MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudoxanthomonas spadix BD-a59 chromosome

Total Repeats: 9700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016147	CAC	2	6	159422	159427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_016147	TTCA	2	8	159435	159442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_016147	GGT	2	6	159483	159488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016147	GGAT	2	8	159494	159501	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016147	CTG	2	6	159612	159617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016147	GC	3	6	159648	159653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_016147	GCG	2	6	159681	159686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016147	CAC	2	6	159728	159733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_016147	TTCA	2	8	159741	159748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_016147	GGT	2	6	159789	159794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016147	GGAT	2	8	159800	159807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016147	CGC	2	6	159834	159839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_016147	TGC	2	6	159876	159881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016147	CTG	2	6	159918	159923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016147	CG	3	6	159953	159958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_016147	TTG	2	6	160001	160006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016147	CAC	2	6	160034	160039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_016147	TTCA	2	8	160047	160054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_016147	GGT	2	6	160095	160100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016147	GGAT	2	8	160106	160113	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016147	CGC	2	6	160140	160145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_016147	GCGG	2	8	160186	160193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
523	NC_016147	TGC	2	6	160224	160229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016147	TCA	2	6	160240	160245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_016147	GC	3	6	160259	160264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_016147	GCG	2	6	160292	160297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016147	CAC	2	6	160339	160344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_016147	TTCA	2	8	160352	160359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_016147	TGG	2	6	160555	160560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016147	GC	3	6	160565	160570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_016147	GCG	2	6	160598	160603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016147	CAC	2	6	160645	160650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_016147	TTCA	2	8	160658	160665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_016147	GGT	2	6	160706	160711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016147	GGAT	2	8	160717	160724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016147	GC	3	6	160871	160876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_016147	GCG	2	6	160904	160909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016147	TTG	2	6	160918	160923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016147	CAC	2	6	160951	160956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_016147	TTCA	2	8	160964	160971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_016147	GGT	2	6	161012	161017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016147	GGAT	2	8	161023	161030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016147	CGC	2	6	161057	161062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_016147	TCA	2	6	161158	161163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016147	GC	3	6	161177	161182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_016147	GCG	2	6	161210	161215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016147	CAC	2	6	161257	161262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_016147	TTCA	2	8	161270	161277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_016147	CAA	2	6	161352	161357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016147	A	6	6	161356	161361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016147	TCGC	2	8	161390	161397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
552	NC_016147	GAC	2	6	161459	161464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016147	CA	3	6	161494	161499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_016147	GTC	2	6	161515	161520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016147	TGG	2	6	161542	161547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016147	GCC	2	6	161549	161554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_016147	GC	3	6	161603	161608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_016147	AGC	3	9	162043	162051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016147	AGAT	2	8	162277	162284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016147	CGT	2	6	162316	162321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016147	GCTG	2	8	162363	162370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
562	NC_016147	CTA	2	6	162389	162394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016147	ATTC	2	8	162441	162448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_016147	AAGCCG	2	12	162449	162460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016147	CGGCT	2	10	162466	162475	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
566	NC_016147	GGT	2	6	162490	162495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016147	GGAT	2	8	162501	162508	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016147	CGC	2	6	162535	162540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_016147	TCA	2	6	162636	162641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016147	GC	3	6	162655	162660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_016147	CAAGCC	2	12	162675	162686	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
572	NC_016147	CAC	2	6	162735	162740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_016147	GGT	2	6	162796	162801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016147	GGAT	2	8	162807	162814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016147	CGC	2	6	162841	162846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_016147	GC	3	6	162961	162966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016147	GCG	2	6	162994	162999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016147	TTG	2	6	163008	163013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016147	CAC	2	6	163041	163046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_016147	TTCA	2	8	163054	163061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_016147	GAGT	2	8	163118	163125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016147	TGGCA	2	10	163541	163550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
583	NC_016147	TGCCA	2	10	163560	163569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
584	NC_016147	GCTC	2	8	164192	164199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_016147	AG	3	6	164231	164236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016147	GCG	2	6	164261	164266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016147	CTG	2	6	164276	164281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016147	ACT	2	6	164328	164333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_016147	AGGC	2	8	164401	164408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_016147	AG	3	6	164439	164444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016147	ATTC	2	8	164467	164474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_016147	AAGCCG	2	12	164475	164486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016147	CGGCT	2	10	164492	164501	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
594	NC_016147	ATTC	2	8	164986	164993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_016147	AAGCCG	2	12	164994	165005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016147	CGGCT	2	10	165011	165020	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
