MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_000963	ATT	2	6	659586	659591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604391
18003	NC_000963	CTT	2	6	659597	659602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604391
18004	NC_000963	TAT	2	6	659648	659653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604391
18005	NC_000963	CCA	2	6	659662	659667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604391
18006	NC_000963	T	6	6	659676	659681	0 %	100 %	0 %	0 %	15604391
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18009	NC_000963	AT	3	6	659874	659879	50 %	50 %	0 %	0 %	15604391
18010	NC_000963	TCA	2	6	659914	659919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604391
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18012	NC_000963	TAA	2	6	659984	659989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604391
18013	NC_000963	TTTA	2	8	660024	660031	25 %	75 %	0 %	0 %	15604391
18014	NC_000963	TTC	2	6	660099	660104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604391
18015	NC_000963	GCA	2	6	660139	660144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604391
18016	NC_000963	AGA	2	6	660159	660164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604391
18017	NC_000963	T	8	8	660200	660207	0 %	100 %	0 %	0 %	15604391
18018	NC_000963	GCT	2	6	660208	660213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604391
18019	NC_000963	AT	3	6	660228	660233	50 %	50 %	0 %	0 %	15604391
18020	NC_000963	TA	3	6	660264	660269	50 %	50 %	0 %	0 %	15604391
18021	NC_000963	ATT	2	6	660417	660422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604391
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18024	NC_000963	TTA	2	6	660463	660468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_000963	TTA	2	6	660472	660477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_000963	TCT	2	6	660496	660501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604392
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18038	NC_000963	TTC	2	6	660933	660938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604392
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18041	NC_000963	TATC	2	8	661140	661147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18042	NC_000963	ATA	3	9	661184	661192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_000963	ATA	2	6	661227	661232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604393
18044	NC_000963	TAAA	2	8	661252	661259	75 %	25 %	0 %	0 %	15604393
18045	NC_000963	TTA	2	6	661269	661274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604393
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18051	NC_000963	TAT	3	9	661563	661571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604393
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18056	NC_000963	TTA	2	6	661722	661727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604393
18057	NC_000963	GCA	2	6	661742	661747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604393
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18077	NC_000963	TA	3	6	662531	662536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_000963	A	7	7	662549	662555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18088	NC_000963	ATA	2	6	662934	662939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_000963	AT	4	8	662947	662954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_000963	TAA	2	6	662979	662984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_000963	ACTAA	2	10	662992	663001	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18092	NC_000963	TAT	2	6	663016	663021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_000963	CTA	2	6	663036	663041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18094	NC_000963	TAC	2	6	663055	663060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18095	NC_000963	AT	3	6	663096	663101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_000963	ATG	2	6	663173	663178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_000963	AAT	2	6	663189	663194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_000963	AT	3	6	663227	663232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_000963	ATA	2	6	663241	663246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18101	NC_000963	TAAT	2	8	663302	663309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_000963	CTT	2	6	663333	663338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_000963	TAAT	2	8	663351	663358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_000963	ATTC	2	8	663375	663382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18105	NC_000963	TGC	2	6	663542	663547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18107	NC_000963	ATT	2	6	663578	663583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_000963	TATT	2	8	663715	663722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_000963	TAT	2	6	663755	663760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_000963	AT	3	6	663778	663783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_000963	TAC	2	6	663787	663792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18112	NC_000963	ATTAT	2	10	663824	663833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_000963	ATC	2	6	663866	663871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18114	NC_000963	TAC	2	6	663940	663945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18115	NC_000963	TCA	2	6	663956	663961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18116	NC_000963	ATT	2	6	663993	663998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_000963	TAATT	2	10	664090	664099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_000963	TTA	2	6	664141	664146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18119	NC_000963	ATGA	2	8	664159	664166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_000963	ATTA	2	8	664185	664192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_000963	AAT	2	6	664206	664211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18122	NC_000963	ATA	2	6	664234	664239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18123	NC_000963	GAT	2	6	664282	664287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_000963	TA	3	6	664299	664304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_000963	T	6	6	664321	664326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_000963	ATTTT	2	10	664352	664361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_000963	TGTA	2	8	664365	664372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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