MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 3486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000963	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	15603882
2	NC_000963	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	15603882
3	NC_000963	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000963	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000963	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	15603884
6	NC_000963	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	15603885
7	NC_000963	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	15603885
8	NC_000963	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	15603885
9	NC_000963	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	15603885
10	NC_000963	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	15603886
11	NC_000963	AGAA	2	8	4131	4138	75 %	0 %	25 %	0 %	15603887
12	NC_000963	AATA	2	8	5190	5197	75 %	25 %	0 %	0 %	15603887
13	NC_000963	TCAC	2	8	5229	5236	25 %	25 %	0 %	50 %	15603887
14	NC_000963	GGCT	2	8	6126	6133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_000963	TTTA	2	8	6199	6206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000963	TAAA	2	8	6218	6225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000963	ACCT	2	8	6584	6591	25 %	25 %	0 %	50 %	15603888
18	NC_000963	ACCA	2	8	6668	6675	50 %	0 %	0 %	50 %	15603888
19	NC_000963	TAAA	2	8	6676	6683	75 %	25 %	0 %	0 %	15603888
20	NC_000963	ATAA	2	8	6839	6846	75 %	25 %	0 %	0 %	15603888
21	NC_000963	CCTG	2	8	7897	7904	0 %	25 %	25 %	50 %	15603890
22	NC_000963	ATTT	2	8	8915	8922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000963	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000963	TATT	2	8	9211	9218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000963	TAAT	2	8	9257	9264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000963	CAAT	2	8	9862	9869	50 %	25 %	0 %	25 %	15603891
27	NC_000963	CATG	2	8	9885	9892	25 %	25 %	25 %	25 %	15603891
28	NC_000963	ATGA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	25 %	0 %	15603891
29	NC_000963	TTGG	2	8	10133	10140	0 %	50 %	50 %	0 %	15603891
30	NC_000963	AAAT	2	8	10677	10684	75 %	25 %	0 %	0 %	15603891
31	NC_000963	TAAA	2	8	10957	10964	75 %	25 %	0 %	0 %	15603892
32	NC_000963	TAAA	2	8	10984	10991	75 %	25 %	0 %	0 %	15603892
33	NC_000963	AAAG	2	8	11261	11268	75 %	0 %	25 %	0 %	15603892
34	NC_000963	TCAT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	15603892
35	NC_000963	TAAT	2	8	12431	12438	50 %	50 %	0 %	0 %	15603894
36	NC_000963	GCTT	2	8	12446	12453	0 %	50 %	25 %	25 %	15603894
37	NC_000963	AATA	2	8	13359	13366	75 %	25 %	0 %	0 %	15603895
38	NC_000963	GCTC	2	8	13563	13570	0 %	25 %	25 %	50 %	15603895
39	NC_000963	TAAG	2	8	14760	14767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000963	ATTA	2	8	14781	14788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000963	AAAG	2	8	14850	14857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000963	TTAT	2	8	15021	15028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000963	TAAG	2	8	15215	15222	50 %	25 %	25 %	0 %	15603896
44	NC_000963	AATA	2	8	15645	15652	75 %	25 %	0 %	0 %	15603896
45	NC_000963	GTAA	2	8	15793	15800	50 %	25 %	25 %	0 %	15603896
46	NC_000963	AGCA	2	8	16075	16082	50 %	0 %	25 %	25 %	15603897
47	NC_000963	AATT	2	8	16688	16695	50 %	50 %	0 %	0 %	15603897
48	NC_000963	AAAG	2	8	17158	17165	75 %	0 %	25 %	0 %	15603897
49	NC_000963	ATTC	2	8	17251	17258	25 %	50 %	0 %	25 %	15603897
