MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 chromosome

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014215	C	6	6	88	93	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_014215	G	6	6	6483	6488	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014215	C	6	6	11583	11588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_014215	G	6	6	34938	34943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014215	G	6	6	36658	36663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014215	C	6	6	47787	47792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_014215	G	6	6	51107	51112	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014215	C	6	6	60737	60742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_014215	T	6	6	94140	94145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014215	G	6	6	100543	100548	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014215	C	6	6	104578	104583	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_014215	A	6	6	119830	119835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014215	C	6	6	133629	133634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_014215	G	6	6	136145	136150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014215	G	6	6	136412	136417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014215	C	8	8	137246	137253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_014215	G	6	6	140926	140931	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014215	C	6	6	146348	146353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_014215	G	6	6	150112	150117	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014215	G	6	6	163679	163684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014215	T	6	6	167818	167823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014215	C	6	6	169285	169290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_014215	G	6	6	173346	173351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014215	A	6	6	181822	181827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014215	G	6	6	185808	185813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014215	G	6	6	202621	202626	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014215	C	6	6	206401	206406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_014215	C	6	6	209031	209036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_014215	C	7	7	209257	209263	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_014215	C	6	6	220861	220866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_014215	G	6	6	227854	227859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014215	G	6	6	229667	229672	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014215	C	6	6	232965	232970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_014215	C	6	6	238952	238957	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_014215	T	6	6	250904	250909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014215	G	6	6	272690	272695	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014215	G	6	6	289034	289039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014215	C	6	6	291556	291561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_014215	G	7	7	302465	302471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014215	C	8	8	303174	303181	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_014215	C	6	6	303205	303210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_014215	G	6	6	317335	317340	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014215	C	7	7	317430	317436	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_014215	G	6	6	329534	329539	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014215	G	6	6	344466	344471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014215	G	6	6	346984	346989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014215	T	6	6	354194	354199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014215	G	6	6	385514	385519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014215	G	6	6	385666	385671	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014215	G	6	6	393143	393148	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014215	G	8	8	423470	423477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014215	T	6	6	427056	427061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014215	G	6	6	440871	440876	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014215	T	6	6	443647	443652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014215	C	7	7	452281	452287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_014215	G	6	6	454081	454086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014215	G	6	6	478253	478258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014215	G	6	6	494450	494455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014215	G	6	6	496966	496971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014215	T	6	6	498521	498526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014215	G	6	6	499988	499993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014215	C	6	6	500322	500327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_014215	G	6	6	500517	500522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014215	G	6	6	500535	500540	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014215	G	6	6	500553	500558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014215	C	6	6	500859	500864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_014215	C	6	6	501231	501236	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_014215	G	6	6	501687	501692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014215	C	6	6	501697	501702	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_014215	T	6	6	508280	508285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014215	A	6	6	510064	510069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014215	G	6	6	511418	511423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014215	C	6	6	538493	538498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_014215	C	6	6	544732	544737	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_014215	C	6	6	557272	557277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_014215	A	6	6	580132	580137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014215	G	6	6	580638	580643	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014215	G	6	6	582620	582625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014215	G	6	6	593434	593439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014215	C	8	8	593494	593501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_014215	G	6	6	598667	598672	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014215	C	6	6	602710	602715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_014215	G	6	6	606368	606373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014215	G	6	6	606402	606407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014215	C	8	8	610509	610516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_014215	G	6	6	637529	637534	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014215	T	6	6	653835	653840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014215	G	6	6	687437	687442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014215	C	6	6	693782	693787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_014215	G	7	7	697032	697038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014215	C	6	6	721544	721549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_014215	G	6	6	725398	725403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014215	G	6	6	730145	730150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014215	C	7	7	757916	757922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_014215	C	6	6	760496	760501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_014215	C	6	6	763289	763294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_014215	C	6	6	768116	768121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_014215	G	6	6	803811	803816	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014215	G	6	6	819307	819312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014215	G	6	6	838369	838374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014215	C	6	6	843158	843163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_014215	C	7	7	847635	847641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_014215	G	6	6	871281	871286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014215	G	6	6	934453	934458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014215	G	6	6	946445	946450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014215	A	6	6	973331	973336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014215	G	7	7	974339	974345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014215	G	6	6	975600	975605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014215	C	6	6	1040205	1040210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_014215	A	6	6	1047810	1047815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014215	C	6	6	1047994	1047999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_014215	G	6	6	1085918	1085923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014215	G	6	6	1132708	1132713	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014215	G	6	6	1183253	1183258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014215	G	6	6	1203070	1203075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014215	G	6	6	1204781	1204786	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014215	G	8	8	1217398	1217405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014215	G	6	6	1270265	1270270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014215	C	6	6	1270287	1270292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_014215	G	6	6	1317848	1317853	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014215	C	6	6	1344806	1344811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_014215	G	7	7	1355260	1355266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014215	C	6	6	1396315	1396320	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_014215	C	6	6	1396869	1396874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_014215	C	6	6	1436900	1436905	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_014215	C	6	6	1473134	1473139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_014215	G	8	8	1488699	1488706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014215	C	6	6	1499738	1499743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_014215	C	6	6	1534905	1534910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_014215	C	6	6	1535228	1535233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_014215	A	6	6	1538485	1538490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014215	C	6	6	1538551	1538556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_014215	C	6	6	1538895	1538900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_014215	C	6	6	1540243	1540248	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_014215	A	6	6	1540330	1540335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014215	C	6	6	1540963	1540968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_014215	G	6	6	1550097	1550102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014215	C	6	6	1550121	1550126	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_014215	C	6	6	1573967	1573972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_014215	C	6	6	1632614	1632619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_014215	C	6	6	1653479	1653484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_014215	G	7	7	1654152	1654158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014215	G	6	6	1667188	1667193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014215	C	6	6	1681254	1681259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_014215	C	6	6	1689315	1689320	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_014215	C	6	6	1710487	1710492	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_014215	C	6	6	1743817	1743822	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_014215	G	6	6	1757946	1757951	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014215	C	6	6	1767056	1767061	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NC_014215	G	8	8	1775543	1775550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014215	C	6	6	1788302	1788307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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153	NC_014215	A	6	6	1792578	1792583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.