MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Photorhabdus asymbiotica plasmid pPAU1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012961	ATTT	2	8	1407	1414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012961	ATAA	2	8	1494	1501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012961	TTTA	2	8	1576	1583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012961	TTAA	2	8	1607	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012961	AGTA	2	8	2032	2039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012961	TAAT	2	8	2188	2195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012961	TTAA	2	8	2199	2206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012961	TGCT	2	8	3817	3824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012961	TGTA	2	8	6039	6046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012961	TAAT	2	8	6068	6075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012961	AATA	2	8	6125	6132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012961	ATTT	2	8	6177	6184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012961	TAAA	2	8	7385	7392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012961	CAGT	2	8	8650	8657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012961	TGAT	2	8	8741	8748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012961	TTAC	2	8	11980	11987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012961	CTTA	2	8	26774	26781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012961	TGCT	2	8	27084	27091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012961	AATT	2	8	27102	27109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012961	TAAG	2	8	27475	27482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012961	ACTT	2	8	27767	27774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012961	TTGG	2	8	28957	28964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012961	ATTT	2	8	29228	29235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012961	GTGA	2	8	29278	29285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.