MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003911	GCG	2	6	23777	23782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694952
502	NC_003911	TCGG	2	8	23806	23813	0 %	25 %	50 %	25 %	56694952
503	NC_003911	GGC	2	6	23857	23862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694953
504	NC_003911	CCG	2	6	23943	23948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694953
505	NC_003911	CAT	2	6	24023	24028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694953
506	NC_003911	CGG	2	6	24049	24054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694953
507	NC_003911	CGC	3	9	24085	24093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694953
508	NC_003911	TGG	2	6	24198	24203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694953
509	NC_003911	GGT	2	6	24205	24210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694953
510	NC_003911	ACT	2	6	24297	24302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694953
511	NC_003911	CGC	2	6	24314	24319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694953
512	NC_003911	GCG	2	6	24331	24336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694953
513	NC_003911	CTA	2	6	24364	24369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694953
514	NC_003911	CG	3	6	24385	24390	0 %	0 %	50 %	50 %	56694953
515	NC_003911	GCA	2	6	24418	24423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694953
516	NC_003911	TCG	2	6	24512	24517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694954
517	NC_003911	TG	3	6	24523	24528	0 %	50 %	50 %	0 %	56694954
518	NC_003911	GC	3	6	24545	24550	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
519	NC_003911	CAC	2	6	24570	24575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694954
520	NC_003911	GCC	2	6	24607	24612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694954
521	NC_003911	CAC	2	6	24693	24698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694954
522	NC_003911	CGC	2	6	24703	24708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694954
523	NC_003911	GCC	2	6	24725	24730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694954
524	NC_003911	GGT	2	6	24735	24740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694954
525	NC_003911	CG	3	6	24771	24776	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
526	NC_003911	GCCCG	2	10	24805	24814	0 %	0 %	40 %	60 %	56694954
527	NC_003911	GGCGC	2	10	24858	24867	0 %	0 %	60 %	40 %	56694954
528	NC_003911	CGAC	2	8	24887	24894	25 %	0 %	25 %	50 %	56694954
529	NC_003911	GGC	2	6	24987	24992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694954
530	NC_003911	CG	3	6	25028	25033	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
531	NC_003911	CGC	2	6	25065	25070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694954
532	NC_003911	GC	3	6	25101	25106	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
533	NC_003911	GAT	2	6	25141	25146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694954
534	NC_003911	CCGAT	2	10	25190	25199	20 %	20 %	20 %	40 %	56694954
535	NC_003911	CGG	2	6	25201	25206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694954
536	NC_003911	GCT	2	6	25291	25296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694954
537	NC_003911	CCG	2	6	25304	25309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694954
538	NC_003911	GGC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694954
539	NC_003911	GC	3	6	25348	25353	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
540	NC_003911	CTT	2	6	25360	25365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56694954
541	NC_003911	GCT	2	6	25377	25382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694954
542	NC_003911	AAC	2	6	25385	25390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694954
543	NC_003911	CGCC	2	8	25406	25413	0 %	0 %	25 %	75 %	56694954
544	NC_003911	GC	3	6	25420	25425	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
545	NC_003911	GCG	2	6	25432	25437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694954
546	NC_003911	GC	3	6	25493	25498	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
547	NC_003911	GC	3	6	25516	25521	0 %	0 %	50 %	50 %	56694954
548	NC_003911	GGC	2	6	25551	25556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694954
549	NC_003911	TCAA	2	8	25586	25593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_003911	AGGTT	2	10	25621	25630	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
551	NC_003911	AGG	2	6	25646	25651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_003911	GTG	2	6	25710	25715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_003911	CGC	2	6	25723	25728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_003911	CGC	2	6	25828	25833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694955
555	NC_003911	GCT	2	6	25901	25906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
556	NC_003911	ATC	2	6	25911	25916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694955
557	NC_003911	CTA	2	6	25943	25948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694955
558	NC_003911	GTC	2	6	25959	25964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
559	NC_003911	GC	3	6	25998	26003	0 %	0 %	50 %	50 %	56694955
560	NC_003911	CTG	2	6	26040	26045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
561	NC_003911	TGC	2	6	26074	26079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
562	NC_003911	GC	4	8	26126	26133	0 %	0 %	50 %	50 %	56694955
563	NC_003911	GTCG	2	8	26153	26160	0 %	25 %	50 %	25 %	56694955
564	NC_003911	C	7	7	26212	26218	0 %	0 %	0 %	100 %	56694955
565	NC_003911	GGC	2	6	26219	26224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
566	NC_003911	GCG	2	6	26286	26291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
567	NC_003911	GGC	2	6	26303	26308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
568	NC_003911	GCT	3	9	26318	26326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
569	NC_003911	GGC	2	6	26402	26407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
570	NC_003911	GTG	2	6	26439	26444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694955
571	NC_003911	GAC	2	6	26487	26492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694955
572	NC_003911	CGC	2	6	26532	26537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694955
