MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Porphyromonas gingivalis TDC60

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015571	GAAGG	2	10	10072	10081	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015571	TGAAA	2	10	15207	15216	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015571	CCATC	2	10	24126	24135	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_015571	CTCTT	2	10	44320	44329	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015571	ATCAA	2	10	49369	49378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015571	GAATC	2	10	73693	73702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015571	GAAAA	2	10	75121	75130	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015571	GCTGA	2	10	98352	98361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015571	TGCCG	2	10	100768	100777	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015571	AACGA	2	10	149289	149298	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015571	ATTTT	2	10	182074	182083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015571	CAAAA	2	10	183229	183238	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015571	ATAAA	2	10	203726	203735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015571	AGAAA	2	10	219852	219861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015571	ACGGA	2	10	219932	219941	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015571	CGAGC	2	10	237029	237038	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015571	TTGGC	2	10	255916	255925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015571	TTTCC	2	10	285612	285621	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015571	GAAAA	2	10	289107	289116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015571	TAGGG	2	10	289178	289187	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015571	TTTAC	2	10	299295	299304	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015571	GGCCG	2	10	339184	339193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015571	TCGTT	2	10	344336	344345	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015571	TCTAT	2	10	348040	348049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015571	GCATA	2	10	349853	349862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015571	CTTGC	2	10	358692	358701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015571	TCCAA	2	10	362320	362329	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015571	CGGAG	2	10	378432	378441	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015571	TACAA	2	10	382350	382359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015571	CTATA	2	10	389147	389156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015571	GATCG	2	10	395742	395751	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015571	CTTTC	2	10	403406	403415	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015571	TTTTG	2	10	403468	403477	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015571	TCGGA	2	10	405698	405707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015571	ATATA	2	10	407895	407904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015571	CCGTA	2	10	408329	408338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015571	AAGAT	2	10	409470	409479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015571	AATCT	2	10	418789	418798	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015571	TAGAA	2	10	429136	429145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015571	GCCTT	2	10	429787	429796	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015571	ACCAT	2	10	433038	433047	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015571	ATGAA	2	10	436631	436640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015571	CGTCC	2	10	440591	440600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_015571	TCGGT	2	10	452413	452422	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015571	CGTTC	2	10	452646	452655	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015571	ACAAA	2	10	470008	470017	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015571	CAAAA	2	10	482448	482457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015571	AAAAG	2	10	493890	493899	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015571	ATCTT	2	10	499782	499791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015571	CGATC	2	10	526091	526100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015571	AAGGA	2	10	529935	529944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015571	TTGTT	2	10	530458	530467	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015571	AAAAG	2	10	542743	542752	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015571	CGAGC	2	10	551173	551182	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015571	AAGAG	2	10	552597	552606	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015571	TCCCC	2	10	554947	554956	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_015571	GGCTT	2	10	556748	556757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015571	TTATA	2	10	577660	577669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015571	CAAGA	2	10	604623	604632	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015571	GCCAC	2	10	607213	607222	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_015571	TTTTC	2	10	611036	611045	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015571	TTTTC	2	10	613521	613530	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015571	TTTTG	2	10	632462	632471	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015571	TTCAC	2	10	639051	639060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015571	TATGA	2	10	639182	639191	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015571	GTTTA	2	10	650381	650390	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015571	CTTCA	2	10	652863	652872	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015571	TCGGA	2	10	659081	659090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015571	ATATA	2	10	661279	661288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015571	CCGTA	2	10	661713	661722	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015571	AAGAT	2	10	662854	662863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015571	TTCCT	2	10	663362	663371	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_015571	CCAAA	2	10	672156	672165	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015571	TAATA	2	10	680740	680749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015571	TTTTA	2	10	687856	687865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015571	AATAG	2	10	701628	701637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015571	TTTTG	2	10	703444	703453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015571	CAAAC	2	10	708526	708535	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015571	AAAGA	2	10	709743	709752	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015571	CATTT	2	10	713571	713580	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015571	CCTTT	2	10	729157	729166	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_015571	CTGTT	2	10	729554	729563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015571	TGTGT	2	10	729957	729966	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015571	CAAAA	2	10	751550	751559	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015571	GTACA	2	10	756920	756929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015571	TGTTT	2	10	756949	756958	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015571	TCGGA	2	10	766794	766803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015571	TAATA	2	10	766907	766916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015571	AAATT	2	10	777696	777705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015571	GCAAT	2	10	777722	777731	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015571	TTGTC	2	10	782380	782389	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015571	TTTTG	2	10	795352	795361	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015571	AGTTT	2	10	810115	810124	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015571	ACGAA	2	10	839557	839566	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015571	GATCC	2	10	852953	852962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015571	CGAGC	2	10	853412	853421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015571	AAGGA	2	10	856670	856679	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015571	CAAAC	2	10	877685	877694	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015571	AAACT	2	10	877709	877718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015571	AACTA	2	10	877733	877742	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015571	TTTGG	2	10	877794	877803	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015571	CTTTT	2	10	879010	879019	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015571	TAGGG	2	10	890520	890529	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015571	TTGTT	2	10	890530	890539	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015571	TCGTC	2	10	894652	894661	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015571	CTTTC	2	10	912807	912816	