MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_000963	T	6	6	1105051	1105056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30003	NC_000963	T	6	6	1105059	1105064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30004	NC_000963	TAA	2	6	1105086	1105091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30005	NC_000963	TTA	2	6	1105144	1105149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30006	NC_000963	AGT	2	6	1105170	1105175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30007	NC_000963	ATTC	2	8	1105201	1105208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30008	NC_000963	TAGA	2	8	1105239	1105246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30009	NC_000963	AT	3	6	1105254	1105259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30011	NC_000963	ATT	2	6	1105380	1105385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30012	NC_000963	T	7	7	1105406	1105412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30013	NC_000963	AACGTT	2	12	1105547	1105558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30014	NC_000963	GATG	2	8	1105559	1105566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30015	NC_000963	TAA	2	6	1105574	1105579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30016	NC_000963	TAA	2	6	1105592	1105597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30017	NC_000963	ATT	3	9	1105599	1105607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30018	NC_000963	A	6	6	1105608	1105613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30019	NC_000963	AGA	2	6	1105632	1105637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30020	NC_000963	TA	3	6	1105666	1105671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30021	NC_000963	A	6	6	1105671	1105676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30022	NC_000963	GTA	2	6	1105677	1105682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30023	NC_000963	AT	3	6	1105723	1105728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30024	NC_000963	ACT	2	6	1105734	1105739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30028	NC_000963	TAA	3	9	1105900	1105908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30029	NC_000963	TAAT	2	8	1105913	1105920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30094	NC_000963	T	7	7	1108249	1108255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30095	NC_000963	T	6	6	1108261	1108266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30101	NC_000963	TAT	2	6	1108445	1108450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.