MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000963	ATA	2	6	187554	187559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604033
5002	NC_000963	AATAA	2	10	187577	187586	80 %	20 %	0 %	0 %	15604033
5003	NC_000963	AAT	2	6	187631	187636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604033
5004	NC_000963	AGC	2	6	187691	187696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604033
5005	NC_000963	CAG	2	6	187702	187707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604033
5006	NC_000963	CAA	2	6	187729	187734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604033
5007	NC_000963	CAA	2	6	187765	187770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604033
5008	NC_000963	A	6	6	187779	187784	100 %	0 %	0 %	0 %	15604033
5009	NC_000963	AAT	2	6	187788	187793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604033
5010	NC_000963	TAA	2	6	187860	187865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_000963	TGT	2	6	187898	187903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_000963	TATT	2	8	187928	187935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_000963	AAAC	2	8	187941	187948	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_000963	ATA	2	6	187986	187991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_000963	AAT	3	9	187992	188000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_000963	AAGA	2	8	188083	188090	75 %	0 %	25 %	0 %	15604034
5017	NC_000963	AGA	2	6	188094	188099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604034
5018	NC_000963	TAA	2	6	188127	188132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604034
5019	NC_000963	TCC	2	6	188193	188198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604034
5020	NC_000963	A	6	6	188202	188207	100 %	0 %	0 %	0 %	15604034
5021	NC_000963	TAA	2	6	188221	188226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604034
5022	NC_000963	TA	3	6	188291	188296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_000963	TAT	3	9	188299	188307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_000963	ATC	2	6	188366	188371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_000963	A	6	6	188381	188386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_000963	T	8	8	188406	188413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_000963	CAC	2	6	188418	188423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_000963	TAC	2	6	188443	188448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_000963	AAT	2	6	188478	188483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_000963	TAA	2	6	188512	188517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_000963	TAT	2	6	188533	188538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_000963	GTAT	2	8	188568	188575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_000963	T	8	8	188590	188597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_000963	ATT	2	6	188631	188636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_000963	TCT	2	6	188647	188652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_000963	T	6	6	188670	188675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_000963	TA	3	6	188692	188697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_000963	ATT	2	6	188719	188724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_000963	ATTA	2	8	188741	188748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_000963	AAG	2	6	188793	188798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_000963	TAT	2	6	188820	188825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_000963	GTT	2	6	188883	188888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_000963	ATTT	2	8	188934	188941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_000963	T	6	6	188965	188970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_000963	TAA	2	6	189000	189005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_000963	TA	3	6	189007	189012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_000963	ATTC	2	8	189052	189059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_000963	TTA	2	6	189065	189070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_000963	ATC	2	6	189094	189099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_000963	TAAT	2	8	189127	189134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_000963	ATA	2	6	189147	189152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_000963	ATA	2	6	189173	189178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_000963	ATT	2	6	189193	189198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_000963	TA	3	6	189219	189224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_000963	AT	3	6	189335	189340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_000963	ATGTA	2	10	189379	189388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_000963	GTT	2	6	189399	189404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_000963	TA	3	6	189444	189449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_000963	ATC	2	6	189503	189508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604035
5060	NC_000963	TCT	2	6	189517	189522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604035
5061	NC_000963	AAATT	2	10	189699	189708	60 %	40 %	0 %	0 %	15604035
5062	NC_000963	T	7	7	189786	189792	0 %	100 %	0 %	0 %	15604035
5063	NC_000963	ACC	2	6	189806	189811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604035
5064	NC_000963	CAC	2	6	189895	189900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604035
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5067	NC_000963	TA	3	6	189974	189979	50 %	50 %	0 %	0 %	15604035
5068	NC_000963	TAT	2	6	189982	189987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604035
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5099	NC_000963	AAAT	2	8	191226	191233	75 %	25 %	0 %	0 %	15604035
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5112	NC_000963	TCT	2	6	191586	191591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604035
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5119	NC_000963	TTTAAT	2	12	191792	191803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_000963	TAG	2	6	191957	191962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_000963	ATA	2	6	191963	191968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_000963	AGCA	2	8	191977	191984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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