MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 102168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003295	GCC	2	6	171666	171671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544870
5002	NC_003295	GGGC	2	8	171686	171693	0 %	0 %	75 %	25 %	17544870
5003	NC_003295	TGC	3	9	171697	171705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544870
5004	NC_003295	GCC	2	6	171731	171736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544870
5005	NC_003295	GCC	2	6	171756	171761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544870
5006	NC_003295	GCT	2	6	171857	171862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544870
5007	NC_003295	GC	3	6	171889	171894	0 %	0 %	50 %	50 %	17544870
5008	NC_003295	TGC	2	6	171895	171900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544870
5009	NC_003295	GGC	2	6	171926	171931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544870
5010	NC_003295	GC	3	6	171934	171939	0 %	0 %	50 %	50 %	17544870
5011	NC_003295	GGC	2	6	171950	171955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544870
5012	NC_003295	GC	5	10	171983	171992	0 %	0 %	50 %	50 %	17544870
5013	NC_003295	ACT	2	6	172067	172072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544870
5014	NC_003295	GC	3	6	172118	172123	0 %	0 %	50 %	50 %	17544871
5015	NC_003295	GTACGT	2	12	172131	172142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17544871
5016	NC_003295	GCC	2	6	172164	172169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544871
5017	NC_003295	CAG	2	6	172183	172188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544871
5018	NC_003295	GGC	2	6	172206	172211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544871
5019	NC_003295	GCC	2	6	172224	172229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544871
5020	NC_003295	GCGCA	2	10	172278	172287	20 %	0 %	40 %	40 %	17544871
5021	NC_003295	CCG	2	6	172298	172303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544871
5022	NC_003295	CCG	2	6	172331	172336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544871
5023	NC_003295	GCAGC	2	10	172366	172375	20 %	0 %	40 %	40 %	17544871
5024	NC_003295	CGT	3	9	172386	172394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544871
5025	NC_003295	GTT	2	6	172464	172469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17544871
5026	NC_003295	CCG	2	6	172523	172528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544871
5027	NC_003295	GCC	2	6	172530	172535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544871
5028	NC_003295	GGTGCG	2	12	172587	172598	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	17544871
5029	NC_003295	GTG	2	6	172624	172629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544871
5030	NC_003295	GACCA	2	10	172636	172645	40 %	0 %	20 %	40 %	17544871
5031	NC_003295	CGG	2	6	172655	172660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544871
5032	NC_003295	CTG	2	6	172680	172685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544871
5033	NC_003295	GTC	2	6	172708	172713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544871
5034	NC_003295	GC	3	6	172715	172720	0 %	0 %	50 %	50 %	17544871
5035	NC_003295	CGA	2	6	172727	172732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544871
5036	NC_003295	GCG	3	9	172747	172755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544871
5037	NC_003295	GC	3	6	172769	172774	0 %	0 %	50 %	50 %	17544871
5038	NC_003295	GCC	2	6	172783	172788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544871
5039	NC_003295	ATG	2	6	172807	172812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544871
5040	NC_003295	TCT	2	6	172817	172822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544871
5041	NC_003295	GGT	2	6	172840	172845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_003295	TGCC	2	8	172895	172902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_003295	GCG	2	6	172920	172925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_003295	CTG	2	6	172937	172942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544872
5045	NC_003295	GGGT	2	8	173118	173125	0 %	25 %	75 %	0 %	17544872
5046	NC_003295	GCGCG	2	10	173185	173194	0 %	0 %	60 %	40 %	17544872
5047	NC_003295	GC	4	8	173208	173215	0 %	0 %	50 %	50 %	17544872
5048	NC_003295	CAG	2	6	173270	173275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544872
5049	NC_003295	CGC	2	6	173308	173313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544872
5050	NC_003295	TCG	3	9	173442	173450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544872
5051	NC_003295	CAG	2	6	173468	173473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544872
5052	NC_003295	GCC	2	6	173495	173500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544872
5053	NC_003295	GCG	2	6	173526	173531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544872
5054	NC_003295	GCG	2	6	173562	173567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544872
5055	NC_003295	GCGCG	2	10	173579	173588	0 %	0 %	60 %	40 %	17544872
5056	NC_003295	GCG	2	6	173667	173672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544872
5057	NC_003295	GAT	2	6	173678	173683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544872
