MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000963	TACT	2	8	37113	37120	25 %	50 %	0 %	25 %	15603914
1002	NC_000963	T	6	6	37123	37128	0 %	100 %	0 %	0 %	15603914
1003	NC_000963	T	6	6	37156	37161	0 %	100 %	0 %	0 %	15603914
1004	NC_000963	TTC	2	6	37165	37170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603914
1005	NC_000963	AGC	2	6	37228	37233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603914
1006	NC_000963	A	6	6	37247	37252	100 %	0 %	0 %	0 %	15603914
1007	NC_000963	T	6	6	37277	37282	0 %	100 %	0 %	0 %	15603914
1008	NC_000963	ATT	2	6	37346	37351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603914
1009	NC_000963	TTA	2	6	37376	37381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_000963	A	6	6	37406	37411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_000963	ATA	2	6	37414	37419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_000963	AAC	2	6	37436	37441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_000963	AT	3	6	37464	37469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_000963	T	6	6	37469	37474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_000963	ATG	2	6	37475	37480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_000963	TTTAAT	2	12	37511	37522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_000963	TAT	2	6	37541	37546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_000963	AGT	2	6	37547	37552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_000963	T	6	6	37582	37587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_000963	T	6	6	37589	37594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_000963	GTT	2	6	37605	37610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_000963	TAT	2	6	37826	37831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_000963	T	6	6	37869	37874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_000963	AAT	2	6	37910	37915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_000963	TAA	2	6	37939	37944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_000963	CAT	2	6	37966	37971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_000963	TCAA	2	8	37974	37981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_000963	T	6	6	38005	38010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_000963	ATGT	2	8	38034	38041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_000963	TA	4	8	38049	38056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_000963	T	6	6	38146	38151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_000963	TCA	2	6	38185	38190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_000963	T	7	7	38220	38226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_000963	TTAA	2	8	38300	38307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_000963	TTA	2	6	38349	38354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_000963	TTAT	2	8	38366	38373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_000963	ATC	2	6	38420	38425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603915
1038	NC_000963	ATC	2	6	38447	38452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603915
1039	NC_000963	TAT	2	6	38474	38479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603915
1040	NC_000963	GAA	2	6	38494	38499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603915
1041	NC_000963	TAA	2	6	38523	38528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603915
1042	NC_000963	AGG	2	6	38532	38537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15603915
1043	NC_000963	TTA	2	6	38548	38553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603915
1044	NC_000963	TAAA	2	8	38576	38583	75 %	25 %	0 %	0 %	15603915
1045	NC_000963	TAT	2	6	38620	38625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603915
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1051	NC_000963	A	6	6	38815	38820	100 %	0 %	0 %	0 %	15603915
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1057	NC_000963	TAT	2	6	39084	39089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603915
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1059	NC_000963	ATT	2	6	39193	39198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603915
1060	NC_000963	TTA	2	6	39268	39273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603915
1061	NC_000963	GTG	2	6	39290	39295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603915
1062	NC_000963	CTA	2	6	39314	39319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603915
1063	NC_000963	AT	3	6	39339	39344	50 %	50 %	0 %	0 %	15603915
1064	NC_000963	TGC	2	6	39354	39359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603915
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1102	NC_000963	ATT	2	6	40976	40981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1104	NC_000963	T	6	6	41009	41014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_000963	A	6	6	41040	41045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_000963	AATA	2	8	41054	41061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_000963	AAAT	2	8	41120	41127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_000963	TAT	2	6	41161	41166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_000963	TTG	2	6	41177	41182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_000963	AAT	2	6	41197	41202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_000963	TAG	2	6	41381	41386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_000963	CTG	2	6	41387	41392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_000963	GTATT	2	10	41419	41428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_000963	TAC	2	6	41451	41456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_000963	ATT	2	6	41470	41475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_000963	TA	3	6	41500	41505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_000963	TA	3	6	41534	41539	50 %	50 %	0 %	0 %	15603916
1118	NC_000963	TAT	2	6	41592	41597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603916
1119	NC_000963	GCA	2	6	41630	41635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603916
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1125	NC_000963	TA	3	6	41919	41924	50 %	50 %	0 %	0 %	15603916
1126	NC_000963	TAC	2	6	41946	41951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603916
1127	NC_000963	TGC	2	6	41983	41988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603916
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1129	NC_000963	CTT	2	6	42015	42020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603916
1130	NC_000963	ATT	2	6	42029	42034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603916
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