MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pirellula staleyi DSM 6068 chromosome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013720	GCACTG	2	12	5328	5339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013720	AACCAG	2	12	17411	17422	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013720	GAGTGC	2	12	25766	25777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013720	TGTGGT	2	12	60202	60213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013720	GGAATC	2	12	66863	66874	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013720	GAGCGC	2	12	120735	120746	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013720	GCGATC	2	12	129872	129883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013720	GCGTCA	2	12	189122	189133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013720	CTTTCG	2	12	203858	203869	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013720	TGGCAC	2	12	327367	327378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013720	GTGCTT	6	36	378606	378641	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013720	CTTGAG	2	12	378749	378760	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013720	TCAATT	2	12	386683	386694	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013720	TCAACC	2	12	417871	417882	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013720	TGGAGG	2	12	448931	448942	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013720	GCAGCG	2	12	505308	505319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013720	AATCGA	2	12	532403	532414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013720	ACGACC	2	12	576844	576855	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013720	TTCAGT	2	12	592362	592373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013720	AGCGCA	2	12	600610	600621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013720	CCTCTG	2	12	609537	609548	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013720	GAGCGA	2	12	681141	681152	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013720	CCAGCT	2	12	683577	683588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013720	TTCGGG	2	12	721423	721434	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013720	AAGAAA	2	12	742621	742632	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013720	GTGTCA	2	12	870891	870902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013720	CTTCTC	2	12	927224	927235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013720	CATGAA	2	12	989415	989426	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013720	ACGCAG	2	12	1009531	1009542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013720	GCAAAA	2	12	1110625	1110636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013720	ATTGGA	2	12	1115815	1115826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013720	ACGAGC	2	12	1123036	1123047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013720	CGAGCA	2	12	1135764	1135775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013720	GCAGAT	2	12	1176410	1176421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013720	AAGCTC	2	12	1203408	1203419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013720	TACTGT	2	12	1420694	1420705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013720	TGGTGA	3	18	1519874	1519891	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013720	GGAGCA	2	12	1559896	1559907	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013720	CCACGC	2	12	1589728	1589739	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013720	ACGTGA	2	12	1602433	1602444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013720	TGCGAT	2	12	1619632	1619643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013720	TCTCAC	2	12	1653812	1653823	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013720	AAACGC	2	12	1675452	1675463	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013720	GCTGTC	2	12	1675506	1675517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013720	AACGAT	2	12	1701870	1701881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013720	ACAGAA	2	12	1702720	1702731	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013720	GGTAGC	2	12	1709342	1709353	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013720	GATCCT	2	12	1733448	1733459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013720	GACGTG	2	12	1836589	1836600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013720	TCAGCA	2	12	1858975	1858986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013720	TCTCAT	2	12	1927049	1927060	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013720	GTGCTG	2	12	1932906	1932917	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013720	GCGTGA	2	12	1988901	1988912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013720	CTTGGT	2	12	1995272	1995283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013720	AAAGGG	2	12	2013569	2013580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013720	GGCGTT	2	12	2025451	2025462	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013720	AGTGTT	2	12	2122801	2122812	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013720	TCTCCC	2	12	2194560	2194571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013720	ACTGCT	2	12	2282073	2282084	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013720	GTTTCC	2	12	2420062	2420073	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013720	GCCTCG	2	12	2420169	2420180	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013720	GCTCCT	2	12	2420361	2420372	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013720	GCTCCT	2	12	2420382	2420393	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013720	GTTGAA	2	12	2436313	2436324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013720	CTTTCC	2	12	2498636	2498647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013720	CGTGCG	2	12	2537963	2537974	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013720	GGAAAG	2	12	2633287	2633298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013720	AACGAG	2	12	2668034	2668045	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013720	CGCCAA	2	12	2716576	2716587	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013720	AGCAAG	2	12	2725040	2725051	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013720	GCATTT	2	12	2767587	2767598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013720	CTTCAG	2	12	2803828	2803839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013720	AGGGGA	2	12	2835653	2835664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013720	GCAATC	2	12	2876083	2876094	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013720	CCTGCC	2	12	2887096	2887107	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013720	ACTTCG	2	12	2929431	2929442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013720	ATCTTA	2	12	3018710	3018721	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013720	AAGTGC	2	12	3020952	3020963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013720	ACCTTG	2	12	3055705	3055716	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013720	