MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Propionibacterium acidipropionici ATCC 4875 chromosome

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019395	GCCCTC	2	12	2098	2109	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019395	CTGGCG	2	12	51254	51265	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019395	AGTGTG	2	12	58605	58616	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019395	CGGGAC	2	12	59545	59556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019395	GTCGAT	2	12	104408	104419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019395	CTGGGG	2	12	146344	146355	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019395	CCCACA	2	12	181458	181469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019395	CACGGT	2	12	191247	191258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019395	CGATGA	2	12	202601	202612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019395	CGATGC	2	12	245624	245635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019395	GACGTC	2	12	246486	246497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019395	CGCGGG	2	12	253661	253672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019395	ACGTCC	2	12	272703	272714	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019395	GGGCCG	2	12	282834	282845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019395	CAGATC	2	12	365747	365758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019395	GGCGTC	2	12	384648	384659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019395	GCCGAC	2	12	385739	385750	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019395	TGGCGC	2	12	397790	397801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019395	AGGGAG	2	12	419843	419854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019395	GACCTC	2	12	425983	425994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019395	GCTGCG	2	12	426358	426369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019395	GACCTC	2	12	426606	426617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019395	CACCGG	2	12	431793	431804	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019395	CCCCAC	2	12	433068	433079	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_019395	GACCTC	2	12	440726	440737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019395	CGCAGC	2	12	441339	441350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019395	GCACCT	2	12	449308	449319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019395	GCGCCG	2	12	485822	485833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019395	CGGCGC	2	12	488749	488760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019395	ACTGTC	2	12	494000	494011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019395	CCGCGA	2	12	522472	522483	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019395	GGTGCT	2	12	523584	523595	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019395	GCTGGT	2	12	523656	523667	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019395	CTGGCC	2	12	524038	524049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019395	TGTGTC	2	12	534339	534350	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019395	AGGCTG	2	12	552904	552915	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019395	GGTGGA	2	12	572097	572108	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019395	CGGGGC	2	12	584259	584270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019395	CCCGGC	2	12	604625	604636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019395	GGGACG	2	12	693031	693042	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019395	TCGCCA	2	12	718531	718542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019395	CCGGAC	2	12	753658	753669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019395	ACCCGA	2	12	754387	754398	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019395	GGGGTC	2	12	771088	771099	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019395	CCCGGC	2	12	791715	791726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019395	CAGCGG	2	12	795852	795863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019395	CGACGC	2	12	798817	798828	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019395	CGGGTG	2	12	802238	802249	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019395	GGACCT	2	12	868391	868402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019395	CGTCCT	2	12	879253	879264	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019395	ACCCGG	2	12	923802	923813	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019395	GCCGGG	2	12	939563	939574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019395	TGCCGC	2	12	983136	983147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019395	CGGCCT	2	12	1009833	1009844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019395	TCTCGC	2	12	1107242	1107253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019395	TGACGG	2	12	1168578	1168589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019395	CAGAGT	2	12	1172556	1172567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019395	CCCGTC	2	12	1222315	1222326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019395	GGGGCC	2	12	1231791	1231802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019395	CGCCAG	2	12	1232473	1232484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019395	GGGGCC	2	12	1232779	1232790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019395	CGTCGC	2	12	1284877	1284888	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019395	CGGTGA	2	12	1301161	1301172	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019395	GGCTGG	2	12	1303934	1303945	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019395	GGGAGT	2	12	1314524	1314535	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019395	CCGGAA	2	12	1315371	1315382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019395	CTGGGG	2	12	1338295	1338306	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019395	GCGACG	2	12	1350218	1350229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019395	GCCTGT	2	12	1359878	1359889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019395	TGTCCT	2	12	1378257	1378268	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019395	TGAGCG	2	12	1438593	1438604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019395	GCGGAG	2	12	1475734	1475745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019395	GATCCG	2	12	1484781	1484792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019395	ACAGAT	2	12	1486685	1486696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019395	CGAATC	2	12	1581152	1581163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019395	CCGTAC	2	12	1609014	1609025	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019395	ACCCGG	2	12	1609107	1609118	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019395	GGGGGT	2	12	1669716	1669727	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019395	CCGTGC	2	12	1683841	1683852	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019395	GTTCCG	2	12	1711159	1711170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019395	CGGCCC	2	12	1738207	1738218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019395	ATGAGG	2	12	1760579	1760590	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019395	GTGGGG	2	12	1767429	1767440	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019395	GTCCCG	2	12	1802046	1802057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019395	GCCCCG	2	12	1802209	1802220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019395	CCCGAT	2	12	1802274	1802285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019395	ACGTGG	2	12	1802647	1802658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019395	GGACCG	2	12	1807621	1807632	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019395	TCGGCG	2	12	1836398	1836409	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019395	CGCAGC	2	12	1839091	1839102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019395	GACCTC	2	12	1839315	1839326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019395	GGGGCC	2	12	1862980	1862991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019395	TGGCGG	2	12	1863149	1863160	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019395	GATCCG	2	12	1960119	1960130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019395	CGATGT	2	12	1972345	1972356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019395	TCCAAG	2	12	1985789	1985800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019395	GACCTC	2	12	1989486	1989497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019395	GCTGCG	2	12	1989861	1989872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019395	GACCTC	2	12	1990109	1990120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019395	CACCGG	2	12	1994163	1994174	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019395	CCCCAC	2	12	1995438	1995449	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