573	NC_003911	CAT	2	6	26567	26572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694955
574	NC_003911	GTG	2	6	26577	26582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694955
575	NC_003911	GCT	2	6	26600	26605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
576	NC_003911	TCG	2	6	26608	26613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
577	NC_003911	TGG	2	6	26668	26673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694955
578	NC_003911	TTTC	2	8	26741	26748	0 %	75 %	0 %	25 %	56694955
579	NC_003911	GTG	2	6	26760	26765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694955
580	NC_003911	GCCCA	2	10	26787	26796	20 %	0 %	20 %	60 %	56694955
581	NC_003911	TGG	2	6	26803	26808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694955
582	NC_003911	GCG	2	6	26884	26889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
583	NC_003911	CGG	2	6	26891	26896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
584	NC_003911	GCT	3	9	26984	26992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
585	NC_003911	GCA	2	6	27089	27094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694955
586	NC_003911	GTC	2	6	27142	27147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
587	NC_003911	GAT	2	6	27167	27172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694955
588	NC_003911	CGC	3	9	27173	27181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694955
589	NC_003911	GCAGG	2	10	27227	27236	20 %	0 %	60 %	20 %	56694955
590	NC_003911	ATG	2	6	27244	27249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694955
591	NC_003911	GCG	2	6	27265	27270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
592	NC_003911	GCG	2	6	27280	27285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
593	NC_003911	GAA	2	6	27323	27328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694955
594	NC_003911	GC	3	6	27361	27366	0 %	0 %	50 %	50 %	56694955
595	NC_003911	GCC	2	6	27384	27389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694955
596	NC_003911	ATG	2	6	27411	27416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694955
597	NC_003911	CTG	2	6	27528	27533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
598	NC_003911	GGGC	2	8	27539	27546	0 %	0 %	75 %	25 %	56694955
599	NC_003911	CGGG	2	8	27574	27581	0 %	0 %	75 %	25 %	56694955
600	NC_003911	CGCCCC	2	12	27648	27659	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	56694956
601	NC_003911	GCG	2	6	27693	27698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694956
602	NC_003911	TCG	2	6	27714	27719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694956
603	NC_003911	GGCA	2	8	27739	27746	25 %	0 %	50 %	25 %	56694956
604	NC_003911	GGT	2	6	27781	27786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694956
605	NC_003911	T	6	6	27818	27823	0 %	100 %	0 %	0 %	56694956
606	NC_003911	CCGG	2	8	27877	27884	0 %	0 %	50 %	50 %	56694956
607	NC_003911	CAA	2	6	27910	27915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694956
608	NC_003911	CGC	2	6	27939	27944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694956
609	NC_003911	CTT	2	6	27991	27996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56694956
610	NC_003911	TGA	2	6	27997	28002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694956
611	NC_003911	GC	3	6	28047	28052	0 %	0 %	50 %	50 %	56694956
612	NC_003911	GGT	2	6	28060	28065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694956
613	NC_003911	CTG	2	6	28187	28192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694956
614	NC_003911	CGG	2	6	28227	28232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694956
615	NC_003911	CGGG	2	8	28235	28242	0 %	0 %	75 %	25 %	56694956
616	NC_003911	GCCGAG	2	12	28316	28327	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56694956
617	NC_003911	CG	3	6	28336	28341	0 %	0 %	50 %	50 %	56694956
618	NC_003911	GGCT	2	8	28382	28389	0 %	25 %	50 %	25 %	56694956
619	NC_003911	TTC	2	6	28406	28411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56694956
620	NC_003911	CTG	2	6	28445	28450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694956
621	NC_003911	TGA	2	6	28563	28568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694956
622	NC_003911	CGG	2	6	28720	28725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694956
623	NC_003911	GGGC	2	8	28788	28795	0 %	0 %	75 %	25 %	56694956
624	NC_003911	TGC	2	6	28815	28820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694956
625	NC_003911	GCG	2	6	28897	28902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694956
626	NC_003911	GCC	2	6	28971	28976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694956
627	NC_003911	GCGA	2	8	28982	28989	25 %	0 %	50 %	25 %	56694956
628	NC_003911	CGC	3	9	29002	29010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694956
629	NC_003911	GGT	2	6	29111	29116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694956
630	NC_003911	CAGCGG	2	12	29117	29128	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56694956
631	NC_003911	GC	4	8	29138	29145	0 %	0 %	50 %	50 %	56694956
632	NC_003911	GC	3	6	29190	29195	0 %	0 %	50 %	50 %	56694956
633	NC_003911	GTG	2	6	29309	29314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694956
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746	NC_003911	GCA	2	6	33880	33885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694962
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753	NC_003911	GCG	2	6	34042	34047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694962
754	NC_003911	CGG	2	6	34075	34080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694962
755	NC_003911	CGCGG	2	10	34084	34093	0 %	0 %	60 %	40 %	56694962
756	NC_003911	CAC	2	6	34166	34171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694962
757	NC_003911	GTT	2	6	34219	34224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694962
758	NC_003911	CG	3	6	34230	34235	0 %	0 %	50 %	50 %	56694962
759	NC_003911	GAAG	2	8	34339	34346	50 %	0 %	50 %	0 %	56694962
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761	NC_003911	GAT	2	6	34505	34510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694962
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889	NC_003911	AACGG	2	10	40427	40436	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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