5058	NC_003295	GC	3	6	173701	173706	0 %	0 %	50 %	50 %	17544872
5059	NC_003295	CGG	2	6	173722	173727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544872
5060	NC_003295	GGT	2	6	173756	173761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544872
5061	NC_003295	CGG	2	6	173785	173790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544872
5062	NC_003295	CCGT	2	8	173805	173812	0 %	25 %	25 %	50 %	17544872
5063	NC_003295	GGC	2	6	173825	173830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544872
5064	NC_003295	AGG	2	6	173847	173852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544872
5065	NC_003295	GC	3	6	173861	173866	0 %	0 %	50 %	50 %	17544872
5066	NC_003295	GGAG	2	8	173881	173888	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_003295	TAA	2	6	173904	173909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_003295	CGC	2	6	173968	173973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_003295	CCG	2	6	174009	174014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544873
5070	NC_003295	TGC	3	9	174026	174034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544873
5071	NC_003295	TGG	2	6	174137	174142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544873
5072	NC_003295	CGC	3	9	174194	174202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544873
5073	NC_003295	CGGC	2	8	174207	174214	0 %	0 %	50 %	50 %	17544873
5074	NC_003295	GGCT	2	8	174220	174227	0 %	25 %	50 %	25 %	17544873
5075	NC_003295	GGC	2	6	174249	174254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544873
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5080	NC_003295	GCG	2	6	174409	174414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544873
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5082	NC_003295	TGGC	2	8	174469	174476	0 %	25 %	50 %	25 %	17544873
5083	NC_003295	AGC	2	6	174496	174501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544873
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5088	NC_003295	GGT	2	6	174606	174611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544873
5089	NC_003295	CG	3	6	174633	174638	0 %	0 %	50 %	50 %	17544873
5090	NC_003295	GCT	2	6	174654	174659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544873
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5094	NC_003295	GC	3	6	174800	174805	0 %	0 %	50 %	50 %	17544873
5095	NC_003295	CGG	2	6	174810	174815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544873
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5097	NC_003295	GC	4	8	174843	174850	0 %	0 %	50 %	50 %	17544873
5098	NC_003295	TGC	2	6	174851	174856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544873
5099	NC_003295	TGC	2	6	174866	174871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544873
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5106	NC_003295	TGA	2	6	175133	175138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544873
5107	NC_003295	GCT	2	6	175167	175172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544873
5108	NC_003295	GTG	2	6	175173	175178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544873
5109	NC_003295	CAG	2	6	175360	175365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544874
5110	NC_003295	GGC	2	6	175381	175386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544874
5111	NC_003295	CGG	2	6	175407	175412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544874
5112	NC_003295	TCA	2	6	175422	175427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544874
5113	NC_003295	GC	3	6	175459	175464	0 %	0 %	50 %	50 %	17544874
5114	NC_003295	CG	3	6	175500	175505	0 %	0 %	50 %	50 %	17544874
5115	NC_003295	TCG	2	6	175574	175579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544874
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5118	NC_003295	AGC	4	12	175664	175675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544874
5119	NC_003295	GCGCC	2	10	175689	175698	0 %	0 %	40 %	60 %	17544874
5120	NC_003295	CGG	2	6	175719	175724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544874
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5122	NC_003295	ACC	2	6	175812	175817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544874
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5124	NC_003295	CGC	3	9	175863	175871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544874
5125	NC_003295	GCATC	2	10	175893	175902	20 %	20 %	20 %	40 %	17544874
5126	NC_003295	GC	3	6	175936	175941	0 %	0 %	50 %	50 %	17544874
5127	NC_003295	GGCC	2	8	175968	175975	0 %	0 %	50 %	50 %	17544874
5128	NC_003295	GCTGGC	2	12	176007	176018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17544874
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5130	NC_003295	CGA	2	6	176037	176042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544874
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5134	NC_003295	CCG	2	6	176234	176239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544874
5135	NC_003295	CGG	2	6	176249	176254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544874
5136	NC_003295	GCCGC	2	10	176264	176273	0 %	0 %	40 %	60 %	17544874
5137	NC_003295	GTA	2	6	176278	176283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544874
