MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003103	AAAGTA	2	12	1186	1197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15891925
2	NC_003103	CAAAAC	2	12	5028	5039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891928
3	NC_003103	CAAAAT	2	12	5881	5892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15891928
4	NC_003103	ACCGTA	2	12	7471	7482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15891932
5	NC_003103	AGAAAA	2	12	11174	11185	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15891935
6	NC_003103	ATTAAA	2	12	12334	12345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891936
7	NC_003103	TTTAAA	2	12	13931	13942	50 %	50 %	0 %	0 %	15891938
8	NC_003103	CTAATT	2	12	13980	13991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15891938
9	NC_003103	CTATAT	2	12	14595	14606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15891938
10	NC_003103	AGAACA	2	12	15178	15189	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_003103	ATTTAG	2	12	19513	19524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15891942
12	NC_003103	AGATGT	2	12	20261	20272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
13	NC_003103	GAAGCT	2	12	20541	20552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15891942
14	NC_003103	AAGGAA	2	12	20838	20849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
15	NC_003103	GCATTA	2	12	21807	21818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15891942
16	NC_003103	TCCGAT	2	12	21924	21935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15891942
17	NC_003103	ATTTAA	2	12	22322	22333	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
18	NC_003103	AGAAAA	2	12	23328	23339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003103	CAAATA	2	12	24119	24130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_003103	TAAAGT	2	12	24282	24293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003103	TTTAGG	2	12	25676	25687	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003103	CATATA	2	12	30980	30991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15891954
23	NC_003103	AATACA	2	12	34549	34560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15891957
24	NC_003103	TTTTTG	2	12	35122	35133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15891959
25	NC_003103	AAGAAA	2	12	36078	36089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003103	ATCTTT	2	12	38476	38487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_003103	ATATTA	2	12	42570	42581	50 %	50 %	0 %	0 %	15891968
28	NC_003103	AAAGCT	2	12	42757	42768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15891969
29	NC_003103	TACTAA	2	12	42817	42828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15891969
30	NC_003103	ATTAAT	2	12	43169	43180	50 %	50 %	0 %	0 %	15891969
31	NC_003103	TTTTTA	2	12	44139	44150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15891971
32	NC_003103	AGTATT	2	12	48775	48786	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15891979
33	NC_003103	GCGGGA	2	12	52604	52615	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_003103	ATTGCT	2	12	53182	53193	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15891983
35	NC_003103	ATTTAT	2	12	53769	53780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891984
36	NC_003103	ATAAGG	2	12	53968	53979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15891984
37	NC_003103	ATCAGA	2	12	57723	57734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15891989
38	NC_003103	AAAACA	2	12	61503	61514	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15891991
39	NC_003103	ATAAAA	2	12	65756	65767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003103	TAATAT	2	12	66607	66618	50 %	50 %	0 %	0 %	15891996
41	NC_003103	CAGCAA	2	12	67276	67287	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15891997
42	NC_003103	ATAGTG	2	12	67607	67618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891997
43	NC_003103	AAAAAG	2	12	68435	68446	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15891997
44	NC_003103	TATAGT	2	12	72226	72237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892002
45	NC_003103	TACCCT	2	12	73868	73879	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15892004
46	NC_003103	ATCCTG	2	12	73890	73901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15892004
47	NC_003103	AAAGCT	2	12	74309	74320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15892004
48	NC_003103	GTAATA	2	12	74948	74959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892004
49	NC_003103	AGTAAA	2	12	83688	83699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892013
50	NC_003103	TATTAA	2	12	84198	84209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003103	AAGGAC	2	12	85337	85348	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15892015
52	NC_003103	CGTGAT	2	12	86306	86317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15892017
53	NC_003103	TTGATT	2	12	88766	88777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15892018
54	NC_003103	GAAGCA	2	12	89858	89869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15892019
55	NC_003103	TTTTAA	2	12	90131	90142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003103	TAAAAA	2	12	92863	92874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003103	TTTTTA	2	12	95229	95240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15892022
58	NC_003103	CCTATA	2	12	100069	100080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892028
59	NC_003103	ACCTAT	2	12	100302	100313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892028
60	NC_003103	ACCGCT	2	12	101650	101661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15892029
61	NC_003103	TAGCGG	2	12	108460	108471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15892033
62	NC_003103	TAGCGG	2	12	116289	116300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15892041
63	NC_003103	CTCAAT	2	12	119553	119564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003103	TTTATT	2	12	121760	121771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15892047
65	NC_003103	TAAAAT	2	12	125756	125767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892053
66	NC_003103	TATTTT	2	12	127775	127786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003103	TTGCTA	2	12	135133	135144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892065
68	NC_003103	AAGATA	2	12	135298	135309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892065
69	NC_003103	CTTTAG	2	12	135460	135471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892065
