MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_003911	CCG	2	6	525375	525380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695443
11502	NC_003911	CG	3	6	525396	525401	0 %	0 %	50 %	50 %	56695443
11503	NC_003911	CAG	2	6	525482	525487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695443
11504	NC_003911	GTC	2	6	525494	525499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695443
11505	NC_003911	CAC	2	6	525542	525547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695443
11506	NC_003911	GACAG	2	10	525558	525567	40 %	0 %	40 %	20 %	56695443
11507	NC_003911	GAT	2	6	525604	525609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695444
11508	NC_003911	CGA	2	6	525643	525648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695444
11509	NC_003911	GGC	2	6	525670	525675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695444
11510	NC_003911	TGC	2	6	525691	525696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695444
11511	NC_003911	GC	3	6	525695	525700	0 %	0 %	50 %	50 %	56695444
11512	NC_003911	CGG	2	6	525726	525731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695444
11513	NC_003911	AGC	2	6	525788	525793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695444
11514	NC_003911	GC	3	6	525829	525834	0 %	0 %	50 %	50 %	56695444
11515	NC_003911	GGCGC	2	10	525850	525859	0 %	0 %	60 %	40 %	56695444
11516	NC_003911	GAC	2	6	525867	525872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695444
11517	NC_003911	CAG	2	6	525889	525894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695444
11518	NC_003911	GCG	2	6	525921	525926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695444
11519	NC_003911	GAA	2	6	525982	525987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695444
11520	NC_003911	TGCG	2	8	525998	526005	0 %	25 %	50 %	25 %	56695444
11521	NC_003911	CG	4	8	526021	526028	0 %	0 %	50 %	50 %	56695444
11522	NC_003911	CGGC	2	8	526085	526092	0 %	0 %	50 %	50 %	56695444
11523	NC_003911	CGG	2	6	526113	526118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695444
11524	NC_003911	G	6	6	526117	526122	0 %	0 %	100 %	0 %	56695444
11525	NC_003911	CCA	2	6	526137	526142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695444
11526	NC_003911	CGG	2	6	526191	526196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695444
11527	NC_003911	AGGGC	2	10	526227	526236	20 %	0 %	60 %	20 %	56695444
11528	NC_003911	TCG	2	6	526255	526260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695445
11529	NC_003911	GCC	2	6	526275	526280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695445
11530	NC_003911	GC	3	6	526331	526336	0 %	0 %	50 %	50 %	56695445
11531	NC_003911	TGG	3	9	526373	526381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695445
11532	NC_003911	GCG	2	6	526384	526389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695445
11533	NC_003911	CGGT	2	8	526393	526400	0 %	25 %	50 %	25 %	56695445
11534	NC_003911	ACC	2	6	526420	526425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695445
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11536	NC_003911	CAGCG	2	10	526504	526513	20 %	0 %	40 %	40 %	56695445
11537	NC_003911	GAT	2	6	526620	526625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695445
11538	NC_003911	GCC	2	6	526946	526951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695445
11539	NC_003911	ATG	3	9	527055	527063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695446
11540	NC_003911	CTG	2	6	527066	527071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11541	NC_003911	GTT	2	6	527087	527092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695446
11542	NC_003911	ACC	2	6	527106	527111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695446
11543	NC_003911	CATGAA	2	12	527135	527146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56695446
11544	NC_003911	ATC	2	6	527169	527174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695446
11545	NC_003911	GGGTC	2	10	527179	527188	0 %	20 %	60 %	20 %	56695446
11546	NC_003911	AGC	2	6	527238	527243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695446
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11548	NC_003911	GAA	2	6	527312	527317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695446
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11550	NC_003911	CGG	2	6	527458	527463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695446
11551	NC_003911	CTT	2	6	527480	527485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695446
11552	NC_003911	CAT	2	6	527495	527500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695446
11553	NC_003911	CTG	2	6	527504	527509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11554	NC_003911	TCT	2	6	527512	527517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695446
11555	NC_003911	GTC	2	6	527522	527527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11556	NC_003911	CGG	2	6	527530	527535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695446
11557	NC_003911	TGA	2	6	527626	527631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695446
11558	NC_003911	GAT	2	6	527645	527650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695446
11559	NC_003911	GCA	2	6	527689	527694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11560	NC_003911	AGA	2	6	527698	527703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695446
11561	NC_003911	GAA	3	9	527717	527725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695446
11562	NC_003911	CTG	2	6	527768	527773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11563	NC_003911	GGT	2	6	527819	527824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695446
11564	NC_003911	GCA	2	6	527863	527868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11565	NC_003911	GCC	2	6	527910	527915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695446
11566	NC_003911	GC	3	6	528016	528021	0 %	0 %	50 %	50 %	56695446
11567	NC_003911	TCAT	2	8	528084	528091	25 %	50 %	0 %	25 %	56695446
11568	NC_003911	CGA	2	6	528094	528099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695446
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11572	NC_003911	CGAC	2	8	528217	528224	25 %	0 %	25 %	50 %	56695446
11573	NC_003911	GCG	2	6	528266	528271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695446
