128102	128107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695045
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2760	NC_003911	GGC	2	6	128236	128241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_003911	TCC	2	6	128310	128315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695046
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2780	NC_003911	CGG	2	6	129284	129289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2781	NC_003911	GCG	2	6	129375	129380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2786	NC_003911	GAGC	2	8	129592	129599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2787	NC_003911	CATCGG	2	12	129603	129614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2790	NC_003911	TTCG	2	8	129647	129654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2791	NC_003911	CGC	2	6	129710	129715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2985	NC_003911	AG	3	6	137347	137352	50 %	0 %	50 %	0 %	56695055
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2989	NC_003911	GCC	2	6	137620	137625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2990	NC_003911	CGA	2	6	137694	137699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695056
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2992	NC_003911	TGCGG	2	10	137889	137898	0 %	20 %	60 %	20 %	56695056
2993	NC_003911	GAG	2	6	137908	137913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695056
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2997	NC_003911	CGA	2	6	138054	138059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695056
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