MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 3586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003295	GCCCG	2	10	433	442	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_003295	GCCGT	2	10	565	574	0 %	20 %	40 %	40 %	17544720
3	NC_003295	TTTGC	2	10	745	754	0 %	60 %	20 %	20 %	17544721
4	NC_003295	TGCCC	2	10	1064	1073	0 %	20 %	20 %	60 %	17544721
5	NC_003295	CGCTG	2	10	1331	1340	0 %	20 %	40 %	40 %	17544722
6	NC_003295	ACCAC	2	10	1855	1864	40 %	0 %	0 %	60 %	17544723
7	NC_003295	GCGCG	2	10	2795	2804	0 %	0 %	60 %	40 %	17544723
8	NC_003295	GGCTG	2	10	2809	2818	0 %	20 %	60 %	20 %	17544723
9	NC_003295	CGCGC	2	10	3622	3631	0 %	0 %	40 %	60 %	17544724
10	NC_003295	GCGCT	2	10	4482	4491	0 %	20 %	40 %	40 %	17544724
11	NC_003295	GGCTG	2	10	5260	5269	0 %	20 %	60 %	20 %	17544726
12	NC_003295	TTTCG	2	10	5478	5487	0 %	60 %	20 %	20 %	17544726
13	NC_003295	CGTCG	2	10	7172	7181	0 %	20 %	40 %	40 %	17544728
14	NC_003295	CTTGC	2	10	8734	8743	0 %	40 %	20 %	40 %	17544729
15	NC_003295	ATCGC	2	10	9617	9626	20 %	20 %	20 %	40 %	17544729
16	NC_003295	GCCAC	2	10	11680	11689	20 %	0 %	20 %	60 %	17544730
17	NC_003295	CCGCG	2	10	11860	11869	0 %	0 %	40 %	60 %	17544730
18	NC_003295	GCGTG	2	10	13423	13432	0 %	20 %	60 %	20 %	17544731
19	NC_003295	TGATC	2	10	15026	15035	20 %	40 %	20 %	20 %	17544733
20	NC_003295	GGCCG	2	10	15758	15767	0 %	0 %	60 %	40 %	17544733
21	NC_003295	CCCGT	2	10	16144	16153	0 %	20 %	20 %	60 %	17544733
22	NC_003295	GCCTG	2	10	18871	18880	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_003295	GCCGT	2	10	19431	19440	0 %	20 %	40 %	40 %	17544736
24	NC_003295	CGTGC	2	10	19471	19480	0 %	20 %	40 %	40 %	17544736
25	NC_003295	CGTGC	2	10	21993	22002	0 %	20 %	40 %	40 %	17544737
26	NC_003295	GGCGA	2	10	22365	22374	20 %	0 %	60 %	20 %	17544737
27	NC_003295	CTGAG	2	10	22481	22490	20 %	20 %	40 %	20 %	17544737
28	NC_003295	ACGCC	2	10	24699	24708	20 %	0 %	20 %	60 %	17544740
29	NC_003295	CGTGG	2	10	24910	24919	0 %	20 %	60 %	20 %	17544740
30	NC_003295	CCGGG	2	10	27025	27034	0 %	0 %	60 %	40 %	17544741
31	NC_003295	GGCCA	2	10	27757	27766	20 %	0 %	40 %	40 %	17544741
32	NC_003295	CGCGG	2	10	28878	28887	0 %	0 %	60 %	40 %	17544743
33	NC_003295	GCCCT	2	10	30506	30515	0 %	20 %	20 %	60 %	17544745
34	NC_003295	GCCCG	2	10	31980	31989	0 %	0 %	40 %	60 %	17544746
35	NC_003295	GCCGG	2	10	32898	32907	0 %	0 %	60 %	40 %	17544747
36	NC_003295	GGCGC	2	10	33885	33894	0 %	0 %	60 %	40 %	17544747
37	NC_003295	GCCGC	2	10	35785	35794	0 %	0 %	40 %	60 %	17544749
38	NC_003295	GCTCG	2	10	36348	36357	0 %	20 %	40 %	40 %	17544749
39	NC_003295	GCCGG	2	10	37964	37973	0 %	0 %	60 %	40 %	17544751
40	NC_003295	CGGCG	2	10	37988	37997	0 %	0 %	60 %	40 %	17544751
41	NC_003295	GTGCA	2	10	38051	38060	20 %	20 %	40 %	20 %	17544751
42	NC_003295	CGGGT	2	10	38234	38243	0 %	20 %	60 %	20 %	17544751