597	NC_016147	ATG	3	9	165049	165057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016147	TCG	2	6	165107	165112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_016147	TCG	2	6	165145	165150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_016147	AGT	2	6	165155	165160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016147	TAC	2	6	165177	165182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016147	CGT	2	6	165197	165202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016147	GC	3	6	165241	165246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_016147	TGG	2	6	165261	165266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016147	GATC	2	8	165293	165300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_016147	GA	3	6	165325	165330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016147	ATTC	2	8	165383	165390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_016147	GCG	2	6	165630	165635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016147	CAT	2	6	165674	165679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_016147	TTCA	2	8	165690	165697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_016147	GGT	2	6	165738	165743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016147	GGAT	2	8	165749	165756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016147	GC	3	6	165903	165908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_016147	GCT	2	6	165932	165937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016147	CGT	2	6	165939	165944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_016147	GCGGTG	2	12	165961	165972	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
617	NC_016147	CAC	2	6	165982	165987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_016147	ATTC	2	8	165994	166001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_016147	GGT	2	6	166043	166048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016147	GGAT	2	8	166054	166061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016147	CGC	2	6	166088	166093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016147	TGC	2	6	166130	166135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_016147	GC	3	6	166207	166212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_016147	GCG	2	6	166240	166245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_016147	CAC	2	6	166287	166292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_016147	TTCA	2	8	166300	166307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_016147	CAC	2	6	166593	166598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_016147	TTCA	2	8	166606	166613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_016147	CGC	2	6	167013	167018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_016147	CGCGG	2	10	167021	167030	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
631	NC_016147	ATTC	2	8	167301	167308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_016147	AAGCCG	2	12	167309	167320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016147	GAA	2	6	167358	167363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016147	GCG	2	6	167664	167669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_016147	AGC	2	6	167746	167751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016147	GCG	2	6	168237	168242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016147	GCC	3	9	169043	169051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_016147	GCG	2	6	169146	169151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_016147	TGA	2	6	169184	169189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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732	NC_016147	TCA	2	6	202237	202242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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776	NC_016147	TGC	2	6	213970	213975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_016147	TGGC	2	8	213977	213984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
778	NC_016147	GCCG	2	8	213991	213998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
779	NC_016147	GGT	2	6	214003	214008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
780	NC_016147	GCG	2	6	214026	214031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_016147	GCA	2	6	214051	214056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
782	NC_016147	ACA	2	6	214085	214090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
783	NC_016147	CAG	2	6	214098	214103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
784	NC_016147	CAT	2	6	214128	214133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_016147	GCCGC	2	10	214877	214886	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
786	NC_016147	GCG	2	6	214890	214895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
787	NC_016147	TCC	2	6	215568	215573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
788	NC_016147	CAG	2	6	215617	215622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_016147	GGT	2	6	215695	215700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
790	NC_016147	GCG	2	6	215718	215723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
791	NC_016147	CAT	2	6	215726	215731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
792	NC_016147	GCC	2	6	219435	219440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
793	NC_016147	GCT	2	6	219444	219449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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795	NC_016147	CG	3	6	221049	221054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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797	NC_016147	TGG	2	6	221172	221177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
798	NC_016147	GCG	2	6	221186	221191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
799	NC_016147	CGG	2	6	221219	221224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
800	NC_016147	GGC	2	6	221251	221256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
801	NC_016147	GCC	2	6	221273	221278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
802	NC_016147	GCC	2	6	222259	222264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
803	NC_016147	GCG	2	6	222274	222279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
804	NC_016147	C	6	6	222329	222334	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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806	NC_016147	TGGCG	2	10	223360	223369	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
807	NC_016147	CG	3	6	223415	223420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
808	NC_016147	CG	3	6	223434	223439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
809	NC_016147	GCGG	2	8	223630	223637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
810	NC_016147	GGCCG	2	10	223669	223678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
811	NC_016147	GC	3	6	223698	223703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
812	NC_016147	GC	5	10	223739	223748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
813	NC_016147	GTC	2	6	224390	224395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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815	NC_016147	GGCG	2	8	227908	227915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
816	NC_016147	CCG	2	6	229920	229925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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821	NC_016147	A	6	6	231720	231725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
822	NC_016147	ATG	2	6	231736	231741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
823	NC_016147	CA	3	6	231820	231825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
824	NC_016147	CCTCC	2	10	233293	233302	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
825	NC_016147	CACC	2	8	233303	233310	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
826	NC_016147	TCCC	3	12	233437	233448	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
827	NC_016147	CAT	2	6	233505	233510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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844	NC_016147	CGGC	2	8	244296	244303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
845	NC_016147	GCC	2	6	246529	246534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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852	NC_016147	CGC	2	6	248516	248521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
853	NC_016147	AAG	2	6	248543	248548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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906	NC_016147	GTA	2	6	269930	269935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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