MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022111	ATATA	2	10	13317	13326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022111	GATGT	2	10	13858	13867	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022111	AAAGT	2	10	16953	16962	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022111	AATTA	2	10	19925	19934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022111	AAGAA	2	10	20279	20288	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022111	TTTCT	2	10	26932	26941	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022111	TGTAA	2	10	27114	27123	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022111	TGTGA	2	10	34333	34342	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022111	GAAAA	2	10	44497	44506	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022111	TTTTA	2	10	57777	57786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022111	AGTGC	2	10	82220	82229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022111	TTTAT	2	10	83212	83221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022111	TTCTC	2	10	88244	88253	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022111	TAAAA	2	10	100932	100941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022111	TAAAA	2	10	101216	101225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022111	TTTTA	2	10	108526	108535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022111	AAAAT	2	10	110304	110313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022111	TTATA	2	10	113836	113845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022111	ATTGT	2	10	116875	116884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022111	TAAAA	2	10	117011	117020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022111	TAATT	2	10	124245	124254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022111	GCATT	2	10	124305	124314	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022111	TTTTG	2	10	130964	130973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022111	AGTAT	2	10	135362	135371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022111	TAAAA	2	10	137823	137832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022111	ACCTT	2	10	138320	138329	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_022111	ATTGT	2	10	157020	157029	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022111	TTTTG	2	10	158338	158347	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022111	ATGAG	2	10	158515	158524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022111	CAGCC	2	10	158790	158799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_022111	GAAAA	2	10	158860	158869	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022111	CTGGA	2	10	180207	180216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022111	TAATT	2	10	185461	185470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022111	GAAAA	2	10	188210	188219	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022111	TAAAA	2	10	188237	188246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022111	CAAAA	2	10	195394	195403	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022111	GCGGG	2	10	203271	203280	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022111	ATATT	2	10	212388	212397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022111	TAAAA	2	10	225654	225663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022111	ATTTT	2	10	228568	228577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022111	GTAAT	2	10	228626	228635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022111	AAAAG	2	10	228784	228793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022111	GCTAT	2	10	232798	232807	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022111	AAATA	2	10	233406	233415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022111	ATTTT	2	10	235190	235199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022111	ATAGC	2	10	242779	242788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022111	GTAAT	2	10	251016	251025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022111	ATTTA	2	10	269889	269898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022111	ATCTT	2	10	297555	297564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022111	TATTT	2	10	304587	304596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022111	GCAAT	2	10	311573	311582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022111	TTGCA	2	10	319764	319773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022111	ACAAA	2	10	325813	325822	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022111	TTTTA	2	10	329386	329395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022111	AAAAG	2	10	329463	329472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022111	TTTCT	2	10	330114	330123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022111	TCTTT	2	10	330873	330882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022111	ATAGA	2	10	339778	339787	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022111	TTTGA	2	10	340895	340904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022111	AAAAG	2	10	347601	347610	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022111	AAAGT	2	10	348982	348991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022111	TAAAA	2	10	351695	351704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022111	AATAA	2	10	352755	352764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022111	TTTTC	2	10	352851	352860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022111	CTTTT	2	10	357331	357340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022111	TTTGT	2	10	358125	358134	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022111	TATAA	2	10	358907	358916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022111	ATATT	2	10	360092	360101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022111	TAGCT	2	10	363221	363230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022111	AAAAG	2	10	367523	367532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022111	CATTT	2	10	369533	369542	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022111	TTTTG	2	10	375058	375067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022111	TATCT	2	10	375130	375139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022111	ATTTT	2	10	375141	375150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022111	AATGA	2	10	375228	375237	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022111	CTTTT	2	10	376262	376271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022111	CTTTT	2	10	384271	384280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022111	ATTTT	2	10	384866	384875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022111	TTTTG	2	10	384989	384998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022111	TAAGT	2	10	385745	385754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022111	TTTTA	2	10	385956	385965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022111	TAGAG	2	10	386045	386054	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022111	TGTAA	2	10	387143	387152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022111	TGTAA	2	10	392920	392929	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022111	TAATA	2	10	402005	402014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022111	CATAA	2	10	403985	403994	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022111	TAAAA	2	10	405709	405718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022111	GAACC	2	10	408510	408519	