MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pleurocapsa sp. PCC 7327 chromosome

Total Repeats: 19415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019689	AAATC	2	10	384334	384343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1502	NC_019689	TTTAA	2	10	384351	384360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_019689	TTTTC	2	10	384364	384373	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1504	NC_019689	CTT	2	6	384394	384399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_019689	TAT	2	6	384407	384412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019689	TAC	2	6	384415	384420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_019689	GTTT	2	8	384421	384428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019689	AG	3	6	384456	384461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019689	TTA	2	6	385400	385405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019689	CAAAG	2	10	385659	385668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_019689	ATT	2	6	385836	385841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019689	CCAA	2	8	385853	385860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_019689	CAA	2	6	385885	385890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_019689	CCG	2	6	385891	385896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_019689	AT	3	6	385917	385922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_019689	GTC	2	6	385957	385962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_019689	T	6	6	386041	386046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_019689	CGAA	2	8	386084	386091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_019689	TAT	2	6	386660	386665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_019689	GCT	2	6	386749	386754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_019689	CCAAA	2	10	386801	386810	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1522	NC_019689	GA	3	6	386816	386821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_019689	A	6	6	386823	386828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_019689	TAAAT	2	10	386869	386878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_019689	TCA	2	6	386913	386918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_019689	TTA	2	6	386921	386926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_019689	AAC	2	6	387491	387496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_019689	TTA	2	6	387507	387512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019689	TTA	2	6	387961	387966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_019689	T	7	7	387970	387976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_019689	CCG	2	6	388034	388039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_019689	CGG	2	6	388045	388050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_019689	TAGCGA	2	12	388083	388094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1534	NC_019689	TTC	2	6	388131	388136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_019689	T	7	7	388200	388206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_019689	A	6	6	388221	388226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019689	A	6	6	388255	388260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_019689	A	6	6	388283	388288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019689	A	6	6	388340	388345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_019689	CTT	2	6	388593	388598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_019689	T	6	6	388597	388602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_019689	TCAA	2	8	388610	388617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_019689	A	7	7	388616	388622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019689	TTA	2	6	388626	388631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_019689	AGG	2	6	388644	388649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_019689	TGA	2	6	389097	389102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_019689	TAA	2	6	389663	389668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_019689	CAA	2	6	389718	389723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_019689	CTT	2	6	390489	390494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_019689	CTA	2	6	390497	390502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_019689	T	6	6	390513	390518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_019689	TCT	2	6	391762	391767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_019689	CAG	2	6	392620	392625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_019689	ATTAG	2	10	392681	392690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019689	GCTT	2	8	392706	392713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_019689	ACT	2	6	392719	392724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_019689	GCTC	2	8	392765	392772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_019689	GA	3	6	392793	392798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_019689	GGAAG	2	10	392811	392820	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019689	TC	3	6	392835	392840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_019689	AG	3	6	392929	392934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_019689	T	6	6	393049	393054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019689	GA	3	6	393055	393060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019689	TA	4	8	393074	393081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_019689	T	6	6	393840	393845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_019689	TTTCC	2	10	393849	393858	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_019689	T	7	7	393911	393917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_019689	GAG	2	6	393943	393948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_019689	A	6	6	393951	393956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_019689	A	6	6	393983	393988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_019689	ATTTT	2	10	396262	396271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_019689	A	6	6	396283	396288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_019689	TTTAG	2	10	398006	398015	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_019689	ACAA	2	8	398021	398028	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_019689	TAA	2	6	400190	400195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_019689	A	6	6	401799	401804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_019689	AGG	2	6	401860	401865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019689	CGT	2	6	401869	401874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_019689	CGG	2	6	401879	401884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_019689	TGC	2	6	403823	403828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_019689	ACT	2	6	403838	403843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_019689	ACT	2	6	403850	403855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_019689	T	6	6	403889	403894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_019689	GTAGT	2	10	403967	403976	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_019689	AAGG	2	8	404006	404013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_019689	TCC	2	6	404382	404387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_019689	TCC	2	6	404389	404394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_019689	TCCCT	2	10	404409	404418	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1589	NC_019689	TAAA	2	8	405436	405443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019689	A	6	6	405497	405502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_019689	GA	3	6	405510	405515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_019689	GCA	2	6	405518	405523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_019689	AATT	2	8	405544	405551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_019689	TAC	2	6	405628	405633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_019689	GCT	2	6	405665	405670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_019689	CTAG	2	8	405723	405730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_019689	ATCT	2	8	405732	405739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_019689	TCGCGA	2	12	405799	405810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_019689	GTC	2	6	405871	405876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_019689	GAC	2	6	405881	405886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_019689	AAT	2	6	406002	406007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_019689	AGT	2	6	406017	406022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_019689	TCT	2	6	407108	407113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_019689	TAA	2	6	407141	407146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_019689	AGG	2	6	407221	407226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_019689	TAA	2	6	407271	407276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_019689	TTGGT	2	10	407365	407374	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_019689	GCT	2	6	408014	408019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_019689	TAA	2	6	409780	409785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_019689	ATGTT	2	10	411182	411191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_019689	GGTTT	2	10	411194	411203	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019689	T	6	6	411255	411260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_019689	TCGA	2	8	411271	411278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_019689	TCT	2	6	411288	411293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_019689	T	8	8	411304	411311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_019689	ATCG	2	8	411321	411328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_019689	CGT	2	6	411388	411393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_019689	TGAT	2	8	411411	411418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_019689	ATT	2	6	411428	411433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_019689	AAT	2	6	411490	411495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019689	A	6	6	411524	411529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_019689	GAA	2	6	411534	411539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019689	ATCA	2	8	411556	411563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_019689	T	6	6	411620	411625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_019689	CTG	2	6	411636	411641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_019689	GCAG	2	8	411647	411654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_019689	A	6	6	412758	412763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_019689	T	6	6	412766	412771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019689	T	6	6	412795	412800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019689	TAA	2	6	414068	414073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_019689	GCGATG	2	12	414159	414170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1632	NC_019689	CAT	2	6	414389	414394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_019689	CCG	2	6	414397	414402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_019689	ATC	2	6	414421	414426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_019689	AAG	2	6	414453	414458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_019689	CAC	2	6	414519	414524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1637	NC_019689	TCAGG	2	10	414710	414719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1638	NC_019689	GTC	2	6	414756	414761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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