MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 chromosome

Total Repeats: 7109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017027	CCA	2	6	1337561	1337566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_017027	TTA	2	6	1337639	1337644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017027	TTTA	2	8	1337716	1337723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017027	CGTTTC	2	12	1337734	1337745	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017027	GGTTGA	2	12	1337788	1337799	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017027	TGC	2	6	1337837	1337842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017027	ATG	2	6	1337870	1337875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017027	CCA	2	6	1337945	1337950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_017027	TAA	2	6	1337977	1337982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017027	TTA	2	6	1337987	1337992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017027	T	6	6	1337998	1338003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017027	CCA	2	6	1338095	1338100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_017027	T	6	6	1338195	1338200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017027	CT	3	6	1338206	1338211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_017027	CCT	2	6	1338260	1338265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_017027	TTTC	2	8	1338306	1338313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_017027	CCA	2	6	1338341	1338346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_017027	CTG	2	6	1338385	1338390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017027	TCG	2	6	1338549	1338554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017027	A	6	6	1338613	1338618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017027	ACC	2	6	1338832	1338837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_017027	AAC	2	6	1338905	1338910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017027	TGGT	2	8	1338972	1338979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017027	TGT	2	6	1339011	1339016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017027	CG	3	6	1339025	1339030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_017027	TCC	3	9	1339036	1339044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_017027	TTC	2	6	1339081	1339086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017027	CAG	2	6	1339275	1339280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017027	CAT	2	6	1339311	1339316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017027	AAATGC	2	12	1339433	1339444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4031	NC_017027	ACC	2	6	1339480	1339485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_017027	GC	3	6	1339504	1339509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_017027	CATAC	2	10	1339779	1339788	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4034	NC_017027	TTG	2	6	1339810	1339815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017027	AGA	2	6	1339867	1339872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017027	T	6	6	1339918	1339923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017027	T	6	6	1339942	1339947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017027	AGT	2	6	1340046	1340051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017027	ATC	2	6	1340065	1340070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017027	T	7	7	1340176	1340182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017027	CTT	2	6	1340184	1340189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017027	TTC	2	6	1340206	1340211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017027	TGT	2	6	1340306	1340311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017027	CTT	2	6	1340364	1340369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017027	TCT	3	9	1340411	1340419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017027	CTT	2	6	1340433	1340438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017027	TTTA	2	8	1340473	1340480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017027	TAA	2	6	1340494	1340499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017027	TTC	2	6	1340533	1340538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017027	GTG	2	6	1340545	1340550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017027	ATT	2	6	1340593	1340598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017027	CTT	2	6	1340622	1340627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017027	CTC	2	6	1340641	1340646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_017027	TCA	2	6	1340696	1340701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017027	TTCATC	2	12	1340743	1340754	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017027	AATA	2	8	1340794	1340801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017027	AAG	2	6	1340815	1340820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017027	TGTT	2	8	1340976	1340983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017027	CCA	2	6	1341123	1341128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_017027	TTG	2	6	1341160	1341165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017027	TAA	2	6	1341166	1341171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017027	CTG	2	6	1341192	1341197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_017027	TAA	2	6	1341213	1341218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017027	TGGCGA	2	12	1341220	1341231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4065	NC_017027	TAA	2	6	1341232	1341237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017027	TTTC	2	8	1341269	1341276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_017027	GAAA	2	8	1341291	1341298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017027	CTT	2	6	1341339	1341344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_017027	GAA	2	6	1341349	1341354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017027	TTTCA	2	10	1341382	1341391	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4071	NC_017027	TCA	2	6	1341473	1341478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017027	GTT	2	6	1341528	1341533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017027	CAA	2	6	1341540	1341545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017027	TTA	2	6	1341590	1341595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017027	ATA	2	6	1341628	1341633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017027	T	6	6	1341646	1341651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017027	GAC	2	6	1341669	1341674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017027	CAT	2	6	1341687	1341692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017027	TCG	2	6	1341714	1341719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017027	TAA	2	6	1341816	1341821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017027	TCC	2	6	1341826	1341831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_017027	TGC	2	6	1341903	1341908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017027	T	6	6	1342034	1342039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017027	TTA	2	6	1342337	1342342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017027	GTT	2	6	1342355	1342360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017027	GCTCA	2	10	1342363	1342372	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4087	NC_017027	TGT	2	6	1342468	1342473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017027	TTG	2	6	1342499	1342504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017027	AAT	2	6	1342522	1342527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017027	ATT	2	6	1342594	1342599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017027	T	6	6	1342598	1342603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017027	CAT	2	6	1342671	1342676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017027	TC	3	6	1342867	1342872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_017027	ATCC	2	8	1342944	1342951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_017027	TAC	2	6	1343010	1343015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017027	GTT	2	6	1343018	1343023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017027	TGGTT	2	10	1343315	1343324	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017027	CAA	2	6	1343334	1343339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017027	TGA	2	6	1343340	1343345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017027	TGA	2	6	1343375	1343380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017027	ATG	2	6	1343389	1343394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017027	CT	3	6	1343395	1343400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_017027	ACC	2	6	1343462	1343467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_017027	TAA	3	9	1343515	1343523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017027	TGA	2	6	1343658	1343663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017027	A	6	6	1343778	1343783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017027	TAA	2	6	1343811	1343816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017027	T	6	6	1343822	1343827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017027	AAT	2	6	1343889	1343894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017027	TGA	2	6	1343943	1343948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017027	CGA	2	6	1343983	1343988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017027	CAC	2	6	1344056	1344061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_017027	AGC	2	6	1344072	1344077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017027	TCA	2	6	1344106	1344111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017027	CGAT	2	8	1344186	1344193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_017027	AAT	2	6	1344235	1344240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017027	T	6	6	1344248	1344253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017027	AAT	2	6	1344275	1344280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017027	TTA	2	6	1344376	1344381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017027	T	6	6	1344426	1344431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017027	TTA	2	6	1344469	1344474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017027	CTGT	2	8	1344506	1344513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_017027	GTT	2	6	1344638	1344643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017027	ATT	2	6	1344759	1344764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017027	ATT	2	6	1344777	1344782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017027	T	6	6	1345075	1345080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017027	T	7	7	1345250	1345256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017027	CTT	2	6	1345301	1345306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4130	NC_017027	CTG	2	6	1345332	1345337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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