MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 102168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003295	GTGG	2	8	17147	17154	0 %	25 %	75 %	0 %	17544734
502	NC_003295	ATGG	2	8	17168	17175	25 %	25 %	50 %	0 %	17544734
503	NC_003295	CG	4	8	17232	17239	0 %	0 %	50 %	50 %	17544734
504	NC_003295	GCC	2	6	17250	17255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544734
505	NC_003295	CGAC	2	8	17266	17273	25 %	0 %	25 %	50 %	17544734
506	NC_003295	GCC	2	6	17307	17312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544734
507	NC_003295	GCG	2	6	17341	17346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544734
508	NC_003295	GC	3	6	17383	17388	0 %	0 %	50 %	50 %	17544734
509	NC_003295	GC	3	6	17441	17446	0 %	0 %	50 %	50 %	17544734
510	NC_003295	CG	3	6	17466	17471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_003295	GCG	2	6	17619	17624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544735
512	NC_003295	GCA	2	6	17646	17651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544735
513	NC_003295	GCC	2	6	17696	17701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544735
514	NC_003295	GGC	2	6	17709	17714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544735
515	NC_003295	CG	3	6	17826	17831	0 %	0 %	50 %	50 %	17544735
516	NC_003295	TCG	2	6	17834	17839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544735
517	NC_003295	GGAC	2	8	17853	17860	25 %	0 %	50 %	25 %	17544735
518	NC_003295	CCA	2	6	17991	17996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544735
519	NC_003295	GGC	2	6	18068	18073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544735
520	NC_003295	CTG	2	6	18097	18102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544735
521	NC_003295	GCG	2	6	18142	18147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544735
522	NC_003295	CGGC	2	8	18180	18187	0 %	0 %	50 %	50 %	17544735
523	NC_003295	ACG	3	9	18215	18223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544735
524	NC_003295	CCG	2	6	18257	18262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544735
525	NC_003295	TGA	2	6	18291	18296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544735
526	NC_003295	GTT	2	6	18415	18420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17544735
527	NC_003295	GCA	2	6	18444	18449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544735
528	NC_003295	GTC	2	6	18487	18492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544735
529	NC_003295	GCA	2	6	18537	18542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544735
530	NC_003295	A	6	6	18542	18547	100 %	0 %	0 %	0 %	17544735
531	NC_003295	GGT	2	6	18562	18567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003295	TTC	2	6	18569	18574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_003295	TCG	2	6	18582	18587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_003295	ACG	2	6	18602	18607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_003295	CGC	2	6	18619	18624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_003295	T	6	6	18666	18671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_003295	GT	3	6	18672	18677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_003295	CCG	2	6	18701	18706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_003295	CGT	2	6	18769	18774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_003295	TCC	2	6	18775	18780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_003295	GCCTG	2	10	18871	18880	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
542	NC_003295	CG	3	6	18991	18996	0 %	0 %	50 %	50 %	17544736
543	NC_003295	TGG	2	6	18999	19004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544736
544	NC_003295	AGG	2	6	19068	19073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544736
545	NC_003295	CGC	2	6	19102	19107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544736
546	NC_003295	AGC	2	6	19119	19124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544736
547	NC_003295	GGA	2	6	19189	19194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544736
548	NC_003295	CAA	2	6	19240	19245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17544736
549	NC_003295	GTG	2	6	19322	19327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544736
550	NC_003295	CAT	2	6	19414	19419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544736
551	NC_003295	GCCGT	2	10	19431	19440	0 %	20 %	40 %	40 %	17544736
552	NC_003295	ACG	2	6	19443	19448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544736
553	NC_003295	CGTGC	2	10	19471	19480	0 %	20 %	40 %	40 %	17544736
554	NC_003295	GCCGTG	2	12	19525	19536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17544736
555	NC_003295	CG	3	6	19572	19577	0 %	0 %	50 %	50 %	17544736
556	NC_003295	CGG	2	6	19603	19608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544736
557	NC_003295	GCT	2	6	19615	19620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544736
558	NC_003295	AAG	2	6	19625	19630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544736
559	NC_003295	CCA	2	6	19653	19658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544736
560	NC_003295	GCTG	2	8	19674	19681	0 %	25 %	50 %	25 %	17544736
561	NC_003295	CCG	2	6	19790	19795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544736
562	NC_003295	CAC	2	6	19819	19824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544736
