MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000963	AAG	2	6	206478	206483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604049
5502	NC_000963	ACA	2	6	206576	206581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604049
5503	NC_000963	ATA	2	6	206658	206663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604049
5504	NC_000963	CT	3	6	206684	206689	0 %	50 %	0 %	50 %	15604049
5505	NC_000963	TAG	2	6	206695	206700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604049
5506	NC_000963	AG	3	6	206723	206728	50 %	0 %	50 %	0 %	15604049
5507	NC_000963	TAT	2	6	206739	206744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604049
5508	NC_000963	GCA	2	6	206769	206774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604049
5509	NC_000963	T	6	6	206832	206837	0 %	100 %	0 %	0 %	15604049
5510	NC_000963	GAA	2	6	206924	206929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604049
5511	NC_000963	TA	3	6	206965	206970	50 %	50 %	0 %	0 %	15604049
5512	NC_000963	CT	3	6	207018	207023	0 %	50 %	0 %	50 %	15604049
5513	NC_000963	ATA	2	6	207092	207097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604049
5514	NC_000963	TTG	2	6	207104	207109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604049
5515	NC_000963	TAA	2	6	207139	207144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604049
5516	NC_000963	T	8	8	207190	207197	0 %	100 %	0 %	0 %	15604049
5517	NC_000963	CATCT	2	10	207220	207229	20 %	40 %	0 %	40 %	15604049
5518	NC_000963	ACC	2	6	207232	207237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604049
5519	NC_000963	TTAC	2	8	207281	207288	25 %	50 %	0 %	25 %	15604049
5520	NC_000963	T	6	6	207304	207309	0 %	100 %	0 %	0 %	15604049
5521	NC_000963	T	8	8	207315	207322	0 %	100 %	0 %	0 %	15604049
5522	NC_000963	ATC	2	6	207418	207423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604049
5523	NC_000963	T	6	6	207505	207510	0 %	100 %	0 %	0 %	15604049
5524	NC_000963	TTGC	2	8	207531	207538	0 %	50 %	25 %	25 %	15604049
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5527	NC_000963	TA	3	6	207630	207635	50 %	50 %	0 %	0 %	15604049
5528	NC_000963	TAT	3	9	207642	207650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604049
5529	NC_000963	TAA	2	6	207676	207681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604049
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5531	NC_000963	T	7	7	207705	207711	0 %	100 %	0 %	0 %	15604049
5532	NC_000963	ATT	2	6	207713	207718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604049
5533	NC_000963	AAT	2	6	207719	207724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_000963	ATTAA	2	10	207729	207738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_000963	TAA	2	6	207870	207875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_000963	TAT	2	6	207893	207898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_000963	ATA	2	6	207929	207934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_000963	A	6	6	207981	207986	100 %	0 %	0 %	0 %	15604050
5539	NC_000963	CATT	2	8	208020	208027	25 %	50 %	0 %	25 %	15604050
5540	NC_000963	TTTG	2	8	208034	208041	0 %	75 %	25 %	0 %	15604050
5541	NC_000963	AGTA	2	8	208077	208084	50 %	25 %	25 %	0 %	15604050
5542	NC_000963	TAT	2	6	208143	208148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604050
5543	NC_000963	AT	3	6	208158	208163	50 %	50 %	0 %	0 %	15604050
5544	NC_000963	T	8	8	208172	208179	0 %	100 %	0 %	0 %	15604050
5545	NC_000963	GGC	2	6	208183	208188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15604050
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5549	NC_000963	ATA	2	6	208259	208264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604050
5550	NC_000963	CTG	2	6	208331	208336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604050
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5552	NC_000963	A	7	7	208386	208392	100 %	0 %	0 %	0 %	15604050
5553	NC_000963	GCA	2	6	208438	208443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604050
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5556	NC_000963	ATT	2	6	208602	208607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604050
5557	NC_000963	TAATT	2	10	208617	208626	40 %	60 %	0 %	0 %	15604050
5558	NC_000963	AGC	2	6	208644	208649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604050
5559	NC_000963	GCTAG	2	10	208720	208729	20 %	20 %	40 %	20 %	15604050
5560	NC_000963	TAG	2	6	208800	208805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604050
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5562	NC_000963	AAATTC	2	12	208815	208826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15604050
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5564	NC_000963	A	6	6	208884	208889	100 %	0 %	0 %	0 %	15604050
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5573	NC_000963	AATT	2	8	209154	209161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_000963	TTG	2	6	209164	209169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5576	NC_000963	ATC	2	6	209188	209193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_000963	TAG	3	9	209236	209244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5581	NC_000963	AT	3	6	209294	209299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_000963	T	6	6	209391	209396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5593	NC_000963	TAAA	2	8	209812	209819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_000963	TAAAA	2	10	209967	209976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_000963	TAG	2	6	209986	209991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5603	NC_000963	AGT	2	6	210086	210091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5605	NC_000963	ATTTT	2	10	210199	210208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_000963	TAT	2	6	210253	210258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_000963	GTT	2	6	210277	210282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_000963	TAA	2	6	210382	210387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_000963	TAG	2	6	210885	210890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604051
5623	NC_000963	TTGCT	2	10	210900	210909	0 %	60 %	20 %	20 %	15604051
5624	NC_000963	T	7	7	210948	210954	0 %	100 %	0 %	0 %	15604051
5625	NC_000963	AT	5	10	210984	210993	50 %	50 %	0 %	0 %	15604051
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5627	NC_000963	AAAGCA	2	12	211106	211117	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15604051
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5629	NC_000963	CAA	2	6	211233	211238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604051
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