MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 102168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003295	GTT	3	9	117849	117857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17544821
3502	NC_003295	GCC	2	6	117882	117887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544821
3503	NC_003295	GTT	2	6	117932	117937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17544821
3504	NC_003295	CTGG	2	8	118049	118056	0 %	25 %	50 %	25 %	17544822
3505	NC_003295	CGG	2	6	118080	118085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544822
3506	NC_003295	TGCG	2	8	118095	118102	0 %	25 %	50 %	25 %	17544822
3507	NC_003295	GGC	3	9	118114	118122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544822
3508	NC_003295	CG	3	6	118167	118172	0 %	0 %	50 %	50 %	17544822
3509	NC_003295	GC	3	6	118189	118194	0 %	0 %	50 %	50 %	17544822
3510	NC_003295	GCG	2	6	118207	118212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544822
3511	NC_003295	ACG	2	6	118227	118232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3512	NC_003295	CGA	3	9	118261	118269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3513	NC_003295	TCA	2	6	118284	118289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544822
3514	NC_003295	GAC	2	6	118291	118296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3515	NC_003295	GC	3	6	118339	118344	0 %	0 %	50 %	50 %	17544822
3516	NC_003295	GGC	2	6	118348	118353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544822
3517	NC_003295	GTG	2	6	118475	118480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544822
3518	NC_003295	CCCG	2	8	118495	118502	0 %	0 %	25 %	75 %	17544822
3519	NC_003295	TGC	2	6	118569	118574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3520	NC_003295	GGGCT	2	10	118580	118589	0 %	20 %	60 %	20 %	17544822
3521	NC_003295	ACG	2	6	118631	118636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3522	NC_003295	CTT	2	6	118717	118722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544822
3523	NC_003295	TCGA	2	8	118727	118734	25 %	25 %	25 %	25 %	17544822
3524	NC_003295	CCG	2	6	118746	118751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544822
3525	NC_003295	TGCAT	2	10	118761	118770	20 %	40 %	20 %	20 %	17544822
3526	NC_003295	CAG	2	6	118783	118788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3527	NC_003295	TGGC	2	8	118814	118821	0 %	25 %	50 %	25 %	17544822
3528	NC_003295	CTT	2	6	118888	118893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544822
3529	NC_003295	AGA	2	6	118956	118961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544822
3530	NC_003295	TCG	2	6	118971	118976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3531	NC_003295	GACCGC	2	12	119011	119022	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17544822
3532	NC_003295	CAG	2	6	119044	119049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544822
3533	NC_003295	CGAA	2	8	119056	119063	50 %	0 %	25 %	25 %	17544822
3534	NC_003295	CGA	2	6	119104	119109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3535	NC_003295	GTC	2	6	119141	119146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3536	NC_003295	CGG	2	6	119149	119154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544823
3537	NC_003295	GGT	2	6	119165	119170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544823
3538	NC_003295	GGC	2	6	119176	119181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544823
3539	NC_003295	CGG	2	6	119221	119226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544823
3540	NC_003295	CAA	2	6	119249	119254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17544823
3541	NC_003295	CGG	2	6	119338	119343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544823
3542	NC_003295	TTG	2	6	119373	119378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17544823
3543	NC_003295	GTG	2	6	119436	119441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544823
3544	NC_003295	GTA	2	6	119444	119449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544823
3545	NC_003295	GTC	2	6	119465	119470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3546	NC_003295	GCC	2	6	119477	119482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544823
3547	NC_003295	ATG	2	6	119484	119489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544823
3548	NC_003295	TGA	2	6	119524	119529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544823
3549	NC_003295	GTC	2	6	119531	119536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3550	NC_003295	CCA	2	6	119544	119549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544823
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3552	NC_003295	ATCGT	2	10	119583	119592	20 %	40 %	20 %	20 %	17544823
3553	NC_003295	CGGCGT	2	12	119620	119631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17544823
3554	NC_003295	TCA	2	6	119646	119651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544823
3555	NC_003295	CCG	4	12	119652	119663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544823
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3557	NC_003295	TCCA	2	8	119748	119755	25 %	25 %	0 %	50 %	17544823
3558	NC_003295	GCC	2	6	119768	119773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544823