563	NC_003295	CGA	2	6	19831	19836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544736
564	NC_003295	TTC	2	6	19910	19915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544736
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566	NC_003295	CGC	2	6	20043	20048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544736
567	NC_003295	TCGA	2	8	20165	20172	25 %	25 %	25 %	25 %	17544736
568	NC_003295	CGGC	2	8	20190	20197	0 %	0 %	50 %	50 %	17544736
569	NC_003295	CGG	2	6	20221	20226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544736
570	NC_003295	CCG	2	6	20227	20232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544736
571	NC_003295	ACC	2	6	20237	20242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544736
572	NC_003295	GC	3	6	20261	20266	0 %	0 %	50 %	50 %	17544736
573	NC_003295	GCC	2	6	20291	20296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544736
574	NC_003295	ACC	2	6	20312	20317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544736
575	NC_003295	GCC	3	9	20318	20326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544736
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579	NC_003295	TGC	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544736
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584	NC_003295	CGA	2	6	20581	20586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544736
585	NC_003295	CGC	2	6	20604	20609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544736
586	NC_003295	GAG	2	6	20615	20620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544736
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588	NC_003295	GCA	2	6	20692	20697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544736
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590	NC_003295	T	9	9	20850	20858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003295	GCCC	2	8	20864	20871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
592	NC_003295	T	7	7	20872	20878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_003295	A	6	6	20927	20932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_003295	ATA	2	6	21014	21019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003295	GT	3	6	21100	21105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003295	CAA	2	6	21135	21140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_003295	GAT	2	6	21141	21146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_003295	A	6	6	21155	21160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003295	ACA	2	6	21243	21248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_003295	GC	3	6	21320	21325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_003295	CGG	2	6	21376	21381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_003295	TGG	2	6	21428	21433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_003295	CGT	2	6	21453	21458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_003295	GCA	2	6	21470	21475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_003295	CGA	2	6	21479	21484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_003295	CGG	2	6	21507	21512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_003295	CCGC	2	8	21542	21549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
608	NC_003295	AAC	2	6	21560	21565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_003295	CAGA	2	8	21574	21581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_003295	GGCGCA	2	12	21749	21760	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	17544737
611	NC_003295	CTG	3	9	21789	21797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544737
612	NC_003295	TCGA	2	8	21825	21832	25 %	25 %	25 %	25 %	17544737
613	NC_003295	TGC	2	6	21835	21840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544737
614	NC_003295	GC	3	6	21856	21861	0 %	0 %	50 %	50 %	17544737
615	NC_003295	CG	4	8	21905	21912	0 %	0 %	50 %	50 %	17544737
616	NC_003295	CGA	2	6	21941	21946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544737
617	NC_003295	CGTGC	2	10	21993	22002	0 %	20 %	40 %	40 %	17544737
618	NC_003295	GCC	2	6	22006	22011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544737
619	NC_003295	CGC	2	6	22015	22020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544737
620	NC_003295	GACG	2	8	22091	22098	25 %	0 %	50 %	25 %	17544737
621	NC_003295	CTG	2	6	22140	22145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544737
622	NC_003295	TGG	2	6	22153	22158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544737
623	NC_003295	GCG	3	9	22312	22320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544737
624	NC_003295	CTG	2	6	22329	22334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544737
625	NC_003295	CCA	2	6	22349	22354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544737
626	NC_003295	GGCGA	2	10	22365	22374	20 %	0 %	60 %	20 %	17544737
627	NC_003295	GC	3	6	22398	22403	0 %	0 %	50 %	50 %	17544737
628	NC_003295	ATG	2	6	22408	22413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544737
629	NC_003295	CTGAG	2	10	22481	22490	20 %	20 %	40 %	20 %	17544737
630	NC_003295	CAA	2	6	22503	22508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_003295	CAAT	2	8	22586	22593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_003295	GAT	2	6	22607	22612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544738
