MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010531	TTC	3	9	224005	224013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010531	ACC	2	6	224038	224043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_010531	GCA	2	6	224065	224070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_010531	GTA	2	6	224113	224118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010531	CAA	2	6	224163	224168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_010531	TGA	2	6	224191	224196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010531	ATC	2	6	224292	224297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010531	TGA	2	6	224300	224305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010531	ACCT	2	8	224448	224455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_010531	CCT	2	6	224534	224539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_010531	TGA	2	6	224612	224617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010531	GCC	2	6	224680	224685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_010531	ATT	2	6	224869	224874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010531	TGC	2	6	224947	224952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010531	GCC	2	6	225014	225019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_010531	GCA	2	6	225047	225052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010531	TTG	2	6	225077	225082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010531	GCC	2	6	225119	225124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_010531	CGC	2	6	225131	225136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_010531	GCAA	2	8	225173	225180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_010531	ATT	2	6	225257	225262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010531	TA	3	6	225265	225270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010531	GT	3	6	225276	225281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010531	TTGAT	2	10	225307	225316	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010531	CAT	2	6	225342	225347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010531	AAT	2	6	225349	225354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010531	CAGC	2	8	225374	225381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_010531	ATTT	2	8	226774	226781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010531	GAAA	2	8	228800	228807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010531	CAAT	2	8	228810	228817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_010531	GTT	2	6	229881	229886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010531	A	6	6	229887	229892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010531	TCT	2	6	229901	229906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010531	A	6	6	229925	229930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010531	T	6	6	229948	229953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010531	GCT	2	6	229983	229988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010531	AAG	2	6	231263	231268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010531	GAA	2	6	231270	231275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010531	TCAA	2	8	232088	232095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_010531	AGA	2	6	232104	232109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010531	TAAA	2	8	236432	236439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010531	CAA	2	6	236458	236463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_010531	T	6	6	238232	238237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010531	T	7	7	238247	238253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010531	AGC	2	6	239753	239758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010531	A	6	6	239761	239766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010531	AG	3	6	239790	239795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010531	AAC	2	6	239979	239984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_010531	A	7	7	243687	243693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010531	TTA	2	6	250806	250811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010531	ATT	2	6	253379	253384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010531	GAT	2	6	253436	253441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010531	AAT	2	6	253458	253463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010531	AATTA	3	15	254540	254554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010531	TCG	2	6	258165	258170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010531	GCA	2	6	258180	258185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010531	TTTAA	2	10	258192	258201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010531	ATTA	2	8	258251	258258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010531	TGA	2	6	258336	258341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010531	GCTA	2	8	258374	258381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_010531	CCA	2	6	258384	258389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_010531	GGC	2	6	258422	258427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010531	ACG	2	6	258431	258436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_010531	GCA	2	6	258459	258464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_010531	AGC	2	6	258473	258478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010531	GT	3	6	258545	258550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010531	TGT	3	9	258548	258556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010531	GT	3	6	258575	258580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010531	TGT	2	6	258605	258610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010531	CAC	2	6	258645	258650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_010531	AGA	2	6	259550	259555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010531	TTAA	2	8	261042	261049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010531	CAA	2	6	261060	261065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010531	GACT	2	8	261068	261075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_010531	CGG	2	6	261096	261101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_010531	CTGA	2	8	261124	261131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_010531	ATG	2	6	261152	261157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010531	ATT	2	6	261173	261178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010531	ATG	2	6	261242	261247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010531	GT	3	6	261350	261355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010531	CCA	2	6	261416	261421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_010531	GCGCT	2	10	261508	261517	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1083	NC_010531	T	7	7	261527	261533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010531	CGTA	2	8	261569	261576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_010531	GCAT	2	8	261598	261605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_010531	ATG	2	6	261610	261615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010531	CAG	2	6	261626	261631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_010531	CGA	2	6	261710	261715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010531	CGATG	2	10	261722	261731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_010531	ATG	2	6	261738	261743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010531	GAA	2	6	261750	261755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010531	TGC	2	6	261802	261807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010531	GTA	2	6	261838	261843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010531	TCAT	2	8	261853	261860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_010531	AGC	2	6	261886	261891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010531	GCTGG	2	10	261923	261932	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_010531	AGA	2	6	261950	261955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010531	AAG	2	6	261984	261989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010531	A	6	6	264377	264382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010531	CCA	2	6	264384	264389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_010531	TGG	2	6	264402	264407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010531	CTT	2	6	264413	264418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_010531	AGGAT	2	10	266634	266643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010531	CAC	2	6	266769	266774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_010531	TCAA	2	8	266775	266782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_010531	GAAC	2	8	267336	267343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_010531	GAAA	2	8	270298	270305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010531	T	8	8	270361	270368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010531	ATT	2	6	270390	270395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010531	TGG	2	6	270404	270409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010531	GCCT	3	12	270442	270453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_010531	CAC	2	6	270474	270479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_010531	AG	3	6	272411	272416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010531	TGA	2	6	273702	273707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010531	A	9	9	274611	274619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010531	ATG	2	6	275723	275728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010531	CAAAA	2	10	277520	277529	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_010531	A	6	6	277526	277531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010531	T	6	6	277549	277554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010531	AGA	2	6	278260	278265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010531	TTG	2	6	278285	278290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010531	CTG	2	6	278354	278359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_010531	GAT	2	6	279142	279147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010531	GAT	2	6	279360	279365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010531	CGT	2	6	281030	281035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_010531	CTT	2	6	281046	281051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_010531	TTC	2	6	281070	281075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010531	ACGTTG	2	12	281082	281093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1129	NC_010531	GC	3	6	281104	281109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_010531	AGC	2	6	281121	281126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010531	T	7	7	281731	281737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010531	TGT	2	6	281745	281750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010531	AAT	2	6	281775	281780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010531	ATTT	2	8	281811	281818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010531	TA	3	6	281820	281825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_010531	CAAG	2	8	289025	289032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1253	NC_010531	T	6	6	322863	322868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_010531	A	6	6	322910	322915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_010531	CTG	2	6	322982	322987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1272	NC_010531	CAGA	2	8	324864	324871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1273	NC_010531	TGA	2	6	324887	324892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1397	NC_010531	GTA	2	6	341765	341770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_010531	TTGC	3	12	341992	342003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1403	NC_010531	CT	3	6	342032	342037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1404	NC_010531	TG	3	6	342181	342186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_010531	A	6	6	342193	342198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_010531	AAG	2	6	342268	342273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_010531	TTG	2	6	347217	347222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_010531	GAAT	2	8	347765	347772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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