43	NC_003295	CTGCG	2	10	40768	40777	0 %	20 %	40 %	40 %	17544755
44	NC_003295	GATCG	2	10	41718	41727	20 %	20 %	40 %	20 %	17544757
45	NC_003295	GCCGC	2	10	42659	42668	0 %	0 %	40 %	60 %	17544758
46	NC_003295	TCGAT	2	10	43632	43641	20 %	40 %	20 %	20 %	17544759
47	NC_003295	GCCGC	2	10	47418	47427	0 %	0 %	40 %	60 %	17544762
48	NC_003295	TCGGC	2	10	48210	48219	0 %	20 %	40 %	40 %	17544763
49	NC_003295	GGCCG	2	10	48963	48972	0 %	0 %	60 %	40 %	17544763
50	NC_003295	TCGAT	2	10	50287	50296	20 %	40 %	20 %	20 %	17544764
51	NC_003295	GCGCC	2	10	51306	51315	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_003295	ATCGA	2	10	51380	51389	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_003295	CAGGC	2	10	51499	51508	20 %	0 %	40 %	40 %	17544766
54	NC_003295	GCGCT	2	10	52140	52149	0 %	20 %	40 %	40 %	17544766
55	NC_003295	GCGCC	2	10	53498	53507	0 %	0 %	40 %	60 %	17544768
56	NC_003295	TGCGC	2	10	54893	54902	0 %	20 %	40 %	40 %	17544769
57	NC_003295	GAGCA	2	10	55027	55036	40 %	0 %	40 %	20 %	17544769
58	NC_003295	GCGCG	2	10	55473	55482	0 %	0 %	60 %	40 %	17544769
59	NC_003295	GCCCT	2	10	55483	55492	0 %	20 %	20 %	60 %	17544769
60	NC_003295	CGCGG	2	10	57158	57167	0 %	0 %	60 %	40 %	17544770
61	NC_003295	TGGGA	2	10	57322	57331	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003295	CAGCG	2	10	58377	58386	20 %	0 %	40 %	40 %	17544772
63	NC_003295	CGGCG	2	10	58482	58491	0 %	0 %	60 %	40 %	17544772
64	NC_003295	GCGCC	2	10	60442	60451	0 %	0 %	40 %	60 %	17544773
65	NC_003295	GCGCG	2	10	60738	60747	0 %	0 %	60 %	40 %	17544774
66	NC_003295	GTGCC	2	10	60752	60761	0 %	20 %	40 %	40 %	17544774
67	NC_003295	CAGCG	2	10	61096	61105	20 %	0 %	40 %	40 %	17544774
68	NC_003295	CGCGG	2	10	61693	61702	0 %	0 %	60 %	40 %	17544775
69	NC_003295	CGGCG	2	10	63765	63774	0 %	0 %	60 %	40 %	17544777
70	NC_003295	CGTGC	2	10	64818	64827	0 %	20 %	40 %	40 %	17544778
71	NC_003295	CACCC	2	10	65644	65653	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_003295	GCCGC	2	10	66905	66914	0 %	0 %	40 %	60 %	17544780
73	NC_003295	CGACC	2	10	70394	70403	20 %	0 %	20 %	60 %	17544782
74	NC_003295	CCGGC	2	10	71355	71364	0 %	0 %	40 %	60 %	17544783
75	NC_003295	CCGGC	2	10	74054	74063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_003295	TGGGC	2	10	74438	74447	0 %	20 %	60 %	20 %	17544785
77	NC_003295	TTTGC	2	10	75330	75339	0 %	60 %	20 %	20 %	17544785
78	NC_003295	CCGGG	2	10	77952	77961	0 %	0 %	60 %	40 %	17544787
79	NC_003295	AGGCC	2	10	78697	78706	20 %	0 %	40 %	40 %	17544788
80	NC_003295	GTCGT	2	10	78747	78756	0 %	40 %	40 %	20 %	17544788
81	NC_003295	CCGCG	2	10	78883	78892	0 %	0 %	40 %	60 %	17544788
82	NC_003295	CGGCG	2	10	82562	82571	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_003295	GCGCC	2	10	82980	82989	0 %	0 %	40 %	60 %	17544791
84	NC_003295	GCTTC	2	10	83559	83568	0 %	40 %	20 %	40 %	17544791
