MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Polymorphum gilvum SL003B-26A1 chromosome

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015259	TTCATC	2	12	9668	9679	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015259	TCCGGA	2	12	55361	55372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015259	GGACAT	2	12	60138	60149	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015259	CAGGCT	2	12	62995	63006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015259	TGCCCG	2	12	72278	72289	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015259	CAAATC	2	12	75596	75607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015259	AAACGG	2	12	98172	98183	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015259	CGGCGT	2	12	101900	101911	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015259	GCCCGC	2	12	115313	115324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015259	GTTTTG	2	12	126205	126216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015259	CCTCGC	2	12	129079	129090	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015259	ACGCGA	2	12	135219	135230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015259	GATCCG	2	12	164198	164209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015259	GGGGAA	2	12	187483	187494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015259	CGTAAG	2	12	196961	196972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015259	GCGTTC	2	12	203717	203728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015259	CTGTTG	2	12	204520	204531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015259	CGGCCG	2	12	247254	247265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015259	GATTTT	2	12	258806	258817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015259	GGTGTC	2	12	262946	262957	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015259	GCCCTC	2	12	303127	303138	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015259	TGCTCG	2	12	345731	345742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015259	GATCCG	2	12	363980	363991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015259	GACGAT	2	12	411547	411558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015259	GACCTC	2	12	427275	427286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015259	TCGCCG	2	12	427357	427368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015259	GCCTTC	2	12	427611	427622	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015259	ACGACC	2	12	439357	439368	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015259	GGCGCC	2	12	460156	460167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015259	TGGCGC	2	12	461179	461190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015259	CGGTTG	2	12	464789	464800	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015259	GACCAC	2	12	478950	478961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015259	GAACCG	2	12	494427	494438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015259	CAGGCC	2	12	515281	515292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015259	ATTTTG	2	12	518455	518466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015259	CCCGCG	2	12	520571	520582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015259	TGCGGG	2	12	523104	523115	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015259	ATCTTG	2	12	525613	525624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015259	TTCTGC	2	12	526577	526588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015259	CGCAGA	2	12	579107	579118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015259	TCCGGA	2	12	588196	588207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015259	GAACCG	2	12	634388	634399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015259	CAGCAC	2	12	723461	723472	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015259	ATTGAG	2	12	725031	725042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015259	GGGAAG	2	12	844598	844609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015259	ATCCGA	2	12	900562	900573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015259	TTTTGT	2	12	947731	947742	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015259	GCCGGC	2	12	955640	955651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015259	CATTAA	2	12	1021085	1021096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015259	CTTAGG	2	12	1087701	1087712	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015259	AGACCG	2	12	1132936	1132947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015259	AACGGG	2	12	1136379	1136390	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015259	CGGCGT	2	12	1188946	1188957	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015259	CAAATT	2	12	1208165	1208176	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015259	CAGTTC	2	12	1269994	1270005	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015259	CGCGGC	2	12	1287895	1287906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015259	GTTGGG	2	12	1349748	1349759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015259	TGAACA	2	12	1349906	1349917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015259	CCTGCC	2	12	1350358	1350369	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015259	GGCCGA	2	12	1376211	1376222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015259	GCACCG	2	12	1376411	1376422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015259	CGCCTG	2	12	1377238	1377249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015259	GCCGGC	2	12	1381085	1381096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015259	CTGCGG	2	12	1389090	1389101	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015259	CGCACC	2	12	1391562	1391573	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015259	CGGGTC	2	12	1437255	1437266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015259	GCCGTT	2	12	1456672	1456683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015259	GGCCGG	2	12	1491745	1491756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015259	CGGGAT	2	12	1512468	1512479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015259	GCTCCT	2	12	1580676	1580687	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015259	CGGCCC	2	12	1628832	1628843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015259	AAGTTT	3	18	1641597	1641614	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015259	GTCGTT	2	12	1644945	1644956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015259	GGGGGA	2	12	1645683	1645694	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015259	GGGGGC	2	12	1665477	1665488	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015259	GGGTGG	2	12	1679228	1679239	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015259	GCATTG	2	12	1723917	1723928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015259	CCGGCA	2	12	1748220	1748231	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015259	CTCGGC	2	12	1768570	1768581	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015259	ACGGGG	2	12	1914324	1914335	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015259	GGGCAA	2	12	1925232	1925243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015259	GCCGGA	2	12	1996579	1996590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015259	CGCGTG	2	12	2009999	2010010	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015259	CGCAGC	2	12	2021323	2021334	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015259	GTTGCG	2	12	2036598	2036609	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015259	AGAAAA	2	12	2170692	2170703	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015259	GCCGAT	2	12	2174678	