MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pedobacter saltans DSM 12145 chromosome

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015177	TTTTTG	2	12	50790	50801	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015177	GATTTC	2	12	142742	142753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015177	GAAAAA	2	12	147344	147355	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015177	ATTTTA	2	12	176441	176452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015177	ATTTTC	2	12	202404	202415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015177	TTAATT	2	12	202538	202549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015177	ATAAAG	2	12	256385	256396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015177	CTTTTT	2	12	261384	261395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015177	AAGCGA	2	12	270509	270520	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015177	ACATTG	2	12	271943	271954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015177	GCAAAT	2	12	297524	297535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015177	ACACTA	2	12	297642	297653	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015177	TAGAAA	2	12	317437	317448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015177	TCAAAA	2	12	323471	323482	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015177	GTTTAG	3	18	330906	330923	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015177	GTATGA	2	12	331570	331581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015177	TATTCT	2	12	443797	443808	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015177	TTATTT	2	12	446821	446832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015177	AATTTG	2	12	446936	446947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015177	ATTAAA	2	12	459928	459939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015177	GAAGGA	2	12	485368	485379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015177	TAAATT	2	12	500408	500419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015177	ATTTTG	2	12	526902	526913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015177	TAAAAA	2	12	547266	547277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015177	GTCTTT	2	12	548509	548520	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015177	GGAGAA	2	12	581944	581955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015177	AGCGAA	2	12	618607	618618	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015177	ATGTTA	2	12	629324	629335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015177	TTTTAT	2	12	670365	670376	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015177	GATAAA	2	12	697307	697318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015177	AAGTAT	2	12	713343	713354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015177	TTATCA	2	12	724186	724197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015177	ATTATC	2	12	728570	728581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015177	GCAACA	2	12	757296	757307	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015177	GGTTTA	2	12	834676	834687	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015177	ACGTTA	2	12	875909	875920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015177	TTACGT	2	12	878119	878130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015177	AATAAA	2	12	884480	884491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015177	TGACGT	2	12	911125	911136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015177	AAGCGA	2	12	926448	926459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015177	ACATTG	2	12	927882	927893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015177	GCTTTT	2	12	936051	936062	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015177	ATTACA	2	12	957088	957099	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015177	CTTTGT	2	12	974819	974830	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015177	ATTCTT	2	12	976496	976507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015177	ATTGTA	2	12	1041444	1041455	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015177	AATTTA	2	12	1046165	1046176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015177	GAAAAA	2	12	1048620	1048631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015177	TTTAAA	2	12	1049497	1049508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015177	ACAATA	2	12	1062146	1062157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015177	TTAAAT	2	12	1065215	1065226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015177	AATTTA	2	12	1110853	1110864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015177	AAGCAT	2	12	1142718	1142729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015177	GAATAT	2	12	1187086	1187097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015177	TTAAAA	2	12	1204296	1204307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015177	TTTTGT	2	12	1275642	1275653	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015177	TAAAAA	2	12	1283919	1283930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015177	TCTATT	2	12	1329037	1329048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015177	ACTTTA	2	12	1329745	1329756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015177	AAGAAT	2	12	1346647	1346658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015177	TATATT	2	12	1415148	1415159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015177	ACATTA	2	12	1441817	1441828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015177	ATTTAA	2	12	1456046	1456057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015177	AAATTA	2	12	1474908	1474919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015177	ACTTTA	2	12	1485354	1485365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015177	AGGAAG	2	12	1515643	1515654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015177	AATTGT	2	12	1610840	1610851	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015177	AGGTTC	2	12	1644500	1644511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015177	TTAAAA	2	12	1699483	1699494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015177	AGCTAT	2	12	1716667	1716678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015177	AGTATG	2	12	1721250	1721261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015177	TTTGCT	2	12	1766133	1766144	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015177	ATTTTT	2	12	1804743	1804754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015177	TTAATA	2	12	1808988	1808999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015177	ATATTA	2	12	1809152	1809163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015177	ATTCAT	2	12	1811396	1811407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015177	GAACTC	2	12	1920476	1920487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015177	ACCTAA	2	12	1920560	1920571	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015177	AATGAC	2	12	1998649	1998660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015177	AAAATT	2	12	2009795	2009806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015177	TAAAAT	2	12	2017752	2017763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015177	TTTAAA	2	12	2036683	2036694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015177	TGAAAA	2	12	2037926	2037937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015177	TAAAAA	2	12	2047191	2047202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015177	GATAAA	2	12	2048949	2048960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015177	ATTAAA	2	12	2065068	2065079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015177	TTGTTA	2	12	2065231	2065242	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015177	AAGAAA	2	12	2069498	2069509	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015177	ATTGAA	2	12	2072898	2072909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015177	ACGTTA	2	12	2105086	2105097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015177	AAATCA	2	12	2131409	2131420	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015177	AATCAA	2	12	2137175	2137186	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015177	AAAAAC	2	12	2152180	2152191	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015177	ATAGTT	2	12	2186602	2186613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015177	AACTAT	2	12	2186636	2186647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015177	AAAATT	2	12	2189052	2189063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015177	ACCATA	2	12	2194352	2194363	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015177	ATCAAA	2	12	2201044	2201055	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015177	GCTATT	2	12	2229580	2229591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015177	AAAAAC	2	12	2236990	2237001	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015177	TCAAAA	2	12	2295947	2295958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015177	AAAAAT	2	12	2332052	2332063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015177	AGATTT	2	12	2358996	2359007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015177	AAGTTT	2	12	2413652	2413663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015177	ATGTTT	2	12	2448808	2448819	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015177	ATTGCA	2	12	2448966	2448977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015177	AGTTAA	2	12	2491949	2491960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015177	ATTTTT	2	12	2502794	2502805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015177	TGATTC	2	12	2557985	2557996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015177	TTTTGT	2	12	2612880	2612891	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015177	CGAAGC	2	12	2643877	2643888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015177	TTCAAA	2	12	2643948	2643959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015177	CAATGT	2	12	2651796	2651807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015177	TCGCTT	2	12	2653230	2653241	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015177	TTACTA	2	12	2675530	2675541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015177	CGAATA	2	12	2690759	2690770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015177	ATAGTT	2	12	2697946	2697957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015177	AAATAG	2	12	2711940	2711951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015177	ACAAAA	2	12	2741887	2741898	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015177	CAAAAA	2	12	2782213	2782224	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015177	TTTTTG	2	12	2784128	2784139	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015177	AAATTG	2	12	2784182	2784193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015177	TTTTTG	2	12	2786014	2786025	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015177	TCCGTC	2	12	2803142	2803153	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015177	TCTTTT	2	12	2818046	2818057	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015177	AGAACA	2	12	2838988	2838999	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015177	AAATCA	2	12	2842978	2842989	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.