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11576	NC_003911	TCG	2	6	528474	528479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11577	NC_003911	TCG	2	6	528510	528515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11578	NC_003911	GCC	2	6	528521	528526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695446
11579	NC_003911	CAG	2	6	528527	528532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695446
11580	NC_003911	GCG	2	6	528553	528558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695446
11581	NC_003911	CGG	3	9	528643	528651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695446
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11584	NC_003911	CGG	3	9	528716	528724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695446
11585	NC_003911	ACCAG	2	10	528736	528745	40 %	0 %	20 %	40 %	56695446
11586	NC_003911	GTG	2	6	528975	528980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695447
11587	NC_003911	TCCAG	2	10	528986	528995	20 %	20 %	20 %	40 %	56695447
11588	NC_003911	TTCCAG	2	12	529107	529118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56695447
11589	NC_003911	GGC	2	6	529140	529145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695447
11590	NC_003911	GCT	3	9	529154	529162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695447
11591	NC_003911	TCA	2	6	529181	529186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695447
11592	NC_003911	GCG	2	6	529224	529229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695447
11593	NC_003911	CCGGT	2	10	529371	529380	0 %	20 %	40 %	40 %	56695447
11594	NC_003911	CCG	2	6	529505	529510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695447
11595	NC_003911	GGCC	2	8	529553	529560	0 %	0 %	50 %	50 %	56695447
11596	NC_003911	AAAT	2	8	529578	529585	75 %	25 %	0 %	0 %	56695447
11597	NC_003911	CAG	2	6	529593	529598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695447
11598	NC_003911	CGGGT	2	10	529603	529612	0 %	20 %	60 %	20 %	56695447
11599	NC_003911	GC	3	6	529620	529625	0 %	0 %	50 %	50 %	56695447
11600	NC_003911	GCC	2	6	529708	529713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695447
11601	NC_003911	GGC	2	6	529824	529829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695447
11602	NC_003911	GCT	2	6	529848	529853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695447
11603	NC_003911	GCG	2	6	529863	529868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695447
11604	NC_003911	CGAG	2	8	529916	529923	25 %	0 %	50 %	25 %	56695447
11605	NC_003911	CG	3	6	530032	530037	0 %	0 %	50 %	50 %	56695447
11606	NC_003911	TTG	2	6	530047	530052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695447
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11608	NC_003911	TGA	2	6	530116	530121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695447
11609	NC_003911	CCA	2	6	530123	530128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695447
11610	NC_003911	TCG	2	6	530140	530145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695447
11611	NC_003911	GAT	2	6	530151	530156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695447
11612	NC_003911	GCC	2	6	530185	530190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695447
11613	NC_003911	CG	3	6	530255	530260	0 %	0 %	50 %	50 %	56695447
11614	NC_003911	TGG	2	6	530266	530271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695447
11615	NC_003911	GGCAAA	2	12	530298	530309	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56695447
11616	NC_003911	CAG	2	6	530334	530339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695447
11617	NC_003911	TC	3	6	530348	530353	0 %	50 %	0 %	50 %	56695447
11618	NC_003911	CCAG	2	8	530357	530364	25 %	0 %	25 %	50 %	56695447
11619	NC_003911	CG	3	6	530498	530503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11620	NC_003911	TTG	2	6	530506	530511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_003911	GCA	2	6	530546	530551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695448
11622	NC_003911	CGG	2	6	530677	530682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695448
11623	NC_003911	TTC	2	6	530692	530697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695448
11624	NC_003911	CTG	2	6	530724	530729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695448
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11646	NC_003911	GC	3	6	531428	531433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11647	NC_003911	GGC	2	6	531494	531499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695449
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11673	NC_003911	CGG	2	6	532506	532511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11675	NC_003911	GC	3	6	532621	532626	0 %	0 %	50 %	50 %	56695450
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11679	NC_003911	CGA	2	6	532829	532834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11728	NC_003911	CGTCC	2	10	534612	534621	0 %	20 %	20 %	60 %	56695454
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11742	NC_003911	GGCCG	2	10	535180	535189	0 %	0 %	60 %	40 %	56695454
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11746	NC_003911	GCG	2	6	535291	535296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695454
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11750	NC_003911	CG	3	6	535484	535489	0 %	0 %	50 %	50 %	56695454
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11990	NC_003911	CAT	2	6	546981	546986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695464
11991	NC_003911	GGT	2	6	547029	547034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695464
11992	NC_003911	GTCGC	2	10	547038	547047	0 %	20 %	40 %	40 %	56695464
11993	NC_003911	GGGCGC	2	12	547139	547150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695464
11994	NC_003911	CCT	2	6	547166	547171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695464
11995	NC_003911	CGG	2	6	547196	547201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695464
11996	NC_003911	GC	3	6	547206	547211	0 %	0 %	50 %	50 %	56695464
11997	NC_003911	GCA	2	6	547214	547219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695464
11998	NC_003911	GC	3	6	547293	547298	0 %	0 %	50 %	50 %	56695464
11999	NC_003911	GCC	2	6	547368	547373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695464
12000	NC_003911	CAG	2	6	547377	547382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695464

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