MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudoalteromonas sp. SM9913 chromosome I

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014803	TTAAA	2	10	15581	15590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014803	ACTCA	2	10	22286	22295	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014803	AACTC	2	10	22363	22372	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014803	TTAAA	2	10	39303	39312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014803	TGATT	2	10	39367	39376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014803	TCAAT	2	10	39818	39827	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014803	AGGGT	2	10	43030	43039	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014803	ACGAG	2	10	43220	43229	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014803	GAAAC	2	10	44793	44802	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014803	TTATT	2	10	54430	54439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014803	AAAGT	2	10	65108	65117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014803	CGATA	2	10	65181	65190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014803	TACTC	2	10	68543	68552	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014803	ATTTT	2	10	82374	82383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014803	AGATG	2	10	118198	118207	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014803	TCAAT	2	10	130756	130765	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014803	AGGGT	2	10	133968	133977	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014803	ACGAG	2	10	134158	134167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014803	GAAAC	2	10	135729	135738	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014803	CGCGA	2	10	144216	144225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014803	ACCAC	2	10	144349	144358	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_014803	TGCCT	2	10	144367	144376	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014803	ATTAA	2	10	146986	146995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014803	TGTAA	2	10	147121	147130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014803	TATGC	2	10	147666	147675	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014803	CTTAA	2	10	155603	155612	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014803	AAAAC	2	10	157700	157709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014803	ATTCT	2	10	178619	178628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014803	ATTTT	2	10	194737	194746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014803	TCCAT	2	10	194760	194769	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014803	CAACC	2	10	197361	197370	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014803	AAAAG	2	10	204952	204961	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014803	AAATA	2	10	215903	215912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014803	CACGT	2	10	222687	222696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014803	TTATT	2	10	231581	231590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014803	GCTTC	2	10	233879	233888	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014803	ATTAA	2	10	239429	239438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014803	AATAA	2	10	264895	264904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014803	TTGAA	2	10	277925	277934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014803	TTGCC	2	10	292976	292985	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014803	AAACA	2	10	294154	294163	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014803	TACTG	2	10	297100	297109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014803	TTAAA	2	10	297199	297208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014803	TTTTA	2	10	297572	297581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014803	ATTTT	2	10	300412	300421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014803	AGGCA	2	10	320419	320428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014803	TGTGG	2	10	320436	320445	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014803	TGTAC	2	10	343747	343756	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014803	TTAAA	2	10	352643	352652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014803	AAGCC	2	10	361397	361406	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014803	TTAAC	2	10	383148	383157	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014803	ATTTT	2	10	388177	388186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014803	ATTTC	2	10	388279	388288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014803	AACTC	2	10	389869	389878	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014803	TGTAT	2	10	391045	391054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014803	AAGAT	2	10	391107	391116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014803	ACGTT	2	10	393581	393590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014803	ATTTA	2	10	396423	396432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014803	ATCAA	2	10	404849	404858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014803	ATTTA	2	10	414993	415002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014803	TAACT	2	10	419665	419674	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014803	ACCAC	2	10	432537	432546	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_014803	TAAAA	2	10	446383	446392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014803	TATAA	2	10	452427	452436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014803	TTTTA	2	10	452463	452472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014803	TTTGT	2	10	466296	466305	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014803	TACAA	2	10	466560	466569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014803	GTTTA	2	10	491820	491829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014803	TTAAA	2	10	491988	491997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014803	TTACT	2	10	498053	498062	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014803	ACCAC	2	10	515054	515063	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014803	TGCCT	2	10	515072	515081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014803	TATTT	2	10	521419	521428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014803	CGCGA	2	10	521548	521557	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014803	CACAT	2	10	543204	543213	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014803	AGCGC	2	10	545037	545046	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014803	ACCAC	2	10	549572	549581	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014803	TGCCT	2	10	549590	549599	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014803	AGTTT	2	10	550286	550295	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014803	CTATT	2	10	561045	561054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014803	GAAAC	2	10	574184	574193	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014803	TCTTT	2	10	578527	578536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014803	AGAGG	2	10	578714	578723	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014803	AATAC	2	10	581040	581049	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014803	TTTAA	2	10	583303	583312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014803	AATTA	2	10	601036	601045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014803	AGGCA	2	10	615249	615258	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014803	TGTGG	2	10	615266	615275	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014803	GTTTT	2	10	615529	615538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014803	TATTT	2	10	622090	622099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014803	TGTTA	2	10	628853	628862	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014803	ACCAC	2	10	652482	652491	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_014803	TGCCT	2	10	652500	652509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014803	TATTT	2	10	662360	662369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014803	ATAGA	2	10	662431	662440	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014803	CCTTA	2	10	667609	667618	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014803	GCCTA	2	10	683110	683119	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014803	TAGGG	2	10	686766	686775	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014803	AAATG	2	10	709576	709585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014803	ATAAA	2	10	718006	718015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014803	