2174689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015259	GCCCGC	2	12	2247638	2247649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015259	CCGGCC	2	12	2325286	2325297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015259	CGGCGC	2	12	2368218	2368229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015259	CCGGAA	2	12	2407919	2407930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015259	GGCCGG	2	12	2407948	2407959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015259	GGCCCG	2	12	2409812	2409823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015259	CGGACC	2	12	2414542	2414553	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015259	GGGCAG	2	12	2417215	2417226	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015259	ACACGG	2	12	2420256	2420267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015259	GCTGCC	2	12	2454140	2454151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015259	CCTCGC	2	12	2454211	2454222	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015259	CTTCCA	2	12	2454310	2454321	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015259	GGGACA	2	12	2468532	2468543	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015259	GGATTA	2	12	2500013	2500024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015259	GGCTCA	4	24	2520745	2520768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015259	CCGCGC	2	12	2528898	2528909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015259	TCGACG	2	12	2545621	2545632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015259	TTTTTC	2	12	2547301	2547312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015259	GCCGAT	2	12	2589397	2589408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015259	CCGGAC	2	12	2589475	2589486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015259	GATGGA	2	12	2607927	2607938	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015259	CGCTGG	2	12	2628758	2628769	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015259	CATGCT	2	12	2671769	2671780	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015259	TCCCCG	2	12	2709358	2709369	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015259	GGGACG	2	12	2744898	2744909	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015259	GACGGG	2	12	2760697	2760708	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015259	GTCATG	2	12	2807762	2807773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015259	GTTATG	3	18	2807774	2807791	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015259	GGCATG	2	12	2807792	2807803	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015259	GTTTTC	2	12	2828678	2828689	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015259	GACGCC	2	12	2828995	2829006	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015259	GGCCCG	2	12	2888874	2888885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015259	GGCCCG	2	12	2889084	2889095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015259	GGACCG	2	12	2895593	2895604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015259	TTATTT	2	12	2899703	2899714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015259	TCCCCG	2	12	2996254	2996265	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015259	GAACAG	2	12	3008696	3008707	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015259	CCGCTC	2	12	3014983	3014994	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015259	CGCAGC	2	12	3024977	3024988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015259	CCGGCG	2	12	3028909	3028920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015259	GCCCGC	2	12	3041471	3041482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015259	CGGCCG	2	12	3107305	3107316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015259	CGTTGT	2	12	3109544	3109555	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015259	CCGGGC	2	12	3121575	3121586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015259	AAATGA	2	12	3121735	3121746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015259	CGGCAG	8	48	3162464	3162511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015259	AGGAAA	2	12	3188572	3188583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015259	GCCCGC	2	12	3212240	3212251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015259	AGGCGA	2	12	3222043	3222054	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015259	GGCTTG	2	12	3226077	3226088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_015259	GCATGC	2	12	3253243	3253254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015259	CAACCC	2	12	3270043	3270054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015259	GCTCGC	2	12	3270989	3271000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015259	ACGCGG	2	12	3301797	3301808	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015259	CCGGAA	2	12	3310695	3310706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015259	CGCCGG	2	12	3321883	3321894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015259	GCCGGC	2	12	3335417	3335428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015259	TGCGCT	2	12	3346491	3346502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015259	GGCCCT	2	12	3493557	3493568	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015259	AACGTA	2	12	3493755	3493766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_015259	ACGATT	2	12	3494553	3494564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_015259	CTGCAG	2	12	3531873	3531884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015259	GACGGC	2	12	3548309	3548320	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015259	GCGCCG	2	12	3583774	3583785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015259	TTAGCG	2	12	3591577	3591588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_015259	CCGGCC	2	12	3600532	3600543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_015259	GCGCCC	2	12	3608063	3608074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_015259	GCTTCG	2	12	3615668	3615679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015259	GCGAGA	2	12	3620986	3620997	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_015259	GGCGCG	2	12	3698778	3698789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015259	ATTTCC	2	12	3709425	3709436	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015259	ACCGGG	2	12	3732579	3732590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015259	CCACCG	2	12	3748350	3748361	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_015259	TCCCGG	2	12	3751009	3751020	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
162	NC_015259	GGCCCA	2	12	3795397	3795408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
163	NC_015259	CCGGAG	2	12	3826600	3826611	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015259	GAACGC	2	12	3853688	3853699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015259	TCGCCG	2	12	3932475	3932486	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
166	NC_015259	CCGCTA	2	12	3933469	3933480	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
167	NC_015259	CTACTC	2	12	3934250	3934261	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_015259	CCGGCG	2	12	3965840	3965851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_015259	GCCTTT	2	12	4000758	4000769	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_015259	CGGCCG	2	12	4071980	4071991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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175	NC_015259	GCATCG	2	12	4097643	4097654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_015259	CTCGAC	2	12	4358096	4358107	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.