633	NC_003295	GTG	3	9	22616	22624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544738
634	NC_003295	GC	3	6	22657	22662	0 %	0 %	50 %	50 %	17544738
635	NC_003295	CGA	2	6	22739	22744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544738
636	NC_003295	GCA	2	6	22754	22759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544738
637	NC_003295	CGTT	2	8	22827	22834	0 %	50 %	25 %	25 %	17544738
638	NC_003295	AGCG	2	8	22946	22953	25 %	0 %	50 %	25 %	17544738
639	NC_003295	CGGC	2	8	23101	23108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_003295	GCCG	2	8	23122	23129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
641	NC_003295	GC	4	8	23160	23167	0 %	0 %	50 %	50 %	17544739
642	NC_003295	GC	3	6	23204	23209	0 %	0 %	50 %	50 %	17544739
643	NC_003295	CATC	2	8	23250	23257	25 %	25 %	0 %	50 %	17544739
644	NC_003295	GC	3	6	23427	23432	0 %	0 %	50 %	50 %	17544739
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648	NC_003295	GCC	2	6	23537	23542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544739
649	NC_003295	CG	3	6	23544	23549	0 %	0 %	50 %	50 %	17544739
650	NC_003295	GTG	2	6	23581	23586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544739
651	NC_003295	TCG	2	6	23597	23602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544739
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660	NC_003295	GCG	3	9	23864	23872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544739
661	NC_003295	CAT	2	6	23905	23910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544739
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663	NC_003295	CTC	2	6	23946	23951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
664	NC_003295	G	6	6	23957	23962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
665	NC_003295	TGA	2	6	23974	23979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
666	NC_003295	GCG	2	6	23980	23985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_003295	ACC	2	6	24130	24135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
668	NC_003295	TCGCGC	2	12	24159	24170	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
669	NC_003295	CCG	2	6	24184	24189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
670	NC_003295	CGGG	2	8	24288	24295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
671	NC_003295	CG	4	8	24316	24323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
672	NC_003295	GGC	2	6	24485	24490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_003295	CAC	2	6	24524	24529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_003295	CGTACG	2	12	24555	24566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
675	NC_003295	TCG	2	6	24588	24593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
676	NC_003295	CAG	2	6	24596	24601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
677	NC_003295	CGG	2	6	24660	24665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544740
678	NC_003295	ACGCC	2	10	24699	24708	20 %	0 %	20 %	60 %	17544740
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680	NC_003295	GGC	2	6	24757	24762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544740
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695	NC_003295	GCG	2	6	25236	25241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544740
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724	NC_003295	GCA	2	6	26108	26113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
725	NC_003295	GTA	2	6	26159	26164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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729	NC_003295	GAG	2	6	26371	26376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
730	NC_003295	CTGG	2	8	26409	26416	0 %	25 %	50 %	25 %	17544741
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732	NC_003295	GC	3	6	26480	26485	0 %	0 %	50 %	50 %	17544741
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749	NC_003295	CCGGG	2	10	27025	27034	0 %	0 %	60 %	40 %	17544741
750	NC_003295	CAT	2	6	27048	27053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544741
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752	NC_003295	CAT	2	6	27078	27083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544741
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754	NC_003295	ACG	2	6	27134	27139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544741
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756	NC_003295	TGC	2	6	27188	27193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544741
757	NC_003295	GCT	3	9	27201	27209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544741
758	NC_003295	CAT	2	6	27252	27257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544741
759	NC_003295	TCG	2	6	27281	27286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544741
760	NC_003295	CGC	2	6	27287	27292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544741
761	NC_003295	AGATGC	2	12	27293	27304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17544741
762	NC_003295	CGG	2	6	27323	27328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544741
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764	NC_003295	GCG	2	6	27386	27391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544741
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