50	NC_000963	TTCA	2	8	18303	18310	25 %	50 %	0 %	25 %	15603898
51	NC_000963	TAAA	2	8	18942	18949	75 %	25 %	0 %	0 %	15603898
52	NC_000963	TATT	2	8	19386	19393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000963	GTAA	2	8	19560	19567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000963	TTAT	2	8	19638	19645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000963	TCAA	2	8	19670	19677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_000963	GTAA	2	8	19839	19846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000963	ATAG	2	8	20074	20081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000963	ATTA	2	8	20178	20185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000963	ATCA	2	8	20740	20747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_000963	AACA	2	8	21101	21108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_000963	GTAT	2	8	21140	21147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000963	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	15603900
63	NC_000963	TAAT	2	8	22413	22420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000963	ATAC	2	8	22459	22466	50 %	25 %	0 %	25 %	15603902
65	NC_000963	AACT	2	8	22647	22654	50 %	25 %	0 %	25 %	15603902
66	NC_000963	AAAT	2	8	22881	22888	75 %	25 %	0 %	0 %	15603902
67	NC_000963	CACT	2	8	22977	22984	25 %	25 %	0 %	50 %	15603902
68	NC_000963	AAGT	2	8	23030	23037	50 %	25 %	25 %	0 %	15603902
69	NC_000963	ATTA	2	8	23412	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	15603903
70	NC_000963	ATTT	2	8	23471	23478	25 %	75 %	0 %	0 %	15603904
71	NC_000963	TATT	2	8	23718	23725	25 %	75 %	0 %	0 %	15603904
72	NC_000963	TCTT	2	8	25028	25035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_000963	AAAT	2	8	25619	25626	75 %	25 %	0 %	0 %	15603906
74	NC_000963	TAAA	2	8	26849	26856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000963	TTAA	2	8	27096	27103	50 %	50 %	0 %	0 %	15603908
76	NC_000963	TAGT	2	8	27259	27266	25 %	50 %	25 %	0 %	15603908
77	NC_000963	ATTT	2	8	27278	27285	25 %	75 %	0 %	0 %	15603908
78	NC_000963	TTGC	2	8	27553	27560	0 %	50 %	25 %	25 %	15603908
79	NC_000963	ATTT	2	8	27703	27710	25 %	75 %	0 %	0 %	15603908
80	NC_000963	TTCC	2	8	27793	27800	0 %	50 %	0 %	50 %	15603908
81	NC_000963	GCTT	2	8	27931	27938	0 %	50 %	25 %	25 %	15603908
82	NC_000963	ATTT	3	12	28763	28774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000963	TACA	2	8	28905	28912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_000963	ATAA	2	8	29080	29087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000963	AATA	2	8	29710	29717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000963	TTTG	2	8	31031	31038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000963	ATTA	2	8	31241	31248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000963	ATAG	2	8	31380	31387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000963	TTTG	2	8	31470	31477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000963	ATTT	2	8	31796	31803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000963	TTCT	2	8	31838	31845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000963	AAAT	2	8	32599	32606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000963	TATT	2	8	32700	32707	25 %	75 %	0 %	0 %	15603910
94	NC_000963	ATTT	2	8	32841	32848	25 %	75 %	0 %	0 %	15603910
95	NC_000963	ATTT	2	8	33281	33288	25 %	75 %	0 %	0 %	15603911
96	NC_000963	AAAT	2	8	33305	33312	75 %	25 %	0 %	0 %	15603911
97	NC_000963	ATAA	2	8	33781	33788	75 %	25 %	0 %	0 %	15603911