ATGTC	2	10	725907	725916	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014803	AGGCA	2	10	740822	740831	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014803	TCAAT	2	10	773903	773912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014803	AGGGT	2	10	777110	777119	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014803	ACGAG	2	10	777300	777309	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014803	GAAAC	2	10	778873	778882	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014803	GAAAA	2	10	787484	787493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014803	AGCAA	2	10	787517	787526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014803	CTTTT	2	10	797232	797241	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014803	TCAAT	2	10	804305	804314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014803	AGGGT	2	10	807511	807520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014803	ACGAG	2	10	807701	807710	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014803	GAAAC	2	10	809275	809284	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014803	GAAAC	2	10	809453	809462	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014803	TATTG	2	10	810184	810193	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014803	TTAAT	2	10	815247	815256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014803	TAAAA	2	10	819270	819279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014803	TAGTG	2	10	839311	839320	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014803	CATCG	2	10	845557	845566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014803	TTAAT	2	10	855147	855156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014803	ACCAC	2	10	866199	866208	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_014803	TTTTA	2	10	891483	891492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014803	TAAAT	2	10	900604	900613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014803	GATCA	2	10	906832	906841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014803	TTTGA	2	10	908157	908166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014803	TTGGT	2	10	927869	927878	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014803	AGTAA	2	10	945295	945304	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014803	TATTT	2	10	960005	960014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014803	TAAAT	2	10	971601	971610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014803	AATGT	2	10	987529	987538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014803	TTTTC	2	10	993929	993938	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014803	TTTTA	2	10	994195	994204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014803	TAAGT	2	10	999323	999332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014803	TGCTG	2	10	1009249	1009258	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014803	ATAAA	2	10	1011826	1011835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014803	ATTTA	2	10	1016589	1016598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014803	GTAAG	2	10	1025237	1025246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014803	GTTTA	2	10	1028810	1028819	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014803	TAATT	2	10	1033419	1033428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014803	TTTAA	2	10	1035674	1035683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014803	ATTGA	2	10	1043780	1043789	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014803	ACCAC	2	10	1045801	1045810	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_014803	TGCCT	2	10	1045819	1045828	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_014803	TTAAA	2	10	1047610	1047619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014803	TTAGT	2	10	1063261	1063270	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014803	ACCAC	2	10	1073485	1073494	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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148	NC_014803	TGTAT	2	10	1076606	1076615	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014803	AATGC	2	10	1108789	1108798	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_014803	TGCTA	2	10	1120626	1120635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_014803	TCTTT	2	10	1199736	1199745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_014803	AGCGC	2	10	1901541	1901550	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
265	NC_014803	TGCCT	2	10	1918742	1918751	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_014803	TATGC	2	10	1935823	1935832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_014803	AAAAT	2	10	1991563	1991572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014803	ACATA	2	10	1998378	1998387	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_014803	AAATA	2	10	2056148	2056157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014803	TAAAA	2	10	2057158	2057167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014803	ACCAC	2	10	2083196	2083205	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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294	NC_014803	TGTGG	2	10	2161076	2161085	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_014803	TTTGT	2	10	3029013	3029022	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
407	NC_014803	ATTGA	2	10	3030878	3030887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_014803	ATCAA	2	10	3036312	3036321	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
410	NC_014803	GTTAA	2	10	3040031	3040040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
411	NC_014803	TTATT	2	10	3055986	3055995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_014803	TATTG	2	10	3058685	3058694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_014803	CTCGT	2	10	3064386	3064395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
416	NC_014803	TACCC	2	10	3064575	3064584	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
417	NC_014803	AAACG	2	10	3065983	3065992	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
418	NC_014803	GTTTA	2	10	3066342	3066351	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
419	NC_014803	ATTGA	2	10	3068138	3068147	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
420	NC_014803	AAAAT	2	10	3081941	3081950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_014803	TAACT	2	10	3082955	3082964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
422	NC_014803	TTTAA	2	10	3111700	3111709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_014803	AGAGA	2	10	3118274	3118283	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
424	NC_014803	TTCAA	2	10	3120095	3120104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
425	NC_014803	GATTT	2	10	3128621	3128630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
426	NC_014803	TTAAA	2	10	3165200	3165209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_014803	GCTTT	2	10	3171431	3171440	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
428	NC_014803	CTGAT	2	10	3174074	3174083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
429	NC_014803	AGAAA	2	10	3179050	3179059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
430	NC_014803	CTAAA	2	10	3183487	3183496	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_014803	AGTAA	2	10	3185121	3185130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
432	NC_014803	CGATT	2	10	3195962	3195971	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
433	NC_014803	TTTAT	2	10	3213352	3213361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_014803	ACTTA	2	10	3247911	3247920	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
435	NC_014803	CTTAA	2	10	3250904	3250913	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
436	NC_014803	AAAAG	2	10	3287657	3287666	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
437	NC_014803	AATAA	2	10	3296069	3296078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_014803	GTTTC	2	10	3299658	3299667	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
439	NC_014803	CTCGT	2	10	3301232	3301241	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
440	NC_014803	TACCC	2	10	3301421	3301430	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
441	NC_014803	TTTGT	2	10	3302763	3302772	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014803	ATTGA	2	10	3304632	3304641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014803	ATTAA	2	10	3305020	3305029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_014803	GTTTT	2	10	3324512	3324521	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
445	NC_014803	TAAAA	2	10	3332737	3332746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.