102	NC_019395	TCCCAC	2	12	2005986	2005997	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019395	CGCCGG	2	12	2009179	2009190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019395	GCAGGC	2	12	2080470	2080481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019395	GCATCG	2	12	2097656	2097667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019395	GGCGAT	2	12	2108699	2108710	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019395	CCCGGA	2	12	2109895	2109906	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019395	CCGGCG	2	12	2109970	2109981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019395	TCGGCC	2	12	2136194	2136205	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019395	CCGGTC	2	12	2136442	2136453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019395	CCCGGC	2	12	2149218	2149229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019395	TCGGCC	2	12	2151776	2151787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019395	GCGAGA	2	12	2159161	2159172	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019395	GGTGAA	2	12	2159982	2159993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019395	CGACTC	2	12	2253370	2253381	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019395	GTCTCG	2	12	2253604	2253615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019395	CGACCC	2	12	2259246	2259257	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019395	GCGAAC	2	12	2273407	2273418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019395	GAACGG	2	12	2286020	2286031	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019395	CAAGAA	2	12	2287507	2287518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019395	CGCCCC	2	12	2330815	2330826	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
122	NC_019395	CGGCCG	2	12	2330827	2330838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019395	CCCCTC	2	12	2333051	2333062	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
124	NC_019395	GGCCCG	2	12	2347517	2347528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019395	TGCACC	2	12	2348824	2348835	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019395	CGATCT	2	12	2348951	2348962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019395	CGAGGA	2	12	2349353	2349364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019395	ACCCCG	2	12	2374373	2374384	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019395	TGCGGG	2	12	2472148	2472159	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019395	CCCCGC	2	12	2610623	2610634	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
131	NC_019395	CATCCA	2	12	2617562	2617573	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019395	GCGCAC	2	12	2658225	2658236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019395	TCGGAC	2	12	2660350	2660361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019395	CGCGAC	2	12	2737398	2737409	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019395	CACACC	2	12	2747726	2747737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019395	CACCGA	2	12	2803710	2803721	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019395	CGGCCG	2	12	2872131	2872142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019395	CACGGA	2	12	2883308	2883319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019395	CGGGCC	2	12	2896227	2896238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019395	CAGGGC	2	12	2896270	2896281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019395	CTGATC	2	12	2905688	2905699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019395	ATCATT	2	12	2918583	2918594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_019395	GGGCCC	2	12	2950488	2950499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019395	CCCGGC	2	12	3027245	3027256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_019395	ACCGCC	2	12	3038968	3038979	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019395	GCTCAT	2	12	3055533	3055544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019395	CATGGG	2	12	3069448	3069459	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_019395	TCGCGG	2	12	3073491	3073502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019395	GTCTCA	2	12	3096939	3096950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019395	GACGTC	2	12	3154548	3154559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019395	ACGATC	2	12	3159411	3159422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019395	GACCAT	2	12	3176895	3176906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_019395	CGGTGA	2	12	3201112	3201123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_019395	GACGCC	2	12	3201561	3201572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_019395	ACGTGG	2	12	3211428	3211439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_019395	GTTCAG	2	12	3223460	3223471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_019395	TCGGGT	2	12	3239779	3239790	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_019395	CCCGGA	2	12	3244591	3244602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_019395	CGGCCC	2	12	3254654	3254665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_019395	GAGTAC	2	12	3261292	3261303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_019395	GGTCGG	2	12	3319742	3319753	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_019395	CGGCCA	2	12	3325489	3325500	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
163	NC_019395	GCGCCC	2	12	3340899	3340910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_019395	GCGAGG	2	12	3353041	3353052	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_019395	TCACGG	2	12	3398032	3398043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_019395	GGCGCC	2	12	3433207	3433218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_019395	GGCCCG	2	12	3539257	3539268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
175	NC_019395	CGGTGG	2	12	3540400	3540411	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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178	NC_019395	GCCACG	2	12	3555609	3555620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
179	NC_019395	ACGCCG	2	12	3558320	3558331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
180	NC_019395	CCCCTC	2	12	3580181	3580192	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
181	NC_019395	GGCACC	2	12	3581241	3581252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
182	NC_019395	CGCGGA	2	12	3581439	3581450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_019395	CGGCCC	2	12	3596049	3596060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_019395	TCGAAC	2	12	3605184	3605195	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_019395	CGGGCA	2	12	3651017	3651028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.