98	NC_000963	AGCA	2	8	34269	34276	50 %	0 %	25 %	25 %	15603912
99	NC_000963	TTTC	2	8	34937	34944	0 %	75 %	0 %	25 %	15603913
100	NC_000963	ATTT	2	8	35802	35809	25 %	75 %	0 %	0 %	15603913
101	NC_000963	TCGT	2	8	36081	36088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_000963	AATC	2	8	36392	36399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_000963	TGAT	2	8	36464	36471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000963	TTGA	2	8	36644	36651	25 %	50 %	25 %	0 %	15603914
105	NC_000963	AGTA	2	8	36763	36770	50 %	25 %	25 %	0 %	15603914
106	NC_000963	TACT	2	8	37113	37120	25 %	50 %	0 %	25 %	15603914
107	NC_000963	TCAA	2	8	37974	37981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_000963	ATGT	2	8	38034	38041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000963	TTAA	2	8	38300	38307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000963	TTAT	2	8	38366	38373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000963	TAAA	2	8	38576	38583	75 %	25 %	0 %	0 %	15603915
112	NC_000963	GAGT	2	8	39870	39877	25 %	25 %	50 %	0 %	15603915
113	NC_000963	AATA	2	8	41054	41061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000963	AAAT	2	8	41120	41127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000963	ATTA	2	8	41995	42002	50 %	50 %	0 %	0 %	15603916
116	NC_000963	ACTT	2	8	42943	42950	25 %	50 %	0 %	25 %	15603917
117	NC_000963	AATA	2	8	43432	43439	75 %	25 %	0 %	0 %	15603917
118	NC_000963	TAAA	2	8	43488	43495	75 %	25 %	0 %	0 %	15603917
119	NC_000963	AAAC	2	8	43785	43792	75 %	0 %	0 %	25 %	15603917
120	NC_000963	ATTT	3	12	43800	43811	25 %	75 %	0 %	0 %	15603917
121	NC_000963	TTTA	2	8	43987	43994	25 %	75 %	0 %	0 %	15603917
122	NC_000963	TAAG	2	8	44379	44386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000963	GTTT	2	8	44771	44778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000963	AGAA	2	8	45023	45030	75 %	0 %	25 %	0 %	15603918
125	NC_000963	AAAG	2	8	45403	45410	75 %	0 %	25 %	0 %	15603919
126	NC_000963	TAAA	2	8	45470	45477	75 %	25 %	0 %	0 %	15603919
127	NC_000963	AAGA	2	8	46448	46455	75 %	0 %	25 %	0 %	15603921
128	NC_000963	TAAT	2	8	46955	46962	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
129	NC_000963	ATTA	2	8	47031	47038	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
130	NC_000963	TTAT	2	8	47226	47233	25 %	75 %	0 %	0 %	15603921
131	NC_000963	GAAT	2	8	47803	47810	50 %	25 %	25 %	0 %	15603922
132	NC_000963	CTTA	2	8	48077	48084	25 %	50 %	0 %	25 %	15603922
133	NC_000963	ATGG	2	8	48357	48364	25 %	25 %	50 %	0 %	15603922
134	NC_000963	TATG	2	8	49085	49092	25 %	50 %	25 %	0 %	15603922
135	NC_000963	TAAT	2	8	49478	49485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000963	GCTA	2	8	51856	51863	25 %	25 %	25 %	25 %	15603924
137	NC_000963	AATT	2	8	51952	51959	50 %	50 %	0 %	0 %	15603924
138	NC_000963	CGAC	2	8	51975	51982	25 %	0 %	25 %	50 %	15603924
139	NC_000963	AAAT	2	8	52049	52056	75 %	25 %	0 %	0 %	15603925
140	NC_000963	ATAA	2	8	52412	52419	75 %	25 %	0 %	0 %	15603925
141	NC_000963	ATAA	2	8	52741	52748	75 %	25 %	0 %	0 %	15603925
142	NC_000963	TAAT	2	8	52793	52800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000963	TGTT	2	8	53020	53027	0 %	75 %	25 %	0 %	15603926
144	NC_000963	TTAA	2	8	53058	53065	50 %	50 %	0 %	0 %	15603926
145	NC_000963	TTAT	2	8	53156	53163	25 %	75 %	0 %	0 %	15603926
146	NC_000963	AACT	2	8	53545	53552	50 %	25 %	0 %	25 %	15603926
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