85	NC_003295	CGGCG	2	10	83855	83864	0 %	0 %	60 %	40 %	17544792
86	NC_003295	AGCCC	2	10	84657	84666	20 %	0 %	20 %	60 %	17544793
87	NC_003295	GCGCC	2	10	86096	86105	0 %	0 %	40 %	60 %	17544794
88	NC_003295	CGTGC	2	10	86301	86310	0 %	20 %	40 %	40 %	17544794
89	NC_003295	GGCGC	2	10	89309	89318	0 %	0 %	60 %	40 %	17544796
90	NC_003295	CATGT	2	10	89623	89632	20 %	40 %	20 %	20 %	17544796
91	NC_003295	ACGGG	2	10	89708	89717	20 %	0 %	60 %	20 %	17544796
92	NC_003295	GCCAC	2	10	90191	90200	20 %	0 %	20 %	60 %	17544797
93	NC_003295	CCGGG	2	10	92981	92990	0 %	0 %	60 %	40 %	17544798
94	NC_003295	GGCGC	2	10	94308	94317	0 %	0 %	60 %	40 %	17544800
95	NC_003295	CCGAT	2	10	94700	94709	20 %	20 %	20 %	40 %	17544800
96	NC_003295	TGCGC	2	10	96141	96150	0 %	20 %	40 %	40 %	17544801
97	NC_003295	CGGCG	2	10	96584	96593	0 %	0 %	60 %	40 %	17544802
98	NC_003295	GCGCC	2	10	96611	96620	0 %	0 %	40 %	60 %	17544802
99	NC_003295	CGCTG	2	10	96788	96797	0 %	20 %	40 %	40 %	17544802
100	NC_003295	TCGGC	2	10	97157	97166	0 %	20 %	40 %	40 %	17544802
101	NC_003295	ATCCC	2	10	97332	97341	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_003295	GCGAG	2	10	99152	99161	20 %	0 %	60 %	20 %	161621735
103	NC_003295	ACGCC	2	10	100429	100438	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_003295	TCGGC	2	10	100576	100585	0 %	20 %	40 %	40 %	17544806
105	NC_003295	GTCCA	2	10	100968	100977	20 %	20 %	20 %	40 %	17544806
106	NC_003295	CGCGG	2	10	101110	101119	0 %	0 %	60 %	40 %	17544806
107	NC_003295	GCGCG	2	10	101158	101167	0 %	0 %	60 %	40 %	17544806
108	NC_003295	ATCGA	2	10	102585	102594	40 %	20 %	20 %	20 %	17544807
109	NC_003295	GCCGC	2	10	102949	102958	0 %	0 %	40 %	60 %	17544807
110	NC_003295	CGCGC	2	10	103673	103682	0 %	0 %	40 %	60 %	17544808
111	NC_003295	TGCCC	2	10	103776	103785	0 %	20 %	20 %	60 %	17544808
112	NC_003295	TATCG	2	10	104047	104056	20 %	40 %	20 %	20 %	17544808
113	NC_003295	GCCCC	2	10	104665	104674	0 %	0 %	20 %	80 %	17544809
114	NC_003295	GGCGA	2	10	107972	107981	20 %	0 %	60 %	20 %	17544813
115	NC_003295	GAGCC	2	10	109896	109905	20 %	0 %	40 %	40 %	17544816
116	NC_003295	ATCCG	2	10	112013	112022	20 %	20 %	20 %	40 %	17544818
117	NC_003295	CCGCG	2	10	112298	112307	0 %	0 %	40 %	60 %	17544818
118	NC_003295	CCGAC	2	10	112788	112797	20 %	0 %	20 %	60 %	17544819
119	NC_003295	GCGCC	2	10	113630	113639	0 %	0 %	40 %	60 %	17544819
120	NC_003295	GGGCT	2	10	118580	118589	0 %	20 %	60 %	20 %	17544822
121	NC_003295	TGCAT	2	10	118761	118770	20 %	40 %	20 %	20 %	17544822
122	NC_003295	ATCGT	2	10	119583	119592	20 %	40 %	20 %	20 %	17544823
123	NC_003295	TGGAC	2	10	123112	123121	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_003295	GCAGG	2	10	123757	123766	20 %	0 %	60 %	20 %	17544825
125	NC_003295	AAGGA	2	10	123918	123927	60 %	0 %	40 %	0 %	17544825
126	NC_003295	GGTGC	2	10	123997	124006	0 %	20 %	60 %	20 %	17544825