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022111	TATAT	2	10	409667	409676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022111	TGATT	2	10	421941	421950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022111	AAGGT	2	10	422003	422012	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022111	ATAGC	2	10	422046	422055	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022111	AAAAT	2	10	428271	428280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022111	TTATT	2	10	444028	444037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022111	ATTAA	2	10	444767	444776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022111	CAAAT	2	10	445975	445984	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022111	TAAAA	2	10	464595	464604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022111	ATAAA	2	10	473181	473190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022111	AAAAG	2	10	473275	473284	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022111	ATTAT	2	10	475976	475985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022111	TAATA	2	10	476189	476198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022111	TTTTG	2	10	483452	483461	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022111	TTGAA	2	10	483657	483666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022111	GCAAT	2	10	483685	483694	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022111	TCTTG	2	10	483844	483853	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022111	AAATA	2	10	483872	483881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022111	GAATG	2	10	486013	486022	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022111	TCTTT	2	10	495702	495711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022111	TAAAA	2	10	495823	495832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022111	AAACA	2	10	497890	497899	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022111	TCTTT	2	10	512573	512582	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022111	TTTAA	2	10	512682	512691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022111	TACAA	2	10	513826	513835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022111	AAAGT	2	10	516306	516315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022111	AAAAG	2	10	520344	520353	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022111	CTTTT	2	10	530918	530927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022111	TTGAT	2	10	536286	536295	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022111	ATGAA	2	10	546777	546786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022111	ATAAA	2	10	554541	554550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022111	TAAAA	2	10	556330	556339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022111	ACTAT	2	10	556481	556490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022111	AATAA	2	10	556562	556571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022111	TAAAA	2	10	559515	559524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022111	TATAA	2	10	563651	563660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022111	TTTTC	2	10	563801	563810	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022111	AACAA	2	10	576803	576812	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022111	AATAA	2	10	580933	580942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022111	GAAAA	2	10	582703	582712	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022111	TTGTT	2	10	597406	597415	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022111	ATTAT	2	10	603639	603648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022111	ATTAA	2	10	612565	612574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022111	ATAAA	2	10	640787	640796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022111	TAATT	2	10	645646	645655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022111	TCTTT	2	10	654434	654443	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022111	ATTTT	2	10	656203	656212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022111	TTATT	2	10	656941	656950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022111	AAAGA	2	10	657821	657830	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022111	ATTTT	2	10	657904	657913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022111	ATACC	2	10	689202	689211	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_022111	TATTT	2	10	707627	707636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022111	AATTT	2	10	728172	728181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022111	TACCG	2	10	740449	740458	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_022111	GAATA	2	10	740499	740508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022111	TATAA	2	10	745425	745434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022111	TGTTT	2	10	745762	745771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022111	TTTTA	2	10	745780	745789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022111	ATTAA	2	10	752662	752671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022111	TATAA	2	10	772745	772754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022111	ATTAT	2	10	774858	774867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022111	TATAA	2	10	774881	774890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022111	TTATT	2	10	774957	774966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022111	CTATT	2	10	802859	802868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_022111	ATTAA	2	10	805959	805968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022111	AAATT	2	10	805969	805978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_022111	TAAAA	2	10	810929	810938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_022111	TAAAA	2	10	899552	899561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022111	TTATA	2	10	899562	899571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_022111	TATTT	2	10	911210	911219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022111	TATTT	2	10	911524	911533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022111	TAGGT	2	10	915921	915930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_022111	TAAAA	2	10	975148	975157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_022111	TTTTG	2	10	1392655	1392664	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022111	TTTTA	2	10	1410426	1410435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_022111	ATTCT	2	10	1415024	1415033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_022111	AATAG	2	10	1418730	1418739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022111	TATTT	2	10	1421502	1421511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022111	CTAAA	2	10	1423223	1423232	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_022111	GGAAT	2	10	1423429	1423438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_022111	AAGAT	2	10	1434735	1434744	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_022111	ATTGC	2	10	1550809	1550818	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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333	NC_022111	GAAAG	2	10	1614324	1614333	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
334	NC_022111	TAATT	2	10	1614500	1614509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_022111	GTAAG	2	10	1649902	1649911	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
345	NC_022111	TATTT	2	10	1649984	1649993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.