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015571	TCTTT	2	10	920056	920065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015571	CAGGA	2	10	926727	926736	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015571	GGGAA	2	10	942616	942625	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015571	CCAAG	2	10	942634	942643	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015571	GAGAT	2	10	981417	981426	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015571	AAAAT	2	10	981454	981463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015571	ATACG	2	10	986119	986128	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015571	CAAAG	2	10	991883	991892	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015571	GTAAA	2	10	997839	997848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015571	TTCGA	2	10	1009300	1009309	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015571	TCGCA	2	10	1011103	1011112	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015571	GTTCC	2	10	1011502	1011511	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015571	TCGGT	2	10	1014680	1014689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015571	TATAA	2	10	1017531	1017540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015571	ATTGC	2	10	1042736	1042745	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015571	AAATA	2	10	1049229	1049238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015571	AAAGA	2	10	1057037	1057046	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015571	GTCGG	2	10	1073932	1073941	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015571	AGAAA	2	10	1074270	1074279	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015571	ATCCG	2	10	1084789	1084798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015571	AGCTT	2	10	1097828	1097837	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015571	GTAGG	2	10	1111686	1111695	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015571	TCCTT	2	10	1112463	1112472	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015571	TATAT	2	10	1112639	1112648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015571	AGAGC	2	10	1117522	1117531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015571	CCTTG	2	10	1133410	1133419	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015571	AGATA	2	10	1161445	1161454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015571	ATTTG	2	10	1165336	1165345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015571	AAGAA	3	15	1166652	1166666	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015571	ACCCG	2	10	1187415	1187424	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_015571	TAAAA	2	10	1188381	1188390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015571	TTCTA	2	10	1190129	1190138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015571	AGGAA	2	10	1202281	1202290	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015571	TCTGC	2	10	1202377	1202386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015571	TTCAT	2	10	1206681	1206690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015571	AATAC	2	10	1210608	1210617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015571	TATAT	2	10	1213192	1213201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015571	ATGAA	2	10	1217125	1217134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015571	AAGAA	2	10	1217421	1217430	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015571	TTTGC	2	10	1218164	1218173	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015571	GCCAT	2	10	1237749	1237758	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_015571	AAACA	2	10	1243838	1243847	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_015571	GATAT	2	10	1246695	1246704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015571	GAAGA	2	10	1251662	1251671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015571	TATAA	2	10	1254018	1254027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015571	CCTAT	2	10	1260698	1260707	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_015571	TTTTA	2	10	1267269	1267278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015571	TTACT	2	10	1267309	1267318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_015571	ATCTT	2	10	1273955	1273964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_015571	TACGG	2	10	1275096	1275105	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_015571	TCCGA	2	10	1277728	1277737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_015571	CGAAT	2	10	1281432	1281441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_015571	AAACC	2	10	1288183	1288192	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_015571	TCTCC	2	10	1301426	1301435	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_015571	ATCAA	2	10	1304236	1304245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_015571	TAAAA	2	10	1323642	1323651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015571	ATTTG	2	10	1331019	1331028	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015571	AATCT	2	10	1332328	1332337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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177	NC_015571	TTTTC	2	10	1376436	1376445	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_015571	CCTAT	2	10	1456416	1456425	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
184	NC_015571	TTTAC	2	10	1456544	1456553	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
185	NC_015571	CGAGC	2	10	1467088	1467097	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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188	NC_015571	TCCTT	2	10	1490827	1490836	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
189	NC_015571	TCTCC	2	10	1495216	1495225	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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196	NC_015571	TCTCT	2	10	1578398	1578407	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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259	NC_015571	TGTAT	2	10	2122122	2122131	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_015571	GTCTT	2	10	2126695	2126704	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_015571	TTGTT	2	10	2130287	2130296	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015571	ATACT	2	10	2150886	2150895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_015571	GAAAA	2	10	2168197	2168206	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_015571	ATGCC	2	10	2173536	2173545	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_015571	GAATC	2	10	2174231	2174240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
269	NC_015571	CAACC	2	10	2175710	2175719	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
270	NC_015571	TCTCT	2	10	2210407	2210416	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
271	NC_015571	AGAAA	2	10	2217873	2217882	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015571	TTCTC	4	20	2219016	2219035	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
273	NC_015571	AAAAT	2	10	2225762	2225771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015571	AGTTT	2	10	2232775	2232784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015571	TCAAA	2	10	2238352	2238361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
276	NC_015571	AAGAT	2	10	2243738	2243747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015571	TCTCC	2	10	2243749	2243758	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
278	NC_015571	CTGTT	2	10	2243765	2243774	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
279	NC_015571	GAAAT	2	10	2248840	2248849	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015571	CGGCT	2	10	2249083	2249092	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
281	NC_015571	TAAGA	2	10	2271894	2271903	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015571	TTCCT	2	10	2275366	2275375	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
283	NC_015571	TATAT	2	10	2279618	2279627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_015571	TCTTT	2	10	2279665	2279674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_015571	TCGGA	2	10	2281574	2281583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_015571	ATATA	2	10	2283771	2283780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015571	CCGTA	2	10	2284205	2284214	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_015571	AAGAT	2	10	2285346	2285355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015571	GTATT	2	10	2301088	2301097	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015571	AGAGA	2	10	2301217	2301226	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015571	AAGCA	2	10	2313617	2313626	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_015571	GAGAT	2	10	2320398	2320407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_015571	CTATT	2	10	2324161	2324170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_015571	ACGGC	2	10	2329432	2329441	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
296	NC_015571	GAAAA	2	10	2331047	2331056	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015571	CAAAA	2	10	2339376	2339385	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.