MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003911	GTT	2	6	68252	68257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694992
1502	NC_003911	A	7	7	68291	68297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_003911	GC	3	6	68301	68306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_003911	CGC	2	6	68353	68358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_003911	TGT	2	6	68359	68364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_003911	GGAT	2	8	68380	68387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_003911	G	7	7	68399	68405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_003911	GGT	2	6	68414	68419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_003911	CCCA	2	8	68424	68431	25 %	0 %	0 %	75 %	56694993
1510	NC_003911	GGC	2	6	68446	68451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694993
1511	NC_003911	GCT	2	6	68471	68476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694993
1512	NC_003911	CCGA	2	8	68493	68500	25 %	0 %	25 %	50 %	56694993
1513	NC_003911	CGG	3	9	68503	68511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694993
1514	NC_003911	GTC	2	6	68522	68527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694993
1515	NC_003911	GGGCAG	2	12	68573	68584	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	56694993
1516	NC_003911	GGC	2	6	68585	68590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694993
1517	NC_003911	GATCAC	2	12	68642	68653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56694993
1518	NC_003911	CTTG	2	8	68683	68690	0 %	50 %	25 %	25 %	56694993
1519	NC_003911	CAC	2	6	68699	68704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694993
1520	NC_003911	GCC	2	6	68722	68727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694993
1521	NC_003911	GCG	2	6	68779	68784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694993
1522	NC_003911	CCGCC	2	10	68788	68797	0 %	0 %	20 %	80 %	56694993
1523	NC_003911	TCGGCC	2	12	68850	68861	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56694993
1524	NC_003911	CAGCCG	2	12	68867	68878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56694993
1525	NC_003911	GCGA	2	8	68913	68920	25 %	0 %	50 %	25 %	56694993
1526	NC_003911	CCGCG	2	10	69082	69091	0 %	0 %	40 %	60 %	56694993
1527	NC_003911	CG	4	8	69088	69095	0 %	0 %	50 %	50 %	56694993
1528	NC_003911	CG	3	6	69115	69120	0 %	0 %	50 %	50 %	56694993
1529	NC_003911	C	6	6	69141	69146	0 %	0 %	0 %	100 %	56694993
1530	NC_003911	CCG	2	6	69175	69180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694993
1531	NC_003911	GCG	3	9	69192	69200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694993
1532	NC_003911	GC	3	6	69217	69222	0 %	0 %	50 %	50 %	56694993
1533	NC_003911	CCT	2	6	69249	69254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56694994
1534	NC_003911	ATG	2	6	69269	69274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694994
1535	NC_003911	ATC	2	6	69329	69334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694994
1536	NC_003911	GGGC	2	8	69382	69389	0 %	0 %	75 %	25 %	56694994
1537	NC_003911	TGA	2	6	69489	69494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694994
1538	NC_003911	GGT	2	6	69550	69555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694994
1539	NC_003911	CGC	2	6	69672	69677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694994
1540	NC_003911	CCG	2	6	69740	69745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694994
1541	NC_003911	TCA	2	6	69774	69779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694994
1542	NC_003911	AC	3	6	69783	69788	50 %	0 %	0 %	50 %	56694994
1543	NC_003911	GCA	2	6	69792	69797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694994
1544	NC_003911	GCC	2	6	69862	69867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694994
1545	NC_003911	GGT	2	6	69934	69939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694994
1546	NC_003911	GACG	2	8	70009	70016	25 %	0 %	50 %	25 %	56694994
1547	NC_003911	GCC	2	6	70048	70053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694994
1548	NC_003911	GCC	2	6	70060	70065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694994
1549	NC_003911	GCA	2	6	70068	70073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694994
1550	NC_003911	CGG	2	6	70168	70173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694994
1551	NC_003911	GC	3	6	70190	70195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_003911	TA	3	6	70227	70232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_003911	GCC	2	6	70325	70330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694995
1554	NC_003911	TGG	2	6	70334	70339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694995
1555	NC_003911	GGT	2	6	70528	70533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694995
1556	NC_003911	GC	3	6	70568	70573	0 %	0 %	50 %	50 %	56694995
1557	NC_003911	CAC	2	6	70615	70620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694995
1558	NC_003911	GGCG	2	8	70639	70646	0 %	0 %	75 %	25 %	56694995
1559	NC_003911	CGT	2	6	70657	70662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694995