3559	NC_003295	GCC	2	6	119795	119800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544823
3560	NC_003295	CGC	2	6	119821	119826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544823
3561	NC_003295	GAA	2	6	119828	119833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544823
3562	NC_003295	CTG	2	6	119834	119839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3563	NC_003295	GGT	2	6	119864	119869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544823
3564	NC_003295	GAA	2	6	119885	119890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544823
3565	NC_003295	TGGG	2	8	119943	119950	0 %	25 %	75 %	0 %	17544823
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3569	NC_003295	GGA	2	6	120241	120246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544823
3570	NC_003295	GCC	2	6	120284	120289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544823
3571	NC_003295	CAG	2	6	120302	120307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3572	NC_003295	TGC	2	6	120321	120326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3573	NC_003295	CTG	2	6	120338	120343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544823
3574	NC_003295	GCA	2	6	120361	120366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544823
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3584	NC_003295	CGA	2	6	120928	120933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544823
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3589	NC_003295	GGC	2	6	121199	121204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544823
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3592	NC_003295	CTTC	2	8	121315	121322	0 %	50 %	0 %	50 %	17544823
3593	NC_003295	TCG	2	6	121458	121463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544823
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3596	NC_003295	TCCA	2	8	121557	121564	25 %	25 %	0 %	50 %	17544823
3597	NC_003295	TGT	2	6	121618	121623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17544823
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3601	NC_003295	T	6	6	121876	121881	0 %	100 %	0 %	0 %	17544823
3602	NC_003295	TCC	2	6	121961	121966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_003295	ACC	2	6	122039	122044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_003295	TAGCCA	2	12	122058	122069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_003295	AGATAA	2	12	122079	122090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_003295	GAT	2	6	122128	122133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_003295	CGAT	2	8	122145	122152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_003295	TGA	2	6	122191	122196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_003295	CG	3	6	122325	122330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_003295	ATC	2	6	122338	122343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_003295	TGG	2	6	122348	122353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_003295	GTT	2	6	122359	122364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_003295	ATTT	2	8	122494	122501	25 %	75 %	0 %	0 %	17544824
3614	NC_003295	T	8	8	122499	122506	0 %	100 %	0 %	0 %	17544824
3615	NC_003295	ATG	2	6	122537	122542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544824
3616	NC_003295	TTTG	2	8	122555	122562	0 %	75 %	25 %	0 %	17544824
3617	NC_003295	TGG	2	6	122566	122571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544824
3618	NC_003295	TTC	2	6	122606	122611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544824
3619	NC_003295	A	6	6	122730	122735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_003295	GTA	2	6	122745	122750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_003295	GCC	2	6	122881	122886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_003295	GGT	2	6	122909	122914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_003295	GC	3	6	122926	122931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_003295	GAT	2	6	122942	122947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3634	NC_003295	G	9	9	123323	123331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3864	NC_003295	CGA	2	6	131520	131525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544832
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3868	NC_003295	CGGC	2	8	131632	131639	0 %	0 %	50 %	50 %	17544832
3869	NC_003295	TGC	2	6	131719	131724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544832
3870	NC_003295	AGC	2	6	131728	131733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544832
3871	NC_003295	TGA	2	6	131810	131815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544832
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3873	NC_003295	GGCGC	2	10	131862	131871	0 %	0 %	60 %	40 %	17544832
3874	NC_003295	GC	3	6	131918	131923	0 %	0 %	50 %	50 %	17544832
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3998	NC_003295	GCGA	2	8	137065	137072	25 %	0 %	50 %	25 %	17544834
3999	NC_003295	GGT	2	6	137088	137093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544834
4000	NC_003295	GCCGGT	2	12	137124	137135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17544834

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