MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 1007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010531	TTGT	2	8	1589	1596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010531	TCTA	2	8	8984	8991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010531	TAAA	2	8	10899	10906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010531	TGGC	2	8	10987	10994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010531	GCTC	2	8	11179	11186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010531	GCAT	2	8	11446	11453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010531	AAAC	2	8	11755	11762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010531	AATG	2	8	16188	16195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010531	TGCT	2	8	16604	16611	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010531	TGGC	2	8	16624	16631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010531	AGTA	2	8	18984	18991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010531	GCCT	2	8	23357	23364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010531	TGCG	2	8	28003	28010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010531	TTGC	2	8	28041	28048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010531	TTAA	2	8	31052	31059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010531	GCTT	2	8	32489	32496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010531	CAAG	2	8	32514	32521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010531	CAAT	2	8	32581	32588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010531	TAAA	2	8	33857	33864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010531	GTGA	2	8	34353	34360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010531	TACC	2	8	34929	34936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010531	AAAC	2	8	35631	35638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010531	GCGA	2	8	36238	36245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010531	GACA	2	8	36930	36937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010531	AAAG	2	8	37071	37078	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010531	TTGA	2	8	37844	37851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010531	ATTT	2	8	38144	38151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010531	TTGT	2	8	53456	53463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010531	AAGT	2	8	53478	53485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010531	AATT	2	8	57996	58003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010531	TTAA	2	8	68866	68873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010531	AAAG	2	8	69778	69785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010531	TATT	2	8	83652	83659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010531	TCAA	2	8	83813	83820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010531	TTGG	2	8	84003	84010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010531	CAAG	2	8	84691	84698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010531	GCAT	2	8	84757	84764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010531	CGTT	2	8	84799	84806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010531	CATT	2	8	84891	84898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010531	GTCA	2	8	85333	85340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010531	GATG	2	8	85445	85452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010531	TTTC	2	8	86098	86105	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010531	AGCC	2	8	86169	86176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010531	GTGA	2	8	86364	86371	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010531	TGGC	2	8	86521	86528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010531	CTAC	2	8	86686	86693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010531	GTTT	2	8	87047	87054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010531	TGAA	2	8	87254	87261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010531	TAGC	2	8	87296	87303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010531	ATTT	2	8	87571	87578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010531	AGGT	2	8	87659	87666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010531	TCAT	2	8	88367	88374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010531	CTTC	2	8	88921	88928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010531	ATAG	2	8	89238	89245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010531	TTGA	2	8	89698	89705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010531	TATT	2	8	89756	89763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010531	TCAA	2	8	94981	94988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010531	TGGT	2	8	95569	95576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010531	TGAT	2	8	95682	95689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010531	CATT	3	12	95783	95794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010531	TGAT	2	8	95842	95849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010531	GTCA	2	8	95933	95940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010531	ATTA	2	8	96288	96295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010531	TAAA	2	8	99613	99620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010531	TTTG	2	8	99982	99989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010531	AGCT	2	8	109016	109023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010531	TTAA	2	8	110011	110018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010531	AGAT	2	8	110326	110333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010531	ATGG	2	8	110664	110671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010531	GCTA	2	8	111377	111384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010531	ATCC	2	8	111512	111519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010531	TCTT	2	8	111831	111838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010531	GGTA	2	8	111891	111898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010531	CAAT	2	8	112700	112707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010531	ATTT	2	8	112776	112783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010531	AAAT	2	8	112899	112906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010531	GTTG	2	8	113356	113363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010531	GTTG	2	8	114456	114463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010531	GTGC	2	8	114512	114519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010531	ATTT	2	8	114754	114761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010531	TCAA	2	8	115665	115672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010531	GCTC	2	8	116283	116290	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010531	CTGG	2	8	116319	116326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010531	CCTT	2	8	117981	117988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010531	AAAT	2	8	121021	121028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010531	TAGT	2	8	122228	122235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010531	AAGC	2	8	125209	125216	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010531	AACT	2	8	125434	125441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010531	AATA	2	8	125669	125676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010531	TCAG	2	8	125848	125855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010531	GAAA	2	8	126140	126147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010531	ATTT	2	8	126284	126291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010531	AAAG	2	8	126706	126713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010531	TTCA	2	8	126853	126860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010531	TTTA	2	8	127109	127116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010531	TTCT	2	8	128710	128717	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010531	TGAT	2	8	128760	128767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010531	GATT	2	8	138829	138836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010531	AATA	2	8	144221	144228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010531	AGAA	2	8	145447	145454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010531	ACAA	2	8	145466	145473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010531	CCAA	2	8	146499	146506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010531	TGAT	2	8	146547	146554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010531	TGAT	2	8	146743	146750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010531	GGTA	2	8	146822	146829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010531	AGCA	2	8	148314	148321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010531	CCGC	2	8	148719	148726	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_010531	AAAT	2	8	149325	149332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010531	CCTT	2	8	149743	149750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010531	GGCG	2	8	150461	150468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010531	GATG	2	8	151725	151732	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010531	CTTT	2	8	173968	173975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010531	GCTG	2	8	175005	175012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010531	TTGC	2	8	175211	175218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010531	TAGT	2	8	175996	176003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010531	GTGG	2	8	176041	176048	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010531	TATT	2	8	177638	177645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010531	ATGA	2	8	179239	179246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010531	ATCG	2	8	179425	179432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010531	TGCA	2	8	183252	183259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010531	ATTT	2	8	186170	186177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010531	CTTG	2	8	186386	186393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010531	GGCG	2	8	186594	186601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010531	GAAA	2	8	186713	186720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010531	TTTC	2	8	187571	187578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010531	TATC	2	8	188148	188155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010531	ATTA	2	8	188919	188926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010531	ACCA	2	8	188933	188940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010531	CTTG	2	8	189708	189715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010531	ATCG	2	8	190983	190990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010531	CGGT	2	8	191089	191096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010531	GGTG	2	8	191109	191116	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010531	GCCT	2	8	191136	191143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010531	TTTA	2	8	191362	191369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010531	CTGA	2	8	193315	193322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010531	GCTC	2	8	206040	206047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010531	GAAG	2	8	206385	206392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010531	CTTT	2	8	207552	207559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010531	AATG	2	8	207590	207597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010531	AGCA	2	8	208098	208105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010531	TACA	2	8	211566	211573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010531	CAAA	2	8	213737	213744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010531	TAAG	2	8	217423	217430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010531	TTAT	2	8	219150	219157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010531	GTTG	2	8	223652	223659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010531	TGGC	2	8	223694	223701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010531	ACCT	2	8	224448	224455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010531	GCAA	2	8	225173	225180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010531	CAGC	2	8	225374	225381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010531	ATTT	2	8	226774	226781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010531	GAAA	2	8	228800	228807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010531	CAAT	2	8	228810	228817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_010531	AATT	2	8	699653	699660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_010531	CTTA	2	8	733410	733417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
497	NC_010531	TTTG	2	8	733676	733683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_010531	ACCA	2	8	739243	739250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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