1560	NC_003911	GGT	2	6	70675	70680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694995
1561	NC_003911	CTG	2	6	70727	70732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694995
1562	NC_003911	CGGG	2	8	70737	70744	0 %	0 %	75 %	25 %	56694995
1563	NC_003911	GGT	2	6	70810	70815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694995
1564	NC_003911	GCTG	2	8	70821	70828	0 %	25 %	50 %	25 %	56694995
1565	NC_003911	CG	3	6	70830	70835	0 %	0 %	50 %	50 %	56694995
1566	NC_003911	TCA	2	6	70857	70862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694995
1567	NC_003911	GTT	2	6	70873	70878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694995
1568	NC_003911	CTG	2	6	70883	70888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694995
1569	NC_003911	GGAA	2	8	71041	71048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_003911	GCA	2	6	71137	71142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694996
1571	NC_003911	AGCC	2	8	71150	71157	25 %	0 %	25 %	50 %	56694996
1572	NC_003911	ATCA	2	8	71192	71199	50 %	25 %	0 %	25 %	56694996
1573	NC_003911	GCG	2	6	71200	71205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694996
1574	NC_003911	ATC	2	6	71208	71213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694996
1575	NC_003911	CG	3	6	71227	71232	0 %	0 %	50 %	50 %	56694996
1576	NC_003911	CGG	2	6	71242	71247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694996
1577	NC_003911	CCA	2	6	71257	71262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694996
1578	NC_003911	CGC	2	6	71344	71349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694996
1579	NC_003911	GGT	2	6	71410	71415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694996
1580	NC_003911	GCA	2	6	71452	71457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694996
1581	NC_003911	CTG	2	6	71488	71493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694996
1582	NC_003911	CAGGGT	2	12	71553	71564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56694997
1583	NC_003911	ATC	2	6	71627	71632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694997
1584	NC_003911	CTGC	2	8	71661	71668	0 %	25 %	25 %	50 %	56694997
1585	NC_003911	GCG	2	6	71720	71725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694997
1586	NC_003911	TGGG	2	8	71744	71751	0 %	25 %	75 %	0 %	56694997
1587	NC_003911	CAG	2	6	71778	71783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694997
1588	NC_003911	CG	4	8	71795	71802	0 %	0 %	50 %	50 %	56694997
1589	NC_003911	AGC	2	6	71808	71813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694997
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1591	NC_003911	C	6	6	72068	72073	0 %	0 %	0 %	100 %	56694997
1592	NC_003911	CGAG	2	8	72136	72143	25 %	0 %	50 %	25 %	56694997
1593	NC_003911	CAG	2	6	72149	72154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694997
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1595	NC_003911	TGC	2	6	72216	72221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694997
1596	NC_003911	GTG	2	6	72240	72245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694997
1597	NC_003911	GCC	2	6	72342	72347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694997
1598	NC_003911	GTC	2	6	72350	72355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694997
1599	NC_003911	CGA	2	6	72356	72361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694997
1600	NC_003911	GCA	2	6	72370	72375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694997
1601	NC_003911	TCG	2	6	72440	72445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694998
1602	NC_003911	GCC	2	6	72448	72453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694998
1603	NC_003911	GCG	2	6	72490	72495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694998
1604	NC_003911	CCCG	2	8	72496	72503	0 %	0 %	25 %	75 %	56694998
1605	NC_003911	CG	3	6	72502	72507	0 %	0 %	50 %	50 %	56694998
1606	NC_003911	ATC	2	6	72512	72517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694998
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1608	NC_003911	GCC	2	6	72817	72822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694999
1609	NC_003911	TCA	2	6	72839	72844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694999
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1611	NC_003911	CAG	3	9	72855	72863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694999
1612	NC_003911	GC	3	6	72867	72872	0 %	0 %	50 %	50 %	56694999
1613	NC_003911	CAG	2	6	73032	73037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694999
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1615	NC_003911	CG	3	6	73128	73133	0 %	0 %	50 %	50 %	56694999
1616	NC_003911	GCCGG	2	10	73149	73158	0 %	0 %	60 %	40 %	56694999
1617	NC_003911	GTCG	2	8	73169	73176	0 %	25 %	50 %	25 %	56694999
1618	NC_003911	GCCC	2	8	73207	73214	0 %	0 %	25 %	75 %	56694999
1619	NC_003911	AGC	2	6	73222	73227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694999
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1629	NC_003911	CAC	2	6	73579	73584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695000
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