70	NC_003103	TTTAGT	2	12	136119	136130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15892065
71	NC_003103	TAATGC	2	12	139839	139850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15892067
72	NC_003103	AAAGAT	2	12	140662	140673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892067
73	NC_003103	TTTATC	2	12	153606	153617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15892076
74	NC_003103	GATTTT	2	12	153900	153911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15892077
75	NC_003103	CTTTTG	2	12	156459	156470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15892079
76	NC_003103	GTAAAA	2	12	157783	157794	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892080
77	NC_003103	CAATAT	2	12	160711	160722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892084
78	NC_003103	ATTGAG	2	12	161062	161073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892085
79	NC_003103	CTTCAT	2	12	161288	161299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892085
80	NC_003103	TCAATT	2	12	163063	163074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15892087
81	NC_003103	AAAGAA	2	12	163703	163714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15892087
82	NC_003103	TCAAGC	2	12	163720	163731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15892087
83	NC_003103	GTTGAG	2	12	164287	164298	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15892088
84	NC_003103	AAGTAA	2	12	166083	166094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892089
85	NC_003103	TTTTAA	2	12	167497	167508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003103	TAGAGC	2	12	168928	168939	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892093
87	NC_003103	AATTTA	2	12	171252	171263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003103	GAACAA	2	12	172449	172460	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15892097
89	NC_003103	ATAAAA	2	12	173866	173877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15892097
90	NC_003103	TTTTTA	2	12	174930	174941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15892098
91	NC_003103	CTGTAG	2	12	177964	177975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161723850
92	NC_003103	TTAAAA	2	12	180210	180221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892104
93	NC_003103	GCTATT	2	12	182057	182068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892104
94	NC_003103	TCCATG	2	12	189020	189031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15892106
95	NC_003103	GATGTT	2	12	190045	190056	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15892107
96	NC_003103	AAAAAT	2	12	192522	192533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15892110
97	NC_003103	AAGCCC	2	12	201578	201589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15892116
98	NC_003103	TATTTA	2	12	207976	207987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003103	CTTTAG	2	12	210150	210161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892125
100	NC_003103	TGCCGA	2	12	210640	210651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15892125
101	NC_003103	ATATTT	2	12	211139	211150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892125
102	NC_003103	GTTTCA	2	12	214428	214439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892129
103	NC_003103	AAATTA	2	12	215519	215530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003103	AAAAGC	2	12	215610	215621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15892130
105	NC_003103	TTTCTT	2	12	217068	217079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892132
106	NC_003103	TTTTCT	2	12	217088	217099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892132
107	NC_003103	AAATTA	2	12	218244	218255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003103	AGTTAA	2	12	220186	220197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892134
109	NC_003103	TCATAA	2	12	222178	222189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892135
110	NC_003103	TAATAT	2	12	222283	222294	50 %	50 %	0 %	0 %	15892135
111	NC_003103	TAAATT	2	12	223869	223880	50 %	50 %	0 %	0 %	15892137
112	NC_003103	AAAGCA	2	12	231114	231125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15892146
113	NC_003103	GTACGA	2	12	235158	235169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892150
114	NC_003103	CTTCTA	2	12	236155	236166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892150
115	NC_003103	ATCTCA	2	12	239031	239042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892152
116	NC_003103	TTCTTT	2	12	240424	240435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892153
117	NC_003103	TACTTC	2	12	242750	242761	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892156
118	NC_003103	GAAAAT	2	12	249816	249827	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892162
119	NC_003103	TATTTT	2	12	251966	251977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003103	CAATAT	2	12	252290	252301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892165
121	NC_003103	TAATTA	2	12	252891	252902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003103	GCACCG	2	12	259924	259935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15892176
123	NC_003103	CTTTAA	2	12	260251	260262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15892177
124	NC_003103	AAATAA	2	12	260397	260408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003103	AAAATG	2	12	260463	260474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003103	GCACCG	2	12	261718	261729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15892179
127	NC_003103	CATTAT	2	12	266978	266989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15892185
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129	NC_003103	ATTGCA	2	12	273081	273092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_003103	TTAAAG	2	12	275928	275939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892196
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133	NC_003103	ATTAAA	2	12	279478	279489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003103	TAAAAT	2	12	281566	281577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003103	CCTGAA	2	12	283193	283204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_003103	AATTTA	2	12	341646	341657	50 %	50 %	0 %	0 %	15892264
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226	NC_003103	AAATTT	2	12	492515	492526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_003103	ATCAAA	2	12	498422	498433	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15892428
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230	NC_003103	AGGAAG	2	12	503505	503516	50 %	0 %	50 %	0 %	15892432
