MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Pediococcus pentosaceus SL4

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022780	TTAAA	2	10	30668	30677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022780	ATAGT	2	10	33283	33292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022780	AAATA	2	10	37344	37353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022780	TCTAA	2	10	39262	39271	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022780	ATTTT	2	10	43973	43982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022780	TAAAA	2	10	59484	59493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022780	GTTTT	2	10	61422	61431	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022780	AATAT	2	10	61631	61640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022780	GATTA	2	10	69445	69454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022780	TAATT	2	10	69874	69883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022780	ATAAA	2	10	85709	85718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022780	GAATT	2	10	96616	96625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022780	GATAA	2	10	97321	97330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022780	AAAAC	2	10	97798	97807	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022780	AAATT	2	10	99279	99288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022780	TTTAT	2	10	100819	100828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022780	TTTGT	2	10	104485	104494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022780	TTTTA	2	10	111651	111660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022780	ATTGT	2	10	111709	111718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022780	TTCTA	2	10	111944	111953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022780	ATATG	2	10	112504	112513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022780	TAAAA	2	10	113569	113578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022780	AAAAT	2	10	118224	118233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022780	TGCTA	2	10	121820	121829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022780	GTATA	2	10	122847	122856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022780	GTCTG	2	10	123908	123917	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022780	TCGTG	2	10	124242	124251	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022780	CTGAA	2	10	126866	126875	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022780	AGGGG	2	10	133459	133468	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022780	AAGTA	2	10	133932	133941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022780	GTGCT	2	10	139177	139186	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022780	ACAAA	2	10	149067	149076	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022780	ATTAT	2	10	154604	154613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022780	ATAGA	2	10	157140	157149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022780	TAATT	2	10	167210	167219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022780	TTAAA	2	10	167358	167367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022780	ATATA	2	10	170039	170048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022780	GTTTG	2	10	176294	176303	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022780	TTAAA	2	10	185176	185185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022780	CTTTG	2	10	193459	193468	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022780	AAAAT	2	10	197420	197429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022780	TTGGT	2	10	200282	200291	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022780	TTTTA	2	10	207372	207381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022780	AGATT	2	10	215731	215740	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022780	AATCT	2	10	215759	215768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022780	TGAAA	2	10	235315	235324	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022780	ACAAT	2	10	239021	239030	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022780	TTTTA	2	10	242039	242048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022780	TTTTA	2	10	250484	250493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022780	TTAAA	2	10	273643	273652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022780	TGCTA	2	10	283382	283391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022780	GTATA	2	10	287912	287921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022780	GTCTG	2	10	288973	288982	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022780	TCGTG	2	10	289307	289316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022780	CTGAA	2	10	291931	291940	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022780	AAACT	2	10	301259	301268	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022780	AGTTT	2	10	301290	301299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022780	TAAAA	2	10	313675	313684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022780	AATCA	2	10	317976	317985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022780	ATTTA	2	10	332235	332244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022780	TAAAA	2	10	338317	338326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022780	ATATT	2	10	342813	342822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022780	TTTCC	2	10	349106	349115	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_022780	ATGAT	2	10	351720	351729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022780	TAAAA	2	10	356251	356260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022780	GTAAA	2	10	362295	362304	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022780	GTGGA	2	10	362442	362451	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022780	CGATT	2	10	363257	363266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022780	GGATG	2	10	373408	373417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022780	CGAAC	2	10	375266	375275	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022780	TATTT	2	10	375541	375550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022780	AAACC	2	10	375564	375573	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022780	TAAAT	2	10	381198	381207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022780	AAGAG	2	10	382370	382379	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022780	AGGTG	2	10	385156	385165	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022780	CTTTA	2	10	393063	393072	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022780	ATGTT	2	10	393561	393570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022780	CAAAA	2	10	407557	407566	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022780	AATAA	2	10	421756	421765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022780	ATTAA	2	10	437760	437769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022780	TAAAA	2	10	438244	438253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022780	TTATG	2	10	467491	467500	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022780	AAATT	2	10	468637	468646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022780	AAAAT	2	10	478983	478992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022780	TTAAA	2	10	484511	484520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022780	TTTTA	2	10	489982	489991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022780	ACAAA	2	10	491304	491313	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022780	TATAA	2	10	493816	493825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022780	TGAAA	2	10	493865	493874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022780	CTTTT	2	10	507923	507932	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022780	TAAAA	2	10	522592	522601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022780	GATTC	2	10	537654	537663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022780	TTTAA	2	10	547712	547721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022780	TAATT	2	10	564532	564541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022780	ATATA	2	10	568953	568962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022780	ATCCA	2	10	575718	575727	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_022780	TAGAA	2	10	575779	575788	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022780	AAAAT	2	10	578330	578339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022780	ATAGA	2	10	578986	578995	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022780	GAAAA	2	10	579013	579022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022780	TTTTA	2	10	585921	585930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022780	CTATA	2	10	589341	589350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022780	GAATT	2	10	589397	589406	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022780	TTGAG	2	10	605478	605487	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022780	AAGAA	2	10	605530	605539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022780	AAAAC	2	10	605720	605729	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022780	ATTTA	2	10	613371	613380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022780	AAAGG	2	10	618515	618524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022780	CTTTT	2	10	620282	620291	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022780	TTTAA	2	10	625914	625923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022780	CTTAA	2	10	628145	628154	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022780	TATAA	2	10	628280	628289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022780	TAAAT	2	10	643776	643785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022780	ATAGT	2	10	649602	649611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022780	ATTAA	2	10	649645	649654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022780	GATTA	2	10	654207	654216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022780	TTTAA	2	10	660004	660013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022780	ATTGA	2	10	660280	660289	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022780	GTCTG	2	10	683243	683252	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022780	TCGTG	2	10	683577	683586	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022780	CTGAA	2	10	686201	686210	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022780	AAATT	2	10	692185	692194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022780	AAATG	2	10	703891	703900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022780	TAAAC	2	10	713234	713243	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022780	CAATT	2	10	715769	715778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022780	GAAAA	2	10	717237	717246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022780	TTAAT	2	10	718324	718333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022780	GAGCG	2	10	721072	721081	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_022780	TGATA	2	10	721602	721611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022780	AATTT	2	10	730027	730036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022780	CATAC	2	10	730055	730064	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_022780	GGAGC	2	10	745885	745894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022780	AACAA	2	10	753465	753474	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022780	ATATA	2	10	761013	761022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022780	AATTA	2	10	762743	762752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022780	TCAAA	2	10	762766	762775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022780	TAATT	2	10	762921	762930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022780	TTGAT	2	10	774705	774714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022780	ATCTG	2	10	775032	775041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022780	AATTG	2	10	775689	775698	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022780	ATTGC	2	10	775770	775779	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022780	GCATG	2	10	776176	776185	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022780	ATTTT	2	10	776814	776823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022780	AAATT	2	10	777178	777187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022780	GCAAA	2	10	790431	790440	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022780	TTAAG	2	10	790443	790452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022780	TTAAT	2	10	790828	790837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022780	AGTAT	2	10	793122	793131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022780	TATGA	2	10	795809	795818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022780	TAAAT	2	10	833041	833050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.