MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Parvibaculum lavamentivorans DS-1 chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009719	GAAAAA	2	12	47617	47628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009719	GCAGGG	2	12	61540	61551	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009719	GGAAAA	2	12	197965	197976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009719	GCCTCG	2	12	206415	206426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009719	GCGGCA	2	12	221458	221469	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009719	CGGCCA	2	12	234763	234774	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009719	GACCCG	2	12	237072	237083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009719	TCCCTC	2	12	244850	244861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009719	CGCGCC	2	12	298289	298300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009719	AAGATG	2	12	370341	370352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009719	CCGCGC	2	12	402816	402827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009719	GTTTCG	2	12	448492	448503	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009719	ACGTCA	2	12	498124	498135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009719	ATCGGG	2	12	624073	624084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009719	CAAAGA	2	12	624257	624268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009719	CGCTCC	2	12	722016	722027	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009719	AGGCGG	2	12	748190	748201	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009719	GGCGCG	2	12	749105	749116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009719	TCTCCC	2	12	837613	837624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009719	AAAAGG	2	12	877168	877179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009719	ATTCAT	2	12	894702	894713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009719	AACGCA	2	12	919943	919954	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009719	GCAGCG	2	12	921858	921869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009719	TGTATT	2	12	948332	948343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009719	CGCCCC	2	12	970801	970812	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_009719	AACGTG	2	12	971507	971518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009719	TGCGGG	2	12	973800	973811	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009719	TGCGGG	2	12	974154	974165	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009719	TCTCCC	2	12	1049274	1049285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009719	GACCGC	2	12	1066118	1066129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009719	CCCGTG	2	12	1069721	1069732	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009719	TTGCGC	2	12	1104333	1104344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009719	GAACTG	2	12	1112032	1112043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009719	AAAGTG	2	12	1113479	1113490	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009719	CGCTTC	2	12	1133753	1133764	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009719	CACGTT	2	12	1154635	1154646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009719	GGCAAG	2	12	1157822	1157833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009719	CTCCGG	2	12	1191213	1191224	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009719	GCGGGG	2	12	1289208	1289219	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009719	CAGAGT	2	12	1295103	1295114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009719	CGGGAA	2	12	1352434	1352445	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009719	CACTCT	2	12	1356989	1357000	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009719	GCGGGG	2	12	1366199	1366210	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009719	TCCGGT	2	12	1398030	1398041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009719	CCCTGA	2	12	1481855	1481866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009719	CGCCGG	2	12	1495609	1495620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009719	GGTCCG	2	12	1503877	1503888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009719	TTCGCC	2	12	1515613	1515624	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009719	GGGGCG	2	12	1519890	1519901	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009719	TTTCGC	2	12	1537063	1537074	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009719	CTTGCC	2	12	1539660	1539671	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009719	GGACTT	2	12	1549789	1549800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009719	CCCCGC	2	12	1579068	1579079	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
54	NC_009719	TATTGT	2	12	1599980	1599991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009719	TGCCGG	2	12	1617770	1617781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009719	TGCGCA	2	12	1669416	1669427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009719	TTCCGC	2	12	1692247	1692258	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009719	GGAAAA	2	12	1692279	1692290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009719	TCTCCC	2	12	1695067	1695078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009719	AGGCAG	2	12	1747919	1747930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009719	GGCCGG	2	12	1755981	1755992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009719	GGAGGG	2	12	1820251	1820262	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009719	CATCGA	2	12	1836255	1836266	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009719	AATCTG	2	12	1844794	1844805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009719	GGCGGG	2	12	1864283	1864294	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009719	GAAAGA	2	12	1871666	1871677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009719	GAGAAA	2	12	1901066	1901077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009719	ATCCGG	2	12	1905598	1905609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009719	CTTCGG	2	12	1928901	1928912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009719	GGCGTC	2	12	2022632	2022643	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009719	GAACCT	2	12	2049506	2049517	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009719	GGCACG	2	12	2161924	2161935	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009719	GGCAGA	2	12	2165540	2165551	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009719	CCGGTC	2	12	2254283	2254294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009719	GGGGGC	2	12	2267953	2267964	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009719	TTGCGC	2	12	2292743	2292754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009719	TTCGGG	2	12	2303933	2303944	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009719	GGGAGG	2	12	2345716	2345727	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009719	GGGGCC	2	12	2370595	2370606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009719	ACAAGA	2	12	2374727	2374738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009719	GGGCAA	2	12	2374797	2374808	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009719	TCATTG	2	12	2422678	2422689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009719	TTTCGG	2	12	2425365	2425376	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009719	GGTCTC	2	12	2452223	2452234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009719	ATTGCG	2	12	2475618	2475629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009719	GGCCGG	2	12	2486080	2486091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009719	GCGGCC	2	12	2510119	2510130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009719	TCCGGA	2	12	2539422	2539433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009719	GCGACA	2	12	2547294	2547305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009719	ATATAG	2	12	2557994	2558005	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009719	CAGGAG	2	12	2570456	2570467	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009719	TGAAGG	2	12	2581693	2581704	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009719	GCCTGC	2	12	2600297	2600308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009719	CCTTTT	2	12	2626031	2626042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009719	AATGCC	2	12	2649866	2649877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009719	TTTACC	2	12	2722553	2722564	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009719	GTTGTG	2	12	2740903	2740914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009719	GGATCG	2	12	2759733	2759744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009719	GCCTGC	2	12	2787715	2787726	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009719	TGGCGT	2	12	2789356	2789367	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009719	TTGCCA	2	12	2802066	2802077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009719	CCGGAG	2	12	2886430	2886441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009719	GCTGGT	2	12	2941812	2941823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009719	CGCTCA	2	12	2962634	2962645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009719	ACGGAA	2	12	2973721	2973732	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009719	CGGAAA	2	12	2975093	2975104	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009719	ACCGGG	2	12	2993665	2993676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009719	GAGCGC	2	12	3021146	3021157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009719	TTTGCC	2	12	3057779	3057790	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009719	TCCGGT	2	12	3104460	3104471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009719	TTCGCT	2	12	3129906	3129917	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009719	CGGGGC	2	12	3239223	3239234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009719	GGCGAG	2	12	3251465	3251476	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009719	CCGATG	2	12	3364048	3364059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009719	GAAAGA	2	12	3379776	3379787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009719	GCGAGA	2	12	3444271	3444282	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009719	CCCGGC	2	12	3473495	3473506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009719	ACGCCA	2	12	3487480	3487491	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009719	CATTAA	2	12	3497187	3497198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009719	GGGGAT	2	12	3502460	3502471	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009719	CGCTTC	2	12	3502504	3502515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009719	CGGCGC	2	12	3507807	3507818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009719	CGGGTT	2	12	3606865	3606876	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009719	CGGTGC	2	12	3626290	3626301	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009719	TTCGGC	2	12	3674161	3674172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009719	AGAGTG	2	12	3760568	3760579	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009719	TTCCCG	2	12	3765123	3765134	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009719	CGCATC	2	12	3834410	3834421	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009719	TTGCCT	2	12	3838037	3838048	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009719	GGGGCG	2	12	3856168	3856179	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009719	AAATAT	2	12	3910030	3910041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.