MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Pyrobaculum sp. 1860 chromosome

Total Repeats: 3685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016645	CGG	2	6	19	24	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016645	CGC	2	6	83	88	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016645	GGA	2	6	194	199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016645	GAA	2	6	18505	18510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016645	TTA	2	6	18540	18545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016645	TCA	2	6	18593	18598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016645	CTA	2	6	18613	18618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016645	TAA	2	6	18638	18643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016645	TTG	2	6	21432	21437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016645	GGT	2	6	23909	23914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016645	AGT	2	6	24011	24016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016645	GTA	2	6	24138	24143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016645	TAA	2	6	24152	24157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016645	GGC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016645	GTT	2	6	24177	24182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016645	CAA	2	6	28320	28325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016645	CTG	2	6	28349	28354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016645	TCG	2	6	33753	33758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016645	TAT	2	6	35635	35640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016645	ATT	2	6	37532	37537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016645	AGG	2	6	40204	40209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016645	ACG	2	6	40215	40220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016645	ATG	2	6	40416	40421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016645	AAG	2	6	40484	40489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016645	TGT	2	6	40499	40504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016645	AGG	2	6	41537	41542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016645	AGA	2	6	41584	41589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016645	CGC	2	6	41599	41604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016645	GAA	2	6	41612	41617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016645	TAA	2	6	41652	41657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016645	CGC	2	6	41796	41801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016645	ACC	2	6	42475	42480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016645	TAG	2	6	42533	42538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016645	GAC	2	6	42574	42579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016645	TCG	2	6	43793	43798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016645	GTG	2	6	46681	46686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016645	CCT	2	6	49812	49817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016645	GTC	2	6	51281	51286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016645	GCC	2	6	51303	51308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016645	ATC	2	6	51332	51337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016645	CAC	2	6	55959	55964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016645	AGG	2	6	57031	57036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016645	CCA	2	6	57305	57310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016645	TGA	2	6	57987	57992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016645	GTG	2	6	58009	58014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016645	ACC	2	6	61314	61319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016645	CAG	2	6	61349	61354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016645	AGG	2	6	62320	62325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016645	CAT	2	6	66895	66900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016645	TTA	2	6	71541	71546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016645	TAA	2	6	71554	71559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016645	TTA	2	6	71622	71627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016645	GTA	2	6	74272	74277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016645	ACT	2	6	74304	74309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016645	TAA	2	6	77162	77167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016645	GCC	2	6	77224	77229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016645	GCG	2	6	77249	77254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016645	CCG	2	6	77300	77305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016645	GAA	2	6	77379	77384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016645	TAA	2	6	81052	81057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016645	GAT	2	6	81071	81076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016645	GCG	2	6	81088	81093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016645	ATG	2	6	85110	85115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016645	AGA	2	6	91584	91589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016645	ACA	2	6	91696	91701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016645	ACC	2	6	91765	91770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016645	CGG	2	6	94461	94466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016645	GAG	3	9	94602	94610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016645	ACC	2	6	94616	94621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016645	AGG	2	6	94639	94644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016645	GCG	2	6	95810	95815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016645	AGA	2	6	97711	97716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016645	CAT	2	6	98584	98589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016645	CAC	2	6	98690	98695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016645	GCG	2	6	98714	98719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016645	CGC	2	6	98723	98728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016645	AGA	2	6	98741	98746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016645	CGC	2	6	98807	98812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016645	ACC	2	6	99448	99453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016645	GGT	2	6	99581	99586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016645	TAA	2	6	99700	99705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016645	ACC	2	6	99791	99796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016645	CTA	2	6	99864	99869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016645	CTA	2	6	99924	99929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016645	AGT	2	6	100012	100017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016645	TAA	2	6	101336	101341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016645	GGC	2	6	101418	101423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016645	GGC	2	6	101467	101472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016645	GCG	2	6	101831	101836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016645	GCC	2	6	101843	101848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016645	ATG	2	6	101931	101936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016645	CGG	2	6	101948	101953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016645	GGT	2	6	101969	101974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016645	CGG	2	6	101990	101995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016645	AAT	2	6	105113	105118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016645	GCG	2	6	105740	105745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016645	TCT	2	6	106158	106163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016645	AGT	2	6	106976	106981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016645	GTG	2	6	108759	108764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016645	AAG	2	6	109623	109628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016645	CCA	2	6	109690	109695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016645	CGG	2	6	109707	109712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016645	CTG	2	6	109765	109770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016645	CAC	2	6	110842	110847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016645	TCC	2	6	110848	110853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016645	TAG	2	6	110870	110875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016645	ATA	2	6	110949	110954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016645	GCC	2	6	111537	111542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_016645	GTG	2	6	111666	111671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016645	ATA	2	6	111704	111709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016645	TTC	2	6	111744	111749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016645	CGC	2	6	111809	111814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016645	GAG	2	6	111828	111833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016645	GTC	2	6	111843	111848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016645	TTA	2	6	111859	111864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016645	GCG	2	6	111880	111885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016645	GAG	2	6	112028	112033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016645	CGG	3	9	112098	112106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016645	GAG	2	6	112107	112112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016645	GCC	2	6	112123	112128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016645	GGC	2	6	112137	112142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016645	CTA	2	6	112146	112151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016645	CTG	2	6	112156	112161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016645	CGG	3	9	115569	115577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016645	GGC	2	6	115591	115596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016645	GGC	2	6	115686	115691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016645	TGG	2	6	115729	115734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016645	GGC	2	6	117005	117010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016645	ACC	2	6	117663	117668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016645	CCT	2	6	119416	119421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016645	ATT	2	6	119486	119491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016645	GCC	2	6	124106	124111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016645	CCA	2	6	124142	124147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016645	CGC	2	6	124161	124166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016645	CCT	2	6	124187	124192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016645	CTC	2	6	124215	124220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016645	CAC	4	12	124311	124322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016645	CGT	2	6	124388	124393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016645	CTT	2	6	124461	124466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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