231	NC_003103	ATCAGT	2	12	507261	507272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15892439
232	NC_003103	ATTTGA	2	12	507540	507551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892439
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235	NC_003103	ATATTA	2	12	513384	513395	50 %	50 %	0 %	0 %	15892446
236	NC_003103	GATAAT	2	12	519844	519855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
237	NC_003103	AAAAAG	2	12	521215	521226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15892453
238	NC_003103	TTAATT	2	12	521871	521882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_003103	GTCAGC	2	12	525315	525326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15892457
240	NC_003103	TTTCAT	2	12	527068	527079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
241	NC_003103	AGATAA	2	12	531355	531366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892463
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250	NC_003103	ATTTTA	2	12	551045	551056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_003103	ATATTT	2	12	749020	749031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
351	NC_003103	TGCTAC	2	12	749055	749066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15892719
352	NC_003103	CTACTC	2	12	759419	759430	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
353	NC_003103	ATGCCG	2	12	762599	762610	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15892731
354	NC_003103	CGGTAG	2	12	764323	764334	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15892732
355	NC_003103	ATTGAT	2	12	764381	764392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892732
356	NC_003103	TATTTT	2	12	764914	764925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_003103	CTTTTT	2	12	770715	770726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892739
358	NC_003103	TCAATA	2	12	771482	771493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892739
359	NC_003103	AAAGGA	2	12	776753	776764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15892744
360	NC_003103	TTTTTC	2	12	777022	777033	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892745
361	NC_003103	TAACAG	2	12	779556	779567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15892748
362	NC_003103	GCTTCA	2	12	781884	781895	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15892750
363	NC_003103	ATTTTT	2	12	784292	784303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15892753
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365	NC_003103	AAATTT	2	12	787356	787367	50 %	50 %	0 %	0 %	15892758
366	NC_003103	ATAAAC	2	12	788161	788172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15892758
367	NC_003103	AGCGAT	2	12	788560	788571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892758
368	NC_003103	TAAACA	2	12	789219	789230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15892758
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370	NC_003103	AGGTGG	2	12	793743	793754	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15892765
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374	NC_003103	ATTCCT	2	12	798938	798949	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892772
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380	NC_003103	ATATTT	2	12	824175	824186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892802
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382	NC_003103	AAGCTA	2	12	827880	827891	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15892803
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389	NC_003103	TTAATA	2	12	846318	846329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_003103	TGAACA	2	12	846824	846835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15892823
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398	NC_003103	ATTATG	2	12	857856	857867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892835
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450	NC_003103	AATTTA	2	12	1005551	1005562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_003103	TGCTTT	2	12	1058558	1058569	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15893070
478	NC_003103	ATCTGT	2	12	1062399	1062410	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15893079
479	NC_003103	CTTTTA	2	12	1069152	1069163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
480	NC_003103	TAAATC	2	12	1073212	1073223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15893097
481	NC_003103	AAACGC	2	12	1074809	1074820	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15893097
482	NC_003103	ATAGCT	2	12	1077256	1077267	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893097
483	NC_003103	TCTTGC	2	12	1077586	1077597	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15893097
484	NC_003103	ATAAAT	2	12	1078940	1078951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893098
485	NC_003103	ATTTAG	2	12	1080454	1080465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893099
486	NC_003103	AGCTTA	2	12	1081128	1081139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
487	NC_003103	ATGCAT	2	12	1082887	1082898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893104
488	NC_003103	TAAAGA	2	12	1084084	1084095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893105
489	NC_003103	GGACTT	2	12	1085638	1085649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15893109
490	NC_003103	ACCACT	2	12	1088696	1088707	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15893110
491	NC_003103	ATACTA	2	12	1090019	1090030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15893111
492	NC_003103	TACCTG	2	12	1091983	1091994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15893117
493	NC_003103	TTCCTC	2	12	1093331	1093342	0 %	50 %	0 %	50 %	15893120
494	NC_003103	CATAAG	2	12	1094601	1094612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15893121
495	NC_003103	ACCTAA	2	12	1096649	1096660	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15893123
496	NC_003103	TGTTCT	2	12	1098274	1098285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15893125
497	NC_003103	AACACC	2	12	1099330	1099341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_003103	ACGGAT	2	12	1100471	1100482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15893129
499	NC_003103	TCTAGT	2	12	1103381	1103392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
500	NC_003103	AAGCAA	2	12	1104593	1104604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15893130

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