TTCTGA	2	12	3056485	3056496	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013720	TCGATT	2	12	3070747	3070758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013720	AGGCAA	2	12	3092524	3092535	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013720	AGTGGA	2	12	3093058	3093069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013720	GAAAGG	2	12	3126869	3126880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013720	GGTTTC	2	12	3166252	3166263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013720	CTGAGC	2	12	3168799	3168810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013720	GTTGCC	2	12	3169523	3169534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013720	AGCGAA	2	12	3348456	3348467	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013720	AACCCC	2	12	3360545	3360556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013720	CGAAGG	2	12	3370708	3370719	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013720	ATCGAG	2	12	3437957	3437968	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013720	GGAAGA	2	12	3463544	3463555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013720	GTGACT	2	12	3501426	3501437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013720	AATTGC	2	12	3555689	3555700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013720	TAATGG	2	12	3564691	3564702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013720	GGTCGC	2	12	3620791	3620802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013720	GATCGC	2	12	3717400	3717411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013720	TCCAGT	2	12	3809686	3809697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013720	CAGTAC	2	12	3867410	3867421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013720	ACCAAT	2	12	3869579	3869590	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013720	TTCGTT	2	12	3902564	3902575	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013720	TGATTA	2	12	3932124	3932135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013720	CTGAGC	3	18	3933195	3933212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013720	TGGTCG	2	12	3995919	3995930	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013720	TGACCG	2	12	4015111	4015122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013720	CGAGAG	2	12	4031621	4031632	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013720	CGTTTT	2	12	4108690	4108701	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013720	GGGTGC	2	12	4150717	4150728	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013720	CATCCT	2	12	4258102	4258113	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013720	AGCGGT	2	12	4294836	4294847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013720	TGATTT	2	12	4324737	4324748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013720	GCTTCA	2	12	4380097	4380108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013720	GCGATC	2	12	4395039	4395050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013720	TTCATC	2	12	4409284	4409295	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013720	GTTTCA	2	12	4692015	4692026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013720	TCTATC	2	12	4762200	4762211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013720	TTCGAC	2	12	4769543	4769554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013720	GAAAGG	2	12	4774672	4774683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013720	CGCAGT	2	12	4843662	4843673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013720	GCTTTT	2	12	4883176	4883187	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013720	GTTTCA	2	12	4912216	4912227	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013720	ACTGAA	2	12	4929289	4929300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013720	GATCGA	2	12	4983618	4983629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013720	AACTGC	2	12	4989166	4989177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013720	ATCGGT	2	12	5013384	5013395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013720	TGCGCT	2	12	5033794	5033805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013720	CGAAAA	2	12	5051482	5051493	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013720	CCAAAC	2	12	5052293	5052304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013720	GAAGGG	2	12	5059141	5059152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013720	TTCCAA	2	12	5063834	5063845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013720	ACCAGT	2	12	5103139	5103150	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013720	CTCGAT	2	12	5145397	5145408	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013720	CAAGGG	2	12	5186571	5186582	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013720	CTTGCG	2	12	5240218	5240229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013720	GCCGAG	2	12	5253823	5253834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013720	GTTTCT	2	12	5274549	5274560	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_013720	CTCTGA	2	12	5462298	5462309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013720	GGCAGC	2	12	5533936	5533947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013720	ACCCAA	2	12	5667367	5667378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013720	GCGAAC	2	12	5702809	5702820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013720	CCCACG	2	12	5721544	5721555	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013720	ATCGAT	2	12	5730596	5730607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_013720	CTTGGT	2	12	5734772	5734783	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_013720	ACCACG	2	12	5771787	5771798	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013720	CGCAGG	2	12	5776441	5776452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013720	GAGGCT	2	12	5795310	5795321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_013720	CACAAA	2	12	5826561	5826572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013720	GATTTC	2	12	5833409	5833420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_013720	CCTTCG	2	12	5878105	5878116	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013720	GACGGG	2	12	5981702	5981713	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_013720	TCGCTT	2	12	5993116	5993127	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013720	TCGCGC	2	12	6015734	6015745	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013720	AGCGGA	2	12	6021555	6021566	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_013720	ATCAAA	2	12	6022315	6022326	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_013720	AAACGC	2	12	6050234	6050245	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013720	CTGGCA	2	12	6050500	6050511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_013720	TGTTCT	2	12	6066317	6066328	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_013720	TGGTCG	2	12	6165869	6165880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_013720	CTTTTT	2	12	6167283	6167294	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.