127	NC_003295	AAAGA	2	10	124232	124241	80 %	0 %	20 %	0 %	17544825
128	NC_003295	CGTGC	2	10	125219	125228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_003295	CAGCG	2	10	126131	126140	20 %	0 %	40 %	40 %	17544827
130	NC_003295	GCGTG	2	10	127203	127212	0 %	20 %	60 %	20 %	17544828
131	NC_003295	GGCCG	2	10	127678	127687	0 %	0 %	60 %	40 %	17544828
132	NC_003295	GGGCT	2	10	128491	128500	0 %	20 %	60 %	20 %	17544829
133	NC_003295	TGCAT	2	10	128672	128681	20 %	40 %	20 %	20 %	17544829
134	NC_003295	CGTGC	2	10	129053	129062	0 %	20 %	40 %	40 %	17544830
135	NC_003295	CCATG	2	10	130418	130427	20 %	20 %	20 %	40 %	17544832
136	NC_003295	GGCGC	2	10	131862	131871	0 %	0 %	60 %	40 %	17544832
137	NC_003295	CTGAC	2	10	132538	132547	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_003295	GCGCG	2	10	133222	133231	0 %	0 %	60 %	40 %	17544833
139	NC_003295	CGAAG	2	10	134391	134400	40 %	0 %	40 %	20 %	17544834
140	NC_003295	CGGCA	2	10	135447	135456	20 %	0 %	40 %	40 %	17544834
141	NC_003295	TGCCG	2	10	137028	137037	0 %	20 %	40 %	40 %	17544834
142	NC_003295	GCCGT	2	10	138049	138058	0 %	20 %	40 %	40 %	17544834
143	NC_003295	GGGCG	2	10	138171	138180	0 %	0 %	80 %	20 %	17544834
144	NC_003295	CGATG	2	10	139184	139193	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_003295	GACGC	2	10	140932	140941	20 %	0 %	40 %	40 %	17544837
146	NC_003295	CGGCC	2	10	140979	140988	0 %	0 %	40 %	60 %	17544837
147	NC_003295	GCCGT	2	10	141108	141117	0 %	20 %	40 %	40 %	17544838
148	NC_003295	CCGGC	2	10	141496	141505	0 %	0 %	40 %	60 %	17544839
149	NC_003295	CGCTG	2	10	141985	141994	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_003295	GCGCC	2	10	142522	142531	0 %	0 %	40 %	60 %	17544840
151	NC_003295	GGCGA	2	10	143269	143278	20 %	0 %	60 %	20 %	17544840
152	NC_003295	CGGCG	2	10	143540	143549	0 %	0 %	60 %	40 %	17544840
153	NC_003295	GTTGT	2	10	143870	143879	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003295	CGCGC	2	10	145006	145015	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
155	NC_003295	GGCCG	2	10	145644	145653	0 %	0 %	60 %	40 %	17544842
156	NC_003295	CGGCC	2	10	146620	146629	0 %	0 %	40 %	60 %	17544842
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161	NC_003295	GGCGC	2	10	151677	151686	0 %	0 %	60 %	40 %	17544849
162	NC_003295	CGCAG	2	10	152199	152208	20 %	0 %	40 %	40 %	17544849
163	NC_003295	GCCCG	2	10	154793	154802	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
164	NC_003295	CAGCG	2	10	154814	154823	20 %	0 %	40 %	40 %	17544851
165	NC_003295	GCGCG	2	10	155490	155499	0 %	0 %	60 %	40 %	17544851
166	NC_003295	CGGCG	2	10	155858	155867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
167	NC_003295	GCCGC	2	10	156788	156797	0 %	0 %	40 %	60 %	17544853
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169	NC_003295	CGCCC	2	10	158631	158640	0 %	0 %	20 %	80 %	17544854
