MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pasteurella multocida 36950 chromosome

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016808	AAAAAT	2	12	54084	54095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016808	CGTTTT	2	12	64797	64808	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016808	AGTTTG	2	12	79746	79757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016808	CAAATA	2	12	102629	102640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016808	TTTATT	2	12	136570	136581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016808	AAATGA	2	12	165645	165656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016808	TTGTGA	2	12	201844	201855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016808	ACCAAT	2	12	223778	223789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016808	TTTTTG	2	12	259236	259247	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016808	CGAAGG	2	12	267511	267522	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016808	TGAAAT	2	12	270960	270971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016808	AGACGA	2	12	271888	271899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016808	TAAAGA	2	12	273171	273182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016808	TTAACT	2	12	275506	275517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016808	ATTTTT	2	12	278564	278575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016808	CGTCAG	2	12	291806	291817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016808	GCTCAG	2	12	326306	326317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016808	AAAGTA	2	12	339532	339543	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016808	AATAAA	2	12	377749	377760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016808	TTTATC	2	12	397242	397253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016808	ATTGAT	2	12	400443	400454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016808	GCTCTT	2	12	413278	413289	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016808	TAGAAA	2	12	413985	413996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016808	TTTTTA	2	12	488283	488294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016808	ATTCAA	2	12	539321	539332	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016808	CGAAGG	2	12	542568	542579	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016808	TGAAAT	2	12	546017	546028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016808	AGACGA	2	12	546945	546956	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016808	CTTTTT	2	12	552456	552467	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016808	TAAAGG	2	12	569670	569681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016808	ACTAGC	2	12	570185	570196	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016808	TCGTGT	2	12	572078	572089	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016808	TAAGTG	2	12	572621	572632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016808	TTTATT	2	12	574083	574094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016808	AAAATA	2	12	632985	632996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016808	GATTAA	2	12	652444	652455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016808	TATTTT	2	12	671136	671147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016808	TTTATA	2	12	699159	699170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016808	ATTTAT	2	12	699260	699271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016808	AATAAA	2	12	710986	710997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016808	AAAAAT	2	12	805146	805157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016808	ATTGTT	2	12	805197	805208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016808	CTTTCA	2	12	820922	820933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016808	GCATTT	2	12	821119	821130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016808	GATACT	2	12	821223	821234	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016808	TCTTTA	2	12	821632	821643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016808	GTATCA	2	12	824665	824676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016808	CAATAG	2	12	825875	825886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016808	ATCATT	2	12	859940	859951	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016808	TTATGA	2	12	867223	867234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016808	CGATAG	2	12	880185	880196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016808	GCCGCT	2	12	893975	893986	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016808	TAAATA	2	12	949251	949262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016808	TTCTTT	2	12	975144	975155	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016808	TTAACA	2	12	1003858	1003869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016808	TTCTCA	2	12	1039165	1039176	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016808	ATTTCA	2	12	1076310	1076321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016808	GCCTTC	2	12	1079535	1079546	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016808	AGATAA	2	12	1159158	1159169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016808	ATAGGG	2	12	1182556	1182567	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016808	ATTTTT	2	12	1264834	1264845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016808	GTTTTT	2	12	1334905	1334916	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016808	CTTAAA	2	12	1352287	1352298	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016808	TCAAAA	2	12	1354990	1355001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016808	TGCTTT	2	12	1356137	1356148	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016808	TCGGCT	2	12	1356315	1356326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016808	CGTTTC	2	12	1356893	1356904	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016808	GGTTGA	2	12	1356947	1356958	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016808	AAATGC	2	12	1358547	1358558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016808	TTCATC	2	12	1359857	1359868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016808	TGGCGA	2	12	1360335	1360346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016808	AAAACC	2	12	1385069	1385080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016808	GGCATC	2	12	1386062	1386073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016808	AATAAA	2	12	1453211	1453222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016808	TTATAC	2	12	1487166	1487177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016808	TATGTT	2	12	1500214	1500225	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016808	ATATCC	2	12	1504713	1504724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016808	TAAAAC	2	12	1588113	1588124	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016808	TAAAAC	2	12	1591750	1591761	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016808	GGCACA	2	12	1609940	1609951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016808	CCAAGC	2	12	1654449	1654460	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016808	AATAAA	2	12	1656474	1656485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016808	TTCACC	2	12	1673736	1673747	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016808	ACAATA	2	12	1677466	1677477	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016808	CCTCCC	2	12	1680028	1680039	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_016808	AAACCG	2	12	1681474	1681485	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016808	GATTAA	2	12	1691829	1691840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016808	AAGACC	2	12	1774146	1774157	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016808	TAAACT	2	12	1823784	1823795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016808	AACAAT	2	12	1827521	1827532	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016808	ATAAAT	2	12	1838066	1838077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016808	TAAATA	2	12	1858981	1858992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016808	CGAAGG	2	12	1875524	1875535	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016808	TGAAAT	2	12	1878973	1878984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016808	AGACGA	2	12	1879901	1879912	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016808	TGTTTT	2	12	1903950	1903961	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016808	TTATCT	2	12	1904023	1904034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016808	ACCGCC	2	12	1904313	1904324	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016808	AAAAAT	2	12	1936393	1936404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016808	CGAAGG	2	12	1943023	1943034	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016808	TGAAAT	2	12	1946248	1946259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016808	AGACGA	2	12	1947176	1947187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016808	TTTCCT	2	12	1957142	1957153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016808	GACTGT	2	12	2106691	2106702	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016808	CGAAGG	2	12	2170892	2170903	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016808	TGAAAT	2	12	2174120	2174131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016808	TTATAT	2	12	2219950	2219961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016808	TTCTTT	2	12	2301340	2301351	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.