MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022042	CTTC	2	8	1572	1579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022042	AAGC	2	8	3951	3958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022042	GCCG	2	8	6124	6131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022042	AGGG	2	8	23915	23922	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022042	ATCT	2	8	27217	27224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022042	CCGC	2	8	28960	28967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_022042	TGCG	2	8	29012	29019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022042	ATGG	2	8	29178	29185	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022042	GAAC	2	8	29498	29505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022042	GTGA	2	8	29843	29850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022042	TCTT	2	8	31615	31622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022042	GCGA	2	8	31918	31925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022042	TCTA	2	8	32244	32251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022042	CGTC	2	8	32614	32621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022042	AGCC	2	8	33911	33918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022042	CCCG	2	8	39022	39029	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_022042	CCGC	2	8	39875	39882	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_022042	GCTG	2	8	51086	51093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022042	CCCG	2	8	56839	56846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_022042	CGTT	2	8	60471	60478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022042	AGCG	2	8	63547	63554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022042	GACG	2	8	70570	70577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022042	GGTC	2	8	70609	70616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022042	TGGG	2	8	70656	70663	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022042	ATGT	2	8	78331	78338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022042	GCAA	2	8	82542	82549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022042	CGCC	2	8	82584	82591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_022042	GGCG	2	8	90602	90609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022042	CGGG	2	8	90655	90662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022042	CCTA	2	8	90666	90673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022042	GATC	2	8	90883	90890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022042	GCCC	2	8	92565	92572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_022042	AGAC	2	8	114704	114711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.