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5143	NC_003295	GCC	2	6	176514	176519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544875
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5145	NC_003295	CGCTGG	2	12	176542	176553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17544875
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5149	NC_003295	TGC	2	6	176653	176658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544875
5150	NC_003295	CGA	2	6	176672	176677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544875
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5199	NC_003295	CGTCG	2	10	178372	178381	0 %	20 %	40 %	40 %	17544877
5200	NC_003295	GC	4	8	178386	178393	0 %	0 %	50 %	50 %	17544877
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5203	NC_003295	GGCC	2	8	178443	178450	0 %	0 %	50 %	50 %	17544877
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5232	NC_003295	CGC	2	6	179376	179381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544878
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5235	NC_003295	TGG	3	9	179432	179440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544878
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5240	NC_003295	GCC	2	6	179524	179529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544878
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5242	NC_003295	GC	3	6	179641	179646	0 %	0 %	50 %	50 %	17544878
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5245	NC_003295	GCG	2	6	179683	179688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544878
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5374	NC_003295	CGG	2	6	183741	183746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544882
5375	NC_003295	ACCA	2	8	183817	183824	50 %	0 %	0 %	50 %	17544882
5376	NC_003295	GC	3	6	183847	183852	0 %	0 %	50 %	50 %	17544882
5377	NC_003295	GGC	2	6	183888	183893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544882
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5379	NC_003295	GGC	2	6	183920	183925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544882
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5388	NC_003295	TGG	2	6	184226	184231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544882
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5401	NC_003295	CCG	2	6	184661	184666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544883
5402	NC_003295	CG	3	6	184708	184713	0 %	0 %	50 %	50 %	17544883
5403	NC_003295	GGCG	2	8	184724	184731	0 %	0 %	75 %	25 %	17544883
5404	NC_003295	GGC	2	6	184740	184745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544883
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5440	NC_003295	TGA	2	6	185952	185957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544884
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5443	NC_003295	GCT	2	6	186079	186084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544884
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5467	NC_003295	TGC	2	6	186748	186753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544885
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5476	NC_003295	CTG	2	6	187041	187046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544885
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5479	NC_003295	GCGG	2	8	187092	187099	0 %	0 %	75 %	25 %	17544885
5480	NC_003295	GCC	2	6	187160	187165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544885
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5482	NC_003295	GGCAC	2	10	187187	187196	20 %	0 %	40 %	40 %	17544885
5483	NC_003295	CGGGG	2	10	187226	187235	0 %	0 %	80 %	20 %	17544885
5484	NC_003295	GCC	2	6	187247	187252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544885
5485	NC_003295	GCC	2	6	187315	187320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544885
5486	NC_003295	CCG	2	6	187411	187416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544885
5487	NC_003295	CTG	2	6	187449	187454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544885
5488	NC_003295	GC	3	6	187523	187528	0 %	0 %	50 %	50 %	17544885
5489	NC_003295	CGAGGC	2	12	187538	187549	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	17544885
5490	NC_003295	ACG	2	6	187555	187560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544885
5491	NC_003295	CGGC	2	8	187561	187568	0 %	0 %	50 %	50 %	17544885
5492	NC_003295	TGC	2	6	187588	187593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544885
5493	NC_003295	AGG	2	6	187603	187608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544885
5494	NC_003295	ACG	2	6	187636	187641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544885
5495	NC_003295	CG	3	6	187640	187645	0 %	0 %	50 %	50 %	17544885
5496	NC_003295	CGC	2	6	187715	187720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544885
5497	NC_003295	CGG	2	6	187721	187726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544885
5498	NC_003295	GCT	2	6	187742	187747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544885
5499	NC_003295	TGC	2	6	187777	187782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544885
5500	NC_003295	CG	3	6	187797	187802	0 %	0 %	50 %	50 %	17544885

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