MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pantoea ananatis AJ13355

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017531	TTAAAA	2	12	122853	122864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017531	TGAAAT	2	12	204925	204936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017531	GAAAAG	2	12	223786	223797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017531	AGGAAA	2	12	266499	266510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017531	TTTATT	2	12	281828	281839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017531	GCGATC	2	12	286390	286401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017531	TTTATT	2	12	290132	290143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017531	ATAAAT	2	12	303643	303654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017531	GCGCAG	2	12	307140	307151	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017531	ATCGAG	2	12	308253	308264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017531	GCAACG	2	12	314129	314140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017531	TTCCCA	2	12	323121	323132	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017531	GTCCCG	2	12	352925	352936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017531	CGGATG	2	12	371165	371176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017531	CGCTGC	2	12	428773	428784	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017531	TAAACC	2	12	439076	439087	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017531	GAAAGC	2	12	464453	464464	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017531	CGTTAA	2	12	464931	464942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017531	GCTAAA	2	12	465649	465660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017531	AAAGAG	2	12	483008	483019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017531	CGGATA	2	12	483132	483143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017531	TTATCA	2	12	486744	486755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017531	AAAATC	2	12	486887	486898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017531	ATTAAT	2	12	523606	523617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017531	AGCTGA	2	12	531446	531457	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017531	GCAGAG	13	78	565630	565707	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017531	CAGAGT	2	12	584001	584012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017531	CCTGGC	2	12	616109	616120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017531	CGTCAG	2	12	666073	666084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017531	GTTTAA	2	12	752147	752158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017531	GAAAAA	2	12	838939	838950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017531	TTTAGC	2	12	842971	842982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017531	GCCTTA	2	12	857259	857270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017531	GCAGTT	2	12	890936	890947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017531	AAATTT	2	12	895521	895532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017531	AGCGCC	2	12	900296	900307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017531	ATATTT	2	12	927426	927437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017531	GACAAG	2	12	927857	927868	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017531	GGTAAC	2	12	997450	997461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017531	TAATGT	2	12	1022974	1022985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017531	TCTGTT	11	66	1024404	1024469	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017531	TTTCTG	8	48	1024474	1024521	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017531	TTCAGG	2	12	1028953	1028964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017531	GCTGGT	2	12	1032345	1032356	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017531	ACGCCA	2	12	1047237	1047248	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017531	AGCGAA	2	12	1049277	1049288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017531	CAGACA	2	12	1077820	1077831	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017531	TAAAAA	2	12	1099823	1099834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017531	TAGGAT	2	12	1105997	1106008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017531	AAATTA	2	12	1107497	1107508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017531	ATGCTT	4	24	1122878	1122901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017531	TTCGTA	2	12	1141355	1141366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017531	CAGGAA	2	12	1153536	1153547	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017531	CAAACG	2	12	1168567	1168578	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017531	AGCTTT	2	12	1175951	1175962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017531	CGCGGA	2	12	1206688	1206699	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017531	TAACGC	2	12	1242471	1242482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017531	GAGGCT	2	12	1249182	1249193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017531	CTGCGC	2	12	1249535	1249546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017531	ACCGGA	2	12	1401792	1401803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017531	AAAAGC	2	12	1403294	1403305	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017531	GCCAGG	2	12	1408369	1408380	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017531	TGTGGT	2	12	1434289	1434300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017531	CTGACG	2	12	1451203	1451214	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017531	CCGTCA	2	12	1465288	1465299	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017531	AAATTG	2	12	1470114	1470125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017531	TAATTA	2	12	1471344	1471355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017531	TTGATG	2	12	1471632	1471643	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017531	GGGCCT	2	12	1472452	1472463	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017531	TCTTTC	2	12	1486419	1486430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017531	TGTGTT	2	12	1503481	1503492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017531	GATACT	2	12	1506704	1506715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017531	ATAAAT	2	12	1508960	1508971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017531	TTACCG	2	12	1552369	1552380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017531	GGGCAT	2	12	1568866	1568877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017531	GCTGAT	2	12	1594545	1594556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017531	TTTTCT	2	12	1612569	1612580	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017531	TAATGG	2	12	1618735	1618746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017531	GAAGGT	2	12	1621512	1621523	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017531	TTATCG	2	12	1623896	1623907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017531	TCCGGT	2	12	1625221	1625232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017531	GCTGCG	2	12	1625243	1625254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017531	CGGCAG	2	12	1638666	1638677	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017531	GCGTTC	2	12	1647152	1647163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017531	AAGATA	2	12	1664033	1664044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017531	CCTTTT	2	12	1664829	1664840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017531	TAAACG	2	12	1669277	1669288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017531	TTTACC	2	12	1673364	1673375	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017531	CATCCC	2	12	1676686	1676697	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017531	TCTAAT	2	12	1680369	1680380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017531	CTTTTG	2	12	1704499	1704510	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017531	GTACGG	2	12	1750932	1750943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017531	TCAACG	2	12	1769303	1769314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017531	GTTTTT	2	12	1818428	1818439	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017531	CAGGCG	2	12	1864745	1864756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017531	CGTTAT	2	12	1889720	1889731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017531	TTTAGG	13	78	1890497	1890574	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017531	TGCAGA	2	12	1898993	1899004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017531	GTCAGG	2	12	1924529	1924540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017531	ACCGCC	2	12	1931726	1931737	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017531	ATTTCG	2	12	1931782	1931793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017531	TTTCTT	2	12	1957674	1957685	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017531	ATTTTA	2	12	1965946	1965957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017531	ATGAAA	2	12	1970653	1970664	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017531	TATAAA	2	12	1988576	1988587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017531	ATCGCA	2	12	1997387	1997398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017531	TACAAA	2	12	2090195	2090206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017531	AATATG	2	12	2109886	2109897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017531	AAAGGT	2	12	2146080	2146091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017531	TGTTGG	2	12	2159811	2159822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017531	TGCTTT	2	12	2207229	2207240	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017531	CCGGTT	2	12	2365714	2365725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017531	AGAAAA	2	12	2381906	2381917	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017531	CAATCA	2	12	2437556	2437567	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017531	CAGCAA	2	12	2437823	2437834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017531	GGATCG	2	12	2455454	2455465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017531	ACATCA	2	12	2549760	2549771	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017531	GGTTGG	2	12	2549864	2549875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017531	CTCAGG	2	12	2569664	2569675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017531	TTGAGT	2	12	2571876	2571887	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017531	CGGTGA	2	12	2573111	2573122	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017531	AAAATA	2	12	2621939	2621950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017531	ATGGCC	2	12	2626246	2626257	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017531	CGCAGC	2	12	2682737	2682748	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017531	TTACCC	2	12	2683293	2683304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017531	TACTTT	2	12	2684868	2684879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017531	AAATTT	2	12	2686262	2686273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017531	TGTGAA	2	12	2691789	2691800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017531	TAAAAA	2	12	2699589	2699600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017531	TAAAAA	2	12	2719063	2719074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017531	GATTAT	2	12	3493639	3493650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017531	CGCATT	2	12	3583523	3583534	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017531	CAGATC	2	12	3598540	3598551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_017531	GGATCA	2	12	3803339	3803350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.