MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Pediococcus pentosaceus SL4

Total Repeats: 466

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022780	AT	3	6	1529	1534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022780	AG	3	6	1540	1545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022780	TA	3	6	10172	10177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022780	AG	3	6	16976	16981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022780	AG	3	6	17241	17246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022780	AT	4	8	21373	21380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022780	AT	3	6	24560	24565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022780	AC	3	6	26312	26317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022780	TA	4	8	28683	28690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022780	TA	3	6	33252	33257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022780	GA	3	6	40163	40168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022780	GA	3	6	50026	50031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022780	GT	3	6	54611	54616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022780	AT	3	6	61183	61188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022780	AT	3	6	61292	61297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022780	AT	3	6	61357	61362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022780	AT	3	6	69749	69754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022780	TA	3	6	69843	69848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022780	GC	4	8	72706	72713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022780	GA	3	6	79127	79132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022780	AT	3	6	81013	81018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022780	TA	4	8	83597	83604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022780	AT	3	6	85018	85023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022780	TA	3	6	86315	86320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022780	AG	3	6	88372	88377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022780	AT	3	6	88422	88427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022780	AG	3	6	88555	88560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022780	TA	3	6	89606	89611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022780	TA	3	6	91518	91523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022780	TC	3	6	91799	91804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022780	GT	3	6	95410	95415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022780	TA	3	6	96652	96657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022780	AT	3	6	97863	97868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022780	AT	3	6	99017	99022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022780	TG	3	6	99051	99056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022780	TA	3	6	99170	99175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022780	AT	4	8	105683	105690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022780	TA	3	6	108917	108922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022780	TA	4	8	110051	110058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022780	AT	3	6	112005	112010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022780	CT	3	6	112053	112058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022780	AG	3	6	112069	112074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022780	AC	3	6	112491	112496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022780	GT	3	6	112573	112578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022780	TG	3	6	113035	113040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022780	CT	4	8	113394	113401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022780	TA	3	6	113418	113423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022780	TG	4	8	113463	113470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022780	GA	3	6	113908	113913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022780	AT	3	6	117572	117577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022780	GC	3	6	118301	118306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022780	AG	3	6	120316	120321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022780	GA	3	6	122870	122875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022780	AT	3	6	123875	123880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022780	AC	3	6	124396	124401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022780	AC	3	6	124565	124570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022780	GA	3	6	124868	124873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022780	TG	3	6	125134	125139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022780	AG	3	6	125324	125329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022780	TC	3	6	125358	125363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022780	TC	3	6	125819	125824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022780	AT	3	6	126019	126024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022780	GA	3	6	126661	126666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022780	GA	3	6	126985	126990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022780	AC	3	6	127660	127665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022780	TG	3	6	127711	127716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022780	GA	3	6	127935	127940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022780	TC	3	6	133346	133351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022780	TA	3	6	134203	134208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022780	AC	3	6	139429	139434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022780	TC	3	6	149190	149195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022780	TG	3	6	159957	159962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022780	AT	4	8	176364	176371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022780	AG	3	6	182554	182559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022780	TA	3	6	193613	193618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022780	TA	3	6	193761	193766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022780	AT	3	6	197498	197503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022780	AT	3	6	197684	197689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022780	GA	3	6	199331	199336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022780	AT	3	6	199772	199777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022780	AG	3	6	201783	201788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022780	TG	3	6	202024	202029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022780	AT	3	6	215860	215865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022780	AG	3	6	215872	215877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022780	TG	3	6	220797	220802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022780	TA	3	6	244952	244957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022780	TG	3	6	249360	249365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022780	CT	3	6	251836	251841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022780	TA	3	6	257002	257007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022780	GA	3	6	258250	258255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022780	TC	3	6	264069	264074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022780	AC	3	6	265420	265425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022780	TA	3	6	268046	268051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022780	AT	4	8	268084	268091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022780	AT	3	6	287777	287782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022780	GA	3	6	287935	287940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022780	AT	3	6	288940	288945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022780	AC	3	6	289461	289466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022780	AC	3	6	289630	289635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022780	GA	3	6	289933	289938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022780	TG	3	6	290199	290204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022780	AG	3	6	290389	290394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022780	TC	3	6	290423	290428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022780	TC	3	6	290884	290889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022780	AT	3	6	291084	291089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022780	GA	3	6	291726	291731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022780	GA	3	6	292050	292055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022780	AC	3	6	292725	292730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022780	TG	3	6	292776	292781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022780	GA	3	6	293000	293005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022780	TA	3	6	306004	306009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022780	AG	4	8	312347	312354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022780	TA	3	6	317179	317184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022780	AT	3	6	345871	345876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022780	AC	3	6	348842	348847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022780	GA	3	6	350175	350180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022780	GA	3	6	358995	359000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022780	AG	3	6	362405	362410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022780	AT	5	10	372124	372133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022780	GA	3	6	382402	382407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022780	GA	3	6	390296	390301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022780	AT	3	6	410188	410193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022780	GT	3	6	412610	412615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022780	TA	3	6	414239	414244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022780	AT	3	6	418409	418414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022780	AT	3	6	419454	419459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022780	AC	3	6	437672	437677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022780	AT	3	6	447117	447122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022780	GT	3	6	447166	447171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022780	TC	3	6	455251	455256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022780	AT	3	6	455985	455990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022780	AC	3	6	468862	468867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022780	AT	3	6	478968	478973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022780	AT	3	6	481139	481144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022780	GA	3	6	490722	490727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022780	AT	3	6	491354	491359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022780	GA	3	6	509918	509923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022780	TG	3	6	510674	510679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022780	TA	3	6	515583	515588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022780	AT	3	6	522638	522643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022780	TA	3	6	522693	522698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022780	AG	3	6	524039	524044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022780	TA	3	6	525187	525192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022780	TG	3	6	532188	532193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022780	GT	3	6	537682	537687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022780	TG	3	6	538132	538137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022780	TC	3	6	539344	539349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022780	TA	3	6	539352	539357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022780	TA	3	6	562920	562925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022780	AT	3	6	562997	563002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022780	TG	3	6	564580	564585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022780	CA	3	6	578284	578289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022780	GC	3	6	578957	578962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022780	AT	3	6	583349	583354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_022780	TA	3	6	583416	583421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_022780	TA	3	6	1741049	1741054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_022780	TA	3	6	1741125	1741130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_022780	AT	3	6	1747545	1747550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_022780	AG	3	6	1747632	1747637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_022780	CT	3	6	1751575	1751580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
460	NC_022780	TA	3	6	1754129	1754134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_022780	TA	3	6	1774727	1774732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_022780	TC	3	6	1781331	1781336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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464	NC_022780	TC	3	6	1788416	1788421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_022780	TA	5	10	1788429	1788438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.