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176	NC_003295	GTGCA	2	10	164679	164688	20 %	20 %	40 %	20 %	17544861
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181	NC_003295	GCCGT	2	10	170776	170785	0 %	20 %	40 %	40 %	17544869
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194	NC_003295	CGGCC	2	10	178264	178273	0 %	0 %	40 %	60 %	17544877
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197	NC_003295	TGGGA	2	10	179893	179902	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
198	NC_003295	AAATC	2	10	179951	179960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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241	NC_003295	GCTCT	2	10	233606	233615	0 %	40 %	20 %	40 %	17544929
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243	NC_003295	GGATT	2	10	234734	234743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
244	NC_003295	CTGGT	2	10	235016	235025	0 %	40 %	40 %	20 %	17544931
245	NC_003295	CGCGC	2	10	237589	237598	0 %	0 %	40 %	60 %	17544934
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249	NC_003295	GCCGC	2	10	241820	241829	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
250	NC_003295	GGCGA	2	10	244293	244302	20 %	0 %	60 %	20 %	17544941
251	NC_003295	CGCGC	2	10	244822	244831	0 %	0 %	40 %	60 %	17544941
252	NC_003295	GCCGG	2	10	245098	245107	0 %	0 %	60 %	40 %	17544941
253	NC_003295	CGATG	2	10	246545	246554	20 %	20 %	40 %	20 %	17544943
254	NC_003295	TGGGC	2	10	246862	246871	0 %	20 %	60 %	20 %	17544943
255	NC_003295	CGAAG	2	10	247393	247402	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
256	NC_003295	GCGCG	2	10	248919	248928	0 %	0 %	60 %	40 %	17544945
257	NC_003295	GCGCT	3	15	249170	249184	0 %	20 %	40 %	40 %	17544945
258	NC_003295	GCCGG	2	10	249451	249460	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
259	NC_003295	AGGGC	2	10	249504	249513	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_003295	AAGGA	2	10	254721	254730	60 %	0 %	40 %	0 %	17544951
261	NC_003295	TGCGG	2	10	255582	255591	0 %	20 %	60 %	20 %	17544952
262	NC_003295	GGGGC	2	10	257137	257146	0 %	0 %	80 %	20 %	17544953
263	NC_003295	CGCGG	2	10	258029	258038	0 %	0 %	60 %	40 %	17544954
264	NC_003295	CGGGG	2	10	258120	258129	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
265	NC_003295	TGGCG	2	10	258183	258192	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
266	NC_003295	GGCAG	2	10	258553	258562	20 %	0 %	60 %	20 %	17544955
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268	NC_003295	GACCC	2	10	261474	261483	20 %	0 %	20 %	60 %	17544956
269	NC_003295	AGCCC	2	10	263070	263079	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
270	NC_003295	GCCGC	2	10	263599	263608	0 %	0 %	40 %	60 %	17544957
271	NC_003295	GCGCG	2	10	265249	265258	0 %	0 %	60 %	40 %	17544958
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